src/smpi/smpi_base.c

   1 /* Copyright (c) 2007-2014. The SimGrid Team.
   2  * All rights reserved.                                                     */
   3
   4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   6
   7 #include "private.h"
   8 #include "xbt/virtu.h"
   9 #include "mc/mc.h"
  10 #include "xbt/replay.h"
  11 #include <errno.h>
  12 #include "simix/smx_private.h"
  13 #include "surf/surf.h"
  14 #include "simgrid/sg_config.h"
  15 #include "colls/colls.h"
  16
  17 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_base, smpi, "Logging specific to SMPI (base)");
  18
  19
  20 static int match_recv(void* a, void* b, smx_synchro_t ignored) {
  21    MPI_Request ref = (MPI_Request)a;
  22    MPI_Request req = (MPI_Request)b;
  23    XBT_DEBUG("Trying to match a recv of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  24
  25   xbt_assert(ref, "Cannot match recv against null reference");
  26   xbt_assert(req, "Cannot match recv against null request");
  27   if((ref->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  28     && ((ref->tag == MPI_ANY_TAG && req->tag >=0) || req->tag == ref->tag)){
  29     //we match, we can transfer some values
  30     // FIXME : move this to the copy function ?
  31     if(ref->src == MPI_ANY_SOURCE)ref->real_src = req->src;
  32     if(ref->tag == MPI_ANY_TAG)ref->real_tag = req->tag;
  33     if(ref->real_size < req->real_size) ref->truncated = 1;
  34     if(req->detached==1){
  35         ref->detached_sender=req; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
  36     }
  37     XBT_DEBUG("match succeeded");
  38     return 1;
  39   }else return 0;
  40 }
  41
  42 static int match_send(void* a, void* b,smx_synchro_t ignored) {
  43    MPI_Request ref = (MPI_Request)a;
  44    MPI_Request req = (MPI_Request)b;
  45    XBT_DEBUG("Trying to match a send of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  46    xbt_assert(ref, "Cannot match send against null reference");
  47    xbt_assert(req, "Cannot match send against null request");
  48
  49    if((req->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  50              && ((req->tag == MPI_ANY_TAG && ref->tag >=0)|| req->tag == ref->tag))
  51    {
  52      if(req->src == MPI_ANY_SOURCE)req->real_src = ref->src;
  53      if(req->tag == MPI_ANY_TAG)req->real_tag = ref->tag;
  54      if(req->real_size < ref->real_size) req->truncated = 1;
  55      if(ref->detached==1){
  56          req->detached_sender=ref; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
  57      }
  58     XBT_DEBUG("match succeeded");
  59      return 1;
  60    } else return 0;
  61 }
  62
  63
  64 typedef struct s_smpi_factor *smpi_factor_t;
  65 typedef struct s_smpi_factor {
  66   long factor;
  67   int nb_values;
  68   double values[4];//arbitrary set to 4
  69 } s_smpi_factor_t;
  70 xbt_dynar_t smpi_os_values = NULL;
  71 xbt_dynar_t smpi_or_values = NULL;
  72 xbt_dynar_t smpi_ois_values = NULL;
  73
  74 double smpi_wtime_sleep = 0.0;
  75 double smpi_iprobe_sleep = 1e-4;
  76 double smpi_test_sleep = 1e-4;
  77
  78
  79 // Methods used to parse and store the values for timing injections in smpi
  80 // These are taken from surf/network.c and generalized to have more factors
  81 // These methods should be merged with those in surf/network.c (moved somewhere in xbt ?)
  82
  83 static int factor_cmp(const void *pa, const void *pb)
  84 {
  85   return (((s_smpi_factor_t*)pa)->factor > ((s_smpi_factor_t*)pb)->factor) ? 1 :
  86          (((s_smpi_factor_t*)pa)->factor < ((s_smpi_factor_t*)pb)->factor) ? -1 : 0;
  87 }
  88
  89
  90 static xbt_dynar_t parse_factor(const char *smpi_coef_string)
  91 {
  92   char *value = NULL;
  93   unsigned int iter = 0;
  94   s_smpi_factor_t fact;
  95   fact.nb_values=0;
  96   int i=0;
  97   xbt_dynar_t smpi_factor, radical_elements, radical_elements2 = NULL;
  98
  99   smpi_factor = xbt_dynar_new(sizeof(s_smpi_factor_t), NULL);
 100   radical_elements = xbt_str_split(smpi_coef_string, ";");
 101   xbt_dynar_foreach(radical_elements, iter, value) {
 102     memset(&fact, 0, sizeof(s_smpi_factor_t));
 103     radical_elements2 = xbt_str_split(value, ":");
 104     if (xbt_dynar_length(radical_elements2) <2 || xbt_dynar_length(radical_elements2) > 5)
 105       xbt_die("Malformed radical for smpi factor!");
 106     for(i =0; i<xbt_dynar_length(radical_elements2);i++ ){
 107         if (i==0){
 108            fact.factor = atol(xbt_dynar_get_as(radical_elements2, i, char *));
 109         }else{
 110            fact.values[fact.nb_values] = atof(xbt_dynar_get_as(radical_elements2, i, char *));
 111            fact.nb_values++;
 112         }
 113     }
 114
 115     xbt_dynar_push_as(smpi_factor, s_smpi_factor_t, fact);
 116     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%ld : %d values, first: %f", fact.factor, fact.nb_values ,fact.values[0]);
 117     xbt_dynar_free(&radical_elements2);
 118   }
 119   xbt_dynar_free(&radical_elements);
 120   iter=0;
 121   xbt_dynar_sort(smpi_factor, &factor_cmp);
 122   xbt_dynar_foreach(smpi_factor, iter, fact) {
 123     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%ld : %d values, first: %f", fact.factor, fact.nb_values ,fact.values[0]);
 124   }
 125   return smpi_factor;
 126 }
 127
 128 static double smpi_os(double size)
 129 {
 130   if (!smpi_os_values) {
 131     smpi_os_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/os"));
 132     smpi_register_static(smpi_os_values, xbt_dynar_free_voidp);
 133   }
 134   unsigned int iter = 0;
 135   s_smpi_factor_t fact;
 136   double current=0.0;
 137   xbt_dynar_foreach(smpi_os_values, iter, fact) {
 138     if (size <= fact.factor) {
 139         XBT_DEBUG("os : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 140       return current;
 141     }else{
 142       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 143     }
 144   }
 145   XBT_DEBUG("os : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 146
 147   return current;
 148 }
 149
 150 static double smpi_ois(double size)
 151 {
 152   if (!smpi_ois_values) {
 153     smpi_ois_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/ois"));
 154     smpi_register_static(smpi_ois_values, xbt_dynar_free_voidp);
 155   }
 156   unsigned int iter = 0;
 157   s_smpi_factor_t fact;
 158   double current=0.0;
 159   xbt_dynar_foreach(smpi_ois_values, iter, fact) {
 160     if (size <= fact.factor) {
 161         XBT_DEBUG("ois : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 162       return current;
 163     }else{
 164       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 165     }
 166   }
 167   XBT_DEBUG("ois : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 168
 169   return current;
 170 }
 171
 172 static double smpi_or(double size)
 173 {
 174   if (!smpi_or_values) {
 175     smpi_or_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/or"));
 176     smpi_register_static(smpi_or_values, xbt_dynar_free_voidp);
 177   }
 178   unsigned int iter = 0;
 179   s_smpi_factor_t fact;
 180   double current=0.0;
 181   xbt_dynar_foreach(smpi_or_values, iter, fact) {
 182     if (size <= fact.factor) {
 183         XBT_DEBUG("or : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 184       return current;
 185     }else
 186       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 187   }
 188   XBT_DEBUG("or : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 189
 190   return current;
 191 }
 192
 193 double smpi_mpi_wtime(){
 194   double time;
 195   if (smpi_process_initialized() && !smpi_process_finalized() && !smpi_process_get_sampling()) {
 196     smpi_bench_end();
 197     time = SIMIX_get_clock();
 198     //to avoid deadlocks if called too many times
 199     if(smpi_wtime_sleep > 0) simcall_process_sleep(smpi_wtime_sleep);
 200     smpi_bench_begin();
 201   } else {
 202     time = SIMIX_get_clock();
 203   }
 204   return time;
 205 }
 206
 207 static MPI_Request build_request(void *buf, int count,
 208                                  MPI_Datatype datatype, int src, int dst,
 209                                  int tag, MPI_Comm comm, unsigned flags)
 210 {
 211   MPI_Request request = NULL;
 212
 213   void *old_buf = NULL;
 214
 215   request = xbt_new(s_smpi_mpi_request_t, 1);
 216
 217   s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
 218
 219   if(((flags & RECV) && (flags & ACCUMULATE)) || (datatype->has_subtype == 1)){
 220     // This part handles the problem of non-contiguous memory
 221     old_buf = buf;
 222     buf = count==0 ? NULL : xbt_malloc(count*smpi_datatype_size(datatype));
 223     if ((datatype->has_subtype == 1) && (flags & SEND)) {
 224       subtype->serialize(old_buf, buf, count, datatype->substruct);
 225     }
 226   }
 227
 228   request->buf = buf;
 229   // This part handles the problem of non-contiguous memory (for the
 230   // unserialisation at the reception)
 231   request->old_buf = old_buf;
 232   request->old_type = datatype;
 233
 234   request->size = smpi_datatype_size(datatype) * count;
 235   request->src = src;
 236   request->dst = dst;
 237   request->tag = tag;
 238   request->comm = comm;
 239   request->action = NULL;
 240   request->flags = flags;
 241   request->detached = 0;
 242   request->detached_sender = NULL;
 243   request->real_src = 0;
 244
 245   request->truncated = 0;
 246   request->real_size = 0;
 247   request->real_tag = 0;
 248   if(flags & PERSISTENT)
 249     request->refcount = 1;
 250   else
 251     request->refcount = 0;
 252   request->op = MPI_REPLACE;
 253 #ifdef HAVE_TRACING
 254   request->send = 0;
 255   request->recv = 0;
 256 #endif
 257   if (flags & SEND) smpi_datatype_unuse(datatype);
 258
 259   return request;
 260 }
 261
 262
 263 void smpi_empty_status(MPI_Status * status)
 264 {
 265   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 266     status->MPI_SOURCE = MPI_ANY_SOURCE;
 267     status->MPI_TAG = MPI_ANY_TAG;
 268     status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
 269     status->count=0;
 270   }
 271 }
 272
 273 void smpi_action_trace_run(char *path)
 274 {
 275   char *name;
 276   xbt_dynar_t todo;
 277   xbt_dict_cursor_t cursor;
 278
 279   action_fp=NULL;
 280   if (path) {
 281     action_fp = fopen(path, "r");
 282     if (action_fp == NULL)
 283       xbt_die("Cannot open %s: %s", path, strerror(errno));
 284   }
 285
 286   if (!xbt_dict_is_empty(action_queues)) {
 287     XBT_WARN
 288       ("Not all actions got consumed. If the simulation ended successfully (without deadlock), you may want to add new processes to your deployment file.");
 289
 290
 291     xbt_dict_foreach(action_queues, cursor, name, todo) {
 292       XBT_WARN("Still %lu actions for %s", xbt_dynar_length(todo), name);
 293     }
 294   }
 295
 296   if (path)
 297     fclose(action_fp);
 298   xbt_dict_free(&action_queues);
 299   action_queues = xbt_dict_new_homogeneous(NULL);
 300 }
 301
 302 static void smpi_mpi_request_free_voidp(void* request)
 303 {
 304   MPI_Request req = request;
 305   smpi_mpi_request_free(&req);
 306 }
 307
 308 /* MPI Low level calls */
 309 MPI_Request smpi_mpi_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 310                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 311 {
 312   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 313   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 314                           comm, PERSISTENT | SEND | PREPARED);
 315   return request;
 316 }
 317
 318 MPI_Request smpi_mpi_ssend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 319                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 320 {
 321   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 322   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 323                           comm, PERSISTENT | SSEND | SEND | PREPARED);
 324   return request;
 325 }
 326
 327 MPI_Request smpi_mpi_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 328                                int src, int tag, MPI_Comm comm)
 329 {
 330   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 331   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 332                           comm, PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 333   return request;
 334 }
 335
 336 void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
 337 {
 338   smx_rdv_t mailbox;
 339
 340   xbt_assert(!request->action, "Cannot (re)start a non-finished communication");
 341   request->flags &= ~PREPARED;
 342   request->flags &= ~FINISHED;
 343   request->refcount++;
 344
 345   if (request->flags & RECV) {
 346     print_request("New recv", request);
 347
 348     if (request->flags & RMA || request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")){
 349     //We have to check both mailboxes (because SSEND messages are sent to the large mbox). begin with the more appropriate one : the small one.
 350       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 351       XBT_DEBUG("Is there a corresponding send already posted in the small mailbox %p (in case of SSEND)?", mailbox);
 352       XBT_DEBUG("Is there a corresponding send already posted the small mailbox %p (in case of SSEND)?", mailbox);
 353       smx_synchro_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
 354
 355       if(action ==NULL){
 356         mailbox = smpi_process_mailbox();
 357         XBT_DEBUG("No, nothing in the small mailbox test the other one : %p", mailbox);
 358         action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
 359         if(action ==NULL){
 360           XBT_DEBUG("Still nothing, switch back to the small mailbox : %p", mailbox);
 361           XBT_DEBUG("Still notching, switch back to the small mailbox : %p", mailbox);
 362           mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 363           }
 364       }else{
 365         XBT_DEBUG("yes there was something for us in the large mailbox");
 366       }
 367     }else{
 368       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 369       XBT_DEBUG("Is there a corresponding send already posted the small mailbox?");
 370     smx_synchro_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
 371
 372       if(action ==NULL){
 373         XBT_DEBUG("No, nothing in the permanent receive mailbox");
 374         mailbox = smpi_process_mailbox();
 375       }else{
 376         XBT_DEBUG("yes there was something for us in the small mailbox");
 377       }
 378     }
 379
 380     //integrate pseudo-timing for buffering of small messages, do not bother to execute the simcall if 0
 381     double sleeptime = request->detached ? smpi_or(request->size) : 0.0;
 382     if(sleeptime!=0.0){
 383         simcall_process_sleep(sleeptime);
 384         XBT_DEBUG("receiving size of %zu : sleep %f ", request->size, smpi_or(request->size));
 385     }
 386
 387     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
 388     request->real_size=request->size;
 389     smpi_datatype_use(request->old_type);
 390     smpi_comm_use(request->comm);
 391     request->action = simcall_comm_irecv(mailbox, request->buf,
 392                                          &request->real_size, &match_recv,
 393                                          !smpi_process_get_replaying()? &smpi_comm_copy_buffer_callback
 394                                          : &smpi_comm_null_copy_buffer_callback,
 395                                          request, -1.0);
 396         XBT_DEBUG("recv simcall posted");
 397
 398
 399   } else {
 400
 401
 402     int receiver = request->dst;
 403
 404     #ifdef HAVE_TRACING
 405       int rank = request->src;
 406       if (TRACE_smpi_view_internals()) {
 407         TRACE_smpi_send(rank, rank, receiver,request->size);
 408       }
 409     #endif
 410     print_request("New send", request);
 411
 412         //if we are giving back the control to the user without waiting for completion, we have to inject timings
 413     double sleeptime = 0.0;
 414     if(request->detached || (request->flags & (ISEND|SSEND))){// issend should be treated as isend
 415       //isend and send timings may be different
 416       sleeptime = (request->flags & ISEND)? smpi_ois(request->size) : smpi_os(request->size);
 417     }
 418
 419     if(sleeptime != 0.0){
 420         simcall_process_sleep(sleeptime);
 421         XBT_DEBUG("sending size of %zu : sleep %f ", request->size, smpi_os(request->size));
 422     }
 423
 424     if (request->flags & RMA || request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")) { // eager mode
 425       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 426       XBT_DEBUG("Is there a corresponding recv already posted in the large mailbox %p?", mailbox);
 427       smx_synchro_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 1,request->dst, request->tag, &match_send, (void*)request);
 428       if(action ==NULL){
 429        if (! (request->flags & SSEND)){
 430          mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
 431          XBT_DEBUG("No, nothing in the large mailbox, message is to be sent on the small one %p", mailbox);
 432        } else{
 433          mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
 434          XBT_DEBUG("SSEND : Is there a corresponding recv already posted in the small mailbox %p?", mailbox);
 435          action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 1,request->dst, request->tag, &match_send, (void*)request);
 436          if(action ==NULL){
 437            XBT_DEBUG("No, we are first, send to large mailbox");
 438            mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 439          }
 440        }
 441       }else{
 442         XBT_DEBUG("Yes there was something for us in the large mailbox");
 443       }
 444     }else{
 445       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 446       XBT_DEBUG("Send request %p is in the large mailbox %p (buf: %p)",mailbox, request,request->buf);
 447     }
 448
 449     void* buf = request->buf;
 450     if ( (! (request->flags & SSEND)) && (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/send_is_detached_thres"))) {
 451       void *oldbuf = NULL;
 452       request->detached = 1;
 453       XBT_DEBUG("Send request %p is detached", request);
 454       request->refcount++;
 455       if(request->old_type->has_subtype == 0){
 456         oldbuf = request->buf;
 457         if (!smpi_process_get_replaying() && oldbuf && request->size!=0){
 458           if((smpi_privatize_global_variables)
 459               && ((char*)request->buf >= start_data_exe)
 460               && ((char*)request->buf < start_data_exe + size_data_exe )){
 461             XBT_DEBUG("Privatization : We are sending from a zone inside global memory. Switch data segment ");
 462             smpi_switch_data_segment(request->src);
 463           }
 464           buf = xbt_malloc(request->size);
 465           memcpy(buf,oldbuf,request->size);
 466           XBT_DEBUG("buf %p copied into %p",oldbuf,buf);
 467         }
 468       }
 469     }
 470
 471     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
 472     request->real_size=request->size;
 473     smpi_datatype_use(request->old_type);
 474     smpi_comm_use(request->comm);
 475     request->action =
 476       simcall_comm_isend(SIMIX_process_from_PID(request->src+1), mailbox, request->size, -1.0,
 477                          buf, request->real_size,
 478                          &match_send,
 479                          &xbt_free_f, // how to free the userdata if a detached send fails
 480                          !smpi_process_get_replaying()? &smpi_comm_copy_buffer_callback
 481                          : &smpi_comm_null_copy_buffer_callback,
 482                          request,
 483                          // detach if msg size < eager/rdv switch limit
 484                          request->detached);
 485     XBT_DEBUG("send simcall posted");
 486
 487
 488
 489 #ifdef HAVE_TRACING
 490     /* FIXME: detached sends are not traceable (request->action == NULL) */
 491     if (request->action)
 492       simcall_set_category(request->action, TRACE_internal_smpi_get_category());
 493
 494 #endif
 495
 496   }
 497
 498 }
 499
 500 void smpi_mpi_startall(int count, MPI_Request * requests)
 501 {
 502   int i;
 503   if(requests==NULL) return;
 504
 505   for(i = 0; i < count; i++) {
 506     smpi_mpi_start(requests[i]);
 507   }
 508 }
 509
 510 void smpi_mpi_request_free(MPI_Request * request)
 511 {
 512   if((*request) != MPI_REQUEST_NULL){
 513     (*request)->refcount--;
 514     if((*request)->refcount<0) xbt_die("wrong refcount");
 515
 516     if((*request)->refcount==0){
 517         print_request("Destroying", (*request));
 518         xbt_free(*request);
 519         *request = MPI_REQUEST_NULL;
 520     }else{
 521         print_request("Decrementing", (*request));
 522     }
 523   }else{
 524       xbt_die("freeing an already free request");
 525   }
 526 }
 527
 528
 529 MPI_Request smpi_rma_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 530                             int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Op op)
 531 {
 532   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 533   if(op==MPI_OP_NULL){
 534     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf , count, datatype, src, dst, tag,
 535                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED);
 536   }else{
 537     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 538                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED | ACCUMULATE);
 539     request->op = op;
 540   }
 541   return request;
 542 }
 543
 544 MPI_Request smpi_rma_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 545                             int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Op op)
 546 {
 547   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 548   if(op==MPI_OP_NULL){
 549     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 550                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 551   }else{
 552     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 553                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | RECV | PREPARED | ACCUMULATE);
 554     request->op = op;
 555   }
 556   return request;
 557 }
 558
 559
 560 MPI_Request smpi_isend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 561                             int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 562 {
 563   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 564   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf , count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 565                           comm, PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED);
 566   return request;
 567 }
 568
 569 MPI_Request smpi_mpi_isend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 570                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 571 {
 572   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 573   request =  build_request(buf==MPI_BOTTOM?(void*)0:buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 574                            comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SEND);
 575   smpi_mpi_start(request);
 576   return request;
 577 }
 578
 579 MPI_Request smpi_mpi_issend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 580                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 581 {
 582   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 583   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 584                           comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SSEND | SEND);
 585   smpi_mpi_start(request);
 586   return request;
 587 }
 588
 589 MPI_Request smpi_irecv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 590                             int src, int tag, MPI_Comm comm)
 591 {
 592   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 593   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 594                           comm, PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 595   return request;
 596 }
 597
 598 MPI_Request smpi_mpi_irecv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 599                            int src, int tag, MPI_Comm comm)
 600 {
 601   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 602   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 603                           comm, NON_PERSISTENT | RECV);
 604   smpi_mpi_start(request);
 605   return request;
 606 }
 607
 608 void smpi_mpi_recv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src,
 609                    int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 610 {
 611   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 612   request = smpi_mpi_irecv(buf, count, datatype, src, tag, comm);
 613   smpi_mpi_wait(&request, status);
 614   request = NULL;
 615 }
 616
 617
 618
 619 void smpi_mpi_send(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst,
 620                    int tag, MPI_Comm comm)
 621 {
 622   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 623   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 624                           comm, NON_PERSISTENT | SEND);
 625
 626   smpi_mpi_start(request);
 627   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 628   request = NULL;
 629 }
 630
 631 void smpi_mpi_ssend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 632                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 633 {
 634   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 635   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 636                 comm, NON_PERSISTENT | SSEND | SEND);
 637
 638   smpi_mpi_start(request);
 639   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 640   request = NULL;
 641 }
 642
 643 void smpi_mpi_sendrecv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 644                        int dst, int sendtag, void *recvbuf, int recvcount,
 645                        MPI_Datatype recvtype, int src, int recvtag,
 646                        MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 647 {
 648   MPI_Request requests[2];
 649   MPI_Status stats[2];
 650   int myid=smpi_process_index();
 651   if ((smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst) == myid) && (smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src) == myid)) {
 652       smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
 653                                      recvbuf, recvcount, recvtype);
 654       return;
 655   }
 656   requests[0] =
 657     smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, dst, sendtag, comm);
 658   requests[1] =
 659     smpi_irecv_init(recvbuf, recvcount, recvtype, src, recvtag, comm);
 660   smpi_mpi_startall(2, requests);
 661   smpi_mpi_waitall(2, requests, stats);
 662   smpi_mpi_request_free(&requests[0]);
 663   smpi_mpi_request_free(&requests[1]);
 664   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 665     // Copy receive status
 666     *status = stats[1];
 667   }
 668 }
 669
 670 int smpi_mpi_get_count(MPI_Status * status, MPI_Datatype datatype)
 671 {
 672   return status->count / smpi_datatype_size(datatype);
 673 }
 674
 675 static void finish_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 676 {
 677   MPI_Request req = *request;
 678   smpi_empty_status(status);
 679
 680   if(!(req->detached && req->flags & SEND)
 681       && !(req->flags & PREPARED)){
 682     if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 683       int src = req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src;
 684       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(req->comm), src);
 685       status->MPI_TAG = req->tag == MPI_ANY_TAG ? req->real_tag : req->tag;
 686       status->MPI_ERROR = req->truncated ? MPI_ERR_TRUNCATE : MPI_SUCCESS;
 687       // this handles the case were size in receive differs from size in send
 688       // FIXME: really this should just contain the count of receive-type blocks,
 689       // right?
 690       status->count = req->real_size;
 691     }
 692
 693     print_request("Finishing", req);
 694     MPI_Datatype datatype = req->old_type;
 695
 696     if((req->flags & ACCUMULATE) || (datatype->has_subtype == 1)){
 697       if (!smpi_process_get_replaying()){
 698         if( smpi_privatize_global_variables
 699             && ((char*)req->old_buf >= start_data_exe)
 700             && ((char*)req->old_buf < start_data_exe + size_data_exe )
 701         ){
 702             XBT_VERB("Privatization : We are unserializing to a zone in global memory - Switch data segment ");
 703             smpi_switch_data_segment(smpi_process_index());
 704         }
 705       }
 706
 707       if(datatype->has_subtype == 1){
 708         // This part handles the problem of non-contignous memory
 709         // the unserialization at the reception
 710         s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
 711         if(req->flags & RECV)
 712           subtype->unserialize(req->buf, req->old_buf, req->real_size/smpi_datatype_size(datatype) , datatype->substruct, req->op);
 713         if(req->detached == 0) free(req->buf);
 714       }else if(req->flags & RECV){//apply op on contiguous buffer for accumulate
 715           int n =req->real_size/smpi_datatype_size(datatype);
 716           smpi_op_apply(req->op, req->buf, req->old_buf, &n, &datatype);
 717       }
 718     }
 719     smpi_comm_unuse(req->comm);
 720     smpi_datatype_unuse(datatype);
 721
 722   }
 723
 724 #ifdef HAVE_TRACING
 725   if (TRACE_smpi_view_internals()) {
 726     if(req->flags & RECV){
 727       int rank = smpi_process_index();
 728       int src_traced = (req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src);
 729       TRACE_smpi_recv(rank, src_traced, rank);
 730     }
 731   }
 732 #endif
 733
 734   if(req->detached_sender!=NULL){
 735     smpi_mpi_request_free(&(req->detached_sender));
 736   }
 737   if(req->flags & PERSISTENT)
 738     req->action = NULL;
 739   req->flags |= FINISHED;
 740
 741   smpi_mpi_request_free(request);
 742
 743 }
 744
 745 int smpi_mpi_test(MPI_Request * request, MPI_Status * status) {
 746   int flag;
 747
 748   //assume that request is not MPI_REQUEST_NULL (filtered in PMPI_Test or smpi_mpi_testall before)
 749
 750   //to avoid deadlocks
 751   //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed test will increase it
 752   static int nsleeps = 1;
 753   if(smpi_test_sleep > 0)  simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_test_sleep);
 754
 755   smpi_empty_status(status);
 756   flag = 1;
 757   if (!((*request)->flags & PREPARED)) {
 758     if ((*request)->action != NULL)
 759       flag = simcall_comm_test((*request)->action);
 760     if (flag) {
 761       finish_wait(request, status);
 762       nsleeps=1;//reset the number of sleeps we will do next time
 763       if (*request != MPI_REQUEST_NULL && !((*request)->flags & PERSISTENT))
 764       *request = MPI_REQUEST_NULL;
 765     }else{
 766       nsleeps++;
 767     }
 768   }
 769   return flag;
 770 }
 771
 772 int smpi_mpi_testany(int count, MPI_Request requests[], int *index,
 773                      MPI_Status * status)
 774 {
 775   xbt_dynar_t comms;
 776   int i, flag, size;
 777   int* map;
 778
 779   *index = MPI_UNDEFINED;
 780   flag = 0;
 781   comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_synchro_t), NULL);
 782   map = xbt_new(int, count);
 783   size = 0;
 784   for(i = 0; i < count; i++) {
 785     if ((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->action &&
 786         !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
 787        xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
 788        map[size] = i;
 789        size++;
 790     }
 791   }
 792   if(size > 0) {
 793     //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed testany will increase it
 794     static int nsleeps = 1;
 795     if(smpi_test_sleep > 0) simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_test_sleep);
 796
 797     i = simcall_comm_testany(comms);
 798     // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 799     if(i != -1) {
 800       *index = map[i];
 801       finish_wait(&requests[*index], status);
 802       if (requests[*index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[*index]->flags & NON_PERSISTENT))
 803       requests[*index] = MPI_REQUEST_NULL;
 804       flag = 1;
 805       nsleeps=1;
 806     }else{
 807       nsleeps++;
 808     }
 809   }else{
 810       //all requests are null or inactive, return true
 811       flag=1;
 812       smpi_empty_status(status);
 813   }
 814   xbt_free(map);
 815   xbt_dynar_free(&comms);
 816
 817   return flag;
 818 }
 819
 820
 821 int smpi_mpi_testall(int count, MPI_Request requests[],
 822                      MPI_Status status[])
 823 {
 824   MPI_Status stat;
 825   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 826   int flag=1;
 827   int i;
 828   for(i=0; i<count; i++){
 829     if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
 830       if (smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)!=1){
 831         flag=0;
 832       }else{
 833           requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
 834       }
 835     }else{
 836       smpi_empty_status(pstat);
 837     }
 838     if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 839       status[i] = *pstat;
 840     }
 841   }
 842   return flag;
 843 }
 844
 845 void smpi_mpi_probe(int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status* status){
 846   int flag=0;
 847   //FIXME find another wait to avoid busy waiting ?
 848   // the issue here is that we have to wait on a nonexistent comm
 849   while(flag==0){
 850     smpi_mpi_iprobe(source, tag, comm, &flag, status);
 851     XBT_DEBUG("Busy Waiting on probing : %d", flag);
 852   }
 853 }
 854
 855 void smpi_mpi_iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int* flag, MPI_Status* status){
 856
 857   MPI_Request request =build_request(NULL, 0, MPI_CHAR, source == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), source), smpi_comm_rank(comm), tag,
 858             comm, PERSISTENT | RECV);
 859
 860   //to avoid deadlock, we have to sleep some time here, or the timer won't advance and we will only do iprobe simcalls
 861   //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed iprobe will increase it
 862   static int nsleeps = 1;
 863   if(smpi_iprobe_sleep > 0)  simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_iprobe_sleep);
 864   // behave like a receive, but don't do it
 865   smx_rdv_t mailbox;
 866
 867   print_request("New iprobe", request);
 868   // We have to test both mailboxes as we don't know if we will receive one one or another
 869     if (sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")>0){
 870         mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 871         XBT_DEBUG("trying to probe the perm recv mailbox");
 872         request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src, request->tag, &match_recv, (void*)request);
 873     }
 874     if (request->action==NULL){
 875         mailbox = smpi_process_mailbox();
 876         XBT_DEBUG("trying to probe the other mailbox");
 877         request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
 878     }
 879
 880   if(request->action){
 881     MPI_Request req = (MPI_Request)SIMIX_comm_get_src_data(request->action);
 882     *flag = 1;
 883     if(status != MPI_STATUS_IGNORE && !(req->flags & PREPARED)) {
 884       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(comm), req->src);
 885       status->MPI_TAG = req->tag;
 886       status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
 887       status->count = req->real_size;
 888     }
 889     nsleeps=1;//reset the number of sleeps we will do next time
 890   }
 891   else {
 892       *flag = 0;
 893       nsleeps++;
 894   }
 895   smpi_mpi_request_free(&request);
 896
 897   return;
 898 }
 899
 900 void smpi_mpi_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 901 {
 902   print_request("Waiting", *request);
 903   if ((*request)->flags & PREPARED) {
 904     smpi_empty_status(status);
 905     return;
 906   }
 907
 908   if ((*request)->action != NULL) { // this is not a detached send
 909     simcall_comm_wait((*request)->action, -1.0);
 910
 911   if((MC_is_active() || MC_record_replay_is_active()) && (*request)->action)
 912     (*request)->action->comm.dst_data = NULL; // dangling pointer : dst_data is freed with a wait, need to set it to NULL for system state comparison
 913   }
 914
 915   finish_wait(request, status);
 916   if (*request != MPI_REQUEST_NULL && ((*request)->flags & NON_PERSISTENT))
 917       *request = MPI_REQUEST_NULL;
 918   // FIXME for a detached send, finish_wait is not called:
 919 }
 920
 921 int smpi_mpi_waitany(int count, MPI_Request requests[],
 922                      MPI_Status * status)
 923 {
 924   xbt_dynar_t comms;
 925   int i, size, index;
 926   int *map;
 927
 928   index = MPI_UNDEFINED;
 929   if(count > 0) {
 930     // Wait for a request to complete
 931     comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_synchro_t), NULL);
 932     map = xbt_new(int, count);
 933     size = 0;
 934     XBT_DEBUG("Wait for one of %d", count);
 935     for(i = 0; i < count; i++) {
 936       if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL
 937           && !(requests[i]->flags & PREPARED)
 938           && !(requests[i]->flags & FINISHED)) {
 939         if (requests[i]->action != NULL) {
 940           XBT_DEBUG("Waiting any %p ", requests[i]);
 941           xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
 942           map[size] = i;
 943           size++;
 944         }else{
 945          //This is a finished detached request, let's return this one
 946          size=0;//so we free the dynar but don't do the waitany call
 947          index=i;
 948          finish_wait(&requests[i], status);//cleanup if refcount = 0
 949          if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[i]->flags & NON_PERSISTENT))
 950          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;//set to null
 951          break;
 952          }
 953       }
 954     }
 955     if(size > 0) {
 956       i = simcall_comm_waitany(comms);
 957
 958       // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 959       if (i != -1) {
 960         index = map[i];
 961         finish_wait(&requests[index], status);
 962         if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[i]->flags & NON_PERSISTENT))
 963         requests[index] = MPI_REQUEST_NULL;
 964       }
 965     }
 966     xbt_free(map);
 967     xbt_dynar_free(&comms);
 968   }
 969
 970   if (index==MPI_UNDEFINED)
 971     smpi_empty_status(status);
 972
 973   return index;
 974 }
 975
 976 int smpi_mpi_waitall(int count, MPI_Request requests[],
 977                       MPI_Status status[])
 978 {
 979   int  index, c;
 980   MPI_Status stat;
 981   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 982   int retvalue = MPI_SUCCESS;
 983   //tag invalid requests in the set
 984   if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 985     for (c = 0; c < count; c++) {
 986       if (requests[c] == MPI_REQUEST_NULL || requests[c]->dst == MPI_PROC_NULL ||
 987           (requests[c]->flags & PREPARED)) {
 988         smpi_empty_status(&status[c]);
 989       } else if (requests[c]->src == MPI_PROC_NULL) {
 990         smpi_empty_status(&status[c]);
 991         status[c].MPI_SOURCE = MPI_PROC_NULL;
 992       }
 993     }
 994   }
 995   for(c = 0; c < count; c++) {
 996
 997     if (MC_is_active() || MC_record_replay_is_active()) {
 998       smpi_mpi_wait(&requests[c], pstat);
 999       index = c;
1000     } else {
1001       index = smpi_mpi_waitany(count, requests, pstat);
1002       if (index == MPI_UNDEFINED)
1003         break;
1004       if (requests[index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[index]->flags & NON_PERSISTENT))
1005       requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
1006     }
1007     if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
1008       status[index] = *pstat;
1009       if (status[index].MPI_ERROR == MPI_ERR_TRUNCATE)
1010         retvalue = MPI_ERR_IN_STATUS;
1011     }
1012   }
1013
1014   return retvalue;
1015 }
1016
1017 int smpi_mpi_waitsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices,
1018                       MPI_Status status[])
1019 {
1020   int i, count, index;
1021   MPI_Status stat;
1022   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
1023
1024   count = 0;
1025   for(i = 0; i < incount; i++)
1026   {
1027     index=smpi_mpi_waitany(incount, requests, pstat);
1028     if(index!=MPI_UNDEFINED){
1029       indices[count] = index;
1030       count++;
1031       if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
1032         status[index] = *pstat;
1033       }
1034      if (requests[index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[index]->flags & NON_PERSISTENT))
1035      requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
1036     }else{
1037       return MPI_UNDEFINED;
1038     }
1039   }
1040   return count;
1041 }
1042
1043 int smpi_mpi_testsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices,
1044                       MPI_Status status[])
1045 {
1046   int i, count, count_dead;
1047   MPI_Status stat;
1048   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
1049
1050   count = 0;
1051   count_dead = 0;
1052   for(i = 0; i < incount; i++) {
1053     if((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL)) {
1054       if(smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)) {
1055          indices[i] = 1;
1056          count++;
1057          if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
1058            status[i] = *pstat;
1059          }
1060          if ((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->flags & NON_PERSISTENT)
1061          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
1062       }
1063     }else{
1064       count_dead++;
1065     }
1066   }
1067   if(count_dead==incount)return MPI_UNDEFINED;
1068   else return count;
1069 }
1070
1071 void smpi_mpi_bcast(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int root,
1072                     MPI_Comm comm)
1073 {
1074   // arity=2: a binary tree, arity=4 seem to be a good setting (see P2P-MPI))
1075   nary_tree_bcast(buf, count, datatype, root, comm, 4);
1076 }
1077
1078 void smpi_mpi_barrier(MPI_Comm comm)
1079 {
1080   // arity=2: a binary tree, arity=4 seem to be a good setting (see P2P-MPI))
1081   nary_tree_barrier(comm, 4);
1082 }
1083
1084 void smpi_mpi_gather(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1085                      void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1086                      int root, MPI_Comm comm)
1087 {
1088   int system_tag = COLL_TAG_GATHER;
1089   int rank, size, src, index;
1090   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1091   MPI_Request *requests;
1092
1093   rank = smpi_comm_rank(comm);
1094   size = smpi_comm_size(comm);
1095   if(rank != root) {
1096     // Send buffer to root
1097     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
1098   } else {
1099     // FIXME: check for errors
1100     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1101     // Local copy from root
1102     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1103                        (char *)recvbuf + root * recvcount * recvext, recvcount, recvtype);
1104     // Receive buffers from senders
1105     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1106     index = 0;
1107     for(src = 0; src < size; src++) {
1108       if(src != root) {
1109         requests[index] = smpi_irecv_init((char *)recvbuf + src * recvcount * recvext,
1110                                           recvcount, recvtype,
1111                                           src, system_tag, comm);
1112         index++;
1113       }
1114     }
1115     // Wait for completion of irecv's.
1116     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1117     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1118     for(src = 0; src < size-1; src++) {
1119       smpi_mpi_request_free(&requests[src]);
1120     }
1121     xbt_free(requests);
1122   }
1123 }
1124
1125
1126 void smpi_mpi_reduce_scatter(void *sendbuf, void *recvbuf, int *recvcounts,
1127                        MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1128 {
1129     int i, size, count;
1130     int *displs;
1131     int rank = smpi_process_index();
1132     void *tmpbuf;
1133
1134     /* arbitrarily choose root as rank 0 */
1135     size = smpi_comm_size(comm);
1136     count = 0;
1137     displs = xbt_new(int, size);
1138     for (i = 0; i < size; i++) {
1139       displs[i] = count;
1140       count += recvcounts[i];
1141     }
1142     tmpbuf=(void*)smpi_get_tmp_sendbuffer(count*smpi_datatype_get_extent(datatype));
1143
1144     mpi_coll_reduce_fun(sendbuf, tmpbuf, count, datatype, op, 0, comm);
1145     smpi_mpi_scatterv(tmpbuf, recvcounts, displs, datatype, recvbuf,
1146                       recvcounts[rank], datatype, 0, comm);
1147     xbt_free(displs);
1148     smpi_free_tmp_buffer(tmpbuf);
1149 }
1150
1151 void smpi_mpi_gatherv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1152                       void *recvbuf, int *recvcounts, int *displs,
1153                       MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1154 {
1155   int system_tag = COLL_TAG_GATHERV;
1156   int rank, size, src, index;
1157   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1158   MPI_Request *requests;
1159
1160   rank = smpi_comm_rank(comm);
1161   size = smpi_comm_size(comm);
1162   if(rank != root) {
1163     // Send buffer to root
1164     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
1165   } else {
1166     // FIXME: check for errors
1167     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1168     // Local copy from root
1169     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1170                        (char *)recvbuf + displs[root] * recvext,
1171                        recvcounts[root], recvtype);
1172     // Receive buffers from senders
1173     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1174     index = 0;
1175     for(src = 0; src < size; src++) {
1176       if(src != root) {
1177         requests[index] =
1178           smpi_irecv_init((char *)recvbuf + displs[src] * recvext,
1179                           recvcounts[src], recvtype, src, system_tag, comm);
1180         index++;
1181       }
1182     }
1183     // Wait for completion of irecv's.
1184     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1185     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1186     for(src = 0; src < size-1; src++) {
1187       smpi_mpi_request_free(&requests[src]);
1188     }
1189     xbt_free(requests);
1190   }
1191 }
1192
1193 void smpi_mpi_allgather(void *sendbuf, int sendcount,
1194                         MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
1195                         int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1196                         MPI_Comm comm)
1197 {
1198   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHER;
1199   int rank, size, other, index;
1200   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1201   MPI_Request *requests;
1202
1203   rank = smpi_comm_rank(comm);
1204   size = smpi_comm_size(comm);
1205   // FIXME: check for errors
1206   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1207   // Local copy from self
1208   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1209                      (char *)recvbuf + rank * recvcount * recvext, recvcount,
1210                      recvtype);
1211   // Send/Recv buffers to/from others;
1212   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1213   index = 0;
1214   for(other = 0; other < size; other++) {
1215     if(other != rank) {
1216       requests[index] =
1217         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,
1218                         comm);
1219       index++;
1220       requests[index] = smpi_irecv_init((char *)recvbuf + other * recvcount * recvext,
1221                                         recvcount, recvtype, other,
1222                                         system_tag, comm);
1223       index++;
1224     }
1225   }
1226   // Wait for completion of all comms.
1227   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1228   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1229   for(other = 0; other < 2*(size-1); other++) {
1230     smpi_mpi_request_free(&requests[other]);
1231   }
1232   xbt_free(requests);
1233 }
1234
1235 void smpi_mpi_allgatherv(void *sendbuf, int sendcount,
1236                          MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
1237                          int *recvcounts, int *displs,
1238                          MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
1239 {
1240   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHERV;
1241   int rank, size, other, index;
1242   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1243   MPI_Request *requests;
1244
1245   rank = smpi_comm_rank(comm);
1246   size = smpi_comm_size(comm);
1247   // FIXME: check for errors
1248   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1249   // Local copy from self
1250   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1251                      (char *)recvbuf + displs[rank] * recvext,
1252                      recvcounts[rank], recvtype);
1253   // Send buffers to others;
1254   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1255   index = 0;
1256   for(other = 0; other < size; other++) {
1257     if(other != rank) {
1258       requests[index] =
1259         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,
1260                         comm);
1261       index++;
1262       requests[index] =
1263         smpi_irecv_init((char *)recvbuf + displs[other] * recvext, recvcounts[other],
1264                         recvtype, other, system_tag, comm);
1265       index++;
1266     }
1267   }
1268   // Wait for completion of all comms.
1269   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1270   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1271   for(other = 0; other < 2*(size-1); other++) {
1272     smpi_mpi_request_free(&requests[other]);
1273   }
1274   xbt_free(requests);
1275 }
1276
1277 void smpi_mpi_scatter(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1278                       void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1279                       int root, MPI_Comm comm)
1280 {
1281   int system_tag = COLL_TAG_SCATTER;
1282   int rank, size, dst, index;
1283   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
1284   MPI_Request *requests;
1285
1286   rank = smpi_comm_rank(comm);
1287   size = smpi_comm_size(comm);
1288   if(rank != root) {
1289     // Recv buffer from root
1290     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm,
1291                   MPI_STATUS_IGNORE);
1292   } else {
1293     // FIXME: check for errors
1294     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1295     // Local copy from root
1296     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1297         smpi_datatype_copy((char *)sendbuf + root * sendcount * sendext,
1298                            sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1299     }
1300     // Send buffers to receivers
1301     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1302     index = 0;
1303     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
1304       if(dst != root) {
1305         requests[index] = smpi_isend_init((char *)sendbuf + dst * sendcount * sendext,
1306                                           sendcount, sendtype, dst,
1307                                           system_tag, comm);
1308         index++;
1309       }
1310     }
1311     // Wait for completion of isend's.
1312     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1313     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1314     for(dst = 0; dst < size-1; dst++) {
1315       smpi_mpi_request_free(&requests[dst]);
1316     }
1317     xbt_free(requests);
1318   }
1319 }
1320
1321 void smpi_mpi_scatterv(void *sendbuf, int *sendcounts, int *displs,
1322                        MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, int recvcount,
1323                        MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1324 {
1325   int system_tag = COLL_TAG_SCATTERV;
1326   int rank, size, dst, index;
1327   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
1328   MPI_Request *requests;
1329
1330   rank = smpi_comm_rank(comm);
1331   size = smpi_comm_size(comm);
1332   if(rank != root) {
1333     // Recv buffer from root
1334     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm,
1335                   MPI_STATUS_IGNORE);
1336   } else {
1337     // FIXME: check for errors
1338     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1339     // Local copy from root
1340     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1341       smpi_datatype_copy((char *)sendbuf + displs[root] * sendext, sendcounts[root],
1342                        sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1343     }
1344     // Send buffers to receivers
1345     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1346     index = 0;
1347     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
1348       if(dst != root) {
1349         requests[index] =
1350           smpi_isend_init((char *)sendbuf + displs[dst] * sendext, sendcounts[dst],
1351                           sendtype, dst, system_tag, comm);
1352         index++;
1353       }
1354     }
1355     // Wait for completion of isend's.
1356     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1357     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1358     for(dst = 0; dst < size-1; dst++) {
1359       smpi_mpi_request_free(&requests[dst]);
1360     }
1361     xbt_free(requests);
1362   }
1363 }
1364
1365 void smpi_mpi_reduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1366                      MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, int root,
1367                      MPI_Comm comm)
1368 {
1369   int system_tag = COLL_TAG_REDUCE;
1370   int rank, size, src, index;
1371   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1372   MPI_Request *requests;
1373   void **tmpbufs;
1374
1375
1376   char* sendtmpbuf = (char*) sendbuf;
1377   if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1378     sendtmpbuf = (char *)smpi_get_tmp_sendbuffer(count*smpi_datatype_get_extent(datatype));
1379     smpi_datatype_copy(recvbuf, count, datatype,sendtmpbuf, count, datatype);
1380   }
1381
1382   rank = smpi_comm_rank(comm);
1383   size = smpi_comm_size(comm);
1384   //non commutative case, use a working algo from openmpi
1385   if(!smpi_op_is_commute(op)){
1386     smpi_coll_tuned_reduce_ompi_basic_linear(sendtmpbuf, recvbuf, count,
1387                      datatype, op, root, comm);
1388     return;
1389   }
1390
1391   if(rank != root) {
1392     // Send buffer to root
1393     smpi_mpi_send(sendtmpbuf, count, datatype, root, system_tag, comm);
1394   } else {
1395     // FIXME: check for errors
1396     smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1397     // Local copy from root
1398     if (sendtmpbuf && recvbuf)
1399       smpi_datatype_copy(sendtmpbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1400     // Receive buffers from senders
1401     //TODO: make a MPI_barrier here ?
1402     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1403     tmpbufs = xbt_new(void *, size - 1);
1404     index = 0;
1405     for(src = 0; src < size; src++) {
1406       if(src != root) {
1407         // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1408         //  mapping...
1409             if (!smpi_process_get_replaying())
1410           tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1411             else
1412               tmpbufs[index] = smpi_get_tmp_sendbuffer(count * dataext);
1413         requests[index] =
1414           smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, src,
1415                           system_tag, comm);
1416         index++;
1417       }
1418     }
1419     // Wait for completion of irecv's.
1420     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1421     for(src = 0; src < size - 1; src++) {
1422       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1423       XBT_DEBUG("finished waiting any request with index %d", index);
1424       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1425         break;
1426       }else{
1427         smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1428       }
1429       if(op) /* op can be MPI_OP_NULL that does nothing */
1430         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1431     }
1432       for(index = 0; index < size - 1; index++) {
1433         smpi_free_tmp_buffer(tmpbufs[index]);
1434       }
1435     xbt_free(tmpbufs);
1436     xbt_free(requests);
1437
1438     if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1439       smpi_free_tmp_buffer(sendtmpbuf);
1440     }
1441   }
1442 }
1443
1444 void smpi_mpi_allreduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1445                         MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1446 {
1447   smpi_mpi_reduce(sendbuf, recvbuf, count, datatype, op, 0, comm);
1448   smpi_mpi_bcast(recvbuf, count, datatype, 0, comm);
1449 }
1450
1451 void smpi_mpi_scan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1452                    MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1453 {
1454   int system_tag = -888;
1455   int rank, size, other, index;
1456   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1457   MPI_Request *requests;
1458   void **tmpbufs;
1459
1460   rank = smpi_comm_rank(comm);
1461   size = smpi_comm_size(comm);
1462
1463   // FIXME: check for errors
1464   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1465
1466   // Local copy from self
1467   smpi_datatype_copy(sendbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1468
1469   // Send/Recv buffers to/from others;
1470   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1471   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1472   index = 0;
1473   for(other = 0; other < rank; other++) {
1474     // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1475     // mapping...
1476     tmpbufs[index] = smpi_get_tmp_sendbuffer(count * dataext);
1477     requests[index] =
1478       smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag,
1479                       comm);
1480     index++;
1481   }
1482   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
1483     requests[index] =
1484       smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1485     index++;
1486   }
1487   // Wait for completion of all comms.
1488   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1489
1490   if(smpi_op_is_commute(op)){
1491     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1492       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1493       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1494         break;
1495       }
1496       if(index < rank) {
1497         // #Request is below rank: it's a irecv
1498         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1499       }
1500     }
1501   }else{
1502     //non commutative case, wait in order
1503     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1504       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1505       if(index < rank) {
1506         smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1507       }
1508     }
1509   }
1510   for(index = 0; index < rank; index++) {
1511     smpi_free_tmp_buffer(tmpbufs[index]);
1512   }
1513   for(index = 0; index < size-1; index++) {
1514     smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1515   }
1516   xbt_free(tmpbufs);
1517   xbt_free(requests);
1518 }
1519
1520 void smpi_mpi_exscan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1521                    MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1522 {
1523   int system_tag = -888;
1524   int rank, size, other, index;
1525   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1526   MPI_Request *requests;
1527   void **tmpbufs;
1528   int recvbuf_is_empty=1;
1529   rank = smpi_comm_rank(comm);
1530   size = smpi_comm_size(comm);
1531
1532   // FIXME: check for errors
1533   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1534
1535   // Send/Recv buffers to/from others;
1536   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1537   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1538   index = 0;
1539   for(other = 0; other < rank; other++) {
1540     // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1541     // mapping...
1542     tmpbufs[index] = smpi_get_tmp_sendbuffer(count * dataext);
1543     requests[index] =
1544       smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag,
1545                       comm);
1546     index++;
1547   }
1548   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
1549     requests[index] =
1550       smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1551     index++;
1552   }
1553   // Wait for completion of all comms.
1554   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1555   if(smpi_op_is_commute(op)){
1556     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1557       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1558       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1559         break;
1560       }
1561       if(index < rank) {
1562         if(recvbuf_is_empty){
1563           smpi_datatype_copy(tmpbufs[index], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1564           recvbuf_is_empty=0;
1565         }else
1566         // #Request is below rank: it's a irecv
1567         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1568       }
1569     }
1570   }else{
1571     //non commutative case, wait in order
1572     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1573       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1574       if(index < rank) {
1575           if(recvbuf_is_empty){
1576             smpi_datatype_copy(tmpbufs[other], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1577             recvbuf_is_empty=0;
1578           }else smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1579       }
1580     }
1581   }
1582   for(index = 0; index < rank; index++) {
1583     smpi_free_tmp_buffer(tmpbufs[index]);
1584   }
1585   for(index = 0; index < size-1; index++) {
1586     smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1587   }
1588   xbt_free(tmpbufs);
1589   xbt_free(requests);
1590 }