src/smpi/smpi_mpi_dt.cpp

   1 /* smpi_mpi_dt.c -- MPI primitives to handle datatypes                        */
   2 /* FIXME: a very incomplete implementation                                    */
   3
   4 /* Copyright (c) 2009-2015. The SimGrid Team.
   5  * All rights reserved.                                                     */
   6
   7 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   8  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   9
  10 #include <stdio.h>
  11 #include <stdlib.h>
  12 #include <string.h>
  13 #include <limits.h>
  14 #include "private.h"
  15 #include "smpi_mpi_dt_private.h"
  16 #include "mc/mc.h"
  17 #include "xbt/replay.h"
  18 #include "simgrid/modelchecker.h"
  19
  20 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_mpi_dt, smpi, "Logging specific to SMPI (datatype)");
  21
  22 xbt_dict_t smpi_type_keyvals = NULL;
  23 int type_keyval_id=0;//avoid collisions
  24
  25 #define CREATE_MPI_DATATYPE(name, type)               \
  26   static s_smpi_mpi_datatype_t mpi_##name = {         \
  27     (char*) # name,                                   \
  28     sizeof(type),   /* size */                        \
  29     0,              /*was 1 sizeof_substruct*/             \
  30     0,              /* lb */                          \
  31     sizeof(type),   /* ub = lb + size */              \
  32     DT_FLAG_BASIC,  /* flags */                       \
  33     NULL,           /* attributes */                  \
  34     NULL,           /* pointer on extended struct*/   \
  35     0               /* in_use counter */              \
  36   };                                                  \
  37 const MPI_Datatype name = &mpi_##name;
  38
  39 #define CREATE_MPI_DATATYPE_NULL(name)                \
  40   static s_smpi_mpi_datatype_t mpi_##name = {         \
  41     (char*) # name,                                   \
  42     0,              /* size */                        \
  43     0,              /* was 1 sizeof_substruct*/            \
  44     0,              /* lb */                          \
  45     0,              /* ub = lb + size */              \
  46     DT_FLAG_BASIC,  /* flags */                       \
  47     NULL,           /* attributes */                  \
  48     NULL,           /* pointer on extended struct*/   \
  49     0               /* in_use counter */              \
  50   };                                                  \
  51 const MPI_Datatype name = &mpi_##name;
  52
  53 //The following are datatypes for the MPI functions MPI_MAXLOC and MPI_MINLOC.
  54 typedef struct {
  55   float value;
  56   int index;
  57 } float_int;
  58 typedef struct {
  59   float value;
  60   float index;
  61 } float_float;
  62 typedef struct {
  63   long value;
  64   long index;
  65 } long_long;
  66 typedef struct {
  67   double value;
  68   double index;
  69 } double_double;
  70 typedef struct {
  71   long value;
  72   int index;
  73 } long_int;
  74 typedef struct {
  75   double value;
  76   int index;
  77 } double_int;
  78 typedef struct {
  79   short value;
  80   int index;
  81 } short_int;
  82 typedef struct {
  83   int value;
  84   int index;
  85 } int_int;
  86 typedef struct {
  87   long double value;
  88   int index;
  89 } long_double_int;
  90 typedef struct {
  91   int64_t value;
  92   int64_t index;
  93 } integer128_t;
  94 // Predefined data types
  95 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_CHAR, char);
  96 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_SHORT, short);
  97 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_INT, int);
  98 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_LONG, long);
  99 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_LONG_LONG, long long);
 100 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_SIGNED_CHAR, signed char);
 101 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_UNSIGNED_CHAR, unsigned char);
 102 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_UNSIGNED_SHORT, unsigned short);
 103 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_UNSIGNED, unsigned int);
 104 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_UNSIGNED_LONG, unsigned long);
 105 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_UNSIGNED_LONG_LONG, unsigned long long);
 106 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_FLOAT, float);
 107 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_DOUBLE, double);
 108 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_LONG_DOUBLE, long double);
 109 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_WCHAR, wchar_t);
 110 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_C_BOOL, bool);
 111 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_BYTE, int8_t);
 112 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_INT8_T, int8_t);
 113 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_INT16_T, int16_t);
 114 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_INT32_T, int32_t);
 115 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_INT64_T, int64_t);
 116 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_UINT8_T, uint8_t);
 117 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_UINT16_T, uint16_t);
 118 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_UINT32_T, uint32_t);
 119 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_UINT64_T, uint64_t);
 120 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_C_FLOAT_COMPLEX, float _Complex);
 121 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_C_DOUBLE_COMPLEX, double _Complex);
 122 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_C_LONG_DOUBLE_COMPLEX, long double _Complex);
 123 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_AINT, MPI_Aint);
 124 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_OFFSET, MPI_Offset);
 125
 126 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_FLOAT_INT, float_int);
 127 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_LONG_INT, long_int);
 128 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_DOUBLE_INT, double_int);
 129 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_SHORT_INT, short_int);
 130 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_2INT, int_int);
 131 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_2FLOAT, float_float);
 132 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_2DOUBLE, double_double);
 133 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_2LONG, long_long);
 134
 135 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_REAL, float);
 136 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_REAL4, float);
 137 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_REAL8, float);
 138 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_REAL16, double);
 139 CREATE_MPI_DATATYPE_NULL(MPI_COMPLEX8);
 140 CREATE_MPI_DATATYPE_NULL(MPI_COMPLEX16);
 141 CREATE_MPI_DATATYPE_NULL(MPI_COMPLEX32);
 142 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_INTEGER1, int);
 143 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_INTEGER2, int16_t);
 144 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_INTEGER4, int32_t);
 145 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_INTEGER8, int64_t);
 146 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_INTEGER16, integer128_t);
 147
 148 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_LONG_DOUBLE_INT, long_double_int);
 149
 150 CREATE_MPI_DATATYPE_NULL(MPI_UB);
 151 CREATE_MPI_DATATYPE_NULL(MPI_LB);
 152 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_PACKED, char);
 153 // Internal use only
 154 CREATE_MPI_DATATYPE(MPI_PTR, void*);
 155
 156 /** Check if the datatype is usable for communications */
 157 int is_datatype_valid(MPI_Datatype datatype) {
 158     return datatype != MPI_DATATYPE_NULL && (datatype->flags & DT_FLAG_COMMITED);
 159 }
 160
 161 size_t smpi_datatype_size(MPI_Datatype datatype)
 162 {
 163   return datatype->size;
 164 }
 165
 166 MPI_Aint smpi_datatype_lb(MPI_Datatype datatype)
 167 {
 168   return datatype->lb;
 169 }
 170
 171 MPI_Aint smpi_datatype_ub(MPI_Datatype datatype)
 172 {
 173   return datatype->ub;
 174 }
 175
 176 int smpi_datatype_dup(MPI_Datatype datatype, MPI_Datatype* new_t)
 177 {
 178   int ret=MPI_SUCCESS;
 179   *new_t= xbt_new(s_smpi_mpi_datatype_t,1);
 180   memcpy(*new_t, datatype, sizeof(s_smpi_mpi_datatype_t));
 181   if (datatype->sizeof_substruct){
 182     (*new_t)->substruct=xbt_malloc(datatype->sizeof_substruct);
 183     memcpy((*new_t)->substruct, datatype->substruct, datatype->sizeof_substruct);
 184   }
 185   if(datatype->name)
 186     (*new_t)->name = xbt_strdup(datatype->name);
 187   if(datatype->attributes !=NULL){
 188       (*new_t)->attributes=xbt_dict_new();
 189       xbt_dict_cursor_t cursor = NULL;
 190       int *key;
 191       int flag;
 192       void* value_in;
 193       void* value_out;
 194       xbt_dict_foreach(datatype->attributes, cursor, key, value_in){
 195         smpi_type_key_elem elem =
 196           static_cast<smpi_type_key_elem>(xbt_dict_get_or_null_ext(smpi_type_keyvals,  (const char*)key, sizeof(int)));
 197         if(elem && elem->copy_fn!=MPI_NULL_COPY_FN){
 198           ret = elem->copy_fn(datatype, *key, NULL, value_in, &value_out, &flag );
 199           if(ret!=MPI_SUCCESS){
 200             *new_t=MPI_DATATYPE_NULL;
 201             return ret;
 202           }
 203           if(flag)
 204             xbt_dict_set_ext((*new_t)->attributes, (const char*)key, sizeof(int),value_out, NULL);
 205         }
 206       }
 207     }
 208   return ret;
 209 }
 210
 211 int smpi_datatype_extent(MPI_Datatype datatype, MPI_Aint * lb, MPI_Aint * extent)
 212 {
 213   if(datatype == MPI_DATATYPE_NULL){
 214     *lb=0;
 215     *extent=0;
 216     return MPI_SUCCESS;
 217   }
 218   *lb = datatype->lb;
 219   *extent = datatype->ub - datatype->lb;
 220   return MPI_SUCCESS;
 221 }
 222
 223 MPI_Aint smpi_datatype_get_extent(MPI_Datatype datatype){
 224   if(datatype == MPI_DATATYPE_NULL){
 225     return 0;
 226   }
 227   return datatype->ub - datatype->lb;
 228 }
 229
 230 void smpi_datatype_get_name(MPI_Datatype datatype, char* name, int* length){
 231   *length = strlen(datatype->name);
 232   strcpy(name, datatype->name);
 233 }
 234
 235 void smpi_datatype_set_name(MPI_Datatype datatype, char* name){
 236   datatype->name = xbt_strdup(name);;
 237 }
 238
 239 int smpi_datatype_copy(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 240                        void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype)
 241 {
 242   int count;
 243   if(smpi_privatize_global_variables){
 244     smpi_switch_data_segment(smpi_process_index());
 245   }
 246   /* First check if we really have something to do */
 247   if (recvcount > 0 && recvbuf != sendbuf) {
 248     /* FIXME: treat packed cases */
 249     sendcount *= smpi_datatype_size(sendtype);
 250     recvcount *= smpi_datatype_size(recvtype);
 251     count = sendcount < recvcount ? sendcount : recvcount;
 252
 253     if(sendtype->sizeof_substruct == 0 && recvtype->sizeof_substruct == 0) {
 254       if(!smpi_process_get_replaying()) memcpy(recvbuf, sendbuf, count);
 255     }
 256     else if (sendtype->sizeof_substruct == 0)
 257     {
 258       s_smpi_subtype_t *subtype =  static_cast<s_smpi_subtype_t*>(recvtype->substruct);
 259       subtype->unserialize( sendbuf, recvbuf, recvcount/smpi_datatype_size(recvtype), subtype, MPI_REPLACE);
 260     }
 261     else if (recvtype->sizeof_substruct == 0)
 262     {
 263       s_smpi_subtype_t *subtype =  static_cast<s_smpi_subtype_t*>(sendtype->substruct);
 264       subtype->serialize(sendbuf, recvbuf, sendcount/smpi_datatype_size(sendtype), subtype);
 265     }else{
 266       s_smpi_subtype_t *subtype =  static_cast<s_smpi_subtype_t*>(sendtype->substruct);
 267
 268       void * buf_tmp = xbt_malloc(count);
 269
 270       subtype->serialize( sendbuf, buf_tmp,count/smpi_datatype_size(sendtype), subtype);
 271       subtype =  static_cast<s_smpi_subtype_t*>(recvtype->substruct);
 272       subtype->unserialize( buf_tmp, recvbuf,count/smpi_datatype_size(recvtype), subtype, MPI_REPLACE);
 273
 274       free(buf_tmp);
 275     }
 276   }
 277
 278   return sendcount > recvcount ? MPI_ERR_TRUNCATE : MPI_SUCCESS;
 279 }
 280
 281 /*
 282  *  Copies noncontiguous data into contiguous memory.
 283  *  @param contiguous_vector - output vector
 284  *  @param noncontiguous_vector - input vector
 285  *  @param type - pointer contening :
 286  *      - stride - stride of between noncontiguous data
 287  *      - block_length - the width or height of blocked matrix
 288  *      - count - the number of rows of matrix
 289  */
 290 void serialize_vector( const void *noncontiguous_vector, void *contiguous_vector, int count, void *type)
 291 {
 292   s_smpi_mpi_vector_t* type_c = (s_smpi_mpi_vector_t*)type;
 293   int i;
 294   char* contiguous_vector_char = (char*)contiguous_vector;
 295   char* noncontiguous_vector_char = (char*)noncontiguous_vector;
 296
 297   for (i = 0; i < type_c->block_count * count; i++) {
 298       if (type_c->old_type->sizeof_substruct == 0)
 299         memcpy(contiguous_vector_char, noncontiguous_vector_char, type_c->block_length * type_c->size_oldtype);
 300       else
 301         ((s_smpi_subtype_t*)type_c->old_type->substruct)->serialize( noncontiguous_vector_char,
 302                                                                      contiguous_vector_char,
 303                                                                      type_c->block_length, type_c->old_type->substruct);
 304
 305     contiguous_vector_char += type_c->block_length*type_c->size_oldtype;
 306     if((i+1)%type_c->block_count ==0)
 307       noncontiguous_vector_char += type_c->block_length*smpi_datatype_get_extent(type_c->old_type);
 308     else
 309       noncontiguous_vector_char += type_c->block_stride*smpi_datatype_get_extent(type_c->old_type);
 310   }
 311 }
 312
 313 /*
 314  *  Copies contiguous data into noncontiguous memory.
 315  *  @param noncontiguous_vector - output vector
 316  *  @param contiguous_vector - input vector
 317  *  @param type - pointer contening :
 318  *      - stride - stride of between noncontiguous data
 319  *      - block_length - the width or height of blocked matrix
 320  *      - count - the number of rows of matrix
 321  */
 322 void unserialize_vector( const void *contiguous_vector, void *noncontiguous_vector, int count, void *type, MPI_Op op)
 323 {
 324   s_smpi_mpi_vector_t* type_c = (s_smpi_mpi_vector_t*)type;
 325   int i;
 326
 327   char* contiguous_vector_char = (char*)contiguous_vector;
 328   char* noncontiguous_vector_char = (char*)noncontiguous_vector;
 329
 330   for (i = 0; i < type_c->block_count * count; i++) {
 331     if (type_c->old_type->sizeof_substruct == 0)
 332       smpi_op_apply(op, contiguous_vector_char, noncontiguous_vector_char, &type_c->block_length,
 333           &type_c->old_type);
 334      /* memcpy(noncontiguous_vector_char,
 335              contiguous_vector_char, type_c->block_length * type_c->size_oldtype);*/
 336     else
 337       ((s_smpi_subtype_t*)type_c->old_type->substruct)->unserialize(contiguous_vector_char, noncontiguous_vector_char,
 338                                                                     type_c->block_length,type_c->old_type->substruct,
 339                                                                     op);
 340     contiguous_vector_char += type_c->block_length*type_c->size_oldtype;
 341     if((i+1)%type_c->block_count ==0)
 342       noncontiguous_vector_char += type_c->block_length*smpi_datatype_get_extent(type_c->old_type);
 343     else
 344       noncontiguous_vector_char += type_c->block_stride*smpi_datatype_get_extent(type_c->old_type);
 345   }
 346 }
 347
 348 /* Create a Sub type vector to be able to serialize and unserialize it the structure s_smpi_mpi_vector_t is derived
 349  * from s_smpi_subtype which required the functions unserialize and serialize */
 350 s_smpi_mpi_vector_t* smpi_datatype_vector_create( int block_stride, int block_length, int block_count,
 351                                                   MPI_Datatype old_type, int size_oldtype){
 352   s_smpi_mpi_vector_t *new_t= xbt_new(s_smpi_mpi_vector_t,1);
 353   new_t->base.serialize = &serialize_vector;
 354   new_t->base.unserialize = &unserialize_vector;
 355   new_t->base.subtype_free = &free_vector;
 356   new_t->base.subtype_use = &use_vector;
 357   new_t->block_stride = block_stride;
 358   new_t->block_length = block_length;
 359   new_t->block_count = block_count;
 360   smpi_datatype_use(old_type);
 361   new_t->old_type = old_type;
 362   new_t->size_oldtype = size_oldtype;
 363   return new_t;
 364 }
 365
 366 void smpi_datatype_create(MPI_Datatype* new_type, int size,int lb, int ub, int sizeof_substruct, void *struct_type,
 367                           int flags){
 368   MPI_Datatype new_t= xbt_new(s_smpi_mpi_datatype_t,1);
 369   new_t->name = NULL;
 370   new_t->size = size;
 371   new_t->sizeof_substruct = size>0? sizeof_substruct:0;
 372   new_t->lb = lb;
 373   new_t->ub = ub;
 374   new_t->flags = flags;
 375   new_t->substruct = struct_type;
 376   new_t->in_use=1;
 377   new_t->attributes=NULL;
 378   *new_type = new_t;
 379
 380 #if HAVE_MC
 381   if(MC_is_active())
 382     MC_ignore(&(new_t->in_use), sizeof(new_t->in_use));
 383 #endif
 384 }
 385
 386 void smpi_datatype_free(MPI_Datatype* type){
 387   xbt_assert((*type)->in_use >= 0);
 388   if((*type)->attributes !=NULL){
 389     xbt_dict_cursor_t cursor = NULL;
 390     int* key;
 391     void * value;
 392     int flag;
 393     xbt_dict_foreach((*type)->attributes, cursor, key, value){
 394       smpi_type_key_elem elem =
 395           static_cast<smpi_type_key_elem>(xbt_dict_get_or_null_ext(smpi_type_keyvals, (const char*)key, sizeof(int)));
 396       if(elem &&  elem->delete_fn)
 397         elem->delete_fn(*type,*key, value, &flag);
 398     }
 399   }
 400
 401   if((*type)->flags & DT_FLAG_PREDEFINED)return;
 402
 403   //if still used, mark for deletion
 404   if((*type)->in_use!=0){
 405       (*type)->flags |=DT_FLAG_DESTROYED;
 406       return;
 407   }
 408
 409   if ((*type)->sizeof_substruct != 0){
 410     //((s_smpi_subtype_t *)(*type)->substruct)->subtype_free(type);
 411     xbt_free((*type)->substruct);
 412   }
 413   if ((*type)->name != NULL){
 414     xbt_free((*type)->name);
 415   }
 416   *type = MPI_DATATYPE_NULL;
 417 }
 418
 419 void smpi_datatype_use(MPI_Datatype type){
 420
 421   if(type)type->in_use++;
 422 XBT_INFO("using type %p, counter %d ", type, type->in_use);
 423   if(type->sizeof_substruct!=0){
 424     ((s_smpi_subtype_t *)(type)->substruct)->subtype_use(&type);
 425   }
 426 #if HAVE_MC
 427   if(MC_is_active())
 428     MC_ignore(&(type->in_use), sizeof(type->in_use));
 429 #endif
 430 }
 431
 432 void smpi_datatype_unuse(MPI_Datatype type){
 433   if (type->in_use > 0)
 434     type->in_use--;
 435
 436 XBT_INFO("unusing type %p, counter %d ", type, type->in_use);
 437   if(type->sizeof_substruct!=0){
 438     ((s_smpi_subtype_t *)(type)->substruct)->subtype_free(&type);
 439   }
 440
 441   if(type && type->in_use == 0){
 442     MPI_Datatype t = type;
 443     if (!(type->flags & DT_FLAG_DESTROYED))
 444       smpi_datatype_free(&type);
 445     if(t->flags & DT_FLAG_PREDEFINED) return;
 446     xbt_free(t);
 447   }
 448 #if HAVE_MC
 449   if(MC_is_active())
 450     MC_ignore(&(type->in_use), sizeof(type->in_use));
 451 #endif
 452 }
 453
 454 /*Contiguous Implementation*/
 455
 456 /* Copies noncontiguous data into contiguous memory.
 457  *  @param contiguous_hvector - output hvector
 458  *  @param noncontiguous_hvector - input hvector
 459  *  @param type - pointer contening :
 460  *      - stride - stride of between noncontiguous data, in bytes
 461  *      - block_length - the width or height of blocked matrix
 462  *      - count - the number of rows of matrix
 463  */
 464 void serialize_contiguous( const void *noncontiguous_hvector, void *contiguous_hvector, int count, void *type)
 465 {
 466   s_smpi_mpi_contiguous_t* type_c = (s_smpi_mpi_contiguous_t*)type;
 467   char* contiguous_vector_char = (char*)contiguous_hvector;
 468   char* noncontiguous_vector_char = (char*)noncontiguous_hvector+type_c->lb;
 469   memcpy(contiguous_vector_char, noncontiguous_vector_char, count* type_c->block_count * type_c->size_oldtype);
 470 }
 471 /* Copies contiguous data into noncontiguous memory.
 472  *  @param noncontiguous_vector - output hvector
 473  *  @param contiguous_vector - input hvector
 474  *  @param type - pointer contening :
 475  *      - stride - stride of between noncontiguous data, in bytes
 476  *      - block_length - the width or height of blocked matrix
 477  *      - count - the number of rows of matrix
 478  */
 479 void unserialize_contiguous(const void *contiguous_vector, void *noncontiguous_vector, int count, void *type, MPI_Op op)
 480 {
 481   s_smpi_mpi_contiguous_t* type_c = (s_smpi_mpi_contiguous_t*)type;
 482   char* contiguous_vector_char = (char*)contiguous_vector;
 483   char* noncontiguous_vector_char = (char*)noncontiguous_vector+type_c->lb;
 484   int n= count* type_c->block_count;
 485   smpi_op_apply(op, contiguous_vector_char, noncontiguous_vector_char, &n, &type_c->old_type);
 486   /*memcpy(noncontiguous_vector_char, contiguous_vector_char, count*  type_c->block_count * type_c->size_oldtype);*/
 487 }
 488
 489 void free_contiguous(MPI_Datatype* d){
 490   smpi_datatype_unuse(((s_smpi_mpi_indexed_t *)(*d)->substruct)->old_type);
 491 }
 492
 493 void use_contiguous(MPI_Datatype* d){
 494   smpi_datatype_use(((s_smpi_mpi_indexed_t *)(*d)->substruct)->old_type);
 495 }
 496
 497 /* Create a Sub type contiguous to be able to serialize and unserialize it the structure s_smpi_mpi_contiguous_t is
 498  * erived from s_smpi_subtype which required the functions unserialize and serialize */
 499 s_smpi_mpi_contiguous_t* smpi_datatype_contiguous_create( MPI_Aint lb, int block_count, MPI_Datatype old_type,
 500                                                   int size_oldtype){
 501   s_smpi_mpi_contiguous_t *new_t= xbt_new(s_smpi_mpi_contiguous_t,1);
 502   new_t->base.serialize = &serialize_contiguous;
 503   new_t->base.unserialize = &unserialize_contiguous;
 504   new_t->base.subtype_free = &free_contiguous;
 505   new_t->base.subtype_use = &use_contiguous;
 506   new_t->lb = lb;
 507   new_t->block_count = block_count;
 508   new_t->old_type = old_type;
 509   smpi_datatype_use(old_type);
 510   new_t->size_oldtype = size_oldtype;
 511   smpi_datatype_use(old_type);
 512   return new_t;
 513 }
 514
 515 int smpi_datatype_contiguous(int count, MPI_Datatype old_type, MPI_Datatype* new_type, MPI_Aint lb)
 516 {
 517   int retval;
 518   if(old_type->sizeof_substruct){
 519     //handle this case as a hvector with stride equals to the extent of the datatype
 520     return smpi_datatype_hvector(count, 1, smpi_datatype_get_extent(old_type), old_type, new_type);
 521   }
 522
 523   s_smpi_mpi_contiguous_t* subtype = smpi_datatype_contiguous_create( lb, count, old_type,smpi_datatype_size(old_type));
 524
 525   smpi_datatype_create(new_type, count * smpi_datatype_size(old_type),lb,lb + count * smpi_datatype_size(old_type),
 526             sizeof(s_smpi_mpi_contiguous_t),subtype, DT_FLAG_CONTIGUOUS);
 527   retval=MPI_SUCCESS;
 528   return retval;
 529 }
 530
 531 int smpi_datatype_vector(int count, int blocklen, int stride, MPI_Datatype old_type, MPI_Datatype* new_type)
 532 {
 533   int retval;
 534   if (blocklen<0) return MPI_ERR_ARG;
 535   MPI_Aint lb = 0;
 536   MPI_Aint ub = 0;
 537   if(count>0){
 538     lb=smpi_datatype_lb(old_type);
 539     ub=((count-1)*stride+blocklen-1)*smpi_datatype_get_extent(old_type)+smpi_datatype_ub(old_type);
 540   }
 541   if(old_type->sizeof_substruct || stride != blocklen){
 542
 543     s_smpi_mpi_vector_t* subtype = smpi_datatype_vector_create(stride, blocklen, count, old_type,
 544                                                                 smpi_datatype_size(old_type));
 545     smpi_datatype_create(new_type, count * (blocklen) * smpi_datatype_size(old_type), lb, ub, sizeof(s_smpi_mpi_vector_t), subtype,
 546                          DT_FLAG_VECTOR);
 547     retval=MPI_SUCCESS;
 548   }else{
 549     /* in this situation the data are contignous thus it's not required to serialize and unserialize it*/
 550     smpi_datatype_create(new_type, count * blocklen * smpi_datatype_size(old_type), 0, ((count -1) * stride + blocklen)*
 551                          smpi_datatype_size(old_type), 0, NULL, DT_FLAG_VECTOR|DT_FLAG_CONTIGUOUS);
 552     retval=MPI_SUCCESS;
 553   }
 554   return retval;
 555 }
 556
 557 void free_vector(MPI_Datatype* d){
 558   smpi_datatype_unuse(((s_smpi_mpi_indexed_t *)(*d)->substruct)->old_type);
 559 }
 560
 561 void use_vector(MPI_Datatype* d){
 562   smpi_datatype_use(((s_smpi_mpi_indexed_t *)(*d)->substruct)->old_type);
 563 }
 564
 565 /* Hvector Implementation - Vector with stride in bytes */
 566
 567 /* Copies noncontiguous data into contiguous memory.
 568  *  @param contiguous_hvector - output hvector
 569  *  @param noncontiguous_hvector - input hvector
 570  *  @param type - pointer contening :
 571  *      - stride - stride of between noncontiguous data, in bytes
 572  *      - block_length - the width or height of blocked matrix
 573  *      - count - the number of rows of matrix
 574  */
 575 void serialize_hvector( const void *noncontiguous_hvector, void *contiguous_hvector, int count, void *type)
 576 {
 577   s_smpi_mpi_hvector_t* type_c = (s_smpi_mpi_hvector_t*)type;
 578   int i;
 579   char* contiguous_vector_char = (char*)contiguous_hvector;
 580   char* noncontiguous_vector_char = (char*)noncontiguous_hvector;
 581
 582   for (i = 0; i < type_c->block_count * count; i++) {
 583     if (type_c->old_type->sizeof_substruct == 0)
 584       memcpy(contiguous_vector_char, noncontiguous_vector_char, type_c->block_length * type_c->size_oldtype);
 585     else
 586       ((s_smpi_subtype_t*)type_c->old_type->substruct)->serialize( noncontiguous_vector_char,
 587                                                                    contiguous_vector_char,
 588                                                                    type_c->block_length, type_c->old_type->substruct);
 589
 590     contiguous_vector_char += type_c->block_length*type_c->size_oldtype;
 591     if((i+1)%type_c->block_count ==0)
 592       noncontiguous_vector_char += type_c->block_length*type_c->size_oldtype;
 593     else
 594       noncontiguous_vector_char += type_c->block_stride;
 595   }
 596 }
 597 /* Copies contiguous data into noncontiguous memory.
 598  *  @param noncontiguous_vector - output hvector
 599  *  @param contiguous_vector - input hvector
 600  *  @param type - pointer contening :
 601  *      - stride - stride of between noncontiguous data, in bytes
 602  *      - block_length - the width or height of blocked matrix
 603  *      - count - the number of rows of matrix
 604  */
 605 void unserialize_hvector( const void *contiguous_vector, void *noncontiguous_vector, int count, void *type, MPI_Op op)
 606 {
 607   s_smpi_mpi_hvector_t* type_c = (s_smpi_mpi_hvector_t*)type;
 608   int i;
 609
 610   char* contiguous_vector_char = (char*)contiguous_vector;
 611   char* noncontiguous_vector_char = (char*)noncontiguous_vector;
 612
 613   for (i = 0; i < type_c->block_count * count; i++) {
 614     if (type_c->old_type->sizeof_substruct == 0)
 615       smpi_op_apply(op, contiguous_vector_char, noncontiguous_vector_char, &type_c->block_length, &type_c->old_type);
 616              /*memcpy(noncontiguous_vector_char,
 617            contiguous_vector_char, type_c->block_length * type_c->size_oldtype);*/
 618     else
 619       ((s_smpi_subtype_t*)type_c->old_type->substruct)->unserialize( contiguous_vector_char, noncontiguous_vector_char,
 620                                                                      type_c->block_length, type_c->old_type->substruct,
 621                                                                      op);
 622     contiguous_vector_char += type_c->block_length*type_c->size_oldtype;
 623     if((i+1)%type_c->block_count ==0)
 624       noncontiguous_vector_char += type_c->block_length*type_c->size_oldtype;
 625     else
 626       noncontiguous_vector_char += type_c->block_stride;
 627   }
 628 }
 629
 630 /* Create a Sub type vector to be able to serialize and unserialize it the structure s_smpi_mpi_vector_t is derived
 631  * from s_smpi_subtype which required the functions unserialize and serialize
 632  *
 633  */
 634 s_smpi_mpi_hvector_t* smpi_datatype_hvector_create( MPI_Aint block_stride, int block_length, int block_count,
 635                                                   MPI_Datatype old_type, int size_oldtype){
 636   s_smpi_mpi_hvector_t *new_t= xbt_new(s_smpi_mpi_hvector_t,1);
 637   new_t->base.serialize = &serialize_hvector;
 638   new_t->base.unserialize = &unserialize_hvector;
 639   new_t->base.subtype_free = &free_hvector;
 640   new_t->base.subtype_use = &use_hvector;
 641   new_t->block_stride = block_stride;
 642   new_t->block_length = block_length;
 643   new_t->block_count = block_count;
 644   new_t->old_type = old_type;
 645   new_t->size_oldtype = size_oldtype;
 646   smpi_datatype_use(old_type);
 647   return new_t;
 648 }
 649
 650 //do nothing for vector types
 651 void free_hvector(MPI_Datatype* d){
 652   smpi_datatype_unuse(((s_smpi_mpi_indexed_t *)(*d)->substruct)->old_type);
 653 }
 654
 655 void use_hvector(MPI_Datatype* d){
 656   smpi_datatype_use(((s_smpi_mpi_indexed_t *)(*d)->substruct)->old_type);
 657 }
 658
 659 int smpi_datatype_hvector(int count, int blocklen, MPI_Aint stride, MPI_Datatype old_type, MPI_Datatype* new_type)
 660 {
 661   int retval;
 662   if (blocklen<0) return MPI_ERR_ARG;
 663   MPI_Aint lb = 0;
 664   MPI_Aint ub = 0;
 665   if(count>0){
 666     lb=smpi_datatype_lb(old_type);
 667     ub=((count-1)*stride)+(blocklen-1)*smpi_datatype_get_extent(old_type)+smpi_datatype_ub(old_type);
 668   }
 669   if(old_type->sizeof_substruct || stride != blocklen*smpi_datatype_get_extent(old_type)){
 670     s_smpi_mpi_hvector_t* subtype = smpi_datatype_hvector_create( stride, blocklen, count, old_type,
 671                                                                   smpi_datatype_size(old_type));
 672
 673     smpi_datatype_create(new_type, count * blocklen * smpi_datatype_size(old_type), lb,ub, sizeof(s_smpi_mpi_hvector_t), subtype, DT_FLAG_VECTOR);
 674     retval=MPI_SUCCESS;
 675   }else{
 676     smpi_datatype_create(new_type, count * blocklen * smpi_datatype_size(old_type),0,count * blocklen *
 677                                              smpi_datatype_size(old_type), 0, NULL, DT_FLAG_VECTOR|DT_FLAG_CONTIGUOUS);
 678     retval=MPI_SUCCESS;
 679   }
 680   return retval;
 681 }
 682
 683 /* Indexed Implementation */
 684
 685 /* Copies noncontiguous data into contiguous memory.
 686  *  @param contiguous_indexed - output indexed
 687  *  @param noncontiguous_indexed - input indexed
 688  *  @param type - pointer contening :
 689  *      - block_lengths - the width or height of blocked matrix
 690  *      - block_indices - indices of each data, in element
 691  *      - count - the number of rows of matrix
 692  */
 693 void serialize_indexed( const void *noncontiguous_indexed, void *contiguous_indexed, int count, void *type)
 694 {
 695   s_smpi_mpi_indexed_t* type_c = (s_smpi_mpi_indexed_t*)type;
 696   int i,j;
 697   char* contiguous_indexed_char = (char*)contiguous_indexed;
 698   char* noncontiguous_indexed_char = (char*)noncontiguous_indexed+type_c->block_indices[0] * type_c->size_oldtype;
 699   for(j=0; j<count;j++){
 700     for (i = 0; i < type_c->block_count; i++) {
 701       if (type_c->old_type->sizeof_substruct == 0)
 702         memcpy(contiguous_indexed_char, noncontiguous_indexed_char, type_c->block_lengths[i] * type_c->size_oldtype);
 703       else
 704         ((s_smpi_subtype_t*)type_c->old_type->substruct)->serialize( noncontiguous_indexed_char,
 705                                                                      contiguous_indexed_char,
 706                                                                      type_c->block_lengths[i],
 707                                                                      type_c->old_type->substruct);
 708
 709       contiguous_indexed_char += type_c->block_lengths[i]*type_c->size_oldtype;
 710       if (i<type_c->block_count-1)
 711         noncontiguous_indexed_char =
 712           (char*)noncontiguous_indexed + type_c->block_indices[i+1]*smpi_datatype_get_extent(type_c->old_type);
 713       else
 714         noncontiguous_indexed_char += type_c->block_lengths[i]*smpi_datatype_get_extent(type_c->old_type);
 715     }
 716     noncontiguous_indexed=(void*)noncontiguous_indexed_char;
 717   }
 718 }
 719 /* Copies contiguous data into noncontiguous memory.
 720  *  @param noncontiguous_indexed - output indexed
 721  *  @param contiguous_indexed - input indexed
 722  *  @param type - pointer contening :
 723  *      - block_lengths - the width or height of blocked matrix
 724  *      - block_indices - indices of each data, in element
 725  *      - count - the number of rows of matrix
 726  */
 727 void unserialize_indexed( const void *contiguous_indexed, void *noncontiguous_indexed, int count, void *type, MPI_Op op)
 728 {
 729   s_smpi_mpi_indexed_t* type_c = (s_smpi_mpi_indexed_t*)type;
 730   int i,j;
 731   char* contiguous_indexed_char = (char*)contiguous_indexed;
 732   char* noncontiguous_indexed_char =
 733     (char*)noncontiguous_indexed+type_c->block_indices[0]*smpi_datatype_get_extent(type_c->old_type);
 734   for(j=0; j<count;j++){
 735     for (i = 0; i < type_c->block_count; i++) {
 736       if (type_c->old_type->sizeof_substruct == 0)
 737         smpi_op_apply(op, contiguous_indexed_char, noncontiguous_indexed_char, &type_c->block_lengths[i],
 738                     &type_c->old_type);
 739                /*memcpy(noncontiguous_indexed_char ,
 740              contiguous_indexed_char, type_c->block_lengths[i] * type_c->size_oldtype);*/
 741       else
 742         ((s_smpi_subtype_t*)type_c->old_type->substruct)->unserialize( contiguous_indexed_char,
 743                                                                        noncontiguous_indexed_char,
 744                                                                        type_c->block_lengths[i],
 745                                                                        type_c->old_type->substruct, op);
 746
 747       contiguous_indexed_char += type_c->block_lengths[i]*type_c->size_oldtype;
 748       if (i<type_c->block_count-1)
 749         noncontiguous_indexed_char =
 750           (char*)noncontiguous_indexed + type_c->block_indices[i+1]*smpi_datatype_get_extent(type_c->old_type);
 751       else
 752         noncontiguous_indexed_char += type_c->block_lengths[i]*smpi_datatype_get_extent(type_c->old_type);
 753     }
 754     noncontiguous_indexed=(void*)noncontiguous_indexed_char;
 755   }
 756 }
 757
 758 void free_indexed(MPI_Datatype* type){
 759   if((*type)->in_use==0){
 760     xbt_free(((s_smpi_mpi_indexed_t *)(*type)->substruct)->block_lengths);
 761     xbt_free(((s_smpi_mpi_indexed_t *)(*type)->substruct)->block_indices);
 762   }
 763   smpi_datatype_unuse(((s_smpi_mpi_indexed_t *)(*type)->substruct)->old_type);
 764 }
 765
 766 void use_indexed(MPI_Datatype* type){
 767   smpi_datatype_use(((s_smpi_mpi_indexed_t *)(*type)->substruct)->old_type);
 768 }
 769
 770
 771 /* Create a Sub type indexed to be able to serialize and unserialize it the structure s_smpi_mpi_indexed_t is derived
 772  * from s_smpi_subtype which required the functions unserialize and serialize */
 773 s_smpi_mpi_indexed_t* smpi_datatype_indexed_create( int* block_lengths, int* block_indices, int block_count,
 774                                                   MPI_Datatype old_type, int size_oldtype){
 775   s_smpi_mpi_indexed_t *new_t= xbt_new(s_smpi_mpi_indexed_t,1);
 776   new_t->base.serialize = &serialize_indexed;
 777   new_t->base.unserialize = &unserialize_indexed;
 778   new_t->base.subtype_free = &free_indexed;
 779   new_t->base.subtype_use = &use_indexed;
 780  //TODO : add a custom function for each time to clean these
 781   new_t->block_lengths= xbt_new(int, block_count);
 782   new_t->block_indices= xbt_new(int, block_count);
 783   int i;
 784   for(i=0;i<block_count;i++){
 785     new_t->block_lengths[i]=block_lengths[i];
 786     new_t->block_indices[i]=block_indices[i];
 787   }
 788   new_t->block_count = block_count;
 789   smpi_datatype_use(old_type);
 790   new_t->old_type = old_type;
 791   new_t->size_oldtype = size_oldtype;
 792   return new_t;
 793 }
 794
 795 int smpi_datatype_indexed(int count, int* blocklens, int* indices, MPI_Datatype old_type, MPI_Datatype* new_type)
 796 {
 797   int i;
 798   int retval;
 799   int size = 0;
 800   int contiguous=1;
 801   MPI_Aint lb = 0;
 802   MPI_Aint ub = 0;
 803   if(count>0){
 804     lb=indices[0]*smpi_datatype_get_extent(old_type);
 805     ub=indices[0]*smpi_datatype_get_extent(old_type) + blocklens[0]*smpi_datatype_ub(old_type);
 806   }
 807
 808   for(i=0; i< count; i++){
 809     if   (blocklens[i]<0)
 810       return MPI_ERR_ARG;
 811     size += blocklens[i];
 812
 813     if(indices[i]*smpi_datatype_get_extent(old_type)+smpi_datatype_lb(old_type)<lb)
 814       lb = indices[i]*smpi_datatype_get_extent(old_type)+smpi_datatype_lb(old_type);
 815     if(indices[i]*smpi_datatype_get_extent(old_type)+blocklens[i]*smpi_datatype_ub(old_type)>ub)
 816       ub = indices[i]*smpi_datatype_get_extent(old_type)+blocklens[i]*smpi_datatype_ub(old_type);
 817
 818     if ( (i< count -1) && (indices[i]+blocklens[i] != indices[i+1]) )contiguous=0;
 819   }
 820   if (old_type->sizeof_substruct != 0)
 821     contiguous=0;
 822
 823   if(!contiguous){
 824     s_smpi_mpi_indexed_t* subtype = smpi_datatype_indexed_create( blocklens, indices, count, old_type,
 825                                                                   smpi_datatype_size(old_type));
 826      smpi_datatype_create(new_type,  size * smpi_datatype_size(old_type),lb,ub,sizeof(s_smpi_mpi_indexed_t), subtype, DT_FLAG_DATA);
 827   }else{
 828     s_smpi_mpi_contiguous_t* subtype = smpi_datatype_contiguous_create( lb, size, old_type,
 829                                                                   smpi_datatype_size(old_type));
 830     smpi_datatype_create(new_type, size * smpi_datatype_size(old_type), lb, ub, sizeof(s_smpi_mpi_contiguous_t), subtype,
 831                          DT_FLAG_DATA|DT_FLAG_CONTIGUOUS);
 832   }
 833   retval=MPI_SUCCESS;
 834   return retval;
 835 }
 836 /* Hindexed Implementation - Indexed with indices in bytes */
 837
 838 /* Copies noncontiguous data into contiguous memory.
 839  *  @param contiguous_hindexed - output hindexed
 840  *  @param noncontiguous_hindexed - input hindexed
 841  *  @param type - pointer contening :
 842  *      - block_lengths - the width or height of blocked matrix
 843  *      - block_indices - indices of each data, in bytes
 844  *      - count - the number of rows of matrix
 845  */
 846 void serialize_hindexed( const void *noncontiguous_hindexed, void *contiguous_hindexed, int count, void *type)
 847 {
 848   s_smpi_mpi_hindexed_t* type_c = (s_smpi_mpi_hindexed_t*)type;
 849   int i,j;
 850   char* contiguous_hindexed_char = (char*)contiguous_hindexed;
 851   char* noncontiguous_hindexed_char = (char*)noncontiguous_hindexed+ type_c->block_indices[0];
 852   for(j=0; j<count;j++){
 853     for (i = 0; i < type_c->block_count; i++) {
 854       if (type_c->old_type->sizeof_substruct == 0)
 855         memcpy(contiguous_hindexed_char, noncontiguous_hindexed_char, type_c->block_lengths[i] * type_c->size_oldtype);
 856       else
 857         ((s_smpi_subtype_t*)type_c->old_type->substruct)->serialize( noncontiguous_hindexed_char,
 858                                                                      contiguous_hindexed_char,
 859                                                                      type_c->block_lengths[i],
 860                                                                      type_c->old_type->substruct);
 861
 862       contiguous_hindexed_char += type_c->block_lengths[i]*type_c->size_oldtype;
 863       if (i<type_c->block_count-1)
 864         noncontiguous_hindexed_char = (char*)noncontiguous_hindexed + type_c->block_indices[i+1];
 865       else
 866         noncontiguous_hindexed_char += type_c->block_lengths[i]*smpi_datatype_get_extent(type_c->old_type);
 867     }
 868     noncontiguous_hindexed=(void*)noncontiguous_hindexed_char;
 869   }
 870 }
 871 /* Copies contiguous data into noncontiguous memory.
 872  *  @param noncontiguous_hindexed - output hindexed
 873  *  @param contiguous_hindexed - input hindexed
 874  *  @param type - pointer contening :
 875  *      - block_lengths - the width or height of blocked matrix
 876  *      - block_indices - indices of each data, in bytes
 877  *      - count - the number of rows of matrix
 878  */
 879 void unserialize_hindexed( const void *contiguous_hindexed, void *noncontiguous_hindexed, int count, void *type,
 880                          MPI_Op op)
 881 {
 882   s_smpi_mpi_hindexed_t* type_c = (s_smpi_mpi_hindexed_t*)type;
 883   int i,j;
 884
 885   char* contiguous_hindexed_char = (char*)contiguous_hindexed;
 886   char* noncontiguous_hindexed_char = (char*)noncontiguous_hindexed+ type_c->block_indices[0];
 887   for(j=0; j<count;j++){
 888     for (i = 0; i < type_c->block_count; i++) {
 889       if (type_c->old_type->sizeof_substruct == 0)
 890         smpi_op_apply(op, contiguous_hindexed_char, noncontiguous_hindexed_char, &type_c->block_lengths[i],
 891                             &type_c->old_type);
 892         /*memcpy(noncontiguous_hindexed_char,contiguous_hindexed_char,type_c->block_lengths[i]*type_c->size_oldtype);*/
 893       else
 894         ((s_smpi_subtype_t*)type_c->old_type->substruct)->unserialize( contiguous_hindexed_char,
 895                                                                        noncontiguous_hindexed_char,
 896                                                                        type_c->block_lengths[i],
 897                                                                        type_c->old_type->substruct, op);
 898
 899       contiguous_hindexed_char += type_c->block_lengths[i]*type_c->size_oldtype;
 900       if (i<type_c->block_count-1)
 901         noncontiguous_hindexed_char = (char*)noncontiguous_hindexed + type_c->block_indices[i+1];
 902       else
 903         noncontiguous_hindexed_char += type_c->block_lengths[i]*smpi_datatype_get_extent(type_c->old_type);
 904     }
 905     noncontiguous_hindexed=(void*)noncontiguous_hindexed_char;
 906   }
 907 }
 908
 909 void free_hindexed(MPI_Datatype* type){
 910   if((*type)->in_use==0){
 911     xbt_free(((s_smpi_mpi_hindexed_t *)(*type)->substruct)->block_lengths);
 912     xbt_free(((s_smpi_mpi_hindexed_t *)(*type)->substruct)->block_indices);
 913   }
 914   smpi_datatype_unuse(((s_smpi_mpi_indexed_t *)(*type)->substruct)->old_type);
 915 }
 916
 917 void use_hindexed(MPI_Datatype* type){
 918   smpi_datatype_use(((s_smpi_mpi_indexed_t *)(*type)->substruct)->old_type);
 919 }
 920
 921 /* Create a Sub type hindexed to be able to serialize and unserialize it the structure s_smpi_mpi_hindexed_t is derived
 922  * from s_smpi_subtype which required the functions unserialize and serialize
 923  */
 924 s_smpi_mpi_hindexed_t* smpi_datatype_hindexed_create( int* block_lengths, MPI_Aint* block_indices, int block_count,
 925                                                   MPI_Datatype old_type, int size_oldtype){
 926   s_smpi_mpi_hindexed_t *new_t= xbt_new(s_smpi_mpi_hindexed_t,1);
 927   new_t->base.serialize = &serialize_hindexed;
 928   new_t->base.unserialize = &unserialize_hindexed;
 929   new_t->base.subtype_free = &free_hindexed;
 930   new_t->base.subtype_use = &use_hindexed;
 931  //TODO : add a custom function for each time to clean these
 932   new_t->block_lengths= xbt_new(int, block_count);
 933   new_t->block_indices= xbt_new(MPI_Aint, block_count);
 934   int i;
 935   for(i=0;i<block_count;i++){
 936     new_t->block_lengths[i]=block_lengths[i];
 937     new_t->block_indices[i]=block_indices[i];
 938   }
 939   new_t->block_count = block_count;
 940   new_t->old_type = old_type;
 941   smpi_datatype_use(old_type);
 942   new_t->size_oldtype = size_oldtype;
 943   return new_t;
 944 }
 945
 946 int smpi_datatype_hindexed(int count, int* blocklens, MPI_Aint* indices, MPI_Datatype old_type, MPI_Datatype* new_type)
 947 {
 948   int i;
 949   int retval;
 950   int size = 0;
 951   int contiguous=1;
 952   MPI_Aint lb = 0;
 953   MPI_Aint ub = 0;
 954   if(count>0){
 955     lb=indices[0] + smpi_datatype_lb(old_type);
 956     ub=indices[0] + blocklens[0]*smpi_datatype_ub(old_type);
 957   }
 958   for(i=0; i< count; i++){
 959     if   (blocklens[i]<0)
 960       return MPI_ERR_ARG;
 961     size += blocklens[i];
 962
 963     if(indices[i]+smpi_datatype_lb(old_type)<lb) lb = indices[i]+smpi_datatype_lb(old_type);
 964     if(indices[i]+blocklens[i]*smpi_datatype_ub(old_type)>ub) ub = indices[i]+blocklens[i]*smpi_datatype_ub(old_type);
 965
 966     if ( (i< count -1) && (indices[i]+blocklens[i]*static_cast<int>(smpi_datatype_size(old_type)) != indices[i+1]) )
 967       contiguous=0;
 968   }
 969   if (old_type->sizeof_substruct != 0 || lb!=0)
 970     contiguous=0;
 971
 972   if(!contiguous){
 973     s_smpi_mpi_hindexed_t* subtype = smpi_datatype_hindexed_create( blocklens, indices, count, old_type,
 974                                                                   smpi_datatype_size(old_type));
 975     smpi_datatype_create(new_type,  size * smpi_datatype_size(old_type), lb, ub ,sizeof(s_smpi_mpi_hindexed_t), subtype, DT_FLAG_DATA);
 976   }else{
 977     s_smpi_mpi_contiguous_t* subtype = smpi_datatype_contiguous_create(lb,size, old_type, smpi_datatype_size(old_type));
 978     smpi_datatype_create(new_type,  size * smpi_datatype_size(old_type), 0,size * smpi_datatype_size(old_type),
 979                1, subtype, DT_FLAG_DATA|DT_FLAG_CONTIGUOUS);
 980   }
 981   retval=MPI_SUCCESS;
 982   return retval;
 983 }
 984
 985 /* struct Implementation - Indexed with indices in bytes */
 986
 987 /* Copies noncontiguous data into contiguous memory.
 988  *  @param contiguous_struct - output struct
 989  *  @param noncontiguous_struct - input struct
 990  *  @param type - pointer contening :
 991  *      - stride - stride of between noncontiguous data
 992  *      - block_length - the width or height of blocked matrix
 993  *      - count - the number of rows of matrix
 994  */
 995 void serialize_struct( const void *noncontiguous_struct, void *contiguous_struct, int count, void *type)
 996 {
 997   s_smpi_mpi_struct_t* type_c = (s_smpi_mpi_struct_t*)type;
 998   int i,j;
 999   char* contiguous_struct_char = (char*)contiguous_struct;
1000   char* noncontiguous_struct_char = (char*)noncontiguous_struct+ type_c->block_indices[0];
1001   for(j=0; j<count;j++){
1002     for (i = 0; i < type_c->block_count; i++) {
1003       if (type_c->old_types[i]->sizeof_substruct == 0)
1004         memcpy(contiguous_struct_char, noncontiguous_struct_char,
1005                type_c->block_lengths[i] * smpi_datatype_size(type_c->old_types[i]));
1006       else
1007         ((s_smpi_subtype_t*)type_c->old_types[i]->substruct)->serialize( noncontiguous_struct_char,
1008                                                                          contiguous_struct_char,
1009                                                                          type_c->block_lengths[i],
1010                                                                          type_c->old_types[i]->substruct);
1011
1012
1013       contiguous_struct_char += type_c->block_lengths[i]*smpi_datatype_size(type_c->old_types[i]);
1014       if (i<type_c->block_count-1)
1015         noncontiguous_struct_char = (char*)noncontiguous_struct + type_c->block_indices[i+1];
1016       else //let's hope this is MPI_UB ?
1017         noncontiguous_struct_char += type_c->block_lengths[i]*smpi_datatype_get_extent(type_c->old_types[i]);
1018     }
1019     noncontiguous_struct=(void*)noncontiguous_struct_char;
1020   }
1021 }
1022
1023 /* Copies contiguous data into noncontiguous memory.
1024  *  @param noncontiguous_struct - output struct
1025  *  @param contiguous_struct - input struct
1026  *  @param type - pointer contening :
1027  *      - stride - stride of between noncontiguous data
1028  *      - block_length - the width or height of blocked matrix
1029  *      - count - the number of rows of matrix
1030  */
1031 void unserialize_struct( const void *contiguous_struct, void *noncontiguous_struct, int count, void *type, MPI_Op op)
1032 {
1033   s_smpi_mpi_struct_t* type_c = (s_smpi_mpi_struct_t*)type;
1034   int i,j;
1035
1036   char* contiguous_struct_char = (char*)contiguous_struct;
1037   char* noncontiguous_struct_char = (char*)noncontiguous_struct+ type_c->block_indices[0];
1038   for(j=0; j<count;j++){
1039     for (i = 0; i < type_c->block_count; i++) {
1040       if (type_c->old_types[i]->sizeof_substruct == 0)
1041         smpi_op_apply(op, contiguous_struct_char, noncontiguous_struct_char, &type_c->block_lengths[i],
1042            & type_c->old_types[i]);
1043       /*memcpy(noncontiguous_struct_char,
1044                contiguous_struct_char, type_c->block_lengths[i] * smpi_datatype_size(type_c->old_types[i]));*/
1045       else
1046         ((s_smpi_subtype_t*)type_c->old_types[i]->substruct)->unserialize( contiguous_struct_char,
1047                                                                            noncontiguous_struct_char,
1048                                                                            type_c->block_lengths[i],
1049                                                                            type_c->old_types[i]->substruct, op);
1050
1051       contiguous_struct_char += type_c->block_lengths[i]*smpi_datatype_size(type_c->old_types[i]);
1052       if (i<type_c->block_count-1)
1053         noncontiguous_struct_char =  (char*)noncontiguous_struct + type_c->block_indices[i+1];
1054       else
1055         noncontiguous_struct_char += type_c->block_lengths[i]*smpi_datatype_get_extent(type_c->old_types[i]);
1056     }
1057     noncontiguous_struct=(void*)noncontiguous_struct_char;
1058   }
1059 }
1060
1061 void free_struct(MPI_Datatype* type){
1062   int i=0;
1063   for (i = 0; i < ((s_smpi_mpi_struct_t *)(*type)->substruct)->block_count; i++)
1064     smpi_datatype_unuse(((s_smpi_mpi_struct_t *)(*type)->substruct)->old_types[i]);
1065   if((*type)->in_use==0){
1066     xbt_free(((s_smpi_mpi_struct_t *)(*type)->substruct)->block_lengths);
1067     xbt_free(((s_smpi_mpi_struct_t *)(*type)->substruct)->block_indices);
1068     xbt_free(((s_smpi_mpi_struct_t *)(*type)->substruct)->old_types);
1069   }
1070 }
1071
1072 void use_struct(MPI_Datatype* type){
1073   int i=0;
1074   for (i = 0; i < ((s_smpi_mpi_struct_t *)(*type)->substruct)->block_count; i++)
1075     smpi_datatype_use(((s_smpi_mpi_struct_t *)(*type)->substruct)->old_types[i]);
1076 }
1077
1078 /* Create a Sub type struct to be able to serialize and unserialize it the structure s_smpi_mpi_struct_t is derived
1079  * from s_smpi_subtype which required the functions unserialize and serialize
1080  */
1081 s_smpi_mpi_struct_t* smpi_datatype_struct_create( int* block_lengths, MPI_Aint* block_indices, int block_count,
1082                                                   MPI_Datatype* old_types){
1083   s_smpi_mpi_struct_t *new_t= xbt_new(s_smpi_mpi_struct_t,1);
1084   new_t->base.serialize = &serialize_struct;
1085   new_t->base.unserialize = &unserialize_struct;
1086   new_t->base.subtype_free = &free_struct;
1087   new_t->base.subtype_use = &use_struct;
1088  //TODO : add a custom function for each time to clean these
1089   new_t->block_lengths= xbt_new(int, block_count);
1090   new_t->block_indices= xbt_new(MPI_Aint, block_count);
1091   new_t->old_types=  xbt_new(MPI_Datatype, block_count);
1092   int i;
1093   for(i=0;i<block_count;i++){
1094     new_t->block_lengths[i]=block_lengths[i];
1095     new_t->block_indices[i]=block_indices[i];
1096     new_t->old_types[i]=old_types[i];
1097     smpi_datatype_use(new_t->old_types[i]);
1098   }
1099   //new_t->block_lengths = block_lengths;
1100   //new_t->block_indices = block_indices;
1101   new_t->block_count = block_count;
1102   //new_t->old_types = old_types;
1103   return new_t;
1104 }
1105
1106 int smpi_datatype_struct(int count, int* blocklens, MPI_Aint* indices, MPI_Datatype* old_types, MPI_Datatype* new_type)
1107 {
1108   int i;
1109   size_t size = 0;
1110   int contiguous=1;
1111   size = 0;
1112   MPI_Aint lb = 0;
1113   MPI_Aint ub = 0;
1114   if(count>0){
1115     lb=indices[0] + smpi_datatype_lb(old_types[0]);
1116     ub=indices[0] + blocklens[0]*smpi_datatype_ub(old_types[0]);
1117   }
1118   int forced_lb=0;
1119   int forced_ub=0;
1120   for(i=0; i< count; i++){
1121     if (blocklens[i]<0)
1122       return MPI_ERR_ARG;
1123     if (old_types[i]->sizeof_substruct != 0)
1124       contiguous=0;
1125
1126     size += blocklens[i]*smpi_datatype_size(old_types[i]);
1127     if (old_types[i]==MPI_LB){
1128       lb=indices[i];
1129       forced_lb=1;
1130     }
1131     if (old_types[i]==MPI_UB){
1132       ub=indices[i];
1133       forced_ub=1;
1134     }
1135
1136     if(!forced_lb && indices[i]+smpi_datatype_lb(old_types[i])<lb) lb = indices[i];
1137     if(!forced_ub &&  indices[i]+blocklens[i]*smpi_datatype_ub(old_types[i])>ub)
1138       ub = indices[i]+blocklens[i]*smpi_datatype_ub(old_types[i]);
1139
1140     if ( (i< count -1) && (indices[i]+blocklens[i]*static_cast<int>(smpi_datatype_size(old_types[i])) != indices[i+1]) )
1141       contiguous=0;
1142   }
1143
1144   if(!contiguous){
1145     s_smpi_mpi_struct_t* subtype = smpi_datatype_struct_create( blocklens, indices, count, old_types);
1146
1147     smpi_datatype_create(new_type,  size, lb, ub,sizeof(s_smpi_mpi_struct_t), subtype, DT_FLAG_DATA);
1148   }else{
1149     s_smpi_mpi_contiguous_t* subtype = smpi_datatype_contiguous_create( lb, size, MPI_CHAR, 1);
1150     smpi_datatype_create(new_type,  size, lb, ub,1, subtype, DT_FLAG_DATA|DT_FLAG_CONTIGUOUS);
1151   }
1152   return MPI_SUCCESS;
1153 }
1154
1155 void smpi_datatype_commit(MPI_Datatype *datatype)
1156 {
1157   (*datatype)->flags=  ((*datatype)->flags | DT_FLAG_COMMITED);
1158 }
1159
1160 typedef struct s_smpi_mpi_op {
1161   MPI_User_function *func;
1162   int is_commute;
1163 } s_smpi_mpi_op_t;
1164
1165 #define MAX_OP(a, b)  (b) = (a) < (b) ? (b) : (a)
1166 #define MIN_OP(a, b)  (b) = (a) < (b) ? (a) : (b)
1167 #define SUM_OP(a, b)  (b) += (a)
1168 #define PROD_OP(a, b) (b) *= (a)
1169 #define LAND_OP(a, b) (b) = (a) && (b)
1170 #define LOR_OP(a, b)  (b) = (a) || (b)
1171 #define LXOR_OP(a, b) (b) = (!(a) && (b)) || ((a) && !(b))
1172 #define BAND_OP(a, b) (b) &= (a)
1173 #define BOR_OP(a, b)  (b) |= (a)
1174 #define BXOR_OP(a, b) (b) ^= (a)
1175 #define MAXLOC_OP(a, b)  (b) = (a.value) < (b.value) ? (b) : (a)
1176 #define MINLOC_OP(a, b)  (b) = (a.value) < (b.value) ? (a) : (b)
1177
1178 #define APPLY_FUNC(a, b, length, type, func) \
1179 {                                          \
1180   int i;                                   \
1181   type* x = (type*)(a);                    \
1182   type* y = (type*)(b);                    \
1183   for(i = 0; i < *(length); i++) {         \
1184     func(x[i], y[i]);                      \
1185   }                                        \
1186 }
1187
1188 static void max_func(void *a, void *b, int *length, MPI_Datatype * datatype)
1189 {
1190   if (*datatype == MPI_CHAR) {
1191     APPLY_FUNC(a, b, length, char, MAX_OP);
1192   } else if (*datatype == MPI_SHORT) {
1193     APPLY_FUNC(a, b, length, short, MAX_OP);
1194   } else if (*datatype == MPI_INT) {
1195     APPLY_FUNC(a, b, length, int, MAX_OP);
1196   } else if (*datatype == MPI_LONG) {
1197     APPLY_FUNC(a, b, length, long, MAX_OP);
1198   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_SHORT) {
1199     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned short, MAX_OP);
1200   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED) {
1201     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned int, MAX_OP);
1202   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_LONG) {
1203     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned long, MAX_OP);
1204   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_CHAR) {
1205     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned char, MAX_OP);
1206   } else if (*datatype == MPI_FLOAT) {
1207     APPLY_FUNC(a, b, length, float, MAX_OP);
1208   } else if (*datatype == MPI_DOUBLE) {
1209     APPLY_FUNC(a, b, length, double, MAX_OP);
1210   } else if (*datatype == MPI_LONG_DOUBLE) {
1211     APPLY_FUNC(a, b, length, long double, MAX_OP);
1212   }
1213 }
1214
1215 static void min_func(void *a, void *b, int *length, MPI_Datatype * datatype)
1216 {
1217   if (*datatype == MPI_CHAR) {
1218     APPLY_FUNC(a, b, length, char, MIN_OP);
1219   } else if (*datatype == MPI_SHORT) {
1220     APPLY_FUNC(a, b, length, short, MIN_OP);
1221   } else if (*datatype == MPI_INT) {
1222     APPLY_FUNC(a, b, length, int, MIN_OP);
1223   } else if (*datatype == MPI_LONG) {
1224     APPLY_FUNC(a, b, length, long, MIN_OP);
1225   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_SHORT) {
1226     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned short, MIN_OP);
1227   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED) {
1228     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned int, MIN_OP);
1229   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_LONG) {
1230     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned long, MIN_OP);
1231   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_CHAR) {
1232     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned char, MIN_OP);
1233   } else if (*datatype == MPI_FLOAT) {
1234     APPLY_FUNC(a, b, length, float, MIN_OP);
1235   } else if (*datatype == MPI_DOUBLE) {
1236     APPLY_FUNC(a, b, length, double, MIN_OP);
1237   } else if (*datatype == MPI_LONG_DOUBLE) {
1238     APPLY_FUNC(a, b, length, long double, MIN_OP);
1239   }
1240 }
1241
1242 static void sum_func(void *a, void *b, int *length, MPI_Datatype * datatype)
1243 {
1244   if (*datatype == MPI_CHAR) {
1245     APPLY_FUNC(a, b, length, char, SUM_OP);
1246   } else if (*datatype == MPI_SHORT) {
1247     APPLY_FUNC(a, b, length, short, SUM_OP);
1248   } else if (*datatype == MPI_INT) {
1249     APPLY_FUNC(a, b, length, int, SUM_OP);
1250   } else if (*datatype == MPI_LONG) {
1251     APPLY_FUNC(a, b, length, long, SUM_OP);
1252   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_SHORT) {
1253     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned short, SUM_OP);
1254   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED) {
1255     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned int, SUM_OP);
1256   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_LONG) {
1257     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned long, SUM_OP);
1258   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_CHAR) {
1259     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned char, SUM_OP);
1260   } else if (*datatype == MPI_FLOAT) {
1261     APPLY_FUNC(a, b, length, float, SUM_OP);
1262   } else if (*datatype == MPI_DOUBLE) {
1263     APPLY_FUNC(a, b, length, double, SUM_OP);
1264   } else if (*datatype == MPI_LONG_DOUBLE) {
1265     APPLY_FUNC(a, b, length, long double, SUM_OP);
1266   } else if (*datatype == MPI_C_FLOAT_COMPLEX) {
1267     APPLY_FUNC(a, b, length, float _Complex, SUM_OP);
1268   } else if (*datatype == MPI_C_DOUBLE_COMPLEX) {
1269     APPLY_FUNC(a, b, length, double _Complex, SUM_OP);
1270   } else if (*datatype == MPI_C_LONG_DOUBLE_COMPLEX) {
1271     APPLY_FUNC(a, b, length, long double _Complex, SUM_OP);
1272   }
1273 }
1274
1275 static void prod_func(void *a, void *b, int *length, MPI_Datatype * datatype)
1276 {
1277   if (*datatype == MPI_CHAR) {
1278     APPLY_FUNC(a, b, length, char, PROD_OP);
1279   } else if (*datatype == MPI_SHORT) {
1280     APPLY_FUNC(a, b, length, short, PROD_OP);
1281   } else if (*datatype == MPI_INT) {
1282     APPLY_FUNC(a, b, length, int, PROD_OP);
1283   } else if (*datatype == MPI_LONG) {
1284     APPLY_FUNC(a, b, length, long, PROD_OP);
1285   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_SHORT) {
1286     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned short, PROD_OP);
1287   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED) {
1288     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned int, PROD_OP);
1289   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_LONG) {
1290     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned long, PROD_OP);
1291   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_CHAR) {
1292     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned char, PROD_OP);
1293   } else if (*datatype == MPI_FLOAT) {
1294     APPLY_FUNC(a, b, length, float, PROD_OP);
1295   } else if (*datatype == MPI_DOUBLE) {
1296     APPLY_FUNC(a, b, length, double, PROD_OP);
1297   } else if (*datatype == MPI_LONG_DOUBLE) {
1298     APPLY_FUNC(a, b, length, long double, PROD_OP);
1299   } else if (*datatype == MPI_C_FLOAT_COMPLEX) {
1300     APPLY_FUNC(a, b, length, float _Complex, PROD_OP);
1301   } else if (*datatype == MPI_C_DOUBLE_COMPLEX) {
1302     APPLY_FUNC(a, b, length, double _Complex, PROD_OP);
1303   } else if (*datatype == MPI_C_LONG_DOUBLE_COMPLEX) {
1304     APPLY_FUNC(a, b, length, long double _Complex, PROD_OP);
1305   }
1306 }
1307
1308 static void land_func(void *a, void *b, int *length, MPI_Datatype * datatype)
1309 {
1310   if (*datatype == MPI_CHAR) {
1311     APPLY_FUNC(a, b, length, char, LAND_OP);
1312   } else if (*datatype == MPI_SHORT) {
1313     APPLY_FUNC(a, b, length, short, LAND_OP);
1314   } else if (*datatype == MPI_INT) {
1315     APPLY_FUNC(a, b, length, int, LAND_OP);
1316   } else if (*datatype == MPI_LONG) {
1317     APPLY_FUNC(a, b, length, long, LAND_OP);
1318   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_SHORT) {
1319     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned short, LAND_OP);
1320   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED) {
1321     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned int, LAND_OP);
1322   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_LONG) {
1323     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned long, LAND_OP);
1324   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_CHAR) {
1325     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned char, LAND_OP);
1326   } else if (*datatype == MPI_C_BOOL) {
1327     APPLY_FUNC(a, b, length, bool, LAND_OP);
1328   }
1329 }
1330
1331 static void lor_func(void *a, void *b, int *length, MPI_Datatype * datatype)
1332 {
1333   if (*datatype == MPI_CHAR) {
1334     APPLY_FUNC(a, b, length, char, LOR_OP);
1335   } else if (*datatype == MPI_SHORT) {
1336     APPLY_FUNC(a, b, length, short, LOR_OP);
1337   } else if (*datatype == MPI_INT) {
1338     APPLY_FUNC(a, b, length, int, LOR_OP);
1339   } else if (*datatype == MPI_LONG) {
1340     APPLY_FUNC(a, b, length, long, LOR_OP);
1341   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_SHORT) {
1342     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned short, LOR_OP);
1343   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED) {
1344     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned int, LOR_OP);
1345   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_LONG) {
1346     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned long, LOR_OP);
1347   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_CHAR) {
1348     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned char, LOR_OP);
1349   } else if (*datatype == MPI_C_BOOL) {
1350     APPLY_FUNC(a, b, length, bool, LOR_OP);
1351   }
1352 }
1353
1354 static void lxor_func(void *a, void *b, int *length, MPI_Datatype * datatype)
1355 {
1356   if (*datatype == MPI_CHAR) {
1357     APPLY_FUNC(a, b, length, char, LXOR_OP);
1358   } else if (*datatype == MPI_SHORT) {
1359     APPLY_FUNC(a, b, length, short, LXOR_OP);
1360   } else if (*datatype == MPI_INT) {
1361     APPLY_FUNC(a, b, length, int, LXOR_OP);
1362   } else if (*datatype == MPI_LONG) {
1363     APPLY_FUNC(a, b, length, long, LXOR_OP);
1364   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_SHORT) {
1365     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned short, LXOR_OP);
1366   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED) {
1367     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned int, LXOR_OP);
1368   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_LONG) {
1369     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned long, LXOR_OP);
1370   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_CHAR) {
1371     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned char, LXOR_OP);
1372   } else if (*datatype == MPI_C_BOOL) {
1373     APPLY_FUNC(a, b, length, bool, LXOR_OP);
1374   }
1375 }
1376
1377 static void band_func(void *a, void *b, int *length, MPI_Datatype * datatype)
1378 {
1379   if (*datatype == MPI_CHAR) {
1380     APPLY_FUNC(a, b, length, char, BAND_OP);
1381   }else if (*datatype == MPI_SHORT) {
1382     APPLY_FUNC(a, b, length, short, BAND_OP);
1383   } else if (*datatype == MPI_INT) {
1384     APPLY_FUNC(a, b, length, int, BAND_OP);
1385   } else if (*datatype == MPI_LONG) {
1386     APPLY_FUNC(a, b, length, long, BAND_OP);
1387   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_SHORT) {
1388     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned short, BAND_OP);
1389   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED) {
1390     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned int, BAND_OP);
1391   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_LONG) {
1392     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned long, BAND_OP);
1393   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_CHAR) {
1394     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned char, BAND_OP);
1395   } else if (*datatype == MPI_BYTE) {
1396     APPLY_FUNC(a, b, length, uint8_t, BAND_OP);
1397   }
1398 }
1399
1400 static void bor_func(void *a, void *b, int *length, MPI_Datatype * datatype)
1401 {
1402   if (*datatype == MPI_CHAR) {
1403     APPLY_FUNC(a, b, length, char, BOR_OP);
1404   } else if (*datatype == MPI_SHORT) {
1405     APPLY_FUNC(a, b, length, short, BOR_OP);
1406   } else if (*datatype == MPI_INT) {
1407     APPLY_FUNC(a, b, length, int, BOR_OP);
1408   } else if (*datatype == MPI_LONG) {
1409     APPLY_FUNC(a, b, length, long, BOR_OP);
1410   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_SHORT) {
1411     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned short, BOR_OP);
1412   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED) {
1413     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned int, BOR_OP);
1414   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_LONG) {
1415     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned long, BOR_OP);
1416   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_CHAR) {
1417     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned char, BOR_OP);
1418   } else if (*datatype == MPI_BYTE) {
1419     APPLY_FUNC(a, b, length, uint8_t, BOR_OP);
1420   }
1421 }
1422
1423 static void bxor_func(void *a, void *b, int *length, MPI_Datatype * datatype)
1424 {
1425   if (*datatype == MPI_CHAR) {
1426     APPLY_FUNC(a, b, length, char, BXOR_OP);
1427   } else if (*datatype == MPI_SHORT) {
1428     APPLY_FUNC(a, b, length, short, BXOR_OP);
1429   } else if (*datatype == MPI_INT) {
1430     APPLY_FUNC(a, b, length, int, BXOR_OP);
1431   } else if (*datatype == MPI_LONG) {
1432     APPLY_FUNC(a, b, length, long, BXOR_OP);
1433   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_SHORT) {
1434     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned short, BXOR_OP);
1435   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED) {
1436     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned int, BXOR_OP);
1437   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_LONG) {
1438     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned long, BXOR_OP);
1439   } else if (*datatype == MPI_UNSIGNED_CHAR) {
1440     APPLY_FUNC(a, b, length, unsigned char, BXOR_OP);
1441   } else if (*datatype == MPI_BYTE) {
1442     APPLY_FUNC(a, b, length, uint8_t, BXOR_OP);
1443   }
1444 }
1445
1446 static void minloc_func(void *a, void *b, int *length, MPI_Datatype * datatype)
1447 {
1448   if (*datatype == MPI_FLOAT_INT) {
1449     APPLY_FUNC(a, b, length, float_int, MINLOC_OP);
1450   } else if (*datatype == MPI_LONG_INT) {
1451     APPLY_FUNC(a, b, length, long_int, MINLOC_OP);
1452   } else if (*datatype == MPI_DOUBLE_INT) {
1453     APPLY_FUNC(a, b, length, double_int, MINLOC_OP);
1454   } else if (*datatype == MPI_SHORT_INT) {
1455     APPLY_FUNC(a, b, length, short_int, MINLOC_OP);
1456   } else if (*datatype == MPI_2LONG) {
1457     APPLY_FUNC(a, b, length, long_long, MINLOC_OP);
1458   } else if (*datatype == MPI_2INT) {
1459     APPLY_FUNC(a, b, length, int_int, MINLOC_OP);
1460   } else if (*datatype == MPI_LONG_DOUBLE_INT) {
1461     APPLY_FUNC(a, b, length, long_double_int, MINLOC_OP);
1462   } else if (*datatype == MPI_2FLOAT) {
1463     APPLY_FUNC(a, b, length, float_float, MINLOC_OP);
1464   } else if (*datatype == MPI_2DOUBLE) {
1465     APPLY_FUNC(a, b, length, double_double, MINLOC_OP);
1466   }
1467 }
1468
1469 static void maxloc_func(void *a, void *b, int *length, MPI_Datatype * datatype)
1470 {
1471   if (*datatype == MPI_FLOAT_INT) {
1472     APPLY_FUNC(a, b, length, float_int, MAXLOC_OP);
1473   } else if (*datatype == MPI_LONG_INT) {
1474     APPLY_FUNC(a, b, length, long_int, MAXLOC_OP);
1475   } else if (*datatype == MPI_DOUBLE_INT) {
1476     APPLY_FUNC(a, b, length, double_int, MAXLOC_OP);
1477   } else if (*datatype == MPI_SHORT_INT) {
1478     APPLY_FUNC(a, b, length, short_int, MAXLOC_OP);
1479   } else if (*datatype == MPI_2LONG) {
1480     APPLY_FUNC(a, b, length, long_long, MAXLOC_OP);
1481   } else if (*datatype == MPI_2INT) {
1482     APPLY_FUNC(a, b, length, int_int, MAXLOC_OP);
1483   } else if (*datatype == MPI_LONG_DOUBLE_INT) {
1484     APPLY_FUNC(a, b, length, long_double_int, MAXLOC_OP);
1485   } else if (*datatype == MPI_2FLOAT) {
1486     APPLY_FUNC(a, b, length, float_float, MAXLOC_OP);
1487   } else if (*datatype == MPI_2DOUBLE) {
1488     APPLY_FUNC(a, b, length, double_double, MAXLOC_OP);
1489   }
1490 }
1491
1492 static void replace_func(void *a, void *b, int *length, MPI_Datatype * datatype)
1493 {
1494   memcpy(b, a, *length * smpi_datatype_size(*datatype));
1495 }
1496
1497 #define CREATE_MPI_OP(name, func)                             \
1498   static s_smpi_mpi_op_t mpi_##name = { &(func) /* func */, true }; \
1499 MPI_Op name = &mpi_##name;
1500
1501 CREATE_MPI_OP(MPI_MAX, max_func);
1502 CREATE_MPI_OP(MPI_MIN, min_func);
1503 CREATE_MPI_OP(MPI_SUM, sum_func);
1504 CREATE_MPI_OP(MPI_PROD, prod_func);
1505 CREATE_MPI_OP(MPI_LAND, land_func);
1506 CREATE_MPI_OP(MPI_LOR, lor_func);
1507 CREATE_MPI_OP(MPI_LXOR, lxor_func);
1508 CREATE_MPI_OP(MPI_BAND, band_func);
1509 CREATE_MPI_OP(MPI_BOR, bor_func);
1510 CREATE_MPI_OP(MPI_BXOR, bxor_func);
1511 CREATE_MPI_OP(MPI_MAXLOC, maxloc_func);
1512 CREATE_MPI_OP(MPI_MINLOC, minloc_func);
1513 CREATE_MPI_OP(MPI_REPLACE, replace_func);
1514
1515 MPI_Op smpi_op_new(MPI_User_function * function, int commute)
1516 {
1517   MPI_Op op;
1518   op = xbt_new(s_smpi_mpi_op_t, 1);
1519   op->func = function;
1520   op-> is_commute = commute;
1521   return op;
1522 }
1523
1524 int smpi_op_is_commute(MPI_Op op)
1525 {
1526   return (op==MPI_OP_NULL) ? 1 : op-> is_commute;
1527 }
1528
1529 void smpi_op_destroy(MPI_Op op)
1530 {
1531   xbt_free(op);
1532 }
1533
1534 void smpi_op_apply(MPI_Op op, void *invec, void *inoutvec, int *len, MPI_Datatype * datatype)
1535 {
1536   if(op==MPI_OP_NULL)
1537     return;
1538
1539   if(smpi_privatize_global_variables){//we need to switch as the called function may silently touch global variables
1540     XBT_DEBUG("Applying operation, switch to the right data frame ");
1541     smpi_switch_data_segment(smpi_process_index());
1542   }
1543
1544   if(!smpi_process_get_replaying())
1545   op->func(invec, inoutvec, len, datatype);
1546 }
1547
1548 int smpi_type_attr_delete(MPI_Datatype type, int keyval){
1549   smpi_type_key_elem elem =
1550     static_cast<smpi_type_key_elem>(xbt_dict_get_or_null_ext(smpi_type_keyvals, (const char*)&keyval, sizeof(int)));
1551   if(!elem)
1552     return MPI_ERR_ARG;
1553   if(elem->delete_fn!=MPI_NULL_DELETE_FN){
1554     void * value;
1555     int flag;
1556     if(smpi_type_attr_get(type, keyval, &value, &flag)==MPI_SUCCESS){
1557       int ret = elem->delete_fn(type, keyval, value, &flag);
1558       if(ret!=MPI_SUCCESS) return ret;
1559     }
1560   }
1561   if(type->attributes==NULL)
1562     return MPI_ERR_ARG;
1563
1564   xbt_dict_remove_ext(type->attributes, (const char*)&keyval, sizeof(int));
1565   return MPI_SUCCESS;
1566 }
1567
1568 int smpi_type_attr_get(MPI_Datatype type, int keyval, void* attr_value, int* flag){
1569   smpi_type_key_elem elem =
1570     static_cast<smpi_type_key_elem>(xbt_dict_get_or_null_ext(smpi_type_keyvals, (const char*)&keyval, sizeof(int)));
1571   if(!elem)
1572     return MPI_ERR_ARG;
1573   xbt_ex_t ex;
1574   if(type->attributes==NULL){
1575     *flag=0;
1576     return MPI_SUCCESS;
1577   }
1578   TRY {
1579     *(void**)attr_value = xbt_dict_get_ext(type->attributes, (const char*)&keyval, sizeof(int));
1580     *flag=1;
1581   }
1582   CATCH(ex) {
1583     *flag=0;
1584     xbt_ex_free(ex);
1585   }
1586   return MPI_SUCCESS;
1587 }
1588
1589 int smpi_type_attr_put(MPI_Datatype type, int keyval, void* attr_value){
1590   if(!smpi_type_keyvals)
1591   smpi_type_keyvals = xbt_dict_new();
1592   smpi_type_key_elem elem =
1593      static_cast<smpi_type_key_elem>(xbt_dict_get_or_null_ext(smpi_type_keyvals, (const char*)&keyval, sizeof(int)));
1594   if(!elem )
1595     return MPI_ERR_ARG;
1596   int flag;
1597   void* value;
1598   smpi_type_attr_get(type, keyval, &value, &flag);
1599   if(flag && elem->delete_fn!=MPI_NULL_DELETE_FN){
1600     int ret = elem->delete_fn(type, keyval, value, &flag);
1601     if(ret!=MPI_SUCCESS) return ret;
1602   }
1603   if(type->attributes==NULL)
1604     type->attributes=xbt_dict_new();
1605
1606   xbt_dict_set_ext(type->attributes, (const char*)&keyval, sizeof(int), attr_value, NULL);
1607   return MPI_SUCCESS;
1608 }
1609
1610 int smpi_type_keyval_create(MPI_Type_copy_attr_function* copy_fn, MPI_Type_delete_attr_function* delete_fn, int* keyval,
1611                             void* extra_state){
1612   if(!smpi_type_keyvals)
1613   smpi_type_keyvals = xbt_dict_new();
1614
1615   smpi_type_key_elem value = (smpi_type_key_elem) xbt_new0(s_smpi_mpi_type_key_elem_t,1);
1616
1617   value->copy_fn=copy_fn;
1618   value->delete_fn=delete_fn;
1619
1620   *keyval = type_keyval_id;
1621   xbt_dict_set_ext(smpi_type_keyvals,(const char*)keyval, sizeof(int),(void*)value, NULL);
1622   type_keyval_id++;
1623   return MPI_SUCCESS;
1624 }
1625
1626 int smpi_type_keyval_free(int* keyval){
1627   smpi_type_key_elem elem =
1628     static_cast<smpi_type_key_elem>(xbt_dict_get_or_null_ext(smpi_type_keyvals, (const char*)keyval, sizeof(int)));
1629   if(!elem){
1630     return MPI_ERR_ARG;
1631   }
1632   xbt_dict_remove_ext(smpi_type_keyvals, (const char*)keyval, sizeof(int));
1633   xbt_free(elem);
1634   return MPI_SUCCESS;
1635 }
1636
1637 int smpi_mpi_pack(void* inbuf, int incount, MPI_Datatype type, void* outbuf, int outcount, int* position,MPI_Comm comm){
1638   size_t size = smpi_datatype_size(type);
1639   if (outcount - *position < incount*static_cast<int>(size))
1640     return MPI_ERR_BUFFER;
1641   smpi_datatype_copy(inbuf, incount, type, (char*)outbuf + *position, outcount, MPI_CHAR);
1642   *position += incount * size;
1643   return MPI_SUCCESS;
1644 }
1645
1646 int smpi_mpi_unpack(void* inbuf, int insize, int* position, void* outbuf, int outcount, MPI_Datatype type,MPI_Comm comm){
1647   int size = static_cast<int>(smpi_datatype_size(type));
1648   if (outcount*size> insize)
1649     return MPI_ERR_BUFFER;
1650   smpi_datatype_copy((char*)inbuf + *position, insize, MPI_CHAR, outbuf, outcount, type);
1651   *position += outcount * size;
1652   return MPI_SUCCESS;
1653 }