src/smpi/internals/smpi_global.cpp

   1 /* Copyright (c) 2007-2019. The SimGrid Team. All rights reserved.          */
   2
   3 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   4  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   5
   6 #include "mc/mc.h"
   7 #include "simgrid/s4u/Engine.hpp"
   8 #include "simgrid/plugins/file_system.h"
   9 #include "smpi_coll.hpp"
  10 #include "smpi_f2c.hpp"
  11 #include "smpi_host.hpp"
  12 #include "src/kernel/activity/CommImpl.hpp"
  13 #include "src/simix/smx_private.hpp"
  14 #include "src/smpi/include/smpi_actor.hpp"
  15 #include "xbt/config.hpp"
  16
  17 #include <algorithm>
  18 #include <cfloat> /* DBL_MAX */
  19 #include <cinttypes>
  20 #include <cstdint> /* intmax_t */
  21 #include <dlfcn.h>
  22 #include <fcntl.h>
  23 #include <fstream>
  24 #include <sys/stat.h>
  25
  26 #if not defined(__APPLE__)
  27 #include <link.h>
  28 #endif
  29
  30 #if defined(__APPLE__)
  31 # include <AvailabilityMacros.h>
  32 # ifndef MAC_OS_X_VERSION_10_12
  33 #   define MAC_OS_X_VERSION_10_12 101200
  34 # endif
  35 constexpr bool HAVE_WORKING_MMAP = (MAC_OS_X_VERSION_MIN_REQUIRED >= MAC_OS_X_VERSION_10_12);
  36 #elif defined(__FreeBSD__) || defined(__FreeBSD_kernel__)
  37 constexpr bool HAVE_WORKING_MMAP = false;
  38 #else
  39 constexpr bool HAVE_WORKING_MMAP = true;
  40 #endif
  41
  42 #if SG_HAVE_SENDFILE
  43 #include <sys/sendfile.h>
  44 #endif
  45
  46 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_kernel, smpi, "Logging specific to SMPI (kernel)");
  47 #include <boost/tokenizer.hpp>
  48 #include <boost/algorithm/string.hpp> /* trim_right / trim_left */
  49
  50 #if SMPI_IFORT
  51   extern "C" void for_rtl_init_ (int *, char **);
  52   extern "C" void for_rtl_finish_ ();
  53 #elif SMPI_FLANG
  54   extern "C" void __io_set_argc(int);
  55   extern "C" void __io_set_argv(char **);
  56 #elif SMPI_GFORTRAN
  57   extern "C" void _gfortran_set_args(int, char **);
  58 #endif
  59
  60 /* RTLD_DEEPBIND is a bad idea of GNU ld that obviously does not exist on other platforms
  61  * See https://www.akkadia.org/drepper/dsohowto.pdf
  62  * and https://lists.freebsd.org/pipermail/freebsd-current/2016-March/060284.html
  63 */
  64 #if !RTLD_DEEPBIND || HAVE_SANITIZER_ADDRESS || HAVE_SANITIZER_THREAD
  65 #define WANT_RTLD_DEEPBIND 0
  66 #else
  67 #define WANT_RTLD_DEEPBIND RTLD_DEEPBIND
  68 #endif
  69
  70 #if HAVE_PAPI
  71 #include "papi.h"
  72 std::string papi_default_config_name = "default";
  73 std::map</* computation unit name */ std::string, papi_process_data> units2papi_setup;
  74 #endif
  75
  76 std::unordered_map<std::string, double> location2speedup;
  77
  78 static std::map</*process_id*/ simgrid::s4u::Actor const*, simgrid::smpi::ActorExt*> process_data;
  79 int process_count = 0;
  80 static int smpi_exit_status = 0;
  81 int smpi_universe_size = 0;
  82 extern double smpi_total_benched_time;
  83 xbt_os_timer_t global_timer;
  84 static std::vector<std::string> privatize_libs_paths;
  85 /**
  86  * Setting MPI_COMM_WORLD to MPI_COMM_UNINITIALIZED (it's a variable)
  87  * is important because the implementation of MPI_Comm checks
  88  * "this == MPI_COMM_UNINITIALIZED"? If yes, it uses smpi_process()->comm_world()
  89  * instead of "this".
  90  * This is basically how we only have one global variable but all processes have
  91  * different communicators (the one their SMPI instance uses).
  92  *
  93  * See smpi_comm.cpp and the functions therein for details.
  94  */
  95 MPI_Comm MPI_COMM_WORLD = MPI_COMM_UNINITIALIZED;
  96 MPI_Errhandler *MPI_ERRORS_RETURN = nullptr;
  97 MPI_Errhandler *MPI_ERRORS_ARE_FATAL = nullptr;
  98 MPI_Errhandler *MPI_ERRHANDLER_NULL = nullptr;
  99 // No instance gets manually created; check also the smpirun.in script as
 100 // this default name is used there as well (when the <actor> tag is generated).
 101 static const std::string smpi_default_instance_name("smpirun");
 102 static simgrid::config::Flag<double> smpi_init_sleep(
 103   "smpi/init", "Time to inject inside a call to MPI_Init", 0.0);
 104
 105 void (*smpi_comm_copy_data_callback)(simgrid::kernel::activity::CommImpl*, void*,
 106                                      size_t) = &smpi_comm_copy_buffer_callback;
 107
 108 int smpi_process_count()
 109 {
 110   return process_count;
 111 }
 112
 113 simgrid::smpi::ActorExt* smpi_process()
 114 {
 115   simgrid::s4u::ActorPtr me = simgrid::s4u::Actor::self();
 116
 117   if (me == nullptr) // This happens sometimes (eg, when linking against NS3 because it pulls openMPI...)
 118     return nullptr;
 119
 120   return process_data.at(me.get());
 121 }
 122
 123 simgrid::smpi::ActorExt* smpi_process_remote(simgrid::s4u::ActorPtr actor)
 124 {
 125   return process_data.at(actor.get());
 126 }
 127
 128 MPI_Comm smpi_process_comm_self(){
 129   return smpi_process()->comm_self();
 130 }
 131
 132 MPI_Info smpi_process_info_env(){
 133   return smpi_process()->info_env();
 134 }
 135
 136 void smpi_process_init(int *argc, char ***argv){
 137   simgrid::smpi::ActorExt::init();
 138 }
 139
 140 void * smpi_process_get_user_data(){
 141   return simgrid::s4u::Actor::self()->get_impl()->get_user_data();
 142 }
 143
 144 void smpi_process_set_user_data(void *data){
 145   simgrid::s4u::Actor::self()->get_impl()->set_user_data(data);
 146 }
 147
 148 void smpi_comm_set_copy_data_callback(void (*callback) (smx_activity_t, void*, size_t))
 149 {
 150   static void (*saved_callback)(smx_activity_t, void*, size_t);
 151   saved_callback               = callback;
 152   smpi_comm_copy_data_callback = [](simgrid::kernel::activity::CommImpl* comm, void* buff, size_t size) {
 153     saved_callback(smx_activity_t(comm), buff, size);
 154   };
 155 }
 156
 157 static void memcpy_private(void* dest, const void* src, std::vector<std::pair<size_t, size_t>>& private_blocks)
 158 {
 159   for (auto const& block : private_blocks)
 160     memcpy((uint8_t*)dest+block.first, (uint8_t*)src+block.first, block.second-block.first);
 161 }
 162
 163 static void check_blocks(std::vector<std::pair<size_t, size_t>> &private_blocks, size_t buff_size) {
 164   for (auto const& block : private_blocks)
 165     xbt_assert(block.first <= block.second && block.second <= buff_size, "Oops, bug in shared malloc.");
 166 }
 167
 168 void smpi_comm_copy_buffer_callback(simgrid::kernel::activity::CommImpl* comm, void* buff, size_t buff_size)
 169 {
 170   int src_shared                        = 0;
 171   int dst_shared                        = 0;
 172   size_t src_offset                     = 0;
 173   size_t dst_offset                     = 0;
 174   std::vector<std::pair<size_t, size_t>> src_private_blocks;
 175   std::vector<std::pair<size_t, size_t>> dst_private_blocks;
 176   XBT_DEBUG("Copy the data over");
 177   if((src_shared=smpi_is_shared(buff, src_private_blocks, &src_offset))) {
 178     XBT_DEBUG("Sender %p is shared. Let's ignore it.", buff);
 179     src_private_blocks = shift_and_frame_private_blocks(src_private_blocks, src_offset, buff_size);
 180   }
 181   else {
 182     src_private_blocks.clear();
 183     src_private_blocks.push_back(std::make_pair(0, buff_size));
 184   }
 185   if ((dst_shared = smpi_is_shared((char*)comm->dst_buff_, dst_private_blocks, &dst_offset))) {
 186     XBT_DEBUG("Receiver %p is shared. Let's ignore it.", (char*)comm->dst_buff_);
 187     dst_private_blocks = shift_and_frame_private_blocks(dst_private_blocks, dst_offset, buff_size);
 188   }
 189   else {
 190     dst_private_blocks.clear();
 191     dst_private_blocks.push_back(std::make_pair(0, buff_size));
 192   }
 193   check_blocks(src_private_blocks, buff_size);
 194   check_blocks(dst_private_blocks, buff_size);
 195   auto private_blocks = merge_private_blocks(src_private_blocks, dst_private_blocks);
 196   check_blocks(private_blocks, buff_size);
 197   void* tmpbuff=buff;
 198   if ((smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) &&
 199       (static_cast<char*>(buff) >= smpi_data_exe_start) &&
 200       (static_cast<char*>(buff) < smpi_data_exe_start + smpi_data_exe_size)) {
 201     XBT_DEBUG("Privatization : We are copying from a zone inside global memory... Saving data to temp buffer !");
 202     smpi_switch_data_segment(comm->src_actor_->iface());
 203     tmpbuff = static_cast<void*>(xbt_malloc(buff_size));
 204     memcpy_private(tmpbuff, buff, private_blocks);
 205   }
 206
 207   if ((smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) &&
 208       ((char*)comm->dst_buff_ >= smpi_data_exe_start) &&
 209       ((char*)comm->dst_buff_ < smpi_data_exe_start + smpi_data_exe_size)) {
 210     XBT_DEBUG("Privatization : We are copying to a zone inside global memory - Switch data segment");
 211     smpi_switch_data_segment(comm->dst_actor_->iface());
 212   }
 213   XBT_DEBUG("Copying %zu bytes from %p to %p", buff_size, tmpbuff, comm->dst_buff_);
 214   memcpy_private(comm->dst_buff_, tmpbuff, private_blocks);
 215
 216   if (comm->detached_) {
 217     // if this is a detached send, the source buffer was duplicated by SMPI
 218     // sender to make the original buffer available to the application ASAP
 219     xbt_free(buff);
 220     //It seems that the request is used after the call there this should be free somewhere else but where???
 221     //xbt_free(comm->comm.src_data);// inside SMPI the request is kept inside the user data and should be free
 222     comm->src_buff_ = nullptr;
 223   }
 224   if (tmpbuff != buff)
 225     xbt_free(tmpbuff);
 226 }
 227
 228 void smpi_comm_null_copy_buffer_callback(simgrid::kernel::activity::CommImpl*, void*, size_t)
 229 {
 230   /* nothing done in this version */
 231 }
 232
 233 static void smpi_check_options()
 234 {
 235   //check correctness of MPI parameters
 236
 237   xbt_assert(simgrid::config::get_value<int>("smpi/async-small-thresh") <=
 238              simgrid::config::get_value<int>("smpi/send-is-detached-thresh"));
 239
 240   if (simgrid::config::is_default("smpi/host-speed")) {
 241     XBT_INFO("You did not set the power of the host running the simulation.  "
 242              "The timings will certainly not be accurate.  "
 243              "Use the option \"--cfg=smpi/host-speed:<flops>\" to set its value."
 244              "Check http://simgrid.org/simgrid/latest/doc/options.html#options_smpi_bench for more information.");
 245   }
 246
 247   xbt_assert(simgrid::config::get_value<double>("smpi/cpu-threshold") >= 0,
 248              "The 'smpi/cpu-threshold' option cannot have negative values [anymore]. If you want to discard "
 249              "the simulation of any computation, please use 'smpi/simulate-computation:no' instead.");
 250 }
 251
 252 int smpi_enabled() {
 253   return not process_data.empty();
 254 }
 255
 256 void smpi_global_init()
 257 {
 258   if (not MC_is_active()) {
 259     global_timer = xbt_os_timer_new();
 260     xbt_os_walltimer_start(global_timer);
 261   }
 262
 263   std::string filename = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/comp-adjustment-file");
 264   if (not filename.empty()) {
 265     std::ifstream fstream(filename);
 266     if (not fstream.is_open()) {
 267       xbt_die("Could not open file %s. Does it exist?", filename.c_str());
 268     }
 269
 270     std::string line;
 271     typedef boost::tokenizer< boost::escaped_list_separator<char>> Tokenizer;
 272     std::getline(fstream, line); // Skip the header line
 273     while (std::getline(fstream, line)) {
 274       Tokenizer tok(line);
 275       Tokenizer::iterator it  = tok.begin();
 276       Tokenizer::iterator end = std::next(tok.begin());
 277
 278       std::string location = *it;
 279       boost::trim(location);
 280       location2speedup.insert(std::pair<std::string, double>(location, std::stod(*end)));
 281     }
 282   }
 283
 284 #if HAVE_PAPI
 285   // This map holds for each computation unit (such as "default" or "process1" etc.)
 286   // the configuration as given by the user (counter data as a pair of (counter_name, counter_counter))
 287   // and the (computed) event_set.
 288
 289   if (not simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/papi-events").empty()) {
 290     if (PAPI_library_init(PAPI_VER_CURRENT) != PAPI_VER_CURRENT)
 291       XBT_ERROR("Could not initialize PAPI library; is it correctly installed and linked?"
 292                 " Expected version is %u", PAPI_VER_CURRENT);
 293
 294     typedef boost::tokenizer<boost::char_separator<char>> Tokenizer;
 295     boost::char_separator<char> separator_units(";");
 296     std::string str = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/papi-events");
 297     Tokenizer tokens(str, separator_units);
 298
 299     // Iterate over all the computational units. This could be processes, hosts, threads, ranks... You name it.
 300     // I'm not exactly sure what we will support eventually, so I'll leave it at the general term "units".
 301     for (auto const& unit_it : tokens) {
 302       boost::char_separator<char> separator_events(":");
 303       Tokenizer event_tokens(unit_it, separator_events);
 304
 305       int event_set = PAPI_NULL;
 306       if (PAPI_create_eventset(&event_set) != PAPI_OK) {
 307         // TODO: Should this let the whole simulation die?
 308         XBT_CRITICAL("Could not create PAPI event set during init.");
 309       }
 310
 311       // NOTE: We cannot use a map here, as we must obey the order of the counters
 312       // This is important for PAPI: We need to map the values of counters back
 313       // to the event_names (so, when PAPI_read() has finished)!
 314       papi_counter_t counters2values;
 315
 316       // Iterate over all counters that were specified for this specific
 317       // unit.
 318       // Note that we need to remove the name of the unit
 319       // (that could also be the "default" value), which always comes first.
 320       // Hence, we start at ++(events.begin())!
 321       for (Tokenizer::iterator events_it = ++(event_tokens.begin()); events_it != event_tokens.end(); ++events_it) {
 322
 323         int event_code   = PAPI_NULL;
 324         char* event_name = const_cast<char*>((*events_it).c_str());
 325         if (PAPI_event_name_to_code(event_name, &event_code) != PAPI_OK) {
 326           XBT_CRITICAL("Could not find PAPI event '%s'. Skipping.", event_name);
 327           continue;
 328         }
 329         if (PAPI_add_event(event_set, event_code) != PAPI_OK) {
 330           XBT_ERROR("Could not add PAPI event '%s'. Skipping.", event_name);
 331           continue;
 332         }
 333         XBT_DEBUG("Successfully added PAPI event '%s' to the event set.", event_name);
 334
 335         counters2values.push_back(
 336             // We cannot just pass *events_it, as this is of type const basic_string
 337             std::make_pair<std::string, long long>(std::string(*events_it), 0));
 338       }
 339
 340       std::string unit_name    = *(event_tokens.begin());
 341       papi_process_data config = {.counter_data = std::move(counters2values), .event_set = event_set};
 342
 343       units2papi_setup.insert(std::make_pair(unit_name, std::move(config)));
 344     }
 345   }
 346 #endif
 347 }
 348
 349 void smpi_global_destroy()
 350 {
 351   smpi_bench_destroy();
 352   smpi_shared_destroy();
 353   smpi_deployment_cleanup_instances();
 354
 355   if (simgrid::smpi::Colls::smpi_coll_cleanup_callback != nullptr)
 356     simgrid::smpi::Colls::smpi_coll_cleanup_callback();
 357
 358   MPI_COMM_WORLD = MPI_COMM_NULL;
 359
 360   if (not MC_is_active()) {
 361     xbt_os_timer_free(global_timer);
 362   }
 363
 364   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP)
 365     smpi_destroy_global_memory_segments();
 366   if(simgrid::smpi::F2C::lookup() != nullptr)
 367     simgrid::smpi::F2C::delete_lookup();
 368 }
 369
 370 static void smpi_init_options(){
 371   // return if already called
 372   if (smpi_cpu_threshold > -1)
 373     return;
 374   simgrid::smpi::Colls::set_collectives();
 375   simgrid::smpi::Colls::smpi_coll_cleanup_callback = nullptr;
 376   smpi_cpu_threshold                               = simgrid::config::get_value<double>("smpi/cpu-threshold");
 377   smpi_host_speed                                  = simgrid::config::get_value<double>("smpi/host-speed");
 378   xbt_assert(smpi_host_speed > 0.0, "You're trying to set the host_speed to a non-positive value (given: %f)", smpi_host_speed);
 379   std::string smpi_privatize_option = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/privatization");
 380   if (smpi_privatize_option == "no" || smpi_privatize_option == "0")
 381     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::NONE;
 382   else if (smpi_privatize_option == "yes" || smpi_privatize_option == "1")
 383     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::DEFAULT;
 384   else if (smpi_privatize_option == "mmap")
 385     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::MMAP;
 386   else if (smpi_privatize_option == "dlopen")
 387     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::DLOPEN;
 388   else
 389     xbt_die("Invalid value for smpi/privatization: '%s'", smpi_privatize_option.c_str());
 390
 391   if (not SMPI_switch_data_segment) {
 392     XBT_DEBUG("Running without smpi_main(); disable smpi/privatization.");
 393     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::NONE;
 394   }
 395   if (not HAVE_WORKING_MMAP && smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
 396     XBT_INFO("mmap privatization is broken on this platform, switching to dlopen privatization instead.");
 397     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::DLOPEN;
 398   }
 399
 400   if (smpi_cpu_threshold < 0)
 401     smpi_cpu_threshold = DBL_MAX;
 402
 403   std::string val = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/shared-malloc");
 404   if ((val == "yes") || (val == "1") || (val == "on") || (val == "global")) {
 405     smpi_cfg_shared_malloc = SharedMallocType::GLOBAL;
 406   } else if (val == "local") {
 407     smpi_cfg_shared_malloc = SharedMallocType::LOCAL;
 408   } else if ((val == "no") || (val == "0") || (val == "off")) {
 409     smpi_cfg_shared_malloc = SharedMallocType::NONE;
 410   } else {
 411     xbt_die("Invalid value '%s' for option smpi/shared-malloc. Possible values: 'on' or 'global', 'local', 'off'",
 412             val.c_str());
 413   }
 414 }
 415
 416 typedef std::function<int(int argc, char *argv[])> smpi_entry_point_type;
 417 typedef int (* smpi_c_entry_point_type)(int argc, char **argv);
 418 typedef void (*smpi_fortran_entry_point_type)();
 419
 420 static int smpi_run_entry_point(const smpi_entry_point_type& entry_point, const std::string& executable_path,
 421                                 std::vector<std::string> args)
 422 {
 423   // copy C strings, we need them writable
 424   std::vector<char*>* args4argv = new std::vector<char*>(args.size());
 425   std::transform(begin(args), end(args), begin(*args4argv), [](const std::string& s) { return xbt_strdup(s.c_str()); });
 426
 427   // set argv[0] to executable_path
 428   xbt_free((*args4argv)[0]);
 429   (*args4argv)[0] = xbt_strdup(executable_path.c_str());
 430
 431 #if !SMPI_IFORT
 432   // take a copy of args4argv to keep reference of the allocated strings
 433   const std::vector<char*> args2str(*args4argv);
 434 #endif
 435   int argc = args4argv->size();
 436   args4argv->push_back(nullptr);
 437   char** argv = args4argv->data();
 438
 439   simgrid::smpi::ActorExt::init();
 440 #if SMPI_IFORT
 441   for_rtl_init_ (&argc, argv);
 442 #elif SMPI_FLANG
 443   __io_set_argc(argc);
 444   __io_set_argv(argv);
 445 #elif SMPI_GFORTRAN
 446   _gfortran_set_args(argc, argv);
 447 #endif
 448   int res = entry_point(argc, argv);
 449
 450 #if SMPI_IFORT
 451   for_rtl_finish_ ();
 452 #else
 453   for (char* s : args2str)
 454     xbt_free(s);
 455   delete args4argv;
 456 #endif
 457
 458   if (res != 0){
 459     XBT_WARN("SMPI process did not return 0. Return value : %d", res);
 460     if (smpi_exit_status == 0)
 461       smpi_exit_status = res;
 462   }
 463   return 0;
 464 }
 465
 466
 467 // TODO, remove the number of functions involved here
 468 static smpi_entry_point_type smpi_resolve_function(void* handle)
 469 {
 470   smpi_fortran_entry_point_type entry_point_fortran = (smpi_fortran_entry_point_type)dlsym(handle, "user_main_");
 471   if (entry_point_fortran != nullptr) {
 472     return [entry_point_fortran](int argc, char** argv) {
 473       entry_point_fortran();
 474       return 0;
 475     };
 476   }
 477
 478   smpi_c_entry_point_type entry_point = (smpi_c_entry_point_type)dlsym(handle, "main");
 479   if (entry_point != nullptr) {
 480     return entry_point;
 481   }
 482
 483   return smpi_entry_point_type();
 484 }
 485
 486 static void smpi_copy_file(const std::string& src, const std::string& target, off_t fdin_size)
 487 {
 488   int fdin = open(src.c_str(), O_RDONLY);
 489   xbt_assert(fdin >= 0, "Cannot read from %s. Please make sure that the file exists and is executable.", src.c_str());
 490   int fdout = open(target.c_str(), O_CREAT | O_RDWR, S_IRWXU);
 491   xbt_assert(fdout >= 0, "Cannot write into %s", target.c_str());
 492
 493   XBT_DEBUG("Copy %" PRIdMAX " bytes into %s", static_cast<intmax_t>(fdin_size), target.c_str());
 494 #if SG_HAVE_SENDFILE
 495   ssize_t sent_size = sendfile(fdout, fdin, NULL, fdin_size);
 496   if (sent_size == fdin_size) {
 497     close(fdin);
 498     close(fdout);
 499     return;
 500   } else if (sent_size != -1 || errno != ENOSYS) {
 501     xbt_die("Error while copying %s: only %zd bytes copied instead of %" PRIdMAX " (errno: %d -- %s)", target.c_str(),
 502             sent_size, static_cast<intmax_t>(fdin_size), errno, strerror(errno));
 503   }
 504 #endif
 505   // If this point is reached, sendfile() actually is not available.  Copy file by hand.
 506   const int bufsize = 1024 * 1024 * 4;
 507   char buf[bufsize];
 508   while (int got = read(fdin, buf, bufsize)) {
 509     if (got == -1) {
 510       xbt_assert(errno == EINTR, "Cannot read from %s", src.c_str());
 511     } else {
 512       char* p  = buf;
 513       int todo = got;
 514       while (int done = write(fdout, p, todo)) {
 515         if (done == -1) {
 516           xbt_assert(errno == EINTR, "Cannot write into %s", target.c_str());
 517         } else {
 518           p += done;
 519           todo -= done;
 520         }
 521       }
 522     }
 523   }
 524   close(fdin);
 525   close(fdout);
 526 }
 527
 528 #if not defined(__APPLE__)
 529 static int visit_libs(struct dl_phdr_info* info, size_t, void* data)
 530 {
 531   char* libname = (char*)(data);
 532   const char *path = info->dlpi_name;
 533   if(strstr(path, libname)){
 534     strncpy(libname, path, 512);
 535     return 1;
 536   }
 537
 538   return 0;
 539 }
 540 #endif
 541
 542 static void smpi_init_privatization_dlopen(const std::string& executable)
 543 {
 544   // Prepare the copy of the binary (get its size)
 545   struct stat fdin_stat;
 546   stat(executable.c_str(), &fdin_stat);
 547   off_t fdin_size         = fdin_stat.st_size;
 548
 549   std::string libnames = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/privatize-libs");
 550   if (not libnames.empty()) {
 551     // split option
 552     std::vector<std::string> privatize_libs;
 553     boost::split(privatize_libs, libnames, boost::is_any_of(";"));
 554
 555     for (auto const& libname : privatize_libs) {
 556       // load the library once to add it to the local libs, to get the absolute path
 557       void* libhandle = dlopen(libname.c_str(), RTLD_LAZY);
 558       // get library name from path
 559       char fullpath[512] = {'\0'};
 560       strncpy(fullpath, libname.c_str(), 511);
 561 #if not defined(__APPLE__)
 562       int ret = dl_iterate_phdr(visit_libs, fullpath);
 563       if (ret == 0)
 564         xbt_die("Can't find a linked %s - check the setting you gave to smpi/privatize-libs", fullpath);
 565       else
 566         XBT_DEBUG("Extra lib to privatize found : %s", fullpath);
 567 #else
 568       xbt_die("smpi/privatize-libs is not (yet) compatible with OSX");
 569 #endif
 570       privatize_libs_paths.push_back(fullpath);
 571       dlclose(libhandle);
 572     }
 573   }
 574
 575   simix_global->default_function = [executable, fdin_size](std::vector<std::string> args) {
 576     return std::function<void()>([executable, fdin_size, args] {
 577       static std::size_t rank = 0;
 578       // Copy the dynamic library:
 579       std::string target_executable =
 580           executable + "_" + std::to_string(getpid()) + "_" + std::to_string(rank) + ".so";
 581
 582       smpi_copy_file(executable, target_executable, fdin_size);
 583       // if smpi/privatize-libs is set, duplicate pointed lib and link each executable copy to a different one.
 584       std::vector<std::string> target_libs;
 585       for (auto const& libpath : privatize_libs_paths) {
 586         // if we were given a full path, strip it
 587         size_t index = libpath.find_last_of("/\\");
 588         std::string libname;
 589         if (index != std::string::npos)
 590           libname = libpath.substr(index + 1);
 591
 592         if (not libname.empty()) {
 593           // load the library to add it to the local libs, to get the absolute path
 594           struct stat fdin_stat2;
 595           stat(libpath.c_str(), &fdin_stat2);
 596           off_t fdin_size2 = fdin_stat2.st_size;
 597
 598           // Copy the dynamic library, the new name must be the same length as the old one
 599           // just replace the name with 7 digits for the rank and the rest of the name.
 600           unsigned int pad = 7;
 601           if (libname.length() < pad)
 602             pad = libname.length();
 603           std::string target_lib =
 604               std::string(pad - std::to_string(rank).length(), '0') + std::to_string(rank) + libname.substr(pad);
 605           target_libs.push_back(target_lib);
 606           XBT_DEBUG("copy lib %s to %s, with size %lld", libpath.c_str(), target_lib.c_str(), (long long)fdin_size2);
 607           smpi_copy_file(libpath, target_lib, fdin_size2);
 608
 609           std::string sedcommand = "sed -i -e 's/" + libname + "/" + target_lib + "/g' " + target_executable;
 610           int ret                = system(sedcommand.c_str());
 611           if (ret != 0)
 612             xbt_die("error while applying sed command %s \n", sedcommand.c_str());
 613         }
 614       }
 615
 616       rank++;
 617       // Load the copy and resolve the entry point:
 618       void* handle    = dlopen(target_executable.c_str(), RTLD_LAZY | RTLD_LOCAL | WANT_RTLD_DEEPBIND);
 619       int saved_errno = errno;
 620       if (simgrid::config::get_value<bool>("smpi/keep-temps") == false) {
 621         unlink(target_executable.c_str());
 622         for (const std::string& target_lib : target_libs)
 623           unlink(target_lib.c_str());
 624       }
 625       if (handle == nullptr)
 626         xbt_die("dlopen failed: %s (errno: %d -- %s)", dlerror(), saved_errno, strerror(saved_errno));
 627       smpi_entry_point_type entry_point = smpi_resolve_function(handle);
 628       if (not entry_point)
 629         xbt_die("Could not resolve entry point");
 630       smpi_run_entry_point(entry_point, executable, args);
 631     });
 632   };
 633 }
 634
 635 static void smpi_init_privatization_no_dlopen(const std::string& executable)
 636 {
 637   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP)
 638     smpi_prepare_global_memory_segment();
 639   // Load the dynamic library and resolve the entry point:
 640   void* handle = dlopen(executable.c_str(), RTLD_LAZY | RTLD_LOCAL);
 641   if (handle == nullptr)
 642     xbt_die("dlopen failed for %s: %s (errno: %d -- %s)", executable.c_str(), dlerror(), errno, strerror(errno));
 643   smpi_entry_point_type entry_point = smpi_resolve_function(handle);
 644   if (not entry_point)
 645     xbt_die("main not found in %s", executable.c_str());
 646   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP)
 647     smpi_backup_global_memory_segment();
 648
 649   // Execute the same entry point for each simulated process:
 650   simix_global->default_function = [entry_point, executable](std::vector<std::string> args) {
 651     return std::function<void()>(
 652         [entry_point, executable, args] { smpi_run_entry_point(entry_point, executable, args); });
 653   };
 654 }
 655
 656 int smpi_main(const char* executable, int argc, char* argv[])
 657 {
 658   if (getenv("SMPI_PRETEND_CC") != nullptr) {
 659     /* Hack to ensure that smpicc can pretend to be a simple compiler. Particularly handy to pass it to the
 660      * configuration tools */
 661     return 0;
 662   }
 663
 664   TRACE_global_init();
 665   SIMIX_global_init(&argc, argv);
 666
 667   SMPI_switch_data_segment = &smpi_switch_data_segment;
 668   sg_storage_file_system_init();
 669   // parse the platform file: get the host list
 670   simgrid::s4u::Engine::get_instance()->load_platform(argv[1]);
 671   SIMIX_comm_set_copy_data_callback(smpi_comm_copy_buffer_callback);
 672
 673   smpi_init_options();
 674   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::DLOPEN)
 675     smpi_init_privatization_dlopen(executable);
 676   else
 677     smpi_init_privatization_no_dlopen(executable);
 678
 679   SMPI_init();
 680   simgrid::s4u::Engine::get_instance()->load_deployment(argv[2]);
 681   SMPI_app_instance_register(smpi_default_instance_name.c_str(), nullptr,
 682                              process_data.size()); // This call has a side effect on process_count...
 683   MPI_COMM_WORLD = *smpi_deployment_comm_world(smpi_default_instance_name);
 684   smpi_universe_size = process_count;
 685
 686
 687   /* Clean IO before the run */
 688   fflush(stdout);
 689   fflush(stderr);
 690
 691   if (MC_is_active()) {
 692     MC_run();
 693   } else {
 694
 695     SIMIX_run();
 696
 697     xbt_os_walltimer_stop(global_timer);
 698     if (simgrid::config::get_value<bool>("smpi/display-timing")) {
 699       double global_time = xbt_os_timer_elapsed(global_timer);
 700       XBT_INFO("Simulated time: %g seconds. \n\n"
 701           "The simulation took %g seconds (after parsing and platform setup)\n"
 702           "%g seconds were actual computation of the application",
 703           SIMIX_get_clock(), global_time , smpi_total_benched_time);
 704
 705       if (smpi_total_benched_time/global_time>=0.75)
 706       XBT_INFO("More than 75%% of the time was spent inside the application code.\n"
 707       "You may want to use sampling functions or trace replay to reduce this.");
 708     }
 709   }
 710   smpi_global_destroy();
 711
 712   return smpi_exit_status;
 713 }
 714
 715 // Called either directly from the user code, or from the code called by smpirun
 716 void SMPI_init(){
 717   simgrid::s4u::Actor::on_creation.connect([](simgrid::s4u::Actor& actor) {
 718     if (not actor.is_daemon()) {
 719       process_data.insert({&actor, new simgrid::smpi::ActorExt(&actor, nullptr)});
 720     }
 721   });
 722   simgrid::s4u::Actor::on_destruction.connect([](simgrid::s4u::Actor const& actor) {
 723     auto it = process_data.find(&actor);
 724     if (it != process_data.end()) {
 725       delete it->second;
 726       process_data.erase(it);
 727     }
 728   });
 729   simgrid::s4u::Host::on_creation.connect(
 730       [](simgrid::s4u::Host& host) { host.extension_set(new simgrid::smpi::Host(&host)); });
 731
 732   smpi_init_options();
 733   smpi_global_init();
 734   smpi_check_options();
 735 }
 736
 737 void SMPI_finalize(){
 738   smpi_global_destroy();
 739 }
 740
 741 void smpi_mpi_init() {
 742   smpi_init_fortran_types();
 743   if(smpi_init_sleep > 0)
 744     simcall_process_sleep(smpi_init_sleep);
 745 }