src/smpi/internals/smpi_utils.cpp

   1 /* Copyright (c) 2016-2021. The SimGrid Team.
   2  * All rights reserved.                                                     */
   3
   4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   6
   7 #include "smpi_utils.hpp"
   8
   9 #include "src/surf/xml/platf_private.hpp"
  10 #include "xbt/log.h"
  11 #include "xbt/parse_units.hpp"
  12 #include "xbt/sysdep.h"
  13 #include "xbt/file.hpp"
  14 #include <boost/tokenizer.hpp>
  15 #include "smpi_config.hpp"
  16 #include "src/simix/smx_private.hpp"
  17 #include <algorithm>
  18 #include "private.hpp"
  19
  20 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_utils, smpi, "Logging specific to SMPI (utils)");
  21
  22 extern std::string surf_parsed_filename;
  23 extern int surf_parse_lineno;
  24
  25 namespace simgrid {
  26 namespace smpi {
  27 namespace utils {
  28
  29 double total_benched_time=0;
  30 unsigned long total_malloc_size=0;
  31 unsigned long total_shared_size=0;
  32 unsigned int total_shared_calls=0;
  33 struct alloc_metadata_t {
  34   size_t size          = 0;
  35   unsigned int numcall = 0;
  36   int line             = 0;
  37   std::string file;
  38 };
  39
  40 struct current_buffer_metadata_t {
  41   alloc_metadata_t alloc;
  42   std::string name;
  43 };
  44
  45 alloc_metadata_t max_malloc;
  46 F2C* current_handle = nullptr;
  47 current_buffer_metadata_t current_buffer1;
  48 current_buffer_metadata_t current_buffer2;
  49
  50 std::unordered_map<const void*, alloc_metadata_t> allocs;
  51
  52 std::vector<s_smpi_factor_t> parse_factor(const std::string& smpi_coef_string)
  53 {
  54   std::vector<s_smpi_factor_t> smpi_factor;
  55
  56   /** Setup the tokenizer that parses the string **/
  57   using Tokenizer = boost::tokenizer<boost::char_separator<char>>;
  58   boost::char_separator<char> sep(";");
  59   boost::char_separator<char> factor_separator(":");
  60   Tokenizer tokens(smpi_coef_string, sep);
  61
  62   /**
  63    * Iterate over patterns like A:B:C:D;E:F;G:H
  64    * These will be broken down into:
  65    * A --> B, C, D
  66    * E --> F
  67    * G --> H
  68    */
  69   for (Tokenizer::iterator token_iter = tokens.begin(); token_iter != tokens.end(); ++token_iter) {
  70     XBT_DEBUG("token : %s", token_iter->c_str());
  71     Tokenizer factor_values(*token_iter, factor_separator);
  72     s_smpi_factor_t fact;
  73     xbt_assert(factor_values.begin() != factor_values.end(), "Malformed radical for smpi factor: '%s'",
  74                smpi_coef_string.c_str());
  75     unsigned int iteration = 0;
  76     for (Tokenizer::iterator factor_iter = factor_values.begin(); factor_iter != factor_values.end(); ++factor_iter) {
  77       iteration++;
  78
  79       if (factor_iter == factor_values.begin()) { /* first element */
  80         try {
  81           fact.factor = std::stoi(*factor_iter);
  82         } catch (const std::invalid_argument&) {
  83           throw std::invalid_argument(std::string("Invalid factor in chunk ") + std::to_string(smpi_factor.size() + 1) +
  84                                       ": " + *factor_iter);
  85         }
  86       } else {
  87         try {
  88           fact.values.push_back(xbt_parse_get_time(surf_parsed_filename, surf_parse_lineno, *factor_iter, ""));
  89         } catch (const std::invalid_argument&) {
  90           throw std::invalid_argument(std::string("Invalid factor value ") + std::to_string(iteration) + " in chunk " +
  91                                       std::to_string(smpi_factor.size() + 1) + ": " + *factor_iter);
  92         }
  93       }
  94     }
  95
  96     smpi_factor.push_back(fact);
  97     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%zu : %zu values, first: %f", fact.factor, smpi_factor.size(), fact.values[0]);
  98   }
  99   std::sort(smpi_factor.begin(), smpi_factor.end(), [](const s_smpi_factor_t &pa, const s_smpi_factor_t &pb) {
 100     return (pa.factor < pb.factor);
 101   });
 102   for (auto const& fact : smpi_factor) {
 103     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%zu : %zu values, first: %f", fact.factor, smpi_factor.size() ,fact.values[0]);
 104   }
 105   smpi_factor.shrink_to_fit();
 106
 107   return smpi_factor;
 108 }
 109
 110 void add_benched_time(double time){
 111   total_benched_time += time;
 112 }
 113
 114 void account_malloc_size(size_t size, const std::string& file, int line, void* ptr)
 115 {
 116   if (smpi_cfg_display_alloc()) {
 117     alloc_metadata_t metadata;
 118     metadata.size = size;
 119     metadata.line = line;
 120     metadata.numcall = 1;
 121     metadata.file    = file;
 122     allocs.emplace(ptr, metadata);
 123
 124     total_malloc_size += size;
 125     if(size > max_malloc.size){
 126       max_malloc.size = size;
 127       max_malloc.line = line;
 128       max_malloc.numcall = 1;
 129       max_malloc.file    = file;
 130     } else if (size == max_malloc.size && max_malloc.line == line && max_malloc.file == file) {
 131       max_malloc.numcall++;
 132     }
 133   }
 134 }
 135
 136 void account_shared_size(size_t size){
 137   if (smpi_cfg_display_alloc()) {
 138     total_shared_size += size;
 139     total_shared_calls++;
 140   }
 141 }
 142
 143 void print_time_analysis(double global_time){
 144   if (simgrid::config::get_value<bool>("smpi/display-timing")) {
 145     XBT_INFO("Simulated time: %g seconds. \n\n"
 146              "The simulation took %g seconds (after parsing and platform setup)\n"
 147              "%g seconds were actual computation of the application",
 148              simgrid_get_clock(), global_time, total_benched_time);
 149     if (total_benched_time/global_time>=0.75)
 150       XBT_INFO("More than 75%% of the time was spent inside the application code.\n"
 151     "You may want to use sampling functions or trace replay to reduce this.");
 152   }
 153 }
 154
 155 static void print_leaked_handles(){
 156   // Put the leaked non-default handles in a vector to sort them by id
 157   std::vector<std::pair<unsigned int, smpi::F2C*>> handles;
 158   if (simgrid::smpi::F2C::lookup() != nullptr)
 159     std::copy_if(simgrid::smpi::F2C::lookup()->begin(), simgrid::smpi::F2C::lookup()->end(),
 160                  std::back_inserter(handles),
 161                  [](auto const& entry) { return entry.first >= simgrid::smpi::F2C::get_num_default_handles(); });
 162   if (not handles.empty()) {
 163     auto max = static_cast<unsigned long>(simgrid::config::get_value<int>("smpi/list-leaks"));
 164     std::string message = "Probable memory leaks in your code: SMPI detected %zu unfreed MPI handles :";
 165     if(max==0)
 166       message +="\nHINT : Display types and addresses (n max) with --cfg=smpi/list-leaks:n.\n"\
 167                 "Running smpirun with -wrapper \"valgrind --leak-check=full\" can provide more information";
 168     XBT_INFO(message.c_str(), handles.size());
 169     if (max > 0) { // we cannot trust F2C::lookup()->size() > F2C::get_num_default_handles() because some default
 170                    // handles are already freed at this point
 171       bool display_advice = false;
 172       std::map<std::string, int, std::less<>> count;
 173       for (const auto& elem : handles) {
 174         std::string key = elem.second->name();
 175         if ((not xbt_log_no_loc) && (not elem.second->call_location().empty()))
 176           key+=" at "+ elem.second->call_location();
 177         else
 178           display_advice=true;
 179         auto result = count.emplace(key, 1);
 180         if (result.second == false)
 181           result.first->second++;
 182       }
 183       if (display_advice)
 184         XBT_WARN("To get more information (location of allocations), compile your code with -trace-call-location flag of smpicc/f90");
 185       unsigned int i = 0;
 186       for (const auto& p : count) {
 187         if(p.second == 1)
 188           XBT_INFO("leaked handle of type %s", p.first.c_str());
 189         else
 190           XBT_INFO("%d leaked handles of type %s", p.second, p.first.c_str());
 191         i++;
 192         if(i == max)
 193           break;
 194       }
 195       if (max < count.size())
 196         XBT_INFO("(%lu more handle leaks hidden as you wanted to see only %lu of them)", count.size()-max, max);
 197     }
 198   }
 199 }
 200
 201 static void print_leaked_buffers(){
 202   if (not allocs.empty()) {
 203     auto max = static_cast<unsigned long>(simgrid::config::get_value<int>("smpi/list-leaks"));
 204     std::string message = "Probable memory leaks in your code: SMPI detected %zu unfreed buffers :";
 205     if(max==0)
 206       message +="display types and addresses (n max) with --cfg=smpi/list-leaks:n.\nRunning smpirun with -wrapper \"valgrind --leak-check=full\" can provide more information";
 207     XBT_INFO(message.c_str(), allocs.size());
 208
 209     if (max > 0) {
 210       //gather by allocation origin (only one group reported in case of no-loc or if trace-call-location is not used)
 211       struct buff_leak{
 212         int count;
 213         size_t total_size;
 214         size_t min_size;
 215         size_t max_size;
 216       };
 217       std::map<std::string, struct buff_leak, std::less<>> leaks_aggreg;
 218       for (const auto& elem : allocs) {
 219         std::string key = "leaked allocations";
 220         if (not xbt_log_no_loc)
 221           key=elem.second.file+":"+std::to_string(elem.second.line)+" : "+key;
 222         auto result = leaks_aggreg.emplace(key, buff_leak{1, elem.second.size, elem.second.size, elem.second.size});
 223         if (result.second == false){
 224           result.first->second.count ++;
 225           result.first->second.total_size += elem.second.size;
 226           if(elem.second.size > result.first->second.max_size)
 227             result.first->second.max_size = elem.second.size;
 228           else if (elem.second.size < result.first->second.min_size)
 229             result.first->second.min_size = elem.second.size;
 230         }
 231       }
 232       //now we can order by total size.
 233       std::vector<std::pair<std::string, buff_leak>> leaks(leaks_aggreg.begin(), leaks_aggreg.end());
 234       std::sort(leaks.begin(), leaks.end(), [](auto const& a, auto const& b) { return a.second.total_size > b.second.total_size; });
 235
 236       unsigned int i =0;
 237       for (const auto& p : leaks) {
 238         if(p.second.min_size == p.second.max_size)
 239           XBT_INFO("%s of total size %zu, called %d times, each with size %zu",
 240                   p.first.c_str(),p.second.total_size,p.second.count,p.second.min_size);
 241         else
 242           XBT_INFO("%s of total size %zu, called %d times, with minimum size %zu and maximum size %zu",
 243                   p.first.c_str(),p.second.total_size,p.second.count,p.second.min_size,p.second.max_size);
 244         i++;
 245         if(i == max)
 246           break;
 247       }
 248       if (max < leaks_aggreg.size())
 249         XBT_INFO("(more buffer leaks hidden as you wanted to see only %lu of them)", max);
 250     }
 251   }
 252 }
 253
 254 void print_memory_analysis()
 255 {
 256   if (smpi_cfg_display_alloc()) {
 257     print_leaked_handles();
 258     print_leaked_buffers();
 259
 260     if(total_malloc_size != 0)
 261       XBT_INFO("Memory Usage: Simulated application allocated %lu bytes during its lifetime through malloc/calloc calls.\n"
 262              "Largest allocation at once from a single process was %zu bytes, at %s:%d. It was called %u times during the whole simulation.\n"
 263              "If this is too much, consider sharing allocations for computation buffers.\n"
 264              "This can be done automatically by setting --cfg=smpi/auto-shared-malloc-thresh to the minimum size wanted size (this can alter execution if data content is necessary)\n",
 265              total_malloc_size, max_malloc.size, simgrid::xbt::Path(max_malloc.file).get_base_name().c_str(), max_malloc.line, max_malloc.numcall
 266       );
 267     else
 268       XBT_INFO("Allocations analysis asked, but 0 bytes were allocated through malloc/calloc calls intercepted by SMPI.\n"
 269                "Either code is using other ways of allocating memory, or it was built with SMPI_NO_OVERRIDE_MALLOC");
 270     if(total_shared_size != 0)
 271       XBT_INFO("%lu bytes were automatically shared between processes, in %u calls\n", total_shared_size, total_shared_calls);
 272   }
 273 }
 274
 275 void set_current_handle(F2C* handle){
 276   current_handle=handle;
 277 }
 278
 279 void print_current_handle(){
 280   if(current_handle){
 281     if(current_handle->call_location().empty())
 282       XBT_INFO("To get handle location information, pass -trace-call-location flag to smpicc/f90 as well");
 283     else
 284       XBT_INFO("Handle %s was allocated by a call at %s", current_handle->name().c_str(),
 285                (char*)(current_handle->call_location().c_str()));
 286   }
 287 }
 288
 289 void set_current_buffer(int i, const char* name, const void* buf){
 290   //clear previous one
 291   if(i==1){
 292     if(not current_buffer1.name.empty()){
 293       current_buffer1.name="";
 294     }
 295     if(not current_buffer2.name.empty()){
 296       current_buffer2.name="";
 297     }
 298   }
 299   auto meta = allocs.find(buf);
 300   if (meta == allocs.end()) {
 301     XBT_DEBUG("Buffer %p was not allocated with malloc/calloc", buf);
 302     return;
 303   }
 304   if(i==1){
 305     current_buffer1.alloc = meta->second;
 306     current_buffer1.name = name;
 307   }else{
 308     current_buffer2.alloc=meta->second;
 309     current_buffer2.name=name;
 310   }
 311 }
 312
 313 void print_buffer_info(){
 314     if(not current_buffer1.name.empty())
 315       XBT_INFO("Buffer %s was allocated from %s line %d, with size %zu", current_buffer1.name.c_str(), current_buffer1.alloc.file.c_str(), current_buffer1.alloc.line, current_buffer1.alloc.size);
 316     if(not current_buffer2.name.empty())
 317       XBT_INFO("Buffer %s was allocated from %s line %d, with size %zu", current_buffer2.name.c_str(), current_buffer2.alloc.file.c_str(), current_buffer2.alloc.line, current_buffer2.alloc.size);
 318 }
 319
 320 size_t get_buffer_size(const void* buf){
 321   auto meta = allocs.find(buf);
 322   if (meta == allocs.end()) {
 323     //we don't know this buffer (on stack or feature disabled), assume it's fine.
 324     return  std::numeric_limits<std::size_t>::max();
 325   }
 326   return meta->second.size;
 327 }
 328
 329 void account_free(const void* ptr){
 330   if (smpi_cfg_display_alloc()) {
 331     allocs.erase(ptr);
 332   }
 333 }
 334
 335 }
 336 }
 337 } // namespace simgrid