src/simdag/sd_daxloader.c

   1 /* Copyright (c) 2009, 2010. The SimGrid Team.
   2  * All rights reserved.                                                     */
   3
   4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   6
   7 #include "private.h"
   8 #include "simdag/simdag.h"
   9 #include "xbt/misc.h"
  10 #include "xbt/log.h"
  11
  12 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(sd_daxparse, sd, "Parsing DAX files");
  13
  14 #undef CLEANUP
  15 #include "dax_dtd.h"
  16 #include "dax_dtd.c"
  17
  18 bool children_are_marked(SD_task_t task);
  19 bool parents_are_marked(SD_task_t task);
  20
  21 /* Parsing helpers */
  22 static void dax_parse_error(char *msg)
  23 {
  24   fprintf(stderr, "Parse error on line %d: %s\n", dax_lineno, msg);
  25   abort();
  26 }
  27
  28 static double dax_parse_double(const char *string)
  29 {
  30   int ret = 0;
  31   double value;
  32
  33   ret = sscanf(string, "%lg", &value);
  34   if (ret != 1)
  35     dax_parse_error(bprintf("%s is not a double", string));
  36   return value;
  37 }
  38
  39 static int dax_parse_int(const char *string)
  40 {
  41   int ret = 0;
  42   int value;
  43
  44   ret = sscanf(string, "%d", &value);
  45   if (ret != 1)
  46     dax_parse_error(bprintf("%s is not an integer", string));
  47   return value;
  48 }
  49
  50 /* Ensure that transfer tasks have unique names even though a file is used
  51  * several times */
  52
  53 void uniq_transfer_task_name(SD_task_t task)
  54 {
  55   SD_task_t child, parent;
  56   xbt_dynar_t children, parents;
  57   char *new_name;
  58
  59   children = SD_task_get_children(task);
  60   parents = SD_task_get_parents(task);
  61
  62   xbt_dynar_get_cpy(children, 0, &child);
  63   xbt_dynar_get_cpy(parents, 0, &parent);
  64
  65   new_name = bprintf("%s_%s_%s",
  66                      SD_task_get_name(parent),
  67                      SD_task_get_name(task), SD_task_get_name(child));
  68
  69   SD_task_set_name(task, new_name);
  70
  71   xbt_dynar_free_container(&children);
  72   xbt_dynar_free_container(&parents);
  73   free(new_name);
  74 }
  75
  76 bool children_are_marked(SD_task_t task){
  77   SD_task_t child_task = NULL;
  78   bool all_marked = true;
  79   SD_dependency_t depafter = NULL;
  80   unsigned int count;
  81   xbt_dynar_foreach(task->tasks_after,count,depafter){
  82     child_task = depafter->dst;
  83     //test marked
  84     if(child_task->marked == 0) {
  85       all_marked = false;
  86       break;
  87     }
  88     child_task = NULL;
  89   }
  90   return all_marked;
  91 }
  92
  93 bool parents_are_marked(SD_task_t task){
  94   SD_task_t parent_task = NULL;
  95   bool all_marked = true;
  96   SD_dependency_t depafter = NULL;
  97   unsigned int count;
  98   xbt_dynar_foreach(task->tasks_after,count,depafter){
  99     parent_task = depafter->dst;
 100     //test marked
 101     if(parent_task->marked == 0) {
 102       all_marked = false;
 103       break;
 104     }
 105     parent_task = NULL;
 106   }
 107   return all_marked;
 108 }
 109
 110 bool acyclic_graph_detail(xbt_dynar_t dag){
 111   unsigned int count=0, count_current=0;
 112   bool all_marked = true;
 113   SD_task_t task = NULL, parent_task = NULL, child_task = NULL;
 114   SD_dependency_t depbefore = NULL, depafter = NULL;
 115   xbt_dynar_t next = NULL, current = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t),NULL);
 116
 117   xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 118     if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 119     task->marked = 0;
 120     if(xbt_dynar_length(task->tasks_after) == 0){
 121       xbt_dynar_push(current, &task);
 122     }
 123   }
 124   task = NULL;
 125   count = 0;
 126   //test if something has to be done for the next iteration
 127   while(xbt_dynar_length(current) != 0){
 128     next = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t),NULL);
 129     //test if the current iteration is done
 130     count_current=0;
 131     xbt_dynar_foreach(current,count_current,task){
 132       if (task == NULL) continue;
 133       count = 0;
 134       //push task in next
 135       task->marked = 1;
 136       count = 0;
 137       xbt_dynar_foreach(task->tasks_before,count,depbefore){
 138         parent_task = depbefore->src;
 139         if(parent_task->kind == SD_TASK_COMM_E2E){
 140           unsigned int j=0;
 141           parent_task->marked = 1;
 142           SD_task_t parent_task_2 = NULL;
 143           xbt_dynar_foreach(parent_task->tasks_before,j,depbefore){
 144             parent_task_2 = depbefore->src;
 145             if(children_are_marked(parent_task_2))
 146               xbt_dynar_push(next, &parent_task_2);
 147           }
 148         } else{
 149           if(children_are_marked(parent_task))
 150             xbt_dynar_push(next, &parent_task);
 151         }
 152         parent_task = NULL;
 153       }
 154       task = NULL;
 155       count = 0;
 156     }
 157     xbt_dynar_free(&current);
 158     current = next;
 159     next = NULL;
 160   }
 161   xbt_dynar_free(&current);
 162   current = NULL;
 163   all_marked = true;
 164   xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 165     if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 166     //test if all tasks are marked
 167     if(task->marked == 0){
 168       WARN1("the task %s is not marked",task->name);
 169       all_marked = false;
 170       break;
 171     }
 172   }
 173   task = NULL;
 174   if(!all_marked){
 175     VERB0("there is at least one cycle in your task graph");
 176
 177     count = 0;
 178     task = NULL;
 179     xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 180       if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 181       task->marked = 0;
 182       if(xbt_dynar_length(task->tasks_before) == 0){
 183         xbt_dynar_push(current, &task);
 184       }
 185     }
 186     task = NULL;
 187     count = 0;
 188     //test if something has to be done for the next iteration
 189     while(xbt_dynar_length(current) != 0){
 190       next = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t),NULL);
 191       //test if the current iteration is done
 192       count_current=0;
 193       xbt_dynar_foreach(current,count_current,task){
 194         if (task == NULL) continue;
 195         count = 0;
 196         //push task in next
 197         task->marked = 1;
 198         count = 0;
 199         xbt_dynar_foreach(task->tasks_after,count,depafter){
 200           child_task = depafter->dst;
 201           if(child_task->kind == SD_TASK_COMM_E2E){
 202             unsigned int j=0;
 203             child_task->marked = 1;
 204             SD_task_t child_task_2 = NULL;
 205             xbt_dynar_foreach(child_task->tasks_after,j,depafter){
 206               child_task_2 = depafter->src;
 207               if(parents_are_marked(child_task_2))
 208                 xbt_dynar_push(next, &child_task_2);
 209             }
 210           } else{
 211             if(parents_are_marked(child_task))
 212               xbt_dynar_push(next, &child_task);
 213           }
 214           parent_task = NULL;
 215         }
 216         task = NULL;
 217         count = 0;
 218       }
 219       xbt_dynar_free(&current);
 220       current = next;
 221       next = NULL;
 222     }
 223     xbt_dynar_free(&current);
 224     current = NULL;
 225     all_marked = true;
 226     xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 227       if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 228       //test if all tasks are marked
 229       if(task->marked == 0){
 230         WARN1("the task %s is not marked",task->name);
 231         all_marked = false;
 232       }
 233     }
 234   }
 235   return all_marked;
 236 }
 237
 238 bool acyclic_graph_detection(xbt_dynar_t dag){
 239   unsigned int count=0, count_current=0;
 240   bool all_marked = true;
 241   SD_task_t task = NULL, parent_task = NULL;
 242   SD_dependency_t depbefore = NULL;
 243   xbt_dynar_t next = NULL, current = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t),NULL);
 244
 245   xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 246     if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 247     task->marked = 0;
 248     if(xbt_dynar_length(task->tasks_after) == 0){
 249       xbt_dynar_push(current, &task);
 250     }
 251   }
 252   task = NULL;
 253   count = 0;
 254   //test if something has to be done for the next iteration
 255   while(xbt_dynar_length(current) != 0){
 256     next = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t),NULL);
 257     //test if the current iteration is done
 258     count_current=0;
 259     xbt_dynar_foreach(current,count_current,task){
 260       if (task == NULL) continue;
 261       count = 0;
 262       //push task in next
 263       task->marked = 1;
 264       count = 0;
 265       xbt_dynar_foreach(task->tasks_before,count,depbefore){
 266         parent_task = depbefore->src;
 267         if(parent_task->kind == SD_TASK_COMM_E2E){
 268           unsigned int j=0;
 269           parent_task->marked = 1;
 270           SD_task_t parent_task_2 = NULL;
 271           xbt_dynar_foreach(parent_task->tasks_before,j,depbefore){
 272             parent_task_2 = depbefore->src;
 273             if(children_are_marked(parent_task_2))
 274               xbt_dynar_push(next, &parent_task_2);
 275           }
 276         } else{
 277           if(children_are_marked(parent_task))
 278             xbt_dynar_push(next, &parent_task);
 279         }
 280         parent_task = NULL;
 281       }
 282       task = NULL;
 283       count = 0;
 284     }
 285     xbt_dynar_free(&current);
 286     current = next;
 287     next = NULL;
 288   }
 289   xbt_dynar_free(&current);
 290   current = NULL;
 291   all_marked = true;
 292   xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 293     if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 294     //test if all tasks are marked
 295     if(task->marked == 0){
 296       WARN1("the task %s is not marked",task->name);
 297       all_marked = false;
 298       break;
 299     }
 300   }
 301   task = NULL;
 302   if(!all_marked){
 303     VERB0("there is at least one cycle in your task graph");
 304   }
 305   return all_marked;
 306 }
 307
 308
 309 static YY_BUFFER_STATE input_buffer;
 310
 311 static xbt_dynar_t result;
 312 static xbt_dict_t jobs;
 313 static xbt_dict_t files;
 314 static SD_task_t current_job;
 315 static SD_task_t root_task, end_task;
 316
 317 static void dump_res()
 318 {
 319   unsigned int cursor;
 320   SD_task_t task;
 321   xbt_dynar_foreach(result, cursor, task) {
 322     INFO1("Task %d", cursor);
 323     SD_task_dump(task);
 324   }
 325 }
 326
 327 static void dax_task_free(void *task)
 328 {
 329   SD_task_t t = task;
 330   SD_task_destroy(t);
 331 }
 332
 333 /** @brief loads a DAX file describing a DAG
 334  *
 335  * See https://confluence.pegasus.isi.edu/display/pegasus/WorkflowGenerator
 336  * for more details.
 337  */
 338 xbt_dynar_t SD_daxload(const char *filename)
 339 {
 340   xbt_dict_cursor_t cursor;
 341   SD_task_t file;
 342   char *name;
 343   FILE *in_file = fopen(filename, "r");
 344   xbt_assert1(in_file, "Unable to open \"%s\"\n", filename);
 345   input_buffer = dax__create_buffer(in_file, 10);
 346   dax__switch_to_buffer(input_buffer);
 347   dax_lineno = 1;
 348
 349   result = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t), dax_task_free);
 350   files = xbt_dict_new();
 351   jobs = xbt_dict_new();
 352   root_task = SD_task_create_comp_seq("root", NULL, 0);
 353   /* by design the root task is always SCHEDULABLE */
 354   __SD_task_set_state(root_task, SD_SCHEDULABLE);
 355
 356   xbt_dynar_push(result, &root_task);
 357   end_task = SD_task_create_comp_seq("end", NULL, 0);
 358
 359   xbt_assert2(!dax_lex(), "Parse error in %s: %s", filename,
 360               dax__parse_err_msg());
 361   dax__delete_buffer(input_buffer);
 362   fclose(in_file);
 363   xbt_dict_free(&jobs);
 364
 365   /* And now, post-process the files.
 366    * We want a file task per pair of computation tasks exchanging the file. Duplicate on need
 367    * Files not produced in the system are said to be produced by root task (top of DAG).
 368    * Files not consumed in the system are said to be consumed by end task (bottom of DAG).
 369    */
 370
 371   xbt_dict_foreach(files, cursor, name, file) {
 372     unsigned int cpt1, cpt2;
 373     SD_task_t newfile = NULL;
 374     SD_dependency_t depbefore, depafter;
 375     if (xbt_dynar_length(file->tasks_before) == 0) {
 376       xbt_dynar_foreach(file->tasks_after, cpt2, depafter) {
 377         SD_task_t newfile =
 378             SD_task_create_comm_e2e(file->name, NULL, file->amount);
 379         SD_task_dependency_add(NULL, NULL, root_task, newfile);
 380         SD_task_dependency_add(NULL, NULL, newfile, depafter->dst);
 381 #ifdef HAVE_TRACING
 382         const char *category = depbefore->src->category;
 383         if (category){
 384           TRACE_category (category);
 385           TRACE_sd_set_task_category (newfile, category);
 386         }
 387 #endif
 388         xbt_dynar_push(result, &newfile);
 389       }
 390     } else if (xbt_dynar_length(file->tasks_after) == 0) {
 391       xbt_dynar_foreach(file->tasks_before, cpt2, depbefore) {
 392         SD_task_t newfile =
 393             SD_task_create_comm_e2e(file->name, NULL, file->amount);
 394         SD_task_dependency_add(NULL, NULL, depbefore->src, newfile);
 395         SD_task_dependency_add(NULL, NULL, newfile, end_task);
 396 #ifdef HAVE_TRACING
 397         const char *category = depbefore->src->category;
 398         if (category){
 399           TRACE_category (category);
 400           TRACE_sd_set_task_category (newfile, category);
 401         }
 402 #endif
 403         xbt_dynar_push(result, &newfile);
 404       }
 405     } else {
 406       xbt_dynar_foreach(file->tasks_before, cpt1, depbefore) {
 407         xbt_dynar_foreach(file->tasks_after, cpt2, depafter) {
 408           if (depbefore->src == depafter->dst) {
 409             WARN2
 410                 ("File %s is produced and consumed by task %s. This loop dependency will prevent the execution of the task.",
 411                  file->name, depbefore->src->name);
 412           }
 413           newfile =
 414               SD_task_create_comm_e2e(file->name, NULL, file->amount);
 415           SD_task_dependency_add(NULL, NULL, depbefore->src, newfile);
 416           SD_task_dependency_add(NULL, NULL, newfile, depafter->dst);
 417 #ifdef HAVE_TRACING
 418           const char *category = depbefore->src->category;
 419           if (category){
 420             TRACE_category (category);
 421             TRACE_sd_set_task_category (newfile, category);
 422           }
 423 #endif
 424           xbt_dynar_push(result, &newfile);
 425         }
 426       }
 427     }
 428   }
 429
 430   /* Push end task last */
 431   xbt_dynar_push(result, &end_task);
 432
 433   /* Free previous copy of the files */
 434   xbt_dict_free(&files);
 435   unsigned int cpt;
 436   xbt_dynar_foreach(result, cpt, file) {
 437     if (SD_task_get_kind(file) == SD_TASK_COMM_E2E) {
 438       uniq_transfer_task_name(file);
 439     }
 440   }
 441
 442   acyclic_graph_detection(result);
 443   return result;
 444 }
 445
 446 void STag_dax__adag(void)
 447 {
 448   double version = dax_parse_double(A_dax__adag_version);
 449
 450   xbt_assert1((version == 2.1),
 451               "Expected version 2.1 in <adag> tag, got %f. Fix the parser or your file",
 452               version);
 453 }
 454
 455 void STag_dax__job(void)
 456 {
 457   double runtime = dax_parse_double(A_dax__job_runtime);
 458   char *name = bprintf("%s@%s", A_dax__job_id, A_dax__job_name);
 459   runtime *= 4200000000.;       /* Assume that timings were done on a 4.2GFlops machine. I mean, why not? */
 460 //  INFO3("See <job id=%s runtime=%s %.0f>",A_dax__job_id,A_dax__job_runtime,runtime);
 461   current_job = SD_task_create_comp_seq(name, NULL, runtime);
 462 #ifdef HAVE_TRACING
 463   char *category = A_dax__job_name;
 464   if (category){
 465     TRACE_category (category);
 466     TRACE_sd_set_task_category(current_job, category);
 467   }
 468 #endif
 469   xbt_dict_set(jobs, A_dax__job_id, current_job, NULL);
 470   free(name);
 471   xbt_dynar_push(result, &current_job);
 472 }
 473
 474 void STag_dax__uses(void)
 475 {
 476   SD_task_t file;
 477   double size = dax_parse_double(A_dax__uses_size);
 478   int is_input = (A_dax__uses_link == A_dax__uses_link_input);
 479
 480 //  INFO2("See <uses file=%s %s>",A_dax__uses_file,(is_input?"in":"out"));
 481   file = xbt_dict_get_or_null(files, A_dax__uses_file);
 482   if (file == NULL) {
 483     file = SD_task_create_comm_e2e(A_dax__uses_file, NULL, size);
 484     xbt_dict_set(files, A_dax__uses_file, file, &dax_task_free);
 485   } else {
 486     if (SD_task_get_amount(file) != size) {
 487       WARN3("Ignoring file %s size redefinition from %.0f to %.0f",
 488             A_dax__uses_file, SD_task_get_amount(file), size);
 489     }
 490   }
 491   if (is_input) {
 492     SD_task_dependency_add(NULL, NULL, file, current_job);
 493   } else {
 494     SD_task_dependency_add(NULL, NULL, current_job, file);
 495     if (xbt_dynar_length(file->tasks_before) > 1) {
 496       WARN1("File %s created at more than one location...", file->name);
 497     }
 498   }
 499 }
 500
 501 static SD_task_t current_child;
 502 void STag_dax__child(void)
 503 {
 504   current_child = xbt_dict_get_or_null(jobs, A_dax__child_ref);
 505   if (current_child == NULL)
 506     dax_parse_error(bprintf
 507                     ("Asked to add dependencies to the non-existent %s task",
 508                      A_dax__child_ref));
 509 }
 510
 511 void ETag_dax__child(void)
 512 {
 513   current_child = NULL;
 514 }
 515
 516 void STag_dax__parent(void)
 517 {
 518   SD_task_t parent = xbt_dict_get_or_null(jobs, A_dax__parent_ref);
 519   if (parent == NULL)
 520     dax_parse_error(bprintf
 521                     ("Asked to add a dependency from %s to %s, but %s does not exist",
 522                      current_child->name, A_dax__parent_ref,
 523                      A_dax__parent_ref));
 524   SD_task_dependency_add(NULL, NULL, parent, current_child);
 525   DEBUG2("Control-flow dependency from %s to %s", current_child->name,
 526          parent->name);
 527 }
 528
 529 void ETag_dax__adag(void)
 530 {
 531 //  INFO0("See </adag>");
 532 }
 533
 534 void ETag_dax__job(void)
 535 {
 536   current_job = NULL;
 537 //  INFO0("See </job>");
 538 }
 539
 540 void ETag_dax__parent(void)
 541 {
 542 //  INFO0("See </parent>");
 543 }
 544
 545 void ETag_dax__uses(void)
 546 {
 547 //  INFO0("See </uses>");
 548 }