Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Public GIT Repository
MPI_Comm -> C++
[simgrid.git] / src / smpi / smpi_rma.cpp
index 6edbee3..2345f55 100644 (file)
@@ -6,11 +6,10 @@
 
 #include "private.h"
 #include <vector>
+#include "src/smpi/smpi_group.hpp"
 
 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_rma, smpi, "Logging specific to SMPI (RMA operations)");
 
-msg_bar_t creation_bar = nullptr;
-
 typedef struct s_smpi_mpi_win{
   void* base;
   MPI_Aint size;
@@ -19,6 +18,7 @@ typedef struct s_smpi_mpi_win{
   MPI_Info info;
   int assert;
   std::vector<MPI_Request> *requests;
+  xbt_mutex_t mut;
   msg_bar_t bar;
   MPI_Win* connected_wins;
   char* name;
@@ -29,13 +29,11 @@ typedef struct s_smpi_mpi_win{
 
 
 MPI_Win smpi_mpi_win_create( void *base, MPI_Aint size, int disp_unit, MPI_Info info, MPI_Comm comm){
-  MPI_Win win;
-
-  int comm_size = smpi_comm_size(comm);
-  int rank=smpi_comm_rank(comm);
+  int comm_size = comm->size();
+  int rank      = comm->rank();
   XBT_DEBUG("Creating window");
 
-  win = xbt_new(s_smpi_mpi_win_t, 1);
+  MPI_Win win    = xbt_new(s_smpi_mpi_win_t, 1);
   win->base = base;
   win->size = size;
   win->disp_unit = disp_unit;
@@ -48,6 +46,7 @@ MPI_Win smpi_mpi_win_create( void *base, MPI_Aint size, int disp_unit, MPI_Info
   win->opened = 0;
   win->group = MPI_GROUP_NULL;
   win->requests = new std::vector<MPI_Request>();
+  win->mut=xbt_mutex_init();
   win->connected_wins = xbt_new0(MPI_Win, comm_size);
   win->connected_wins[rank] = win;
   win->count = 0;
@@ -67,7 +66,9 @@ MPI_Win smpi_mpi_win_create( void *base, MPI_Aint size, int disp_unit, MPI_Info
 int smpi_mpi_win_free( MPI_Win* win){
   //As per the standard, perform a barrier to ensure every async comm is finished
   MSG_barrier_wait((*win)->bar);
+  xbt_mutex_acquire((*win)->mut);
   delete (*win)->requests;
+  xbt_mutex_release((*win)->mut);
   xbt_free((*win)->connected_wins);
   if ((*win)->name != nullptr){
     xbt_free((*win)->name);
@@ -77,9 +78,10 @@ int smpi_mpi_win_free( MPI_Win* win){
   }
 
   mpi_coll_barrier_fun((*win)->comm);
-  int rank=smpi_comm_rank((*win)->comm);
+  int rank=(*win)->comm->rank();
   if(rank == 0)
     MSG_barrier_destroy((*win)->bar);
+  xbt_mutex_destroy((*win)->mut);
   xbt_free(*win);
   *win = MPI_WIN_NULL;
   return MPI_SUCCESS;
@@ -97,7 +99,7 @@ void smpi_mpi_win_get_name(MPI_Win win, char* name, int* length){
 
 void smpi_mpi_win_get_group(MPI_Win win, MPI_Group* group){
   if(win->comm != MPI_COMM_NULL){
-    *group = smpi_comm_group(win->comm);
+    *group = win->comm->group();
   } else {
     *group = MPI_GROUP_NULL;
   }
@@ -107,32 +109,39 @@ void smpi_mpi_win_set_name(MPI_Win win, char* name){
   win->name = xbt_strdup(name);
 }
 
-int smpi_mpi_win_fence( int assert,  MPI_Win win){
+int smpi_mpi_win_fence(int assert, MPI_Win win)
+{
   XBT_DEBUG("Entering fence");
-  if(win->opened==0)
+  if (win->opened == 0)
     win->opened=1;
-  if(assert != MPI_MODE_NOPRECEDE){
+  if (assert != MPI_MODE_NOPRECEDE) {
+    // This is not the first fence => finalize what came before
     MSG_barrier_wait(win->bar);
-
+    xbt_mutex_acquire(win->mut);
+    // This (simulated) mutex ensures that no process pushes to the vector of requests during the waitall.
+    // Without this, the vector could get redimensionned when another process pushes.
+    // This would result in the array used by smpi_mpi_waitall() to be invalidated.
+    // Another solution would be to copy the data and cleanup the vector *before* smpi_mpi_waitall
     std::vector<MPI_Request> *reqs = win->requests;
     int size = static_cast<int>(reqs->size());
     // start all requests that have been prepared by another process
-    if(size>0){
-        for(auto req: *reqs){
-          if (req && (req->flags & PREPARED))
-            smpi_mpi_start(req);
-        }
+    if (size > 0) {
+      for (const auto& req : *reqs) {
+        if (req && (req->flags & PREPARED))
+          smpi_mpi_start(req);
+      }
 
-        MPI_Request* treqs = &(*reqs)[0];
+      MPI_Request* treqs = &(*reqs)[0];
 
-        smpi_mpi_waitall(size,treqs,MPI_STATUSES_IGNORE);
+      smpi_mpi_waitall(size, treqs, MPI_STATUSES_IGNORE);
     }
     win->count=0;
+    xbt_mutex_release(win->mut);
   }
   win->assert = assert;
 
   MSG_barrier_wait(win->bar);
-  XBT_DEBUG("Leaving fence ");
+  XBT_DEBUG("Leaving fence");
 
   return MPI_SUCCESS;
 }
@@ -148,23 +157,26 @@ int smpi_mpi_put( void *origin_addr, int origin_count, MPI_Datatype origin_datat
   void* recv_addr = static_cast<void*> ( static_cast<char*>(recv_win->base) + target_disp * recv_win->disp_unit);
   XBT_DEBUG("Entering MPI_Put to %d", target_rank);
 
-  if(target_rank != smpi_comm_rank(win->comm)){
+  if(target_rank != win->comm->rank()){
     //prepare send_request
     MPI_Request sreq = smpi_rma_send_init(origin_addr, origin_count, origin_datatype, smpi_process_index(),
-        smpi_group_index(smpi_comm_group(win->comm),target_rank), SMPI_RMA_TAG+1, win->comm, MPI_OP_NULL);
+        win->comm->group()->index(target_rank), SMPI_RMA_TAG+1, win->comm, MPI_OP_NULL);
 
     //prepare receiver request
     MPI_Request rreq = smpi_rma_recv_init(recv_addr, target_count, target_datatype, smpi_process_index(),
-        smpi_group_index(smpi_comm_group(win->comm),target_rank), SMPI_RMA_TAG+1, recv_win->comm, MPI_OP_NULL);
+        win->comm->group()->index(target_rank), SMPI_RMA_TAG+1, recv_win->comm, MPI_OP_NULL);
 
     //push request to receiver's win
+    xbt_mutex_acquire(recv_win->mut);
     recv_win->requests->push_back(rreq);
-
+    xbt_mutex_release(recv_win->mut);
     //start send
     smpi_mpi_start(sreq);
 
     //push request to sender's win
+    xbt_mutex_acquire(win->mut);
     win->requests->push_back(sreq);
+    xbt_mutex_release(win->mut);
   }else{
     smpi_datatype_copy(origin_addr, origin_count, origin_datatype, recv_addr, target_count, target_datatype);
   }
@@ -183,28 +195,30 @@ int smpi_mpi_get( void *origin_addr, int origin_count, MPI_Datatype origin_datat
   void* send_addr = static_cast<void*>(static_cast<char*>(send_win->base) + target_disp * send_win->disp_unit);
   XBT_DEBUG("Entering MPI_Get from %d", target_rank);
 
-  if(target_rank != smpi_comm_rank(win->comm)){
+  if(target_rank != win->comm->rank()){
     //prepare send_request
     MPI_Request sreq = smpi_rma_send_init(send_addr, target_count, target_datatype,
-        smpi_group_index(smpi_comm_group(win->comm),target_rank), smpi_process_index(), SMPI_RMA_TAG+2, send_win->comm,
+        win->comm->group()->index(target_rank), smpi_process_index(), SMPI_RMA_TAG+2, send_win->comm,
         MPI_OP_NULL);
 
     //prepare receiver request
     MPI_Request rreq = smpi_rma_recv_init(origin_addr, origin_count, origin_datatype,
-        smpi_group_index(smpi_comm_group(win->comm),target_rank), smpi_process_index(), SMPI_RMA_TAG+2, win->comm,
+        win->comm->group()->index(target_rank), smpi_process_index(), SMPI_RMA_TAG+2, win->comm,
         MPI_OP_NULL);
 
     //start the send, with another process than us as sender. 
     smpi_mpi_start(sreq);
-
     //push request to receiver's win
+    xbt_mutex_acquire(send_win->mut);
     send_win->requests->push_back(sreq);
+    xbt_mutex_release(send_win->mut);
 
     //start recv
     smpi_mpi_start(rreq);
-
     //push request to sender's win
+    xbt_mutex_acquire(win->mut);
     win->requests->push_back(rreq);
+    xbt_mutex_release(win->mut);
   }else{
     smpi_datatype_copy(send_addr, target_count, target_datatype, origin_addr, origin_count, origin_datatype);
   }
@@ -227,20 +241,24 @@ int smpi_mpi_accumulate( void *origin_addr, int origin_count, MPI_Datatype origi
     //As the tag will be used for ordering of the operations, add count to it
     //prepare send_request
     MPI_Request sreq = smpi_rma_send_init(origin_addr, origin_count, origin_datatype,
-        smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(win->comm),target_rank), SMPI_RMA_TAG+3+win->count, win->comm, op);
+        smpi_process_index(), win->comm->group()->index(target_rank), SMPI_RMA_TAG+3+win->count, win->comm, op);
 
     //prepare receiver request
     MPI_Request rreq = smpi_rma_recv_init(recv_addr, target_count, target_datatype,
-        smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(win->comm),target_rank), SMPI_RMA_TAG+3+win->count, recv_win->comm, op);
+        smpi_process_index(), win->comm->group()->index(target_rank), SMPI_RMA_TAG+3+win->count, recv_win->comm, op);
 
     win->count++;
     //push request to receiver's win
+    xbt_mutex_acquire(recv_win->mut);
     recv_win->requests->push_back(rreq);
+    xbt_mutex_release(recv_win->mut);
     //start send
     smpi_mpi_start(sreq);
 
     //push request to sender's win
+    xbt_mutex_acquire(win->mut);
     win->requests->push_back(sreq);
+    xbt_mutex_release(win->mut);
 
   return MPI_SUCCESS;
 }
@@ -259,17 +277,18 @@ int smpi_mpi_win_start(MPI_Group group, int assert, MPI_Win win){
     must complete, without further dependencies.  */
 
   //naive, blocking implementation.
-  int i=0,j=0;
-  int size = smpi_group_size(group);
-  MPI_Request* reqs = xbt_new0(MPI_Request, size);
-
-  while(j!=size){
-    int src=smpi_group_index(group,j);
-    if(src!=smpi_process_index()){
-      reqs[i]=smpi_irecv_init(nullptr, 0, MPI_CHAR, src,SMPI_RMA_TAG+4, MPI_COMM_WORLD);
-      i++;
-    }
-    j++;
+    int i             = 0;
+    int j             = 0;
+    int size          = group->size();
+    MPI_Request* reqs = xbt_new0(MPI_Request, size);
+
+    while (j != size) {
+      int src = group->index(j);
+      if (src != smpi_process_index() && src != MPI_UNDEFINED) {
+        reqs[i] = smpi_irecv_init(nullptr, 0, MPI_CHAR, src, SMPI_RMA_TAG + 4, MPI_COMM_WORLD);
+        i++;
+      }
+      j++;
   }
   size=i;
   smpi_mpi_startall(size, reqs);
@@ -280,19 +299,20 @@ int smpi_mpi_win_start(MPI_Group group, int assert, MPI_Win win){
   xbt_free(reqs);
   win->opened++; //we're open for business !
   win->group=group;
-  smpi_group_use(group);
+  group->use();
   return MPI_SUCCESS;
 }
 
 int smpi_mpi_win_post(MPI_Group group, int assert, MPI_Win win){
   //let's make a synchronous send here
-  int i=0,j=0;
-  int size = smpi_group_size(group);
+  int i             = 0;
+  int j             = 0;
+  int size = group->size();
   MPI_Request* reqs = xbt_new0(MPI_Request, size);
 
   while(j!=size){
-    int dst=smpi_group_index(group,j);
-    if(dst!=smpi_process_index()){
+    int dst=group->index(j);
+    if(dst!=smpi_process_index() && dst!=MPI_UNDEFINED){
       reqs[i]=smpi_mpi_send_init(nullptr, 0, MPI_CHAR, dst, SMPI_RMA_TAG+4, MPI_COMM_WORLD);
       i++;
     }
@@ -308,7 +328,7 @@ int smpi_mpi_win_post(MPI_Group group, int assert, MPI_Win win){
   xbt_free(reqs);
   win->opened++; //we're open for business !
   win->group=group;
-  smpi_group_use(group);
+  group->use();
   return MPI_SUCCESS;
 }
 
@@ -317,13 +337,14 @@ int smpi_mpi_win_complete(MPI_Win win){
     xbt_die("Complete called on already opened MPI_Win");
 
   XBT_DEBUG("Entering MPI_Win_Complete");
-  int i=0,j=0;
-  int size = smpi_group_size(win->group);
+  int i             = 0;
+  int j             = 0;
+  int size = win->group->size();
   MPI_Request* reqs = xbt_new0(MPI_Request, size);
 
   while(j!=size){
-    int dst=smpi_group_index(win->group,j);
-    if(dst!=smpi_process_index()){
+    int dst=win->group->index(j);
+    if(dst!=smpi_process_index() && dst!=MPI_UNDEFINED){
       reqs[i]=smpi_mpi_send_init(nullptr, 0, MPI_CHAR, dst, SMPI_RMA_TAG+5, MPI_COMM_WORLD);
       i++;
     }
@@ -340,21 +361,25 @@ int smpi_mpi_win_complete(MPI_Win win){
   xbt_free(reqs);
 
   //now we can finish RMA calls
-
+  xbt_mutex_acquire(win->mut);
   std::vector<MPI_Request> *reqqs = win->requests;
   size = static_cast<int>(reqqs->size());
 
   XBT_DEBUG("Win_complete - Finishing %d RMA calls", size);
-  // start all requests that have been prepared by another process
-  for (auto req: *reqqs){
-    if (req && (req->flags & PREPARED))
-      smpi_mpi_start(req);
+  if (size > 0) {
+    // start all requests that have been prepared by another process
+    for (const auto& req : *reqqs) {
+      if (req && (req->flags & PREPARED))
+        smpi_mpi_start(req);
+    }
+
+    MPI_Request* treqs = &(*reqqs)[0];
+    smpi_mpi_waitall(size, treqs, MPI_STATUSES_IGNORE);
+    reqqs->clear();
   }
+  xbt_mutex_release(win->mut);
 
-  MPI_Request* treqs = &(*reqqs)[0];
-  smpi_mpi_waitall(size,treqs,MPI_STATUSES_IGNORE);
-  reqqs->clear();
-  smpi_group_unuse(win->group);
+  win->group->unuse();
   win->opened--; //we're closed for business !
   return MPI_SUCCESS;
 }
@@ -363,12 +388,12 @@ int smpi_mpi_win_wait(MPI_Win win){
   //naive, blocking implementation.
   XBT_DEBUG("Entering MPI_Win_Wait");
   int i=0,j=0;
-  int size = smpi_group_size(win->group);
+  int size = win->group->size();
   MPI_Request* reqs = xbt_new0(MPI_Request, size);
 
   while(j!=size){
-    int src=smpi_group_index(win->group,j);
-    if(src!=smpi_process_index()){
+    int src=win->group->index(j);
+    if(src!=smpi_process_index() && src!=MPI_UNDEFINED){
       reqs[i]=smpi_irecv_init(nullptr, 0, MPI_CHAR, src,SMPI_RMA_TAG+5, MPI_COMM_WORLD);
       i++;
     }
@@ -382,22 +407,25 @@ int smpi_mpi_win_wait(MPI_Win win){
     smpi_mpi_request_free(&reqs[i]);
   }
   xbt_free(reqs);
-
+  xbt_mutex_acquire(win->mut);
   std::vector<MPI_Request> *reqqs = win->requests;
   size = static_cast<int>(reqqs->size());
 
-  XBT_DEBUG("Win_complete - Finishing %d RMA calls", size);
+  XBT_DEBUG("Win_wait - Finishing %d RMA calls", size);
+  if (size > 0) {
+    // start all requests that have been prepared by another process
+    for (const auto& req : *reqqs) {
+      if (req && (req->flags & PREPARED))
+        smpi_mpi_start(req);
+    }
 
-  // start all requests that have been prepared by another process
-  for(auto req: *reqqs){
-    if (req && (req->flags & PREPARED))
-      smpi_mpi_start(req);
+    MPI_Request* treqs = &(*reqqs)[0];
+    smpi_mpi_waitall(size, treqs, MPI_STATUSES_IGNORE);
+    reqqs->clear();
   }
+  xbt_mutex_release(win->mut);
 
-  MPI_Request* treqs = &(*reqqs)[0];
-  smpi_mpi_waitall(size,treqs,MPI_STATUSES_IGNORE);
-  reqqs->clear();
-  smpi_group_unuse(win->group);
+  win->group->unuse();
   win->opened--; //we're opened for business !
   return MPI_SUCCESS;
 }