Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Public GIT Repository
transfer some parts of the initialization from SIMIX_global_init to EngineImpl::initi...
[simgrid.git] / src / smpi / internals / smpi_global.cpp
1 /* Copyright (c) 2007-2021. The SimGrid Team. All rights reserved.          */
2
3 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
4  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
5
6 #include "mc/mc.h"
7 #include "simgrid/plugins/file_system.h"
8 #include "simgrid/s4u/Engine.hpp"
9 #include "smpi_coll.hpp"
10 #include "smpi_config.hpp"
11 #include "smpi_f2c.hpp"
12 #include "smpi_host.hpp"
13 #include "src/kernel/EngineImpl.hpp"
14 #include "src/kernel/activity/CommImpl.hpp"
15 #include "src/simix/smx_private.hpp"
16 #include "src/smpi/include/smpi_actor.hpp"
17 #include "xbt/config.hpp"
18 #include "xbt/file.hpp"
19
20 #include <algorithm>
21 #include <array>
22 #include <boost/algorithm/string.hpp> /* split */
23 #include <boost/tokenizer.hpp>
24 #include <cerrno>
25 #include <cinttypes>
26 #include <cstdint> /* intmax_t */
27 #include <cstring> /* strerror */
28 #include <dlfcn.h>
29 #include <fcntl.h>
30 #include <fstream>
31 #include <sys/stat.h>
32
33 #if SG_HAVE_SENDFILE
34 #include <sys/sendfile.h>
35 #endif
36
37 #if HAVE_PAPI
38 #include "papi.h"
39 #endif
40
41 #if not defined(__APPLE__) && not defined(__HAIKU__)
42 #include <link.h>
43 #endif
44
45 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_kernel, smpi, "Logging specific to SMPI (kernel)");
46
47 #if SMPI_IFORT
48   extern "C" void for_rtl_init_ (int *, char **);
49   extern "C" void for_rtl_finish_ ();
50 #elif SMPI_FLANG
51   extern "C" void __io_set_argc(int);
52   extern "C" void __io_set_argv(char **);
53 #elif SMPI_GFORTRAN
54   extern "C" void _gfortran_set_args(int, char **);
55 #endif
56
57 /* RTLD_DEEPBIND is a bad idea of GNU ld that obviously does not exist on other platforms
58  * See https://www.akkadia.org/drepper/dsohowto.pdf
59  * and https://lists.freebsd.org/pipermail/freebsd-current/2016-March/060284.html
60 */
61 #if !RTLD_DEEPBIND || HAVE_SANITIZER_ADDRESS || HAVE_SANITIZER_THREAD
62 #define WANT_RTLD_DEEPBIND 0
63 #else
64 #define WANT_RTLD_DEEPBIND RTLD_DEEPBIND
65 #endif
66
67 #if HAVE_PAPI
68 std::map</* computation unit name */ std::string, papi_process_data, std::less<>> units2papi_setup;
69 #endif
70
71 std::unordered_map<std::string, double> location2speedup;
72
73 static int smpi_exit_status = 0;
74 xbt_os_timer_t global_timer;
75 static std::vector<std::string> privatize_libs_paths;
76
77 // No instance gets manually created; check also the smpirun.in script as
78 // this default name is used there as well (when the <actor> tag is generated).
79 static const std::string smpi_default_instance_name("smpirun");
80
81 static simgrid::config::Flag<std::string>
82     smpi_hostfile("smpi/hostfile",
83                   "Classical MPI hostfile containing list of machines to dispatch "
84                   "the processes, one per line",
85                   "");
86
87 static simgrid::config::Flag<std::string> smpi_replay("smpi/replay",
88                                                       "Replay a trace instead of executing the application", "");
89
90 static simgrid::config::Flag<int> smpi_np("smpi/np", "Number of processes to be created", 0);
91
92 static simgrid::config::Flag<int> smpi_map("smpi/map", "Display the mapping between nodes and processes", 0);
93
94 void (*smpi_comm_copy_data_callback)(simgrid::kernel::activity::CommImpl*, void*,
95                                      size_t) = &smpi_comm_copy_buffer_callback;
96
97 simgrid::smpi::ActorExt* smpi_process()
98 {
99   simgrid::s4u::ActorPtr me = simgrid::s4u::Actor::self();
100
101   if (me == nullptr) // This happens sometimes (eg, when linking against NS3 because it pulls openMPI...)
102     return nullptr;
103
104   return me->extension<simgrid::smpi::ActorExt>();
105 }
106
107 simgrid::smpi::ActorExt* smpi_process_remote(simgrid::s4u::ActorPtr actor)
108 {
109   if (actor.get() == nullptr)
110     return nullptr;
111   return actor->extension<simgrid::smpi::ActorExt>();
112 }
113
114 MPI_Comm smpi_process_comm_self(){
115   return smpi_process()->comm_self();
116 }
117
118 MPI_Info smpi_process_info_env(){
119   return smpi_process()->info_env();
120 }
121
122 void * smpi_process_get_user_data(){
123   return simgrid::s4u::Actor::self()->get_data();
124 }
125
126 void smpi_process_set_user_data(void *data){
127   simgrid::s4u::Actor::self()->set_data(data);
128 }
129
130 void smpi_comm_set_copy_data_callback(void (*callback) (smx_activity_t, void*, size_t))
131 {
132   static void (*saved_callback)(smx_activity_t, void*, size_t);
133   saved_callback               = callback;
134   smpi_comm_copy_data_callback = [](simgrid::kernel::activity::CommImpl* comm, void* buff, size_t size) {
135     saved_callback(comm, buff, size);
136   };
137 }
138
139 static void memcpy_private(void* dest, const void* src, const std::vector<std::pair<size_t, size_t>>& private_blocks)
140 {
141   for (auto const& block : private_blocks)
142     memcpy((uint8_t*)dest+block.first, (uint8_t*)src+block.first, block.second-block.first);
143 }
144
145 static void check_blocks(const std::vector<std::pair<size_t, size_t>>& private_blocks, size_t buff_size)
146 {
147   for (auto const& block : private_blocks)
148     xbt_assert(block.first <= block.second && block.second <= buff_size, "Oops, bug in shared malloc.");
149 }
150
151 static void smpi_cleanup_comm_after_copy(simgrid::kernel::activity::CommImpl* comm, void* buff){
152   if (comm->detached()) {
153     // if this is a detached send, the source buffer was duplicated by SMPI
154     // sender to make the original buffer available to the application ASAP
155     xbt_free(buff);
156     //It seems that the request is used after the call there this should be free somewhere else but where???
157     //xbt_free(comm->comm.src_data);// inside SMPI the request is kept inside the user data and should be free
158     comm->src_buff_ = nullptr;
159   }
160 }
161
162 void smpi_comm_copy_buffer_callback(simgrid::kernel::activity::CommImpl* comm, void* buff, size_t buff_size)
163 {
164   size_t src_offset                     = 0;
165   size_t dst_offset                     = 0;
166   std::vector<std::pair<size_t, size_t>> src_private_blocks;
167   std::vector<std::pair<size_t, size_t>> dst_private_blocks;
168   XBT_DEBUG("Copy the data over");
169   if(smpi_is_shared(buff, src_private_blocks, &src_offset)) {
170     src_private_blocks = shift_and_frame_private_blocks(src_private_blocks, src_offset, buff_size);
171     if (src_private_blocks.empty()) { // simple shared malloc ... return.
172       XBT_VERB("Sender is shared. Let's ignore it.");
173       smpi_cleanup_comm_after_copy(comm, buff);
174       return;
175     }
176   }
177   else {
178     src_private_blocks.clear();
179     src_private_blocks.emplace_back(0, buff_size);
180   }
181   if (smpi_is_shared((char*)comm->dst_buff_, dst_private_blocks, &dst_offset)) {
182     dst_private_blocks = shift_and_frame_private_blocks(dst_private_blocks, dst_offset, buff_size);
183     if (dst_private_blocks.empty()) { // simple shared malloc ... return.
184       XBT_VERB("Receiver is shared. Let's ignore it.");
185       smpi_cleanup_comm_after_copy(comm, buff);
186       return;
187     }
188   }
189   else {
190     dst_private_blocks.clear();
191     dst_private_blocks.emplace_back(0, buff_size);
192   }
193   check_blocks(src_private_blocks, buff_size);
194   check_blocks(dst_private_blocks, buff_size);
195   auto private_blocks = merge_private_blocks(src_private_blocks, dst_private_blocks);
196   check_blocks(private_blocks, buff_size);
197   void* tmpbuff=buff;
198   if (smpi_switch_data_segment(comm->src_actor_->get_iface(), buff)) {
199     XBT_DEBUG("Privatization : We are copying from a zone inside global memory... Saving data to temp buffer !");
200     tmpbuff = xbt_malloc(buff_size);
201     memcpy_private(tmpbuff, buff, private_blocks);
202   }
203
204   if (smpi_switch_data_segment(comm->dst_actor_->get_iface(), comm->dst_buff_))
205     XBT_DEBUG("Privatization : We are copying to a zone inside global memory - Switch data segment");
206
207   XBT_DEBUG("Copying %zu bytes from %p to %p", buff_size, tmpbuff, comm->dst_buff_);
208   memcpy_private(comm->dst_buff_, tmpbuff, private_blocks);
209
210   smpi_cleanup_comm_after_copy(comm,buff);
211   if (tmpbuff != buff)
212     xbt_free(tmpbuff);
213 }
214
215 void smpi_comm_null_copy_buffer_callback(simgrid::kernel::activity::CommImpl*, void*, size_t)
216 {
217   /* nothing done in this version */
218 }
219
220 int smpi_enabled() {
221   return MPI_COMM_WORLD != MPI_COMM_UNINITIALIZED;
222 }
223
224 static void smpi_init_papi()
225 {
226 #if HAVE_PAPI
227   // This map holds for each computation unit (such as "default" or "process1" etc.)
228   // the configuration as given by the user (counter data as a pair of (counter_name, counter_counter))
229   // and the (computed) event_set.
230
231   if (smpi_cfg_papi_events_file().empty())
232     return;
233
234   if (PAPI_library_init(PAPI_VER_CURRENT) != PAPI_VER_CURRENT) {
235     XBT_ERROR("Could not initialize PAPI library; is it correctly installed and linked? Expected version is %u",
236               PAPI_VER_CURRENT);
237     return;
238   }
239
240   using Tokenizer = boost::tokenizer<boost::char_separator<char>>;
241   boost::char_separator<char> separator_units(";");
242   std::string str = smpi_cfg_papi_events_file();
243   Tokenizer tokens(str, separator_units);
244
245   // Iterate over all the computational units. This could be processes, hosts, threads, ranks... You name it.
246   // I'm not exactly sure what we will support eventually, so I'll leave it at the general term "units".
247   for (auto const& unit_it : tokens) {
248     boost::char_separator<char> separator_events(":");
249     Tokenizer event_tokens(unit_it, separator_events);
250
251     int event_set = PAPI_NULL;
252     if (PAPI_create_eventset(&event_set) != PAPI_OK) {
253       // TODO: Should this let the whole simulation die?
254       XBT_CRITICAL("Could not create PAPI event set during init.");
255       break;
256     }
257
258     // NOTE: We cannot use a map here, as we must obey the order of the counters
259     // This is important for PAPI: We need to map the values of counters back to the event_names (so, when PAPI_read()
260     // has finished)!
261     papi_counter_t counters2values;
262
263     // Iterate over all counters that were specified for this specific unit.
264     // Note that we need to remove the name of the unit (that could also be the "default" value), which always comes
265     // first. Hence, we start at ++(events.begin())!
266     for (Tokenizer::iterator events_it = ++(event_tokens.begin()); events_it != event_tokens.end(); ++events_it) {
267       int event_code   = PAPI_NULL;
268       auto* event_name = const_cast<char*>((*events_it).c_str());
269       if (PAPI_event_name_to_code(event_name, &event_code) != PAPI_OK) {
270         XBT_CRITICAL("Could not find PAPI event '%s'. Skipping.", event_name);
271         continue;
272       }
273       if (PAPI_add_event(event_set, event_code) != PAPI_OK) {
274         XBT_ERROR("Could not add PAPI event '%s'. Skipping.", event_name);
275         continue;
276       }
277       XBT_DEBUG("Successfully added PAPI event '%s' to the event set.", event_name);
278
279       counters2values.emplace_back(*events_it, 0LL);
280     }
281
282     std::string unit_name    = *(event_tokens.begin());
283     papi_process_data config = {.counter_data = std::move(counters2values), .event_set = event_set};
284
285     units2papi_setup.insert(std::make_pair(unit_name, std::move(config)));
286   }
287 #endif
288 }
289
290 using smpi_entry_point_type         = std::function<int(int argc, char* argv[])>;
291 using smpi_c_entry_point_type       = int (*)(int argc, char** argv);
292 using smpi_fortran_entry_point_type = void (*)();
293
294 template <typename F>
295 static int smpi_run_entry_point(const F& entry_point, const std::string& executable_path,
296                                 const std::vector<std::string>& args)
297 {
298   // copy C strings, we need them writable
299   auto* args4argv = new std::vector<char*>(args.size());
300   std::transform(begin(args), end(args), begin(*args4argv), [](const std::string& s) { return xbt_strdup(s.c_str()); });
301
302   // set argv[0] to executable_path
303   xbt_free((*args4argv)[0]);
304   (*args4argv)[0] = xbt_strdup(executable_path.c_str());
305
306 #if !SMPI_IFORT
307   // take a copy of args4argv to keep reference of the allocated strings
308   const std::vector<char*> args2str(*args4argv);
309 #endif
310   int argc = static_cast<int>(args4argv->size());
311   args4argv->push_back(nullptr);
312   char** argv = args4argv->data();
313
314 #if SMPI_IFORT
315   for_rtl_init_ (&argc, argv);
316 #elif SMPI_FLANG
317   __io_set_argc(argc);
318   __io_set_argv(argv);
319 #elif SMPI_GFORTRAN
320   _gfortran_set_args(argc, argv);
321 #endif 
322   int res = entry_point(argc, argv);
323
324 #if SMPI_IFORT
325   for_rtl_finish_ ();
326 #else
327   for (char* s : args2str)
328     xbt_free(s);
329   delete args4argv;
330 #endif
331
332   if (res != 0){
333     XBT_WARN("SMPI process did not return 0. Return value : %d", res);
334     if (smpi_exit_status == 0)
335       smpi_exit_status = res;
336   }
337   return 0;
338 }
339
340
341 // TODO, remove the number of functions involved here
342 static smpi_entry_point_type smpi_resolve_function(void* handle)
343 {
344   auto* entry_point_fortran = reinterpret_cast<smpi_fortran_entry_point_type>(dlsym(handle, "user_main_"));
345   if (entry_point_fortran != nullptr) {
346     return [entry_point_fortran](int, char**) {
347       entry_point_fortran();
348       return 0;
349     };
350   }
351
352   auto* entry_point = reinterpret_cast<smpi_c_entry_point_type>(dlsym(handle, "main"));
353   if (entry_point != nullptr) {
354     return entry_point;
355   }
356
357   return smpi_entry_point_type();
358 }
359
360 static void smpi_copy_file(const std::string& src, const std::string& target, off_t fdin_size)
361 {
362   int fdin = open(src.c_str(), O_RDONLY);
363   xbt_assert(fdin >= 0, "Cannot read from %s. Please make sure that the file exists and is executable.", src.c_str());
364   xbt_assert(unlink(target.c_str()) == 0 || errno == ENOENT, "Failed to unlink file %s: %s", target.c_str(),
365              strerror(errno));
366   int fdout = open(target.c_str(), O_CREAT | O_RDWR | O_EXCL, S_IRWXU);
367   xbt_assert(fdout >= 0, "Cannot write into %s: %s", target.c_str(), strerror(errno));
368
369   XBT_DEBUG("Copy %" PRIdMAX " bytes into %s", static_cast<intmax_t>(fdin_size), target.c_str());
370 #if SG_HAVE_SENDFILE
371   ssize_t sent_size = sendfile(fdout, fdin, nullptr, fdin_size);
372   if (sent_size == fdin_size) {
373     close(fdin);
374     close(fdout);
375     return;
376   }
377   xbt_assert(sent_size == -1 && errno == ENOSYS,
378              "Error while copying %s: only %zd bytes copied instead of %" PRIdMAX " (errno: %d -- %s)", target.c_str(),
379              sent_size, static_cast<intmax_t>(fdin_size), errno, strerror(errno));
380 #endif
381   // If this point is reached, sendfile() actually is not available.  Copy file by hand.
382   std::vector<unsigned char> buf(1024 * 1024 * 4);
383   while (ssize_t got = read(fdin, buf.data(), buf.size())) {
384     if (got == -1) {
385       xbt_assert(errno == EINTR, "Cannot read from %s", src.c_str());
386       continue;
387     }
388     const unsigned char* p = buf.data();
389     ssize_t todo           = got;
390     while (ssize_t done = write(fdout, p, todo)) {
391       if (done == -1) {
392         xbt_assert(errno == EINTR, "Cannot write into %s", target.c_str());
393         continue;
394       }
395       p += done;
396       todo -= done;
397     }
398   }
399   close(fdin);
400   close(fdout);
401 }
402
403 #if not defined(__APPLE__) && not defined(__HAIKU__)
404 static int visit_libs(struct dl_phdr_info* info, size_t, void* data)
405 {
406   auto* libname    = static_cast<std::string*>(data);
407   std::string path = info->dlpi_name;
408   if (path.find(*libname) != std::string::npos) {
409     *libname = std::move(path);
410     return 1;
411   }
412   return 0;
413 }
414 #endif
415
416 static void smpi_init_privatization_dlopen(const std::string& executable)
417 {
418   // Prepare the copy of the binary (get its size)
419   struct stat fdin_stat;
420   stat(executable.c_str(), &fdin_stat);
421   off_t fdin_size         = fdin_stat.st_size;
422
423   std::string libnames = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/privatize-libs");
424   if (not libnames.empty()) {
425     // split option
426     std::vector<std::string> privatize_libs;
427     boost::split(privatize_libs, libnames, boost::is_any_of(";"));
428
429     for (auto const& libname : privatize_libs) {
430       // load the library once to add it to the local libs, to get the absolute path
431       void* libhandle = dlopen(libname.c_str(), RTLD_LAZY);
432       xbt_assert(libhandle != nullptr, "Cannot dlopen %s - check your settings in smpi/privatize-libs",
433                  libname.c_str());
434       // get library name from path
435       std::string fullpath = libname;
436 #if not defined(__APPLE__) && not defined(__HAIKU__)
437       xbt_assert(dl_iterate_phdr(visit_libs, &fullpath) != 0,
438                  "Can't find a linked %s - check your settings in smpi/privatize-libs", fullpath.c_str());
439       XBT_DEBUG("Extra lib to privatize '%s' found", fullpath.c_str());
440 #else
441       xbt_die("smpi/privatize-libs is not (yet) compatible with OSX nor with Haiku");
442 #endif
443       privatize_libs_paths.emplace_back(std::move(fullpath));
444       dlclose(libhandle);
445     }
446   }
447
448   simgrid::s4u::Engine::get_instance()->register_default([executable, fdin_size](std::vector<std::string> args) {
449     return simgrid::kernel::actor::ActorCode([executable, fdin_size, args = std::move(args)] {
450       static std::size_t rank = 0;
451       // Copy the dynamic library:
452       simgrid::xbt::Path path(executable);
453       std::string target_executable = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/tmpdir") + "/" +
454           path.get_base_name() + "_" + std::to_string(getpid()) + "_" + std::to_string(rank) + ".so";
455
456       smpi_copy_file(executable, target_executable, fdin_size);
457       // if smpi/privatize-libs is set, duplicate pointed lib and link each executable copy to a different one.
458       std::vector<std::string> target_libs;
459       for (auto const& libpath : privatize_libs_paths) {
460         // if we were given a full path, strip it
461         size_t index = libpath.find_last_of("/\\");
462         std::string libname;
463         if (index != std::string::npos)
464           libname = libpath.substr(index + 1);
465
466         if (not libname.empty()) {
467           // load the library to add it to the local libs, to get the absolute path
468           struct stat fdin_stat2;
469           stat(libpath.c_str(), &fdin_stat2);
470           off_t fdin_size2 = fdin_stat2.st_size;
471
472           // Copy the dynamic library, the new name must be the same length as the old one
473           // just replace the name with 7 digits for the rank and the rest of the name.
474           auto pad                   = std::min<size_t>(7, libname.length());
475           std::string target_libname = std::string(pad - std::to_string(rank).length(), '0') + std::to_string(rank) + libname.substr(pad);
476           std::string target_lib = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/tmpdir") + "/" + target_libname;
477           target_libs.push_back(target_lib);
478           XBT_DEBUG("copy lib %s to %s, with size %lld", libpath.c_str(), target_lib.c_str(), (long long)fdin_size2);
479           smpi_copy_file(libpath, target_lib, fdin_size2);
480
481           std::string sedcommand = "sed -i -e 's/" + libname + "/" + target_libname + "/g' " + target_executable;
482           int status             = system(sedcommand.c_str());
483           xbt_assert(status == 0, "error while applying sed command %s \n", sedcommand.c_str());
484         }
485       }
486
487       rank++;
488       // Load the copy and resolve the entry point:
489       void* handle    = dlopen(target_executable.c_str(), RTLD_LAZY | RTLD_LOCAL | WANT_RTLD_DEEPBIND);
490       int saved_errno = errno;
491       if (not simgrid::config::get_value<bool>("smpi/keep-temps")) {
492         unlink(target_executable.c_str());
493         for (const std::string& target_lib : target_libs)
494           unlink(target_lib.c_str());
495       }
496       xbt_assert(handle != nullptr,
497                  "dlopen failed: %s (errno: %d -- %s).\nError: Did you compile the program with a SMPI-specific "
498                  "compiler (spmicc or friends)?",
499                  dlerror(), saved_errno, strerror(saved_errno));
500
501       smpi_entry_point_type entry_point = smpi_resolve_function(handle);
502       xbt_assert(entry_point, "Could not resolve entry point. Does your program contain a main() function?");
503       smpi_run_entry_point(entry_point, executable, args);
504     });
505   });
506 }
507
508 static void smpi_init_privatization_no_dlopen(const std::string& executable)
509 {
510   if (smpi_cfg_privatization() == SmpiPrivStrategies::MMAP)
511     smpi_prepare_global_memory_segment();
512
513   // Load the dynamic library and resolve the entry point:
514   void* handle = dlopen(executable.c_str(), RTLD_LAZY | RTLD_LOCAL);
515   xbt_assert(handle != nullptr, "dlopen failed for %s: %s (errno: %d -- %s)", executable.c_str(), dlerror(), errno,
516              strerror(errno));
517   smpi_entry_point_type entry_point = smpi_resolve_function(handle);
518   xbt_assert(entry_point, "main not found in %s", executable.c_str());
519
520   if (smpi_cfg_privatization() == SmpiPrivStrategies::MMAP)
521     smpi_backup_global_memory_segment();
522
523   // Execute the same entry point for each simulated process:
524   simgrid::s4u::Engine::get_instance()->register_default([entry_point, executable](std::vector<std::string> args) {
525     return simgrid::kernel::actor::ActorCode([entry_point, executable, args = std::move(args)] {
526       if (smpi_cfg_privatization() == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
527         simgrid::smpi::ActorExt* ext = smpi_process();
528         /* Now using the segment index of this process  */
529         ext->set_privatized_region(smpi_init_global_memory_segment_process());
530         /* Done at the process's creation */
531         smpi_switch_data_segment(simgrid::s4u::Actor::self());
532       }
533       smpi_run_entry_point(entry_point, executable, args);
534     });
535   });
536 }
537
538 int smpi_main(const char* executable, int argc, char* argv[])
539 {
540   if (getenv("SMPI_PRETEND_CC") != nullptr) {
541     /* Hack to ensure that smpicc can pretend to be a simple compiler. Particularly handy to pass it to the
542      * configuration tools */
543     return 0;
544   }
545
546   smpi_init_options_internal(true);
547   auto engine = simgrid::s4u::Engine::get_instance(&argc, argv);
548
549   sg_storage_file_system_init();
550   // parse the platform file: get the host list
551   engine->load_platform(argv[1]);
552   engine->set_default_comm_data_copy_callback(smpi_comm_copy_buffer_callback);
553
554   if (smpi_cfg_privatization() == SmpiPrivStrategies::DLOPEN)
555     smpi_init_privatization_dlopen(executable);
556   else
557     smpi_init_privatization_no_dlopen(executable);
558
559   simgrid::smpi::colls::set_collectives();
560   simgrid::smpi::colls::smpi_coll_cleanup_callback = nullptr;
561   
562   SMPI_init();
563
564   const std::vector<const char*> args(argv + 2, argv + argc);
565   int rank_counts =
566       smpi_deployment_smpirun(engine, smpi_hostfile.get(), smpi_np.get(), smpi_replay.get(), smpi_map.get(), args);
567
568   SMPI_app_instance_register(smpi_default_instance_name.c_str(), nullptr, rank_counts);
569   MPI_COMM_WORLD = *smpi_deployment_comm_world(smpi_default_instance_name);
570
571   /* Clean IO before the run */
572   fflush(stdout);
573   fflush(stderr);
574
575   if (MC_is_active()) {
576     MC_run();
577   } else {
578     simgrid::kernel::EngineImpl::get_instance()->run();
579
580     xbt_os_walltimer_stop(global_timer);
581     simgrid::smpi::utils::print_time_analysis(xbt_os_timer_elapsed(global_timer));
582   }
583   SMPI_finalize();
584
585   return smpi_exit_status;
586 }
587
588 // Called either directly from the user code, or from the code called by smpirun
589 void SMPI_init(){
590   smpi_init_options_internal(false);
591   simgrid::s4u::Actor::on_creation.connect([](simgrid::s4u::Actor& actor) {
592     if (not actor.is_daemon())
593       actor.extension_set<simgrid::smpi::ActorExt>(new simgrid::smpi::ActorExt(&actor));
594   });
595   simgrid::s4u::Host::on_creation.connect(
596       [](simgrid::s4u::Host& host) { host.extension_set(new simgrid::smpi::Host(&host)); });
597   for (auto const& host : simgrid::s4u::Engine::get_instance()->get_all_hosts())
598     host->extension_set(new simgrid::smpi::Host(host));
599
600   if (not MC_is_active()) {
601     global_timer = xbt_os_timer_new();
602     xbt_os_walltimer_start(global_timer);
603   }
604   smpi_init_papi();
605   smpi_check_options();
606 }
607
608 void SMPI_finalize()
609 {
610   smpi_bench_destroy();
611   smpi_shared_destroy();
612   smpi_deployment_cleanup_instances();
613
614   if (simgrid::smpi::colls::smpi_coll_cleanup_callback != nullptr)
615     simgrid::smpi::colls::smpi_coll_cleanup_callback();
616
617   MPI_COMM_WORLD = MPI_COMM_NULL;
618
619   if (not MC_is_active()) {
620     xbt_os_timer_free(global_timer);
621   }
622
623   if (smpi_cfg_privatization() == SmpiPrivStrategies::MMAP)
624     smpi_destroy_global_memory_segments();
625
626   simgrid::smpi::utils::print_memory_analysis();
627 }
628
629 void smpi_mpi_init() {
630   smpi_init_fortran_types();
631   if(_smpi_init_sleep > 0)
632     simgrid::s4u::this_actor::sleep_for(_smpi_init_sleep);
633 }
634
635 void SMPI_thread_create() {
636   TRACE_smpi_init(simgrid::s4u::this_actor::get_pid(), __func__);
637   smpi_process()->mark_as_initialized();
638 }