[config] some declare_flag to Flag

synchro-mutex example: don't have all pairs intermix their results

Thanks @jean-edouard-boulanger for noticing.

Cope with Eigen 3.3.4 directly in cmake

and remove the specific workaround for our robots. Also, move the
Eigen detection with the other external dependencies in the CMakeLists.

Fix the cleanup. Sorry @agiersch for breaking everything so consistently

Fix clang builds

Tutorial: try to hint on some errors that the users may get when attempting the tutorial

more C++ish in EngineImpl

Move some stuff to the object destructor where it belongs.

There is still a lot to do in there before it's real C++ code...

Cosmetics in comments (mainly in EngineImpl::run)

Make sure that ActorImpl::cleanup_from_kernel is called only once per actor, and move on_termination to there

Merge branch 'dev-profile-callbacks' into 'master'

Refactoring profiles to use generic callbacks

See merge request simgrid/simgrid!82

Refactoring profiles to use generic callbacks

Cosmetics [ci-skip].

Make test work with python < 3.9.

See https://stackoverflow.com/questions/39458193/using-list-tuple-etc-from-typing-vs-directly-referring-type-as-list-tuple-etc

Thanks @tocornebize and @bruno.donassolo for the hint

Update documentation.

Fix distcheck.

Remove target "make uninstall".

Close simgrid/simgrid#104

Update comments.

Mark more smx_* type aliases as deprecated.

Mark smx_actor_t as deprecated.

Merge branch 'xsltproc' into 'master'

Add missing xsltproc dependency for starpu-mpi

See merge request simgrid/simgrid!86

Add missing xsltproc dependency for starpu-mpi

Merge branch 'starpu-mpi' into 'master'

Explicitly tell StarPU to enable starpu-mpi

See merge request simgrid/simgrid!85

Explicitly tell StarPU to enable starpu-mpi

This is not enabled by default.

Disable parallel tests.

ctest --output-on-failure on jar building [no-ci]

Sometimes propagating an exception across different libraries fails.

I don't know if this is the case here, but take a safe bet.

fix jarfile.yml

add eigen to bigdft test

Also test java builds on github jar action

Merge remote-tracking branch 'github/master'

Merge branch 'fix_bindings_mistakenly_set_as_member_functions' into 'master'

Make Python bindings static where needed

See merge request simgrid/simgrid!83

Jarfile github action: fix scoop install + add eigen   (#379)

* Update jarfile.yml

* add eigen

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update CMakeLists.txt

* Update CMakeLists.txt

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

* Update jarfile.yml

Kill a useless static function

Sort Actor traits alphabetically + cleanups

Introduce ActorIDTrait to split ActorImpl apart

Simplify parameter passing between EngineImpl and ContextFactory

Indeed, it's easier to pass the object as a parameter instead of
having the called getting it afterward through a call back to the
caller.

Move the actor lifecycle markers from Context to ActorImpl

and reduce Context.hpp visibility

make the semaphore monkey more robust to deadlocks and to unanswered simcalls in RAII

document a function

ActorImpl::join: react right away if the other actor is already dead

fflush for all processes.

2nd try to make asan warnings ignored.
rank==0 is not always the last one to print.
[ci-skip]

[tesh] Remove ignored lines *before* trimming the output.

[ci-skip]

Adapt tests to avoid failures when spurious ASan warnings are interlaced.

Blind attempt at getting scoop working again on Azur windows

obey our coding conventions in ActorImpl::mailboxes, and free them once only

Simplify the Context::stop() and reduce duplication

Defuse a trap on refcounting activities by adding a comment

Make Python bindings static where needed

augment example to check sharing of a thread-execute

Make sure that actors killed by a timer are properly finished

ActorImpl::exit() does not schedule the victim for execution because
exit() usually denotes a suicide.

When ran from a timer, it's executed in maestro context, so the victim
needs to be scheduled to be properly freed.

It worked properly before commit 2cb8c87fc8 because the actors were
completely destroyed by Context::stop() which is still used here. Now,
the cleanup is split in 2 parts (in actor context and in maestro
context), that are not directly inter-linked.

Gosh, that was a long debug session for a small patch. I hope it's OK now

Cosmetics in ActorImpl

Merge branch 'add_remaining_comm_sync_bindings' into 'master'

Add remaining Comm synchronisation Python bindings

See merge request simgrid/simgrid!81

Minor improv in threads

Let the user_bound for bounds given by S4U user (if any).

For the requested_cores, the bound is already configured when creating
the action at CpuCas01Action.

Also, the current implementation for threads use the same mechanism used
by VMs, for a N-thread action:
- priority/sharing_penalty: 1/N to increase the amount of CPU given to
action.
- individual bound: speed < N*C: to limit the action speed to the number
of cores.

Comment back the unsuccessful try to use faster matrix solver.

Ideally we would like to use PartialPivLU most of the time. But in some
cases, as tested in the UTs, we need the complete pivoting and the
assurance given by FullPivLU.

Document why it didn't work.
Need another way to check that the solution is invalid that doesn't
include isNaN.

Add unit tests aiming at covering Comm::send and Comm::recv.

Kill dead code.

Unused since there is no future.

Use std::function for smpi_comm_copy_data_callback.

Use std::function for Extension deleters.

Use std::function for Comm callbacks.

easy sonar fixes

cosmetics in the release notes

Better split between the cleanups from self and the ones from the kernel (ie on maestro context)

This shall remove the need for OS synchronization when registering the
actors that should die. So that's hopefully another fix for the problem solved
by be00fecb16c89d44253052889f4815b35ab9abbe

Also, it protects more modifications to global datastructures from
concurrent modifications by doing them in maestro context. The
previous solution was only protecting a very small amount of them.

Add remaining Comm synchronisation Python bindings

Make our valgrind wrapper less verbose, so that it does not break tesh outputs when no error

further simpify the MC initialization on app side

Simplify the parameter passing while initializing the MC on the app side

Seal the platform only once from EngineImpl::run

Fix mingw warning.

redeclared without dllimport attribute: previous dllimport ignored [-Wattributes]

Kill useless target "make maintainer-clean".

It only tries to remove an non-existent file...

Don't modify variable twice in the same expression.

Define initial value, even if it's useless.

Provide constructor with parameters for lmm::Element.

Fix clang builds (unused lambda capture)

Cosmetics in the changelog and release notes

Improve the Actor::set_auto_restart doc by specifying which attributes are saved over reboots

Introduce a Trait to deal with autorestart matter in ActorImpl, and fix bugs

The daemonized behavior was not correctly saved, as noted by the
updated tesh-actor-autorestart test

use get_restart_count from the monkey-masterwork, for simplicity and to test it

new: Actor::get_restart_count(): Returns the number of reboots that this actor did

Fixes https://framagit.org/simgrid/simgrid/-/issues/11
(again)

Update an outdated comment

Rename mc::SafetyChecker to mc::DFSExplorer

Rename mc::CheckerAlgorithm to mc::ExplorationAlgorithm, because that's what it is

Update comment.

Move Simcall from namespace simix to kernel::actor.

Rename example, and update doc.

Configuration option simix/breakpoint was renamed some time ago.

Rename popping.cpp -> simcall.cpp to better reflect its content.

Make Simcall a real class.

Remove reference to dead files.

add an s to example name

Use existing XBT macro to declare enum class Simcall.

Mark all of simix.h as deprecated.

This include file will be empty after that anyway.

BMF: One pass in sonar issues

Missing include.

Define Comm::send and Comm::recv (replace simcall_comm_send/recv).

Mark last legacy simcalls as deprecated.

introduce thread_execute

mark 3 more simcalls as deprecated

Revert "Being optimistic for better performance"

This reverts commit aedc2aa6b82c69adc779ffc4bb8ece31ac423440.

Being optimistic for better performance

If the matrix isn't singular (which is true most of the cases) this
PartialPivLU is much faster than FullPivLU.

Let's be optimistic, what can go wrong? ;)

[jenkins] Avoid build errors on centos.

DISTRIB_ID is apparently now all lowercase on NixOS.

Fix install prefix for Eigen3 on appveyor.