Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Public GIT Repository
Move collective algorithms to separate folders
[simgrid.git] / src / smpi / colls / alltoall-3dmesh.cpp
diff --git a/src/smpi/colls/alltoall-3dmesh.cpp b/src/smpi/colls/alltoall-3dmesh.cpp
deleted file mode 100644 (file)
index 10735e0..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,186 +0,0 @@
-/* Copyright (c) 2013-2014. The SimGrid Team.
- * All rights reserved.                                                     */
-
-/* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
- * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
-
-#include "colls_private.h"
-#include <math.h>
-
-/*****************************************************************************
-
- * Function: alltoall_3dmesh_shoot
-
- * Return: int
-
- * Inputs:
-    send_buff: send input buffer
-    send_count: number of elements to send
-    send_type: data type of elements being sent
-    recv_buff: receive output buffer
-    recv_count: number of elements to received
-    recv_type: data type of elements being received
-    comm: communicator
-
- * Descrp: Function realizes the alltoall operation using the 3dmesh
-           algorithm. It actually performs allgather operation in x dimension,
-           y dimension, then in z dimension. Each node then extracts the
-           needed data. The communication in all dimension is simple.
-
- * Auther: Ahmad Faraj
-****************************************************************************/
-
-static int alltoall_check_is_3dmesh(int num, int *i, int *j, int *k)
-{
-  int x, max = num / 3;
-  x = cbrt(num);
-  *i = *j = *k = 0;
-  while (x <= max) {
-    if ((num % (x * x)) == 0) {
-      *i = *j = x;
-      *k = num / (x * x);
-      return 1;
-    }
-    x++;
-  }
-  return 0;
-}
-
-int smpi_coll_tuned_alltoall_3dmesh(void *send_buff, int send_count,
-                                    MPI_Datatype send_type,
-                                    void *recv_buff, int recv_count,
-                                    MPI_Datatype recv_type, MPI_Comm comm)
-{
-  MPI_Request *reqs, *req_ptr;
-  MPI_Aint extent;
-  MPI_Status status, *statuses;
-  int i, j, src, dst, rank, num_procs, num_reqs, X, Y, Z, block_size, count;
-  int my_z, two_dsize, my_row_base, my_col_base, my_z_base, src_row_base;
-  int src_z_base, send_offset, recv_offset, tag = COLL_TAG_ALLTOALL;
-
-  char *tmp_buff1, *tmp_buff2;
-
-  rank = comm->rank();
-  num_procs = comm->size();
-  extent = send_type->get_extent();
-
-  if (!alltoall_check_is_3dmesh(num_procs, &X, &Y, &Z))
-    return MPI_ERR_OTHER;
-
-  num_reqs = X;
-  if (Y > X)
-    num_reqs = Y;
-  if (Z > Y)
-    num_reqs = Z;
-
-  two_dsize = X * Y;
-  my_z = rank / two_dsize;
-
-  my_row_base = (rank / X) * X;
-  my_col_base = (rank % Y) + (my_z * two_dsize);
-  my_z_base = my_z * two_dsize;
-
-  block_size = extent * send_count;
-
-  tmp_buff1 = (char *) smpi_get_tmp_sendbuffer(block_size * num_procs * two_dsize);
-  tmp_buff2 = (char *) smpi_get_tmp_recvbuffer(block_size * two_dsize);
-
-  statuses = (MPI_Status *) xbt_malloc(num_reqs * sizeof(MPI_Status));
-  reqs = (MPI_Request *) xbt_malloc(num_reqs * sizeof(MPI_Request));
-
-  req_ptr = reqs;
-
-  recv_offset = (rank % two_dsize) * block_size * num_procs;
-
-  Request::sendrecv(send_buff, send_count * num_procs, send_type, rank, tag,
-               tmp_buff1 + recv_offset, num_procs * recv_count,
-               recv_type, rank, tag, comm, &status);
-
-  count = send_count * num_procs;
-
-  for (i = 0; i < Y; i++) {
-    src = i + my_row_base;
-    if (src == rank)
-      continue;
-    recv_offset = (src % two_dsize) * block_size * num_procs;
-    *(req_ptr++) = Request::irecv(tmp_buff1 + recv_offset, count, recv_type, src, tag, comm);
-  }
-
-  for (i = 0; i < Y; i++) {
-    dst = i + my_row_base;
-    if (dst == rank)
-      continue;
-    Request::send(send_buff, count, send_type, dst, tag, comm);
-  }
-
-  Request::waitall(Y - 1, reqs, statuses);
-  req_ptr = reqs;
-
-
-  for (i = 0; i < X; i++) {
-    src = (i * Y + my_col_base);
-    if (src == rank)
-      continue;
-
-    src_row_base = (src / X) * X;
-
-    recv_offset = (src_row_base % two_dsize) * block_size * num_procs;
-    *(req_ptr++) = Request::irecv(tmp_buff1 + recv_offset, recv_count * num_procs * Y,
-              recv_type, src, tag, comm);
-  }
-
-  send_offset = (my_row_base % two_dsize) * block_size * num_procs;
-  for (i = 0; i < X; i++) {
-    dst = (i * Y + my_col_base);
-    if (dst == rank)
-      continue;
-    Request::send(tmp_buff1 + send_offset, send_count * num_procs * Y, send_type,
-             dst, tag, comm);
-  }
-
-  Request::waitall(X - 1, reqs, statuses);
-  req_ptr = reqs;
-
-  for (i = 0; i < two_dsize; i++) {
-    send_offset = (rank * block_size) + (i * block_size * num_procs);
-    recv_offset = (my_z_base * block_size) + (i * block_size);
-    Request::sendrecv(tmp_buff1 + send_offset, send_count, send_type, rank, tag,
-                 (char *) recv_buff + recv_offset, recv_count, recv_type,
-                 rank, tag, comm, &status);
-  }
-
-  for (i = 1; i < Z; i++) {
-    src = (rank + i * two_dsize) % num_procs;
-    src_z_base = (src / two_dsize) * two_dsize;
-
-    recv_offset = (src_z_base * block_size);
-
-    *(req_ptr++) = Request::irecv((char *) recv_buff + recv_offset, recv_count * two_dsize,
-              recv_type, src, tag, comm);
-  }
-
-  for (i = 1; i < Z; i++) {
-    dst = (rank + i * two_dsize) % num_procs;
-
-    recv_offset = 0;
-    for (j = 0; j < two_dsize; j++) {
-      send_offset = (dst + j * num_procs) * block_size;
-      Request::sendrecv(tmp_buff1 + send_offset, send_count, send_type,
-                   rank, tag, tmp_buff2 + recv_offset, recv_count,
-                   recv_type, rank, tag, comm, &status);
-
-      recv_offset += block_size;
-    }
-
-    Request::send(tmp_buff2, send_count * two_dsize, send_type, dst, tag, comm);
-
-  }
-
-  Request::waitall(Z - 1, reqs, statuses);
-
-  free(reqs);
-  free(statuses);
-  smpi_free_tmp_buffer(tmp_buff1);
-  smpi_free_tmp_buffer(tmp_buff2);
-  return MPI_SUCCESS;
-}