use our xbt_getline on every platform to ease our cmake mess

Also, as stdio.h is not loaded by root headers of the simgrid tree, we
need to explicitely load it in some locations.

fix get_phys_host

add get_phys_host, which enables us to pick up private data at any layer

always have display_timing activated for smpi, as it is quite useful

Rename getline as xbt_getline.

Update documentation about java bindings.

Fix javadoc warnings.

Make javadoc less verbose.

Add MPI_Alltoallv support to the SMPI replay tool. Make it easy to change MPI_Datatype for the SMPI replay tool (IS benchmark uses MPI_INT and some others use MPI_BYTE)

Connect log categories used in java bindings.

Change message to debug loglevel.

Fix java examples: catch exceptions on failures.

Don't let exceptions pass through the MSG layer.

Typo.

Run Java tests from build directory, instead of source directory.

Remove output file after run.

There's no test for java_io.

Improve dependencies around simgrid.jar (again).

Strip libraries in release mode only.

SG_java_tracing is not a separate library anymore.

Improve output of check_dist_archive.

cleanups in .gitignore files

- re-kill two files that got re-added when merging with github
- ignore java compiled files

Merge branch 'master' of github.com:mquinson/simgrid

Update the MPI_Waitall for SMPI replay tool, remove unnecessary loop

add vm_migration with no overhead

Another fix in build depends.

Hope it is correct now.

Workaround a bug in cmake -E touch, where the modifiction time is
truncated when file exists.

add vm_resume and fix minor erros

model-checker : remove var in list of global variables with MC_ignore_data_bss

Add missing files for dist.

Consolidate .gitignore files.

model-checker : fix index of dynar in get_location

Try to guess JSG_BUNDLE on unknown systems.

Add rules to install Java bindings.

Fix library name.

chainsend: remove active wait at peer termination

Use predefined variables instead of hardcoded values.  Fix #15322.

Typo.

Fix dependencies for Java and its examples.

Try to avoid to rebuild targets when not needed.

Do the right thing for 'root' and 'end' in dot_add_parallel_task
Various cosmetics

typo

chainsend: reduce filesize in tesh to avoid timeouts in slow platforms

chainsend: remove end of data message, send that information at chain initialization

Fix conflict - Adrien

Fix more and more bugs - Adrien

bugfix in Task.setDataSize(): change both C and Java worlds

Compile with a recent flexml

make it compile in paranoid mode

ignore some new stuff

fix variable mismatches

model-checker : update tesh bugged1_liveness and chord_neverjoin

model-checker : remove trigger for state equality detection

model-checker : debug message if log enabled

model-checker : variable used ifdef MC_VERBOSE

model-checker : start heap comparison from local variables

model-checker : fix get_local_variables

model-checker : get bytes used in std_heap instead of chunks used

model-checker : remove unnecessary variable

Remove remaining cruft from simgrid-java import.

Enable tests for all Java examples.

Enable build for all Java examples.

Oops... forgot to include Java bindings for tracing.

Avoid to modify simgrid.jar at each build.

fix double brace

Merge branch 'master' into hypervisor

Merge branch 'master' into hypervisor

Fix conflict - Adrien

Still fixing bugs - Adrien

add vm_suspend stuff

globally declare surf_vm_workstation_model

fix a compilation error at SIMIX_vm_shutdown

fix xbt_lib_unset

add the missing systemcall of SIMIX_vm_shutdown

fix msg_vm_shutdown

fix msg_vm_destroy

Still fixing bugs - Adrien

fix vm_ws_destroy()

ignore some new stuff

Merge branch 'with_java'

Add CMakeLists.txt for examples/java.

Update CMakeLists.txt for java_bittorrent.

Fix conflict - Adrien

Still fixing bugs - Adrien

Adding MPI_Alltoall and MPI_Waitall to the SMPI replay tool

Fix path.

don't compile simdag_trace if Tracing is off

protect TRACE_sd_dotloader in case Tracing is off

fix destroy() of vm_ws

add xbt_lib_unset

Final fix for the java-bittorrent example.

Combine the native libraries in simgrid.jar.

Move around remaining files from SimGrid-java.

fix conflict

add missing one

minor stuff

Adrien Fix conflict

Minor fixes - Adrien

add vm shutdown (ongoing)

Add java-bittorrent example (still not working).

Add xbt_lib_remove

Fix warning: [cast] redundant cast to java.lang.String.