src/smpi/smpi_base.cpp

   1 /* Copyright (c) 2007-2015. The SimGrid Team.
   2  * All rights reserved.                                                     */
   3
   4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   6
   7 #include <xbt/config.hpp>
   8
   9 #include "private.h"
  10 #include "xbt/virtu.h"
  11 #include "mc/mc.h"
  12 #include "src/mc/mc_replay.h"
  13 #include "xbt/replay.h"
  14 #include <errno.h>
  15 #include "src/simix/smx_private.h"
  16 #include "surf/surf.h"
  17 #include "simgrid/sg_config.h"
  18 #include "colls/colls.h"
  19
  20 #include "src/simix/SynchroComm.hpp"
  21
  22 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_base, smpi, "Logging specific to SMPI (base)");
  23
  24 static int match_recv(void* a, void* b, smx_synchro_t ignored) {
  25    MPI_Request ref = static_cast<MPI_Request>(a);
  26    MPI_Request req = static_cast<MPI_Request>(b);
  27    XBT_DEBUG("Trying to match a recv of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  28
  29   xbt_assert(ref, "Cannot match recv against null reference");
  30   xbt_assert(req, "Cannot match recv against null request");
  31   if((ref->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  32     && ((ref->tag == MPI_ANY_TAG && req->tag >=0) || req->tag == ref->tag)){
  33     //we match, we can transfer some values
  34     if(ref->src == MPI_ANY_SOURCE)
  35         ref->real_src = req->src;
  36     if(ref->tag == MPI_ANY_TAG)
  37         ref->real_tag = req->tag;
  38     if(ref->real_size < req->real_size)
  39         ref->truncated = 1;
  40     if(req->detached==1)
  41         ref->detached_sender=req; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
  42     XBT_DEBUG("match succeeded");
  43     return 1;
  44   }else return 0;
  45 }
  46
  47 static int match_send(void* a, void* b,smx_synchro_t ignored) {
  48    MPI_Request ref = static_cast<MPI_Request>(a);
  49    MPI_Request req = static_cast<MPI_Request>(b);
  50    XBT_DEBUG("Trying to match a send of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  51    xbt_assert(ref, "Cannot match send against null reference");
  52    xbt_assert(req, "Cannot match send against null request");
  53
  54    if((req->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  55              && ((req->tag == MPI_ANY_TAG && ref->tag >=0)|| req->tag == ref->tag))
  56    {
  57      if(req->src == MPI_ANY_SOURCE)
  58         req->real_src = ref->src;
  59      if(req->tag == MPI_ANY_TAG)
  60         req->real_tag = ref->tag;
  61      if(req->real_size < ref->real_size)
  62         req->truncated = 1;
  63      if(ref->detached==1)
  64          req->detached_sender=ref; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
  65      XBT_DEBUG("match succeeded");
  66      return 1;
  67    } else return 0;
  68 }
  69
  70 // Methods used to parse and store the values for timing injections in smpi
  71 // These are taken from surf/network.c and generalized to have more values for each factor
  72 typedef struct s_smpi_factor_multival *smpi_os_factor_multival_t;
  73 typedef struct s_smpi_factor_multival { // FIXME: this should be merged (deduplicated) with s_smpi_factor defined in network_smpi.c
  74   long factor;
  75   int nb_values;
  76   double values[4];//arbitrary set to 4
  77 } s_smpi_factor_multival_t;
  78
  79 xbt_dynar_t smpi_os_values  = nullptr;
  80 xbt_dynar_t smpi_or_values  = nullptr;
  81 xbt_dynar_t smpi_ois_values = nullptr;
  82
  83 static simgrid::config::Flag<double> smpi_wtime_sleep(
  84   "smpi/wtime", "Minimum time to inject inside a call to MPI_Wtime", 0.0);
  85 static simgrid::config::Flag<double> smpi_init_sleep(
  86   "smpi/init", "Time to inject inside a call to MPI_Init", 0.0);
  87 static simgrid::config::Flag<double> smpi_iprobe_sleep(
  88   "smpi/iprobe", "Minimum time to inject inside a call to MPI_Iprobe", 1e-4);
  89 static simgrid::config::Flag<double> smpi_test_sleep(
  90   "smpi/test", "Minimum time to inject inside a call to MPI_Test", 1e-4);
  91
  92 static int factor_cmp(const void *pa, const void *pb)
  93 {
  94   return ((static_cast<const s_smpi_factor_multival_t*>(pa))->factor > (static_cast<const s_smpi_factor_multival_t*>(pb))->factor) ? 1 :
  95          ((static_cast<const s_smpi_factor_multival_t*>(pa))->factor < (static_cast<const s_smpi_factor_multival_t*>(pb))->factor) ? -1 : 0;
  96 }
  97
  98 static xbt_dynar_t parse_factor(const char *smpi_coef_string)
  99 {
 100   char *value = NULL;
 101   unsigned int iter = 0;
 102   s_smpi_factor_multival_t fact;
 103   fact.nb_values=0;
 104   unsigned int i=0;
 105   xbt_dynar_t radical_elements2 = NULL;
 106
 107   xbt_dynar_t smpi_factor = xbt_dynar_new(sizeof(s_smpi_factor_multival_t), NULL);
 108   xbt_dynar_t radical_elements = xbt_str_split(smpi_coef_string, ";");
 109   xbt_dynar_foreach(radical_elements, iter, value) {
 110     memset(&fact, 0, sizeof(s_smpi_factor_multival_t));
 111     radical_elements2 = xbt_str_split(value, ":");
 112     if (xbt_dynar_length(radical_elements2) <2 || xbt_dynar_length(radical_elements2) > 5)
 113       xbt_die("Malformed radical for smpi factor: '%s'", smpi_coef_string);
 114     for(i =0; i<xbt_dynar_length(radical_elements2);i++ ){
 115       char *errmsg;
 116       if (i==0) {
 117         errmsg = bprintf("Invalid factor in chunk #%d: %%s", iter+1);
 118         fact.factor = xbt_str_parse_int(xbt_dynar_get_as(radical_elements2, i, char *), errmsg);
 119       } else {
 120         errmsg = bprintf("Invalid factor value %d in chunk #%d: %%s", i, iter+1);
 121         fact.values[fact.nb_values] = xbt_str_parse_double(xbt_dynar_get_as(radical_elements2, i, char *), errmsg);
 122         fact.nb_values++;
 123       }
 124       xbt_free(errmsg);
 125     }
 126
 127     xbt_dynar_push_as(smpi_factor, s_smpi_factor_multival_t, fact);
 128     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%ld : %d values, first: %f", fact.factor, fact.nb_values ,fact.values[0]);
 129     xbt_dynar_free(&radical_elements2);
 130   }
 131   xbt_dynar_free(&radical_elements);
 132   xbt_dynar_sort(smpi_factor, &factor_cmp);
 133   xbt_dynar_foreach(smpi_factor, iter, fact) {
 134     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%ld : %d values, first: %f", fact.factor, fact.nb_values ,fact.values[0]);
 135   }
 136   return smpi_factor;
 137 }
 138
 139 static double smpi_os(double size)
 140 {
 141   if (smpi_os_values == nullptr) {
 142     smpi_os_values = parse_factor(xbt_cfg_get_string("smpi/os"));
 143     smpi_register_static(smpi_os_values, xbt_dynar_free_voidp);
 144   }
 145   unsigned int iter = 0;
 146   s_smpi_factor_multival_t fact;
 147   double current=0.0;
 148   // Iterate over all the sections that were specified and find the right
 149   // value. (fact.factor represents the interval sizes; we want to find the
 150   // section that has fact.factor <= size and no other such fact.factor <= size)
 151   // Note: parse_factor() (used before) already sorts the dynar we iterate over!
 152   xbt_dynar_foreach(smpi_os_values, iter, fact) {
 153     if (size <= fact.factor) { // Values already too large, use the previously
 154                                // computed value of current!
 155         XBT_DEBUG("os : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 156       return current;
 157     }else{
 158       // If the next section is too large, the current section must be used.
 159       // Hence, save the cost, as we might have to use it.
 160       current = fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 161     }
 162   }
 163   XBT_DEBUG("os : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 164
 165   return current;
 166 }
 167
 168 static double smpi_ois(double size)
 169 {
 170   if (smpi_ois_values == nullptr) {
 171     smpi_ois_values = parse_factor(xbt_cfg_get_string("smpi/ois"));
 172     smpi_register_static(smpi_ois_values, xbt_dynar_free_voidp);
 173   }
 174   unsigned int iter = 0;
 175   s_smpi_factor_multival_t fact;
 176   double current=0.0;
 177   // Iterate over all the sections that were specified and find the right value. (fact.factor represents the interval
 178   // sizes; we want to find the section that has fact.factor <= size and no other such fact.factor <= size)
 179   // Note: parse_factor() (used before) already sorts the dynar we iterate over!
 180   xbt_dynar_foreach(smpi_ois_values, iter, fact) {
 181     if (size <= fact.factor) { // Values already too large, use the previously  computed value of current!
 182         XBT_DEBUG("ois : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 183       return current;
 184     }else{
 185       // If the next section is too large, the current section must be used.
 186       // Hence, save the cost, as we might have to use it.
 187       current = fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 188     }
 189   }
 190   XBT_DEBUG("ois : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 191
 192   return current;
 193 }
 194
 195 static double smpi_or(double size)
 196 {
 197   if (smpi_or_values == nullptr) {
 198     smpi_or_values = parse_factor(xbt_cfg_get_string("smpi/or"));
 199     smpi_register_static(smpi_or_values, xbt_dynar_free_voidp);
 200   }
 201   unsigned int iter = 0;
 202   s_smpi_factor_multival_t fact;
 203   double current=0.0;
 204   // Iterate over all the sections that were specified and find the right value. (fact.factor represents the interval
 205   // sizes; we want to find the section that has fact.factor <= size and no other such fact.factor <= size)
 206   // Note: parse_factor() (used before) already sorts the dynar we iterate over!
 207   xbt_dynar_foreach(smpi_or_values, iter, fact) {
 208     if (size <= fact.factor) { // Values already too large, use the previously
 209                                // computed value of current!
 210         XBT_DEBUG("or : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 211       return current;
 212     } else {
 213       // If the next section is too large, the current section must be used.
 214       // Hence, save the cost, as we might have to use it.
 215       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 216     }
 217   }
 218   XBT_DEBUG("or : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 219
 220   return current;
 221 }
 222
 223 void smpi_mpi_init() {
 224   if(smpi_init_sleep > 0)
 225     simcall_process_sleep(smpi_init_sleep);
 226 }
 227
 228 double smpi_mpi_wtime(){
 229   double time;
 230   if (smpi_process_initialized() != 0 &&
 231       smpi_process_finalized() == 0 &&
 232       smpi_process_get_sampling() == 0) {
 233     smpi_bench_end();
 234     time = SIMIX_get_clock();
 235     // to avoid deadlocks if used as a break condition, such as
 236     //     while (MPI_Wtime(...) < time_limit) {
 237     //       ....
 238     //     }
 239     // because the time will not normally advance when only calls to MPI_Wtime
 240     // are made -> deadlock (MPI_Wtime never reaches the time limit)
 241     if(smpi_wtime_sleep > 0)
 242       simcall_process_sleep(smpi_wtime_sleep);
 243     smpi_bench_begin();
 244   } else {
 245     time = SIMIX_get_clock();
 246   }
 247   return time;
 248 }
 249
 250 static MPI_Request build_request(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm,
 251                                  unsigned flags)
 252 {
 253   MPI_Request request = NULL;
 254
 255   void *old_buf = NULL;
 256
 257   request = xbt_new(s_smpi_mpi_request_t, 1);
 258
 259   s_smpi_subtype_t *subtype = static_cast<s_smpi_subtype_t*>(datatype->substruct);
 260
 261   if((((flags & RECV) != 0) && ((flags & ACCUMULATE) !=0)) || (datatype->sizeof_substruct != 0)){
 262     // This part handles the problem of non-contiguous memory
 263     old_buf = buf;
 264     buf = count==0 ? NULL : xbt_malloc(count*smpi_datatype_size(datatype));
 265     if ((datatype->sizeof_substruct != 0) && ((flags & SEND) != 0)) {
 266       subtype->serialize(old_buf, buf, count, datatype->substruct);
 267     }
 268   }
 269
 270   request->buf      = buf;
 271   // This part handles the problem of non-contiguous memory (for the unserialisation at the reception)
 272   request->old_buf  = old_buf;
 273   request->old_type = datatype;
 274
 275   request->size = smpi_datatype_size(datatype) * count;
 276   smpi_datatype_use(datatype);
 277   request->src  = src;
 278   request->dst  = dst;
 279   request->tag  = tag;
 280   request->comm = comm;
 281   smpi_comm_use(request->comm);
 282   request->action          = nullptr;
 283   request->flags           = flags;
 284   request->detached        = 0;
 285   request->detached_sender = nullptr;
 286   request->real_src        = 0;
 287   request->truncated       = 0;
 288   request->real_size       = 0;
 289   request->real_tag        = 0;
 290   if (flags & PERSISTENT)
 291     request->refcount = 1;
 292   else
 293     request->refcount = 0;
 294   request->op   = MPI_REPLACE;
 295   request->send = 0;
 296   request->recv = 0;
 297
 298   return request;
 299 }
 300
 301 void smpi_empty_status(MPI_Status * status)
 302 {
 303   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 304     status->MPI_SOURCE = MPI_ANY_SOURCE;
 305     status->MPI_TAG = MPI_ANY_TAG;
 306     status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
 307     status->count=0;
 308   }
 309 }
 310
 311 static void smpi_mpi_request_free_voidp(void* request)
 312 {
 313   MPI_Request req = static_cast<MPI_Request>(request);
 314   smpi_mpi_request_free(&req);
 315 }
 316
 317 /* MPI Low level calls */
 318 MPI_Request smpi_mpi_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 319                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 320 {
 321   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 322   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? NULL : buf, count, datatype, smpi_process_index(),
 323                           smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag, comm, PERSISTENT | SEND | PREPARED);
 324   return request;
 325 }
 326
 327 MPI_Request smpi_mpi_ssend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 328                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 329 {
 330   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 331   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? NULL : buf, count, datatype, smpi_process_index(),
 332                         smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag, comm, PERSISTENT | SSEND | SEND | PREPARED);
 333   return request;
 334 }
 335
 336 MPI_Request smpi_mpi_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 337                                int src, int tag, MPI_Comm comm)
 338 {
 339   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 340   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? NULL : buf, count, datatype,
 341                           src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src),
 342                           smpi_process_index(), tag, comm, PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 343   return request;
 344 }
 345
 346 void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
 347 {
 348   smx_mailbox_t mailbox;
 349
 350   xbt_assert(request->action == nullptr, "Cannot (re-)start unfinished communication");
 351   request->flags &= ~PREPARED;
 352   request->flags &= ~FINISHED;
 353   request->refcount++;
 354
 355   if ((request->flags & RECV) != 0) {
 356     print_request("New recv", request);
 357
 358     int async_small_thresh = xbt_cfg_get_int("smpi/async-small-thresh");
 359
 360     xbt_mutex_t mut = smpi_process_mailboxes_mutex();
 361     if (async_small_thresh != 0 || (request->flags & RMA) != 0)
 362       xbt_mutex_acquire(mut);
 363
 364     if (async_small_thresh == 0 && (request->flags & RMA) == 0 ) {
 365       mailbox = smpi_process_mailbox();
 366     }
 367     else if (((request->flags & RMA) != 0) || static_cast<int>(request->size) < async_small_thresh) {
 368       //We have to check both mailboxes (because SSEND messages are sent to the large mbox).
 369       //begin with the more appropriate one : the small one.
 370       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 371       XBT_DEBUG("Is there a corresponding send already posted in the small mailbox %p (in case of SSEND)?", mailbox);
 372       smx_synchro_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, static_cast<void*>(request));
 373
 374       if (action == nullptr) {
 375         mailbox = smpi_process_mailbox();
 376         XBT_DEBUG("No, nothing in the small mailbox test the other one : %p", mailbox);
 377         action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, static_cast<void*>(request));
 378         if (action == nullptr) {
 379           XBT_DEBUG("Still nothing, switch back to the small mailbox : %p", mailbox);
 380           mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 381         }
 382       }
 383       else {
 384         XBT_DEBUG("yes there was something for us in the large mailbox");
 385       }
 386     }
 387     else {
 388       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 389       XBT_DEBUG("Is there a corresponding send already posted the small mailbox?");
 390       smx_synchro_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
 391
 392       if (action == nullptr) {
 393         XBT_DEBUG("No, nothing in the permanent receive mailbox");
 394         mailbox = smpi_process_mailbox();
 395       }
 396       else {
 397         XBT_DEBUG("yes there was something for us in the small mailbox");
 398       }
 399     }
 400
 401     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
 402     request->real_size=request->size;
 403     request->action = simcall_comm_irecv(SIMIX_process_self(), mailbox, request->buf, &request->real_size, &match_recv,
 404                                          ! smpi_process_get_replaying()? &smpi_comm_copy_buffer_callback
 405                                          : &smpi_comm_null_copy_buffer_callback, request, -1.0);
 406         XBT_DEBUG("recv simcall posted");
 407
 408     if (async_small_thresh != 0 || (request->flags & RMA) != 0 )
 409       xbt_mutex_release(mut);
 410   }
 411   else { /* the RECV flag was not set, so this is a send */
 412     int receiver = request->dst;
 413
 414     int rank = request->src;
 415     if (TRACE_smpi_view_internals()) {
 416       TRACE_smpi_send(rank, rank, receiver,request->size);
 417     }
 418     print_request("New send", request);
 419
 420     void* buf = request->buf;
 421     if ( (request->flags & SSEND) == 0
 422         && ( (request->flags & RMA) != 0 || static_cast<int>(request->size) < xbt_cfg_get_int("smpi/send-is-detached-thresh") ) ) {
 423       void *oldbuf = NULL;
 424       request->detached = 1;
 425       XBT_DEBUG("Send request %p is detached", request);
 426       request->refcount++;
 427       if(request->old_type->sizeof_substruct == 0){
 428         oldbuf = request->buf;
 429         if (!smpi_process_get_replaying() && oldbuf != NULL && request->size!=0){
 430           if((smpi_privatize_global_variables != 0)
 431             && (static_cast<char*>(request->buf) >= smpi_start_data_exe)
 432             && (static_cast<char*>(request->buf) < smpi_start_data_exe + smpi_size_data_exe )){
 433             XBT_DEBUG("Privatization : We are sending from a zone inside global memory. Switch data segment ");
 434             smpi_switch_data_segment(request->src);
 435           }
 436           buf = xbt_malloc(request->size);
 437           memcpy(buf,oldbuf,request->size);
 438           XBT_DEBUG("buf %p copied into %p",oldbuf,buf);
 439         }
 440       }
 441     }
 442
 443     //if we are giving back the control to the user without waiting for completion, we have to inject timings
 444     double sleeptime = 0.0;
 445     if(request->detached != 0 || ((request->flags & (ISEND|SSEND)) != 0)){// issend should be treated as isend
 446       //isend and send timings may be different
 447       sleeptime = ((request->flags & ISEND) != 0) ? smpi_ois(request->size) : smpi_os(request->size);
 448     }
 449
 450     if(sleeptime > 0.0){
 451         simcall_process_sleep(sleeptime);
 452         XBT_DEBUG("sending size of %zu : sleep %f ", request->size, sleeptime);
 453     }
 454
 455     int async_small_thresh = xbt_cfg_get_int("smpi/async-small-thresh");
 456
 457     xbt_mutex_t mut=smpi_process_remote_mailboxes_mutex(receiver);
 458
 459     if (async_small_thresh != 0 || (request->flags & RMA) != 0)
 460       xbt_mutex_acquire(mut);
 461
 462     if (!(async_small_thresh != 0 || (request->flags & RMA) !=0)) {
 463       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 464     }
 465     else if (((request->flags & RMA) != 0) || static_cast<int>(request->size) < async_small_thresh) { // eager mode
 466       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 467       XBT_DEBUG("Is there a corresponding recv already posted in the large mailbox %p?", mailbox);
 468       smx_synchro_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 1,request->dst, request->tag, &match_send, static_cast<void*>(request));
 469       if (action == nullptr) {
 470         if ((request->flags & SSEND) == 0){
 471           mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
 472           XBT_DEBUG("No, nothing in the large mailbox, message is to be sent on the small one %p", mailbox);
 473         }
 474         else {
 475           mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
 476           XBT_DEBUG("SSEND : Is there a corresponding recv already posted in the small mailbox %p?", mailbox);
 477           action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 1,request->dst, request->tag, &match_send, static_cast<void*>(request));
 478           if (action == nullptr) {
 479             XBT_DEBUG("No, we are first, send to large mailbox");
 480             mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 481           }
 482         }
 483       }
 484       else {
 485         XBT_DEBUG("Yes there was something for us in the large mailbox");
 486       }
 487     }
 488     else {
 489       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 490       XBT_DEBUG("Send request %p is in the large mailbox %p (buf: %p)",mailbox, request,request->buf);
 491     }
 492
 493     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
 494     request->real_size=request->size;
 495     request->action = simcall_comm_isend(SIMIX_process_from_PID(request->src+1), mailbox, request->size, -1.0,
 496                                          buf, request->real_size, &match_send,
 497                          &xbt_free_f, // how to free the userdata if a detached send fails
 498                          !smpi_process_get_replaying() ? &smpi_comm_copy_buffer_callback
 499                          : &smpi_comm_null_copy_buffer_callback, request,
 500                          // detach if msg size < eager/rdv switch limit
 501                          request->detached);
 502     XBT_DEBUG("send simcall posted");
 503
 504     /* FIXME: detached sends are not traceable (request->action == nullptr) */
 505     if (request->action != nullptr)
 506       simcall_set_category(request->action, TRACE_internal_smpi_get_category());
 507
 508     if (async_small_thresh != 0 || ((request->flags & RMA)!=0))
 509       xbt_mutex_release(mut);
 510   }
 511 }
 512
 513 void smpi_mpi_startall(int count, MPI_Request * requests)
 514 {
 515   if(requests== nullptr)
 516     return;
 517
 518   for(int i = 0; i < count; i++) {
 519     smpi_mpi_start(requests[i]);
 520   }
 521 }
 522
 523 void smpi_mpi_request_free(MPI_Request * request)
 524 {
 525   if((*request) != MPI_REQUEST_NULL){
 526     (*request)->refcount--;
 527     if((*request)->refcount<0) xbt_die("wrong refcount");
 528
 529     if((*request)->refcount==0){
 530         smpi_datatype_unuse((*request)->old_type);
 531         smpi_comm_unuse((*request)->comm);
 532         print_request("Destroying", (*request));
 533         xbt_free(*request);
 534         *request = MPI_REQUEST_NULL;
 535     }else{
 536         print_request("Decrementing", (*request));
 537     }
 538   }else{
 539       xbt_die("freeing an already free request");
 540   }
 541 }
 542
 543 MPI_Request smpi_rma_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm,
 544                                MPI_Op op)
 545 {
 546   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 547   if(op==MPI_OP_NULL){
 548     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? NULL : buf , count, datatype, src, dst, tag,
 549                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED);
 550   }else{
 551     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? NULL : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 552                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED | ACCUMULATE);
 553     request->op = op;
 554   }
 555   return request;
 556 }
 557
 558 MPI_Request smpi_rma_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm,
 559                                MPI_Op op)
 560 {
 561   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 562   if(op==MPI_OP_NULL){
 563     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? NULL : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 564                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 565   }else{
 566     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? NULL : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 567                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | RECV | PREPARED | ACCUMULATE);
 568     request->op = op;
 569   }
 570   return request;
 571 }
 572
 573 MPI_Request smpi_isend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 574 {
 575   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 576   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? NULL : buf , count, datatype, smpi_process_index(),
 577                           smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,comm, PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED);
 578   return request;
 579 }
 580
 581 MPI_Request smpi_mpi_isend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 582 {
 583   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 584   request =  build_request(buf==MPI_BOTTOM ? NULL : buf, count, datatype, smpi_process_index(),
 585                            smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag, comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SEND);
 586   smpi_mpi_start(request);
 587   return request;
 588 }
 589
 590 MPI_Request smpi_mpi_issend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 591 {
 592   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 593   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? NULL : buf, count, datatype, smpi_process_index(),
 594                         smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SSEND | SEND);
 595   smpi_mpi_start(request);
 596   return request;
 597 }
 598
 599 MPI_Request smpi_irecv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src, int tag, MPI_Comm comm)
 600 {
 601   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 602   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? NULL : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE :
 603                           smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 604                           comm, PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 605   return request;
 606 }
 607
 608 MPI_Request smpi_mpi_irecv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src, int tag, MPI_Comm comm)
 609 {
 610   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 611   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? NULL : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE :
 612                           smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag, comm,
 613                           NON_PERSISTENT | RECV);
 614   smpi_mpi_start(request);
 615   return request;
 616 }
 617
 618 void smpi_mpi_recv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 619 {
 620   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 621   request = smpi_mpi_irecv(buf, count, datatype, src, tag, comm);
 622   smpi_mpi_wait(&request, status);
 623   request = NULL;
 624 }
 625
 626 void smpi_mpi_send(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 627 {
 628   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 629   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? NULL : buf, count, datatype, smpi_process_index(),
 630                           smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag, comm, NON_PERSISTENT | SEND);
 631
 632   smpi_mpi_start(request);
 633   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 634   request = NULL;
 635 }
 636
 637 void smpi_mpi_ssend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 638 {
 639   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 640   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? NULL : buf, count, datatype, smpi_process_index(),
 641                           smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag, comm, NON_PERSISTENT | SSEND | SEND);
 642
 643   smpi_mpi_start(request);
 644   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 645   request = NULL;
 646 }
 647
 648 void smpi_mpi_sendrecv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,int dst, int sendtag,
 649                        void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype, int src, int recvtag,
 650                        MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 651 {
 652   MPI_Request requests[2];
 653   MPI_Status stats[2];
 654   int myid=smpi_process_index();
 655   if ((smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst) == myid) && (smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src) == myid)){
 656       smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
 657       return;
 658   }
 659   requests[0] = smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, dst, sendtag, comm);
 660   requests[1] = smpi_irecv_init(recvbuf, recvcount, recvtype, src, recvtag, comm);
 661   smpi_mpi_startall(2, requests);
 662   smpi_mpi_waitall(2, requests, stats);
 663   smpi_mpi_request_free(&requests[0]);
 664   smpi_mpi_request_free(&requests[1]);
 665   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 666     // Copy receive status
 667     *status = stats[1];
 668   }
 669 }
 670
 671 int smpi_mpi_get_count(MPI_Status * status, MPI_Datatype datatype)
 672 {
 673   return status->count / smpi_datatype_size(datatype);
 674 }
 675
 676 static void finish_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 677 {
 678   MPI_Request req = *request;
 679   smpi_empty_status(status);
 680
 681   if(!((req->detached != 0) && ((req->flags & SEND) != 0)) && ((req->flags & PREPARED) == 0)){
 682     if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 683       int src = req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src;
 684       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(req->comm), src);
 685       status->MPI_TAG = req->tag == MPI_ANY_TAG ? req->real_tag : req->tag;
 686       status->MPI_ERROR = req->truncated != 0 ? MPI_ERR_TRUNCATE : MPI_SUCCESS;
 687       // this handles the case were size in receive differs from size in send
 688       status->count = req->real_size;
 689     }
 690
 691     print_request("Finishing", req);
 692     MPI_Datatype datatype = req->old_type;
 693
 694     if(((req->flags & ACCUMULATE) != 0) || (datatype->sizeof_substruct != 0)){
 695       if (!smpi_process_get_replaying()){
 696         if( smpi_privatize_global_variables != 0 && (static_cast<char*>(req->old_buf) >= smpi_start_data_exe)
 697             && ((char*)req->old_buf < smpi_start_data_exe + smpi_size_data_exe )){
 698             XBT_VERB("Privatization : We are unserializing to a zone in global memory - Switch data segment ");
 699             smpi_switch_data_segment(smpi_process_index());
 700         }
 701       }
 702
 703       if(datatype->sizeof_substruct != 0){
 704         // This part handles the problem of non-contignous memory the unserialization at the reception
 705         s_smpi_subtype_t *subtype = static_cast<s_smpi_subtype_t*>(datatype->substruct);
 706         if(req->flags & RECV)
 707           subtype->unserialize(req->buf, req->old_buf, req->real_size/smpi_datatype_size(datatype) ,
 708                                datatype->substruct, req->op);
 709         xbt_free(req->buf);
 710       }else if(req->flags & RECV){//apply op on contiguous buffer for accumulate
 711           int n =req->real_size/smpi_datatype_size(datatype);
 712           smpi_op_apply(req->op, req->buf, req->old_buf, &n, &datatype);
 713           xbt_free(req->buf);
 714       }
 715     }
 716   }
 717
 718   if (TRACE_smpi_view_internals() && ((req->flags & RECV) != 0)){
 719     int rank = smpi_process_index();
 720     int src_traced = (req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src);
 721     TRACE_smpi_recv(rank, src_traced, rank);
 722   }
 723
 724   if(req->detached_sender!=NULL){
 725
 726     //integrate pseudo-timing for buffering of small messages, do not bother to execute the simcall if 0
 727     double sleeptime = smpi_or(req->real_size);
 728     if(sleeptime > 0.0){
 729         simcall_process_sleep(sleeptime);
 730         XBT_DEBUG("receiving size of %zu : sleep %f ", req->real_size, sleeptime);
 731     }
 732
 733     smpi_mpi_request_free(&(req->detached_sender));
 734   }
 735   if(req->flags & PERSISTENT)
 736     req->action = NULL;
 737   req->flags |= FINISHED;
 738
 739   smpi_mpi_request_free(request);
 740 }
 741
 742 int smpi_mpi_test(MPI_Request * request, MPI_Status * status) {
 743   //assume that request is not MPI_REQUEST_NULL (filtered in PMPI_Test or smpi_mpi_testall before)
 744
 745   // to avoid deadlocks if used as a break condition, such as
 746   //     while (MPI_Test(request, flag, status) && flag) {
 747   //     }
 748   // because the time will not normally advance when only calls to MPI_Test are made -> deadlock
 749   // multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed test will increase it
 750   static int nsleeps = 1;
 751   if(smpi_test_sleep > 0)
 752     simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_test_sleep);
 753
 754   smpi_empty_status(status);
 755   int flag = 1;
 756   if (((*request)->flags & PREPARED) == 0) {
 757     if ((*request)->action != NULL)
 758       flag = simcall_comm_test((*request)->action);
 759     if (flag) {
 760       finish_wait(request, status);
 761       nsleeps=1;//reset the number of sleeps we will do next time
 762       if (*request != MPI_REQUEST_NULL && ((*request)->flags & PERSISTENT)==0)
 763       *request = MPI_REQUEST_NULL;
 764     }else{
 765       nsleeps++;
 766     }
 767   }
 768   return flag;
 769 }
 770
 771 int smpi_mpi_testany(int count, MPI_Request requests[], int *index, MPI_Status * status)
 772 {
 773   xbt_dynar_t comms;
 774   int i;
 775   int* map;
 776   int flag = 0;
 777   int size = 0;
 778
 779   *index = MPI_UNDEFINED;
 780   comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_synchro_t), NULL);
 781   map = xbt_new(int, count);
 782   for(i = 0; i < count; i++) {
 783     if ((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->action && !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
 784        xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
 785        map[size] = i;
 786        size++;
 787     }
 788   }
 789   if(size > 0) {
 790     //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed testany will increase it
 791     static int nsleeps = 1;
 792     if(smpi_test_sleep > 0)
 793       simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_test_sleep);
 794
 795     i = simcall_comm_testany(comms);
 796     // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 797     if(i != -1) {
 798       *index = map[i];
 799       finish_wait(&requests[*index], status);
 800       if (requests[*index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[*index]->flags & NON_PERSISTENT))
 801       requests[*index] = MPI_REQUEST_NULL;
 802       flag = 1;
 803       nsleeps=1;
 804     }else{
 805       nsleeps++;
 806     }
 807   }else{
 808       //all requests are null or inactive, return true
 809       flag=1;
 810       smpi_empty_status(status);
 811   }
 812   xbt_free(map);
 813   xbt_dynar_free(&comms);
 814
 815   return flag;
 816 }
 817
 818 int smpi_mpi_testall(int count, MPI_Request requests[], MPI_Status status[])
 819 {
 820   MPI_Status stat;
 821   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 822   int flag=1;
 823   int i;
 824   for(i=0; i<count; i++){
 825     if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
 826       if (smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)!=1){
 827         flag=0;
 828       }else{
 829           requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
 830       }
 831     }else{
 832       smpi_empty_status(pstat);
 833     }
 834     if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 835       status[i] = *pstat;
 836     }
 837   }
 838   return flag;
 839 }
 840
 841 void smpi_mpi_probe(int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status* status){
 842   int flag=0;
 843   //FIXME find another way to avoid busy waiting ?
 844   // the issue here is that we have to wait on a nonexistent comm
 845   while(flag==0){
 846     smpi_mpi_iprobe(source, tag, comm, &flag, status);
 847     XBT_DEBUG("Busy Waiting on probing : %d", flag);
 848   }
 849 }
 850
 851 void smpi_mpi_iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int* flag, MPI_Status* status){
 852
 853   MPI_Request request = build_request(NULL, 0, MPI_CHAR, source == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE :
 854                  smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), source), smpi_comm_rank(comm), tag, comm, PERSISTENT | RECV);
 855
 856   // to avoid deadlock, we have to sleep some time here, or the timer won't advance and we will only do iprobe simcalls
 857   // (especially when used as a break condition, such as while(MPI_Iprobe(...)) ... )
 858   // multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed iprobe will increase it
 859   static int nsleeps = 1;
 860   if(smpi_iprobe_sleep > 0)
 861     simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_iprobe_sleep);
 862   // behave like a receive, but don't do it
 863   smx_mailbox_t mailbox;
 864
 865   print_request("New iprobe", request);
 866   // We have to test both mailboxes as we don't know if we will receive one one or another
 867   if (xbt_cfg_get_int("smpi/async-small-thresh") > 0){
 868       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 869       XBT_DEBUG("Trying to probe the perm recv mailbox");
 870       request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src, request->tag, &match_recv, static_cast<void*>(request));
 871   }
 872
 873   if (request->action == nullptr){
 874     mailbox = smpi_process_mailbox();
 875     XBT_DEBUG("trying to probe the other mailbox");
 876     request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, static_cast<void*>(request));
 877   }
 878
 879   if (request->action != nullptr){
 880     simgrid::simix::Comm *sync_comm = static_cast<simgrid::simix::Comm*>(request->action);
 881     MPI_Request req                 = static_cast<MPI_Request>(sync_comm->src_data);
 882     *flag = 1;
 883     if(status != MPI_STATUS_IGNORE && (req->flags & PREPARED) == 0) {
 884       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(comm), req->src);
 885       status->MPI_TAG    = req->tag;
 886       status->MPI_ERROR  = MPI_SUCCESS;
 887       status->count      = req->real_size;
 888     }
 889     nsleeps = 1;//reset the number of sleeps we will do next time
 890   }
 891   else {
 892     *flag = 0;
 893     nsleeps++;
 894   }
 895   smpi_mpi_request_free(&request);
 896
 897   return;
 898 }
 899
 900 void smpi_mpi_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 901 {
 902   print_request("Waiting", *request);
 903   if ((*request)->flags & PREPARED) {
 904     smpi_empty_status(status);
 905     return;
 906   }
 907
 908   if ((*request)->action != NULL)
 909     // this is not a detached send
 910     simcall_comm_wait((*request)->action, -1.0);
 911
 912   finish_wait(request, status);
 913   if (*request != MPI_REQUEST_NULL && (((*request)->flags & NON_PERSISTENT)!=0))
 914       *request = MPI_REQUEST_NULL;
 915 }
 916
 917 int smpi_mpi_waitany(int count, MPI_Request requests[], MPI_Status * status)
 918 {
 919   xbt_dynar_t comms;
 920   int i;
 921   int size = 0;
 922   int index = MPI_UNDEFINED;
 923   int *map;
 924
 925   if(count > 0) {
 926     // Wait for a request to complete
 927     comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_synchro_t), NULL);
 928     map = xbt_new(int, count);
 929     XBT_DEBUG("Wait for one of %d", count);
 930     for(i = 0; i < count; i++) {
 931       if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && !(requests[i]->flags & PREPARED) && !(requests[i]->flags & FINISHED)) {
 932         if (requests[i]->action != NULL) {
 933           XBT_DEBUG("Waiting any %p ", requests[i]);
 934           xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
 935           map[size] = i;
 936           size++;
 937         }else{
 938          //This is a finished detached request, let's return this one
 939          size=0;//so we free the dynar but don't do the waitany call
 940          index=i;
 941          finish_wait(&requests[i], status);//cleanup if refcount = 0
 942          if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[i]->flags & NON_PERSISTENT))
 943          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;//set to null
 944          break;
 945          }
 946       }
 947     }
 948     if(size > 0) {
 949       i = simcall_comm_waitany(comms);
 950
 951       // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 952       if (i != -1) {
 953         index = map[i];
 954         finish_wait(&requests[index], status);
 955         if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[i]->flags & NON_PERSISTENT))
 956         requests[index] = MPI_REQUEST_NULL;
 957       }
 958     }
 959     xbt_free(map);
 960     xbt_dynar_free(&comms);
 961   }
 962
 963   if (index==MPI_UNDEFINED)
 964     smpi_empty_status(status);
 965
 966   return index;
 967 }
 968
 969 int smpi_mpi_waitall(int count, MPI_Request requests[], MPI_Status status[])
 970 {
 971   int  index, c;
 972   MPI_Status stat;
 973   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 974   int retvalue = MPI_SUCCESS;
 975   //tag invalid requests in the set
 976   if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 977     for (c = 0; c < count; c++) {
 978       if (requests[c] == MPI_REQUEST_NULL || requests[c]->dst == MPI_PROC_NULL || (requests[c]->flags & PREPARED)) {
 979         smpi_empty_status(&status[c]);
 980       } else if (requests[c]->src == MPI_PROC_NULL) {
 981         smpi_empty_status(&status[c]);
 982         status[c].MPI_SOURCE = MPI_PROC_NULL;
 983       }
 984     }
 985   }
 986   for(c = 0; c < count; c++) {
 987
 988     if (MC_is_active() || MC_record_replay_is_active()) {
 989       smpi_mpi_wait(&requests[c], pstat);
 990       index = c;
 991     } else {
 992       index = smpi_mpi_waitany(count, requests, pstat);
 993       if (index == MPI_UNDEFINED)
 994         break;
 995       if (requests[index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[index]->flags & NON_PERSISTENT))
 996       requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
 997     }
 998     if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 999       status[index] = *pstat;
1000       if (status[index].MPI_ERROR == MPI_ERR_TRUNCATE)
1001         retvalue = MPI_ERR_IN_STATUS;
1002     }
1003   }
1004
1005   return retvalue;
1006 }
1007
1008 int smpi_mpi_waitsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices, MPI_Status status[])
1009 {
1010   int i;
1011   int count = 0;
1012   int index;
1013   MPI_Status stat;
1014   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
1015
1016   for(i = 0; i < incount; i++)
1017   {
1018     index=smpi_mpi_waitany(incount, requests, pstat);
1019     if(index!=MPI_UNDEFINED){
1020       indices[count] = index;
1021       count++;
1022       if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
1023         status[index] = *pstat;
1024       }
1025      if (requests[index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[index]->flags & NON_PERSISTENT))
1026      requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
1027     }else{
1028       return MPI_UNDEFINED;
1029     }
1030   }
1031   return count;
1032 }
1033
1034 int smpi_mpi_testsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices, MPI_Status status[])
1035 {
1036   int i;
1037   int count = 0;
1038   int count_dead = 0;
1039   MPI_Status stat;
1040   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
1041
1042   for(i = 0; i < incount; i++) {
1043     if((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL)) {
1044       if(smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)) {
1045          indices[i] = 1;
1046          count++;
1047          if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
1048            status[i] = *pstat;
1049          }
1050          if ((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->flags & NON_PERSISTENT)
1051          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
1052       }
1053     }else{
1054       count_dead++;
1055     }
1056   }
1057   if(count_dead==incount)
1058     return MPI_UNDEFINED;
1059   else return count;
1060 }
1061
1062 void smpi_mpi_bcast(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int root, MPI_Comm comm)
1063 {
1064     smpi_coll_tuned_bcast_binomial_tree(buf, count, datatype, root, comm);
1065 }
1066
1067 void smpi_mpi_barrier(MPI_Comm comm)
1068 {
1069     smpi_coll_tuned_barrier_ompi_basic_linear(comm);
1070 }
1071
1072 void smpi_mpi_gather(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1073                      void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1074 {
1075   int system_tag = COLL_TAG_GATHER;
1076   int rank, size, src, index;
1077   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1078   MPI_Request *requests;
1079
1080   rank = smpi_comm_rank(comm);
1081   size = smpi_comm_size(comm);
1082   if(rank != root) {
1083     // Send buffer to root
1084     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
1085   } else {
1086     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1087     // Local copy from root
1088     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype, static_cast<char*>(recvbuf) + root * recvcount * recvext, recvcount, recvtype);
1089     // Receive buffers from senders
1090     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1091     index = 0;
1092     for(src = 0; src < size; src++) {
1093       if(src != root) {
1094         requests[index] = smpi_irecv_init(static_cast<char*>(recvbuf) + src * recvcount * recvext, recvcount, recvtype,
1095                                           src, system_tag, comm);
1096         index++;
1097       }
1098     }
1099     // Wait for completion of irecv's.
1100     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1101     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1102     for(src = 0; src < size-1; src++) {
1103       smpi_mpi_request_free(&requests[src]);
1104     }
1105     xbt_free(requests);
1106   }
1107 }
1108
1109 void smpi_mpi_reduce_scatter(void *sendbuf, void *recvbuf, int *recvcounts, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op,
1110                              MPI_Comm comm)
1111 {
1112     int i, size, count;
1113     int *displs;
1114     int rank = smpi_comm_rank(comm);
1115     void *tmpbuf;
1116
1117     /* arbitrarily choose root as rank 0 */
1118     size = smpi_comm_size(comm);
1119     count = 0;
1120     displs = xbt_new(int, size);
1121     for (i = 0; i < size; i++) {
1122       displs[i] = count;
1123       count += recvcounts[i];
1124     }
1125     tmpbuf=static_cast<void*>(smpi_get_tmp_sendbuffer(count*smpi_datatype_get_extent(datatype)));
1126
1127     mpi_coll_reduce_fun(sendbuf, tmpbuf, count, datatype, op, 0, comm);
1128     smpi_mpi_scatterv(tmpbuf, recvcounts, displs, datatype, recvbuf, recvcounts[rank], datatype, 0, comm);
1129     xbt_free(displs);
1130     smpi_free_tmp_buffer(tmpbuf);
1131 }
1132
1133 void smpi_mpi_gatherv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, int *recvcounts, int *displs,
1134                       MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1135 {
1136   int system_tag = COLL_TAG_GATHERV;
1137   int rank, size, src, index;
1138   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1139   MPI_Request *requests;
1140
1141   rank = smpi_comm_rank(comm);
1142   size = smpi_comm_size(comm);
1143   if(rank != root) {
1144     // Send buffer to root
1145     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
1146   } else {
1147     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1148     // Local copy from root
1149     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype, static_cast<char*>(recvbuf) + displs[root] * recvext,
1150                        recvcounts[root], recvtype);
1151     // Receive buffers from senders
1152     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1153     index = 0;
1154     for(src = 0; src < size; src++) {
1155       if(src != root) {
1156         requests[index] = smpi_irecv_init(static_cast<char*>(recvbuf) + displs[src] * recvext,
1157                           recvcounts[src], recvtype, src, system_tag, comm);
1158         index++;
1159       }
1160     }
1161     // Wait for completion of irecv's.
1162     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1163     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1164     for(src = 0; src < size-1; src++) {
1165       smpi_mpi_request_free(&requests[src]);
1166     }
1167     xbt_free(requests);
1168   }
1169 }
1170
1171 void smpi_mpi_allgather(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1172                         void *recvbuf,int recvcount, MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
1173 {
1174   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHER;
1175   int rank, size, other, index;
1176   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1177   MPI_Request *requests;
1178
1179   rank = smpi_comm_rank(comm);
1180   size = smpi_comm_size(comm);
1181   // FIXME: check for errors
1182   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1183   // Local copy from self
1184   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype, static_cast<char *>(recvbuf) + rank * recvcount * recvext, recvcount, recvtype);
1185   // Send/Recv buffers to/from others;
1186   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1187   index = 0;
1188   for(other = 0; other < size; other++) {
1189     if(other != rank) {
1190       requests[index] = smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,comm);
1191       index++;
1192       requests[index] = smpi_irecv_init(static_cast<char *>(recvbuf) + other * recvcount * recvext, recvcount, recvtype, other,
1193                                         system_tag, comm);
1194       index++;
1195     }
1196   }
1197   // Wait for completion of all comms.
1198   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1199   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1200   for(other = 0; other < 2*(size-1); other++) {
1201     smpi_mpi_request_free(&requests[other]);
1202   }
1203   xbt_free(requests);
1204 }
1205
1206 void smpi_mpi_allgatherv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
1207                          int *recvcounts, int *displs, MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
1208 {
1209   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHERV;
1210   int rank, size, other, index;
1211   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1212   MPI_Request *requests;
1213
1214   rank = smpi_comm_rank(comm);
1215   size = smpi_comm_size(comm);
1216   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1217   // Local copy from self
1218   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype, static_cast<char *>(recvbuf) + displs[rank] * recvext,recvcounts[rank], recvtype);
1219   // Send buffers to others;
1220   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1221   index = 0;
1222   for(other = 0; other < size; other++) {
1223     if(other != rank) {
1224       requests[index] =
1225         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag, comm);
1226       index++;
1227       requests[index] = smpi_irecv_init(static_cast<char *>(recvbuf) + displs[other] * recvext, recvcounts[other],
1228                           recvtype, other, system_tag, comm);
1229       index++;
1230     }
1231   }
1232   // Wait for completion of all comms.
1233   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1234   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1235   for(other = 0; other < 2*(size-1); other++) {
1236     smpi_mpi_request_free(&requests[other]);
1237   }
1238   xbt_free(requests);
1239 }
1240
1241 void smpi_mpi_scatter(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1242                       void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1243 {
1244   int system_tag = COLL_TAG_SCATTER;
1245   int rank, size, dst, index;
1246   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
1247   MPI_Request *requests;
1248
1249   rank = smpi_comm_rank(comm);
1250   size = smpi_comm_size(comm);
1251   if(rank != root) {
1252     // Recv buffer from root
1253     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm, MPI_STATUS_IGNORE);
1254   } else {
1255     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1256     // Local copy from root
1257     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1258         smpi_datatype_copy(static_cast<char *>(sendbuf) + root * sendcount * sendext,
1259                            sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1260     }
1261     // Send buffers to receivers
1262     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1263     index = 0;
1264     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
1265       if(dst != root) {
1266         requests[index] = smpi_isend_init(static_cast<char *>(sendbuf) + dst * sendcount * sendext, sendcount, sendtype, dst,
1267                                           system_tag, comm);
1268         index++;
1269       }
1270     }
1271     // Wait for completion of isend's.
1272     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1273     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1274     for(dst = 0; dst < size-1; dst++) {
1275       smpi_mpi_request_free(&requests[dst]);
1276     }
1277     xbt_free(requests);
1278   }
1279 }
1280
1281 void smpi_mpi_scatterv(void *sendbuf, int *sendcounts, int *displs, MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, int recvcount,
1282                        MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1283 {
1284   int system_tag = COLL_TAG_SCATTERV;
1285   int rank, size, dst, index;
1286   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
1287   MPI_Request *requests;
1288
1289   rank = smpi_comm_rank(comm);
1290   size = smpi_comm_size(comm);
1291   if(rank != root) {
1292     // Recv buffer from root
1293     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm, MPI_STATUS_IGNORE);
1294   } else {
1295     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1296     // Local copy from root
1297     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1298       smpi_datatype_copy(static_cast<char *>(sendbuf) + displs[root] * sendext, sendcounts[root],
1299                        sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1300     }
1301     // Send buffers to receivers
1302     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1303     index = 0;
1304     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
1305       if(dst != root) {
1306         requests[index] = smpi_isend_init(static_cast<char *>(sendbuf) + displs[dst] * sendext, sendcounts[dst],
1307                             sendtype, dst, system_tag, comm);
1308         index++;
1309       }
1310     }
1311     // Wait for completion of isend's.
1312     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1313     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1314     for(dst = 0; dst < size-1; dst++) {
1315       smpi_mpi_request_free(&requests[dst]);
1316     }
1317     xbt_free(requests);
1318   }
1319 }
1320
1321 void smpi_mpi_reduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, int root,
1322                      MPI_Comm comm)
1323 {
1324   int system_tag = COLL_TAG_REDUCE;
1325   int rank, size, src, index;
1326   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1327   MPI_Request *requests;
1328   void **tmpbufs;
1329
1330   char* sendtmpbuf = static_cast<char *>(sendbuf);
1331
1332
1333   rank = smpi_comm_rank(comm);
1334   size = smpi_comm_size(comm);
1335   //non commutative case, use a working algo from openmpi
1336   if(!smpi_op_is_commute(op)){
1337     smpi_coll_tuned_reduce_ompi_basic_linear(sendtmpbuf, recvbuf, count, datatype, op, root, comm);
1338     return;
1339   }
1340
1341   if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1342     sendtmpbuf = static_cast<char *>(smpi_get_tmp_sendbuffer(count*smpi_datatype_get_extent(datatype)));
1343     smpi_datatype_copy(recvbuf, count, datatype,sendtmpbuf, count, datatype);
1344   }
1345
1346   if(rank != root) {
1347     // Send buffer to root
1348     smpi_mpi_send(sendtmpbuf, count, datatype, root, system_tag, comm);
1349   } else {
1350     smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1351     // Local copy from root
1352     if (sendtmpbuf != NULL && recvbuf != NULL)
1353       smpi_datatype_copy(sendtmpbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1354     // Receive buffers from senders
1355     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1356     tmpbufs = xbt_new(void *, size - 1);
1357     index = 0;
1358     for(src = 0; src < size; src++) {
1359       if(src != root) {
1360          if (!smpi_process_get_replaying())
1361           tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1362          else
1363            tmpbufs[index] = smpi_get_tmp_sendbuffer(count * dataext);
1364         requests[index] =
1365           smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, src, system_tag, comm);
1366         index++;
1367       }
1368     }
1369     // Wait for completion of irecv's.
1370     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1371     for(src = 0; src < size - 1; src++) {
1372       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1373       XBT_DEBUG("finished waiting any request with index %d", index);
1374       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1375         break;
1376       }else{
1377         smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1378       }
1379       if(op) /* op can be MPI_OP_NULL that does nothing */
1380         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1381     }
1382       for(index = 0; index < size - 1; index++) {
1383         smpi_free_tmp_buffer(tmpbufs[index]);
1384       }
1385     xbt_free(tmpbufs);
1386     xbt_free(requests);
1387
1388   }
1389   if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1390     smpi_free_tmp_buffer(sendtmpbuf);
1391   }
1392 }
1393
1394 void smpi_mpi_allreduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1395 {
1396   smpi_mpi_reduce(sendbuf, recvbuf, count, datatype, op, 0, comm);
1397   smpi_mpi_bcast(recvbuf, count, datatype, 0, comm);
1398 }
1399
1400 void smpi_mpi_scan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1401 {
1402   int system_tag = -888;
1403   int rank, size, other, index;
1404   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1405   MPI_Request *requests;
1406   void **tmpbufs;
1407
1408   rank = smpi_comm_rank(comm);
1409   size = smpi_comm_size(comm);
1410
1411   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1412
1413   // Local copy from self
1414   smpi_datatype_copy(sendbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1415
1416   // Send/Recv buffers to/from others;
1417   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1418   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1419   index = 0;
1420   for(other = 0; other < rank; other++) {
1421     tmpbufs[index] = smpi_get_tmp_sendbuffer(count * dataext);
1422     requests[index] = smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag, comm);
1423     index++;
1424   }
1425   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
1426     requests[index] = smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1427     index++;
1428   }
1429   // Wait for completion of all comms.
1430   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1431
1432   if(smpi_op_is_commute(op)){
1433     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1434       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1435       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1436         break;
1437       }
1438       if(index < rank) {
1439         // #Request is below rank: it's a irecv
1440         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1441       }
1442     }
1443   }else{
1444     //non commutative case, wait in order
1445     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1446       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1447       if(index < rank) {
1448         smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1449       }
1450     }
1451   }
1452   for(index = 0; index < rank; index++) {
1453     smpi_free_tmp_buffer(tmpbufs[index]);
1454   }
1455   for(index = 0; index < size-1; index++) {
1456     smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1457   }
1458   xbt_free(tmpbufs);
1459   xbt_free(requests);
1460 }
1461
1462 void smpi_mpi_exscan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1463 {
1464   int system_tag = -888;
1465   int rank, size, other, index;
1466   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1467   MPI_Request *requests;
1468   void **tmpbufs;
1469   int recvbuf_is_empty=1;
1470   rank = smpi_comm_rank(comm);
1471   size = smpi_comm_size(comm);
1472
1473   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1474
1475   // Send/Recv buffers to/from others;
1476   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1477   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1478   index = 0;
1479   for(other = 0; other < rank; other++) {
1480     tmpbufs[index] = smpi_get_tmp_sendbuffer(count * dataext);
1481     requests[index] =
1482       smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag, comm);
1483     index++;
1484   }
1485   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
1486     requests[index] =
1487       smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1488     index++;
1489   }
1490   // Wait for completion of all comms.
1491   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1492   if(smpi_op_is_commute(op)){
1493     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1494       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1495       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1496         break;
1497       }
1498       if(index < rank) {
1499         if(recvbuf_is_empty){
1500           smpi_datatype_copy(tmpbufs[index], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1501           recvbuf_is_empty=0;
1502         }else
1503         // #Request is below rank: it's a irecv
1504         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1505       }
1506     }
1507   }else{
1508     //non commutative case, wait in order
1509     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1510       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1511       if(index < rank) {
1512           if(recvbuf_is_empty){
1513             smpi_datatype_copy(tmpbufs[other], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1514             recvbuf_is_empty=0;
1515           }else smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1516       }
1517     }
1518   }
1519   for(index = 0; index < rank; index++) {
1520     smpi_free_tmp_buffer(tmpbufs[index]);
1521   }
1522   for(index = 0; index < size-1; index++) {
1523     smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1524   }
1525   xbt_free(tmpbufs);
1526   xbt_free(requests);
1527 }