Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Public GIT Repository
resolve conflict
[simgrid.git] / src / smpi / smpi_base.c
index cc9e409..52eba54 100644 (file)
@@ -71,6 +71,11 @@ xbt_dynar_t smpi_os_values = NULL;
 xbt_dynar_t smpi_or_values = NULL;
 xbt_dynar_t smpi_ois_values = NULL;
 
+double smpi_wtime_sleep = 0.0;
+double smpi_iprobe_sleep = 1e-4;
+double smpi_test_sleep = 1e-4;
+
+
 // Methods used to parse and store the values for timing injections in smpi
 // These are taken from surf/network.c and generalized to have more factors
 // These methods should be merged with those in surf/network.c (moved somewhere in xbt ?)
@@ -185,6 +190,20 @@ static double smpi_or(double size)
   return current;
 }
 
+double smpi_mpi_wtime(){
+  double time;
+  if (smpi_process_initialized() && !smpi_process_finalized() && !smpi_process_get_sampling()) {
+    smpi_bench_end();
+    time = SIMIX_get_clock();
+    //to avoid deadlocks if called too many times
+    if(smpi_wtime_sleep > 0) simcall_process_sleep(smpi_wtime_sleep);
+    smpi_bench_begin();
+  } else {
+    time = SIMIX_get_clock();
+  }
+  return time;
+}
+
 static MPI_Request build_request(void *buf, int count,
                                  MPI_Datatype datatype, int src, int dst,
                                  int tag, MPI_Comm comm, unsigned flags)
@@ -197,11 +216,11 @@ static MPI_Request build_request(void *buf, int count,
 
   s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
 
-  if(datatype->has_subtype == 1){
+  if(((flags & RECV) && (flags & ACCUMULATE)) || (datatype->has_subtype == 1)){
     // This part handles the problem of non-contiguous memory
     old_buf = buf;
     buf = count==0 ? NULL : xbt_malloc(count*smpi_datatype_size(datatype));
-    if (flags & SEND) {
+    if ((datatype->has_subtype == 1) && (flags & SEND)) {
       subtype->serialize(old_buf, buf, count, datatype->substruct);
     }
   }
@@ -230,7 +249,7 @@ static MPI_Request build_request(void *buf, int count,
     request->refcount = 1;
   else
     request->refcount = 0;
-
+  request->op = MPI_REPLACE;
 #ifdef HAVE_TRACING
   request->send = 0;
   request->recv = 0;
@@ -326,7 +345,7 @@ void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
   if (request->flags & RECV) {
     print_request("New recv", request);
     //FIXME: if receive is posted with a large size, but send is smaller, mailboxes may not match !
-    if (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres"))
+    if (request->flags & RMA || request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres"))
       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
     else
       mailbox = smpi_process_mailbox();
@@ -335,7 +354,8 @@ void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
     smpi_datatype_use(request->old_type);
     smpi_comm_use(request->comm);
     request->action = simcall_comm_irecv(mailbox, request->buf,
-                                         &request->real_size, &match_recv, &smpi_comm_copy_buffer_callback,
+                                         &request->real_size, &match_recv,
+                                         &smpi_comm_copy_buffer_callback,
                                          request, -1.0);
 
     //integrate pseudo-timing for buffering of small messages, do not bother to execute the simcall if 0
@@ -351,7 +371,7 @@ void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
     int receiver = request->dst;//smpi_group_index(smpi_comm_group(request->comm), request->dst);
 
     #ifdef HAVE_TRACING
-      int rank = smpi_process_index();
+      int rank = request->src;
       if (TRACE_smpi_view_internals()) {
         TRACE_smpi_send(rank, rank, receiver,request->size);
       }
@@ -361,7 +381,7 @@ void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
 /*      return;*/
 /*    }*/
     print_request("New send", request);
-    if (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")) { // eager mode
+    if (request->flags & RMA || request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")) { // eager mode
       mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
     }else{
       XBT_DEBUG("Send request %p is not in the permanent receive mailbox (buf: %p)",request,request->buf);
@@ -372,6 +392,7 @@ void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
     if ( (! (request->flags & SSEND)) && (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/send_is_detached_thres"))) {
       void *oldbuf = NULL;
       request->detached = 1;
+      XBT_DEBUG("Send request %p is detached", request);
       request->refcount++;
       if(request->old_type->has_subtype == 0){
         oldbuf = request->buf;
@@ -380,13 +401,13 @@ void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
              && ((char*)request->buf >= start_data_exe)
              && ((char*)request->buf < start_data_exe + size_data_exe )){
             XBT_DEBUG("Privatization : We are sending from a zone inside global memory. Switch data segment ");
-                   switch_data_segment(smpi_process_index());
+                   smpi_switch_data_segment(request->src);
          }
           buf = xbt_malloc(request->size);
           memcpy(buf,oldbuf,request->size);
+          XBT_DEBUG("buf %p copied into %p",oldbuf,buf);
         }
       }
-      XBT_DEBUG("Send request %p is detached; buf %p copied into %p",request,oldbuf,request->buf);
     }
 
     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
@@ -405,12 +426,11 @@ void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
         simcall_process_sleep(sleeptime);
         XBT_DEBUG("sending size of %zu : sleep %f ", request->size, smpi_os(request->size));
     }
-
     request->action =
-      simcall_comm_isend(mailbox, request->size, -1.0,
+      simcall_comm_isend(SIMIX_process_from_PID(request->src+1), mailbox, request->size, -1.0,
                          buf, request->real_size,
                          &match_send,
-                         &xbt_free, // how to free the userdata if a detached send fails
+                         &xbt_free_f, // how to free the userdata if a detached send fails
                          &smpi_comm_copy_buffer_callback,
                          request,
                          // detach if msg size < eager/rdv switch limit
@@ -455,6 +475,38 @@ void smpi_mpi_request_free(MPI_Request * request)
   }
 }
 
+
+MPI_Request smpi_rma_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
+                            int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Op op)
+{
+  MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
+  if(op==MPI_OP_NULL){
+    request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf , count, datatype, src, dst, tag,
+                            comm, RMA | NON_PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED);
+  }else{
+    request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
+                            comm, RMA | NON_PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED | ACCUMULATE);
+    request->op = op;
+  }
+  return request;
+}
+
+MPI_Request smpi_rma_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
+                            int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Op op)
+{
+  MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
+  if(op==MPI_OP_NULL){
+    request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
+                            comm, RMA | NON_PERSISTENT | RECV | PREPARED);
+  }else{
+    request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
+                            comm, RMA | NON_PERSISTENT | RECV | PREPARED | ACCUMULATE);
+    request->op = op;
+  }
+  return request;
+}
+
+
 MPI_Request smpi_isend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
                             int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 {
@@ -484,8 +536,6 @@ MPI_Request smpi_mpi_issend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
   return request;
 }
 
-
-
 MPI_Request smpi_irecv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
                             int src, int tag, MPI_Comm comm)
 {
@@ -593,23 +643,28 @@ static void finish_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
     print_request("Finishing", req);
     MPI_Datatype datatype = req->old_type;
 
-    if(datatype->has_subtype == 1){
+    if((req->flags & ACCUMULATE) || (datatype->has_subtype == 1)){
       if (!_xbt_replay_is_active()){
         if( smpi_privatize_global_variables
             && ((char*)req->old_buf >= start_data_exe)
             && ((char*)req->old_buf < start_data_exe + size_data_exe )
         ){
             XBT_VERB("Privatization : We are unserializing to a zone in global memory - Switch data segment ");
-            switch_data_segment(smpi_process_index());
+            smpi_switch_data_segment(smpi_process_index());
         }
       }
-      // This part handles the problem of non-contignous memory
-      // the unserialization at the reception
-      s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
-      if(req->flags & RECV) {
-        subtype->unserialize(req->buf, req->old_buf, req->real_size/smpi_datatype_size(datatype) , datatype->substruct);
+
+      if(datatype->has_subtype == 1){
+        // This part handles the problem of non-contignous memory
+        // the unserialization at the reception
+        s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
+        if(req->flags & RECV)
+          subtype->unserialize(req->buf, req->old_buf, req->real_size/smpi_datatype_size(datatype) , datatype->substruct, req->op);
+        if(req->detached == 0) free(req->buf);
+      }else if(req->flags & RECV){//apply op on contiguous buffer for accumulate
+          int n =req->real_size/smpi_datatype_size(datatype);
+          smpi_op_apply(req->op, req->buf, req->old_buf, &n, &datatype);
       }
-      if(req->detached == 0) free(req->buf);
     }
     smpi_comm_unuse(req->comm);
     smpi_datatype_unuse(datatype);
@@ -641,6 +696,12 @@ int smpi_mpi_test(MPI_Request * request, MPI_Status * status) {
   int flag;
 
   //assume that request is not MPI_REQUEST_NULL (filtered in PMPI_Test or smpi_mpi_testall before)
+
+  //to avoid deadlocks
+  //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed test will increase it
+  static int nsleeps = 1;
+  if(smpi_test_sleep > 0)  simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_test_sleep);
+
   smpi_empty_status(status);
   flag = 1;
   if (!((*request)->flags & PREPARED)) {
@@ -648,8 +709,11 @@ int smpi_mpi_test(MPI_Request * request, MPI_Status * status) {
       flag = simcall_comm_test((*request)->action);
     if (flag) {
       finish_wait(request, status);
+      nsleeps=1;//reset the number of sleeps we will do next time
       if (*request != MPI_REQUEST_NULL && !((*request)->flags & PERSISTENT))
       *request = MPI_REQUEST_NULL;
+    }else{
+      nsleeps++;
     }
   }
   return flag;
@@ -676,6 +740,10 @@ int smpi_mpi_testany(int count, MPI_Request requests[], int *index,
     }
   }
   if(size > 0) {
+    //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed testany will increase it
+    static int nsleeps = 1;
+    if(smpi_test_sleep > 0) simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_test_sleep);
+
     i = simcall_comm_testany(comms);
     // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
     if(i != -1) {
@@ -684,6 +752,9 @@ int smpi_mpi_testany(int count, MPI_Request requests[], int *index,
       if (requests[*index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[*index]->flags & NON_PERSISTENT))
       requests[*index] = MPI_REQUEST_NULL;
       flag = 1;
+      nsleeps=1;
+    }else{
+      nsleeps++;
     }
   }else{
       //all requests are null or inactive, return true
@@ -737,12 +808,9 @@ void smpi_mpi_iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int* flag, MPI_Status*
             comm, PERSISTENT | RECV);
 
   //to avoid deadlock, we have to sleep some time here, or the timer won't advance and we will only do iprobe simcalls
-  double sleeptime= sg_cfg_get_double("smpi/iprobe");
   //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed iprobe will increase it
   static int nsleeps = 1;
-
-  simcall_process_sleep(sleeptime);
-
+  if(smpi_iprobe_sleep > 0)  simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_iprobe_sleep);
   // behave like a receive, but don't do it
   smx_rdv_t mailbox;
 
@@ -751,12 +819,12 @@ void smpi_mpi_iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int* flag, MPI_Status*
     if (sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")>0){
         mailbox = smpi_process_mailbox_small();
         XBT_DEBUG("trying to probe the perm recv mailbox");
-        request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, request->src, request->tag, &match_recv, (void*)request);
+        request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src, request->tag, &match_recv, (void*)request);
     }
     if (request->action==NULL){
        mailbox = smpi_process_mailbox();
         XBT_DEBUG("trying to probe the other mailbox");
-        request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, request->src, request->tag, &match_recv, (void*)request);
+        request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
     }
 
   if(request->action){