Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Public GIT Repository
switch way old SMP aware algos work, to be closer to the ones from mvapich
[simgrid.git] / src / smpi / colls / allreduce-smp-binomial-pipeline.c
index b5efc1e..e831be9 100644 (file)
@@ -1,4 +1,10 @@
-#include "colls.h"
+/* Copyright (c) 2013-2014. The SimGrid Team.
+ * All rights reserved.                                                     */
+
+/* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
+ * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
+
+#include "colls_private.h"
 /* IMPLEMENTED BY PITCH PATARASUK 
    Non-topoloty-specific (however, number of cores/node need to be changed) 
    all-reduce operation designed for smp clusters
@@ -6,11 +12,7 @@
    inter-communication
    The communication are done in a pipeline fashion */
 
-/* change number of core per smp-node
-   we assume that number of core per process will be the same for all implementations */
-#ifndef NUM_CORE
-#define NUM_CORE 8
-#endif
+
 
 /* this is a default segment size for pipelining, 
    but it is typically passed as a command line argument */
@@ -29,18 +31,6 @@ int allreduce_smp_binomial_pipeline_segment_size = 4096;
    This code assume commutative and associative reduce operator (MPI_SUM, MPI_MAX, etc).
 */
 
-#ifndef MPICH2
-extern void *MPIR_ToPointer();
-
-struct MPIR_OP {
-  MPI_User_function *op;
-  int commute, permanent;
-};
-
-#else
-extern MPI_User_function *MPIR_Op_table[];
-#endif
-
 /*
 This fucntion performs all-reduce operation as follow. ** in a pipeline fashion **
 1) binomial_tree reduce inside each SMP node
@@ -55,24 +45,22 @@ int smpi_coll_tuned_allreduce_smp_binomial_pipeline(void *send_buf,
 {
   int comm_size, rank;
   void *tmp_buf;
-  int tag = 50;
+  int tag = COLL_TAG_ALLREDUCE;
   int mask, src, dst;
   MPI_Status status;
-  int num_core = NUM_CORE;
-
-  MPI_User_function *uop;
-#ifndef MPICH2
-  struct MPIR_OP *op_ptr = MPIR_ToPointer(op);
-  uop = (MPI_User_function *) op_ptr->op;
-#else
-  uop = MPIR_Op_table[op % 16 - 1];
-#endif
-
-  MPI_Comm_size(comm, &comm_size);
-  MPI_Comm_rank(comm, &rank);
+  if(smpi_comm_get_leaders_comm(comm)==MPI_COMM_NULL){
+    smpi_comm_init_smp(comm);
+  }
+  int num_core=1;
+  if (smpi_comm_is_uniform(comm)){
+    num_core = smpi_comm_size(smpi_comm_get_intra_comm(comm));
+  }
+
+  comm_size = smpi_comm_size(comm);
+  rank = smpi_comm_rank(comm);
   MPI_Aint extent;
-  MPI_Type_extent(dtype, &extent);
-  tmp_buf = (void *) malloc(count * extent);
+  extent = smpi_datatype_get_extent(dtype);
+  tmp_buf = (void *) xbt_malloc(count * extent);
 
   int intra_rank, inter_rank;
   intra_rank = rank % num_core;
@@ -91,7 +79,7 @@ int smpi_coll_tuned_allreduce_smp_binomial_pipeline(void *send_buf,
   int inter_comm_size = (comm_size + num_core - 1) / num_core;
 
   /* copy input buffer to output buffer */
-  MPI_Sendrecv(send_buf, count, dtype, rank, tag,
+  smpi_mpi_sendrecv(send_buf, count, dtype, rank, tag,
                recv_buf, count, dtype, rank, tag, comm, &status);
 
   /* compute pipe length */
@@ -110,13 +98,13 @@ int smpi_coll_tuned_allreduce_smp_binomial_pipeline(void *send_buf,
           src = (inter_rank * num_core) + (intra_rank | mask);
           if (src < comm_size) {
             recv_offset = phase * pcount * extent;
-            MPI_Recv(tmp_buf, pcount, dtype, src, tag, comm, &status);
-            (*uop) (tmp_buf, (char *)recv_buf + recv_offset, &pcount, &dtype);
+            smpi_mpi_recv(tmp_buf, pcount, dtype, src, tag, comm, &status);
+            smpi_op_apply(op, tmp_buf, (char *)recv_buf + recv_offset, &pcount, &dtype);
           }
         } else {
           send_offset = phase * pcount * extent;
           dst = (inter_rank * num_core) + (intra_rank & (~mask));
-          MPI_Send((char *)recv_buf + send_offset, pcount, dtype, dst, tag, comm);
+          smpi_mpi_send((char *)recv_buf + send_offset, pcount, dtype, dst, tag, comm);
           break;
         }
         mask <<= 1;
@@ -134,13 +122,13 @@ int smpi_coll_tuned_allreduce_smp_binomial_pipeline(void *send_buf,
             src = (inter_rank | mask) * num_core;
             if (src < comm_size) {
               recv_offset = (phase - 1) * pcount * extent;
-              MPI_Recv(tmp_buf, pcount, dtype, src, tag, comm, &status);
-              (*uop) (tmp_buf, (char *)recv_buf + recv_offset, &pcount, &dtype);
+              smpi_mpi_recv(tmp_buf, pcount, dtype, src, tag, comm, &status);
+              smpi_op_apply(op, tmp_buf, (char *)recv_buf + recv_offset, &pcount, &dtype);
             }
           } else {
             dst = (inter_rank & (~mask)) * num_core;
             send_offset = (phase - 1) * pcount * extent;
-            MPI_Send((char *)recv_buf + send_offset, pcount, dtype, dst, tag, comm);
+            smpi_mpi_send((char *)recv_buf + send_offset, pcount, dtype, dst, tag, comm);
             break;
           }
           mask <<= 1;
@@ -157,7 +145,7 @@ int smpi_coll_tuned_allreduce_smp_binomial_pipeline(void *send_buf,
           if (inter_rank & mask) {
             src = (inter_rank - mask) * num_core;
             recv_offset = (phase - 2) * pcount * extent;
-            MPI_Recv((char *)recv_buf + recv_offset, pcount, dtype, src, tag, comm,
+            smpi_mpi_recv((char *)recv_buf + recv_offset, pcount, dtype, src, tag, comm,
                      &status);
             break;
           }
@@ -171,7 +159,7 @@ int smpi_coll_tuned_allreduce_smp_binomial_pipeline(void *send_buf,
             if (dst < comm_size) {
               //printf("Node %d send to node %d when mask is %d\n", rank, dst, mask);
               send_offset = (phase - 2) * pcount * extent;
-              MPI_Send((char *)recv_buf + send_offset, pcount, dtype, dst, tag, comm);
+              smpi_mpi_send((char *)recv_buf + send_offset, pcount, dtype, dst, tag, comm);
             }
           }
           mask >>= 1;
@@ -190,7 +178,7 @@ int smpi_coll_tuned_allreduce_smp_binomial_pipeline(void *send_buf,
         if (intra_rank & mask) {
           src = (inter_rank * num_core) + (intra_rank - mask);
           recv_offset = (phase - 3) * pcount * extent;
-          MPI_Recv((char *)recv_buf + recv_offset, pcount, dtype, src, tag, comm,
+          smpi_mpi_recv((char *)recv_buf + recv_offset, pcount, dtype, src, tag, comm,
                    &status);
           break;
         }
@@ -202,7 +190,7 @@ int smpi_coll_tuned_allreduce_smp_binomial_pipeline(void *send_buf,
         dst = (inter_rank * num_core) + (intra_rank + mask);
         if (dst < comm_size) {
           send_offset = (phase - 3) * pcount * extent;
-          MPI_Send((char *)recv_buf + send_offset, pcount, dtype, dst, tag, comm);
+          smpi_mpi_send((char *)recv_buf + send_offset, pcount, dtype, dst, tag, comm);
         }
         mask >>= 1;
       }