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Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid
[simgrid.git] / doc / doxygen / options.doc
index 3cc9ea3..edb44a1 100644 (file)
@@ -18,7 +18,7 @@ type the following: \verbatim
 my_simulator --cfg=Item:Value (other arguments)
 \endverbatim
 
-Several \c --cfg command line arguments can naturally be used. If you
+Several \c `--cfg` command line arguments can naturally be used. If you
 need to include spaces in the argument, don't forget to quote the
 argument. You can even escape the included quotes (write \' for ' if
 you have your argument between ').
@@ -31,7 +31,8 @@ ignored so you don't really need to pass it. The important par is that
 within that tag, you can pass one or several \c \<prop\> tags to specify
 the configuration to use. For example, setting \c Item to \c Value
 can be done by adding the following to the beginning of your platform
-file: \verbatim
+file: 
+\verbatim
 <config>
   <prop id="Item" value="Value"/>
 </config>
@@ -239,7 +240,7 @@ initialization are done in the simulator.
 It is possible to specify a timing gap between consecutive emission on
 the same network card through the \b network/sender_gap item. This
 is still under investigation as of writting, and the default value is
-to wait 0 seconds between emissions (no gap applied).
+to wait 10 microseconds (1e-5 seconds) between emissions.
 
 \subsubsection options_model_network_asyncsend Simulating asyncronous send
 
@@ -390,8 +391,8 @@ stacks), leading to segfaults with corrupted stack traces.
 
 If you want to push the scalability limits of your code, you really
 want to reduce the \b contexts/stack_size item. Its default value
-is 128 (in Kib), while our Chord simulation works with stacks as small
-as 16 Kib, for example. For the thread factory, the default value 
+is 8192 (in KiB), while our Chord simulation works with stacks as small
+as 16 KiB, for example. For the thread factory, the default value 
 is the one of the system, if it is too large/small, it has to be set 
 with this parameter.
 
@@ -528,9 +529,38 @@ to 1, \c smpirun will display this information when the simulation ends. \verbat
 Simulation time: 1e3 seconds.
 \endverbatim
 
-\subsection options_model_smpi_detached Simulating MPI detached send
+\subsection options_smpi_global Automatic privatization of global variables
+
+MPI executables are meant to be executed in separated processes, but SMPI is 
+executed in only one process. Global variables from executables will be placed 
+in the same memory zone and shared between processes, causing hard to find bugs.
+To avoid this, several options are possible :
+  - Manual edition of the code, for example to add __thread keyword before data
+  declaration, which allows the resulting code to work with SMPI, but only 
+  if the thread factory (see \ref options_virt_factory) is used, as global 
+  variables are then placed in the TLS (thread local storage) segment. 
+  - Source-to-source transformation, to add a level of indirection 
+  to the global variables. SMPI does this for F77 codes compiled with smpiff, 
+  and used to provide coccinelle scripts for C codes, which are not functional anymore.
+  - Compilation pass, to have the compiler automatically put the data in 
+  an adapted zone. 
+  - Runtime automatic switching of the data segments. SMPI stores a copy of 
+  each global data segment for each process, and at each context switch replaces 
+  the actual data with its copy from the right process. This mechanism uses mmap,
+  and is for now limited to systems supporting this functionnality (all Linux 
+  and some BSD should be compatible).
+  Another limitation is that SMPI only accounts for global variables defined in
+  the executable. If the processes use external global variables from dynamic 
+  libraries, they won't be switched correctly. To avoid this, using static 
+  linking is advised (but not with the simgrid library, to avoid replicating 
+  its own global variables). 
+
+  To use this runtime automatic switching, the variable \b smpi/privatize_global_variables 
+  should be set to yes
 
-(this configuration item is experimental and may change or disapear)
+
+
+\subsection options_model_smpi_detached Simulating MPI detached send
 
 This threshold specifies the size in bytes under which the send will return 
 immediately. This is different from the threshold detailed in  \ref options_model_network_asyncsend