src/smpi/smpi_base.c

   1 /* Copyright (c) 2007, 2008, 2009, 2010. The SimGrid Team.
   2  * All rights reserved.                                                     */
   3
   4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   6
   7 #include "private.h"
   8 #include "xbt/virtu.h"
   9 #include "mc/mc.h"
  10 #include "xbt/replay.h"
  11 #include <errno.h>
  12 #include "simix/smx_private.h"
  13 #include "surf/surf.h"
  14
  15
  16 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_base, smpi, "Logging specific to SMPI (base)");
  17
  18
  19 static int match_recv(void* a, void* b, smx_action_t ignored) {
  20    MPI_Request ref = (MPI_Request)a;
  21    MPI_Request req = (MPI_Request)b;
  22    XBT_DEBUG("Trying to match a recv of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  23
  24   xbt_assert(ref, "Cannot match recv against null reference");
  25   xbt_assert(req, "Cannot match recv against null request");
  26   return (ref->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  27     && (ref->tag == MPI_ANY_TAG || req->tag == ref->tag);
  28 }
  29
  30 static int match_send(void* a, void* b,smx_action_t ignored) {
  31    MPI_Request ref = (MPI_Request)a;
  32    MPI_Request req = (MPI_Request)b;
  33    XBT_DEBUG("Trying to match a send of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  34    xbt_assert(ref, "Cannot match send against null reference");
  35    xbt_assert(req, "Cannot match send against null request");
  36    return (req->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  37           && (req->tag == MPI_ANY_TAG || req->tag == ref->tag);
  38 }
  39
  40 static MPI_Request build_request(void *buf, int count,
  41                                  MPI_Datatype datatype, int src, int dst,
  42                                  int tag, MPI_Comm comm, unsigned flags)
  43 {
  44   MPI_Request request;
  45
  46   void *old_buf = NULL;
  47
  48   request = xbt_new(s_smpi_mpi_request_t, 1);
  49
  50   s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
  51
  52   if(datatype->has_subtype == 1){
  53     // This part handles the problem of non-contignous memory
  54     old_buf = buf;
  55     buf = malloc(count*smpi_datatype_size(datatype));
  56     if (flags & SEND) {
  57       subtype->serialize(old_buf, buf, count, datatype->substruct);
  58     }
  59   }
  60
  61   request->buf = buf;
  62   // This part handles the problem of non-contignous memory (for the
  63   // unserialisation at the reception)
  64   request->old_buf = old_buf;
  65   request->old_type = datatype;
  66
  67   request->size = smpi_datatype_size(datatype) * count;
  68   request->src = src;
  69   request->dst = dst;
  70   request->tag = tag;
  71   request->comm = comm;
  72   request->action = NULL;
  73   request->flags = flags;
  74   request->detached = 0;
  75 #ifdef HAVE_TRACING
  76   request->send = 0;
  77   request->recv = 0;
  78 #endif
  79   return request;
  80 }
  81
  82
  83 void smpi_empty_status(MPI_Status * status) {
  84   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
  85       status->MPI_SOURCE=MPI_ANY_SOURCE;
  86       status->MPI_TAG=MPI_ANY_TAG;
  87       status->count=0;
  88   }
  89 }
  90
  91 void smpi_action_trace_run(char *path)
  92 {
  93   char *name;
  94   xbt_dynar_t todo;
  95   xbt_dict_cursor_t cursor;
  96
  97   action_fp=NULL;
  98   if (path) {
  99     action_fp = fopen(path, "r");
 100     xbt_assert(action_fp != NULL, "Cannot open %s: %s", path,
 101                strerror(errno));
 102   }
 103
 104   if (!xbt_dict_is_empty(action_queues)) {
 105     XBT_WARN
 106       ("Not all actions got consumed. If the simulation ended successfully (without deadlock), you may want to add new processes to your deployment file.");
 107
 108
 109     xbt_dict_foreach(action_queues, cursor, name, todo) {
 110       XBT_WARN("Still %lu actions for %s", xbt_dynar_length(todo), name);
 111     }
 112   }
 113
 114   if (path)
 115     fclose(action_fp);
 116   xbt_dict_free(&action_queues);
 117   action_queues = xbt_dict_new_homogeneous(NULL);
 118 }
 119
 120 static void smpi_mpi_request_free_voidp(void* request)
 121 {
 122   MPI_Request req = request;
 123   smpi_mpi_request_free(&req);
 124 }
 125
 126 /* MPI Low level calls */
 127 MPI_Request smpi_mpi_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 128                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 129 {
 130   MPI_Request request =
 131     build_request(buf, count, datatype, smpi_comm_rank(comm), dst, tag,
 132                   comm, PERSISTENT | SEND);
 133
 134   return request;
 135 }
 136
 137 MPI_Request smpi_mpi_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 138                                int src, int tag, MPI_Comm comm)
 139 {
 140   MPI_Request request =
 141     build_request(buf, count, datatype, src, smpi_comm_rank(comm), tag,
 142                   comm, PERSISTENT | RECV);
 143
 144   return request;
 145 }
 146
 147 void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
 148 {
 149   smx_rdv_t mailbox;
 150
 151   xbt_assert(!request->action,
 152              "Cannot (re)start a non-finished communication");
 153   if(request->flags & RECV) {
 154     print_request("New recv", request);
 155     if (request->size < surf_cfg_get_int("smpi/async_small_thres"))
 156       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 157     else
 158       mailbox = smpi_process_mailbox();
 159
 160     // FIXME: SIMIX does not yet support non-contiguous datatypes
 161     request->action = simcall_comm_irecv(mailbox, request->buf, &request->size, &match_recv, request);
 162   } else {
 163
 164     int receiver = smpi_group_index(smpi_comm_group(request->comm), request->dst);
 165 /*    if(receiver == MPI_UNDEFINED) {*/
 166 /*      XBT_WARN("Trying to send a message to a wrong rank");*/
 167 /*      return;*/
 168 /*    }*/
 169     print_request("New send", request);
 170     if (request->size < surf_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")) { // eager mode
 171       mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
 172     }else{
 173       XBT_DEBUG("Send request %p is not in the permanent receive mailbox (buf: %p)",request,request->buf);
 174       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 175     }
 176     if (request->size < 64*1024 ) { //(FIXME: this limit should be configurable)
 177       void *oldbuf = NULL;
 178       if(request->old_type->has_subtype == 0){
 179         oldbuf = request->buf;
 180         request->detached = 1;
 181         if (oldbuf){
 182           request->buf = malloc(request->size);
 183           memcpy(request->buf,oldbuf,request->size);
 184         }
 185       }
 186       XBT_DEBUG("Send request %p is detached; buf %p copied into %p",request,oldbuf,request->buf);
 187     }
 188
 189     request->action =
 190       simcall_comm_isend(mailbox, request->size, -1.0,
 191                          request->buf, request->size,
 192                          &match_send,
 193                          &smpi_mpi_request_free_voidp, // how to free the userdata if a detached send fails
 194                          request,
 195                          // detach if msg size < eager/rdv switch limit
 196                          request->detached);
 197
 198 #ifdef HAVE_TRACING
 199     /* FIXME: detached sends are not traceable (request->action == NULL) */
 200     if (request->action)
 201       simcall_set_category(request->action, TRACE_internal_smpi_get_category());
 202 #endif
 203
 204   }
 205
 206 }
 207
 208 void smpi_mpi_startall(int count, MPI_Request * requests)
 209 {
 210   int i;
 211
 212   for(i = 0; i < count; i++) {
 213     smpi_mpi_start(requests[i]);
 214   }
 215 }
 216
 217 void smpi_mpi_request_free(MPI_Request * request)
 218 {
 219   xbt_free(*request);
 220   *request = MPI_REQUEST_NULL;
 221 }
 222
 223 MPI_Request smpi_isend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 224                             int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 225 {
 226   MPI_Request request =
 227     build_request(buf, count, datatype, smpi_comm_rank(comm), dst, tag,
 228                   comm, NON_PERSISTENT | SEND);
 229
 230   return request;
 231 }
 232
 233 MPI_Request smpi_mpi_isend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 234                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 235 {
 236   MPI_Request request =
 237     smpi_isend_init(buf, count, datatype, dst, tag, comm);
 238
 239   smpi_mpi_start(request);
 240   return request;
 241 }
 242
 243 MPI_Request smpi_irecv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 244                             int src, int tag, MPI_Comm comm)
 245 {
 246   MPI_Request request =
 247     build_request(buf, count, datatype, src, smpi_comm_rank(comm), tag,
 248                   comm, NON_PERSISTENT | RECV);
 249   return request;
 250 }
 251
 252 MPI_Request smpi_mpi_irecv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 253                            int src, int tag, MPI_Comm comm)
 254 {
 255   MPI_Request request =
 256     smpi_irecv_init(buf, count, datatype, src, tag, comm);
 257
 258   smpi_mpi_start(request);
 259   return request;
 260 }
 261
 262 void smpi_mpi_recv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src,
 263                    int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 264 {
 265   MPI_Request request;
 266   request = smpi_mpi_irecv(buf, count, datatype, src, tag, comm);
 267   smpi_mpi_wait(&request, status);
 268 }
 269
 270
 271
 272 void smpi_mpi_send(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst,
 273                    int tag, MPI_Comm comm)
 274 {
 275   MPI_Request request;
 276
 277   request = smpi_mpi_isend(buf, count, datatype, dst, tag, comm);
 278   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 279 }
 280
 281 void smpi_mpi_sendrecv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 282                        int dst, int sendtag, void *recvbuf, int recvcount,
 283                        MPI_Datatype recvtype, int src, int recvtag,
 284                        MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 285 {
 286   MPI_Request requests[2];
 287   MPI_Status stats[2];
 288
 289   requests[0] =
 290     smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, dst, sendtag, comm);
 291   requests[1] =
 292     smpi_irecv_init(recvbuf, recvcount, recvtype, src, recvtag, comm);
 293   smpi_mpi_startall(2, requests);
 294   smpi_mpi_waitall(2, requests, stats);
 295   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 296     // Copy receive status
 297     memcpy(status, &stats[1], sizeof(MPI_Status));
 298   }
 299 }
 300
 301 int smpi_mpi_get_count(MPI_Status * status, MPI_Datatype datatype)
 302 {
 303   return status->count / smpi_datatype_size(datatype);
 304 }
 305
 306 static void finish_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 307 {
 308   MPI_Request req = *request;
 309   // if we have a sender, we should use its data, and not the data from the receive
 310   //FIXME : mail fail if req->action has already been freed, the pointer being invalid
 311   if((req->action)&&
 312      (req->src==MPI_ANY_SOURCE || req->tag== MPI_ANY_TAG))
 313     req = (MPI_Request)SIMIX_comm_get_src_data((*request)->action);
 314
 315   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 316     status->MPI_SOURCE = req->src;
 317     status->MPI_TAG = req->tag;
 318     //if((*request)->action && ((MPI_Request)SIMIX_comm_get_src_data((*request)->action))->size == (*request)->size)
 319     status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
 320     //else status->MPI_ERROR = MPI_ERR_TRUNCATE;
 321     // this handles the case were size in receive differs from size in send
 322     // FIXME: really this should just contain the count of receive-type blocks,
 323     // right?
 324     status->count = req->size;
 325   }
 326   req = *request;
 327
 328   print_request("Finishing", req);
 329   MPI_Datatype datatype = req->old_type;
 330   if(datatype->has_subtype == 1){
 331       // This part handles the problem of non-contignous memory
 332       // the unserialization at the reception
 333     s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
 334     if(req->flags & RECV) {
 335       subtype->unserialize(req->buf, req->old_buf, req->size/smpi_datatype_size(datatype) , datatype->substruct);
 336     }
 337     if(req->detached == 0) free(req->buf);
 338   }
 339
 340   if(req->flags & NON_PERSISTENT) {
 341     smpi_mpi_request_free(request);
 342   } else {
 343     req->action = NULL;
 344   }
 345 }
 346
 347 int smpi_mpi_test(MPI_Request * request, MPI_Status * status) {
 348   int flag;
 349
 350   //assume that request is not MPI_REQUEST_NULL (filtered in PMPI_Test or smpi_mpi_testall before)
 351   if ((*request)->action == NULL)
 352     flag = 1;
 353   else
 354     flag = simcall_comm_test((*request)->action);
 355   if(flag) {
 356     finish_wait(request, status);
 357   }else{
 358     smpi_empty_status(status);
 359   }
 360   return flag;
 361 }
 362
 363 int smpi_mpi_testany(int count, MPI_Request requests[], int *index,
 364                      MPI_Status * status)
 365 {
 366   xbt_dynar_t comms;
 367   int i, flag, size;
 368   int* map;
 369
 370   *index = MPI_UNDEFINED;
 371   flag = 0;
 372   if(count > 0) {
 373     comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_action_t), NULL);
 374     map = xbt_new(int, count);
 375     size = 0;
 376     for(i = 0; i < count; i++) {
 377       if((requests[i]!=MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->action) {
 378          xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
 379          map[size] = i;
 380          size++;
 381       }
 382     }
 383     if(size > 0) {
 384       i = simcall_comm_testany(comms);
 385       // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 386       if(i != -1) {
 387         *index = map[i];
 388         finish_wait(&requests[*index], status);
 389         flag = 1;
 390       }
 391     }else{
 392         //all requests are null or inactive, return true
 393         flag=1;
 394         smpi_empty_status(status);
 395     }
 396     xbt_free(map);
 397     xbt_dynar_free(&comms);
 398   }
 399
 400   return flag;
 401 }
 402
 403
 404 int smpi_mpi_testall(int count, MPI_Request requests[],
 405                      MPI_Status status[])
 406 {
 407   MPI_Status stat;
 408   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 409   int flag=1;
 410   int i;
 411   for(i=0; i<count; i++){
 412     if(requests[i]!= MPI_REQUEST_NULL){
 413       if (smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)!=1){
 414         flag=0;
 415       }
 416     }else{
 417       smpi_empty_status(pstat);
 418     }
 419     if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 420       memcpy(&status[i], pstat, sizeof(*pstat));
 421     }
 422   }
 423   return flag;
 424 }
 425
 426 void smpi_mpi_probe(int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status* status){
 427   int flag=0;
 428   //FIXME find another wait to avoid busy waiting ?
 429   // the issue here is that we have to wait on a nonexistent comm
 430   while(flag==0){
 431     smpi_mpi_iprobe(source, tag, comm, &flag, status);
 432     XBT_DEBUG("Busy Waiting on probing : %d", flag);
 433     if(!flag) {
 434       simcall_process_sleep(0.0001);
 435     }
 436   }
 437 }
 438
 439 void smpi_mpi_iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int* flag, MPI_Status* status){
 440   MPI_Request request =build_request(NULL, 0, MPI_CHAR, source, smpi_comm_rank(comm), tag,
 441             comm, NON_PERSISTENT | RECV);
 442
 443   // behave like a receive, but don't do it
 444   smx_rdv_t mailbox;
 445
 446   print_request("New iprobe", request);
 447   // We have to test both mailboxes as we don't know if we will receive one one or another
 448     if (surf_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")>0){
 449         mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 450         XBT_DEBUG("trying to probe the perm recv mailbox");
 451         request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, request->src, request->tag, &match_recv, (void*)request);
 452     }
 453     if (request->action==NULL){
 454         mailbox = smpi_process_mailbox();
 455         XBT_DEBUG("trying to probe the other mailbox");
 456         request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, request->src, request->tag, &match_recv, (void*)request);
 457     }
 458
 459   if(request->action){
 460     MPI_Request req = (MPI_Request)SIMIX_comm_get_src_data(request->action);
 461     *flag = 1;
 462     if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 463       status->MPI_SOURCE = req->src;
 464       status->MPI_TAG = req->tag;
 465       status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
 466       status->count = req->size;
 467     }
 468   }
 469   else *flag = 0;
 470   smpi_mpi_request_free(&request);
 471
 472   return;
 473 }
 474
 475 void smpi_mpi_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 476 {
 477   print_request("Waiting", *request);
 478   if ((*request)->action != NULL) { // this is not a detached send
 479     simcall_comm_wait((*request)->action, -1.0);
 480     finish_wait(request, status);
 481   }
 482   // FIXME for a detached send, finish_wait is not called:
 483 }
 484
 485 int smpi_mpi_waitany(int count, MPI_Request requests[],
 486                      MPI_Status * status)
 487 {
 488   xbt_dynar_t comms;
 489   int i, size, index;
 490   int *map;
 491
 492   index = MPI_UNDEFINED;
 493   if(count > 0) {
 494     // Wait for a request to complete
 495     comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_action_t), NULL);
 496     map = xbt_new(int, count);
 497     size = 0;
 498     XBT_DEBUG("Wait for one of");
 499     for(i = 0; i < count; i++) {
 500       if((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) && (requests[i]->action != NULL)) {
 501         print_request("Waiting any ", requests[i]);
 502         xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
 503         map[size] = i;
 504         size++;
 505       }
 506     }
 507     if(size > 0) {
 508       i = simcall_comm_waitany(comms);
 509
 510       // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 511       if (i != -1) {
 512         index = map[i];
 513         finish_wait(&requests[index], status);
 514       }
 515     }
 516     xbt_free(map);
 517     xbt_dynar_free(&comms);
 518   }
 519
 520   if (index==MPI_UNDEFINED)
 521     smpi_empty_status(status);
 522
 523   return index;
 524 }
 525
 526 int smpi_mpi_waitall(int count, MPI_Request requests[],
 527                       MPI_Status status[])
 528 {
 529   int  index, c;
 530   MPI_Status stat;
 531   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 532   int retvalue=MPI_SUCCESS;
 533   //tag invalid requests in the set
 534   for(c = 0; c < count; c++) {
 535     if(requests[c]==MPI_REQUEST_NULL || requests[c]->dst == MPI_PROC_NULL ){
 536       if(status != MPI_STATUSES_IGNORE)
 537         smpi_empty_status(&status[c]);
 538     }else if(requests[c]->src == MPI_PROC_NULL ){
 539       if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 540         smpi_empty_status(&status[c]);
 541         status[c].MPI_SOURCE=MPI_PROC_NULL;
 542       }
 543     }
 544   }
 545
 546   for(c = 0; c < count; c++) {
 547       if(MC_is_active()) {
 548         smpi_mpi_wait(&requests[c], pstat);
 549         index = c;
 550       } else {
 551         index = smpi_mpi_waitany(count, requests, pstat);
 552         if(index == MPI_UNDEFINED) {
 553           break;
 554        }
 555       if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 556         memcpy(&status[index], pstat, sizeof(*pstat));
 557         if(status[index].MPI_ERROR==MPI_ERR_TRUNCATE)retvalue=MPI_ERR_IN_STATUS;
 558
 559       }
 560     }
 561   }
 562   return retvalue;
 563 }
 564
 565 int smpi_mpi_waitsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices,
 566                       MPI_Status status[])
 567 {
 568   int i, count, index;
 569   MPI_Status stat;
 570   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 571
 572   count = 0;
 573   for(i = 0; i < incount; i++)
 574   {
 575     index=smpi_mpi_waitany(incount, requests, pstat);
 576     if(index!=MPI_UNDEFINED){
 577       indices[count] = index;
 578       count++;
 579       if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 580         memcpy(&status[index], pstat, sizeof(*pstat));
 581       }
 582     }else{
 583       return MPI_UNDEFINED;
 584     }
 585   }
 586   return count;
 587 }
 588
 589 int smpi_mpi_testsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices,
 590                       MPI_Status status[])
 591 {
 592   int i, count, count_dead;
 593   MPI_Status stat;
 594   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 595
 596   count = 0;
 597   count_dead = 0;
 598   for(i = 0; i < incount; i++) {
 599     if((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL)) {
 600       if(smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)) {
 601          indices[count] = i;
 602          count++;
 603          if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 604             memcpy(&status[i], pstat, sizeof(*pstat));
 605          }
 606       }
 607     }else{
 608       count_dead++;
 609     }
 610   }
 611   if(count_dead==incount)return MPI_UNDEFINED;
 612   else return count;
 613 }
 614
 615 void smpi_mpi_bcast(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int root,
 616                     MPI_Comm comm)
 617 {
 618   // arity=2: a binary tree, arity=4 seem to be a good setting (see P2P-MPI))
 619   nary_tree_bcast(buf, count, datatype, root, comm, 4);
 620 }
 621
 622 void smpi_mpi_barrier(MPI_Comm comm)
 623 {
 624   // arity=2: a binary tree, arity=4 seem to be a good setting (see P2P-MPI))
 625   nary_tree_barrier(comm, 4);
 626 }
 627
 628 void smpi_mpi_gather(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 629                      void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
 630                      int root, MPI_Comm comm)
 631 {
 632   int system_tag = 666;
 633   int rank, size, src, index;
 634   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
 635   MPI_Request *requests;
 636
 637   rank = smpi_comm_rank(comm);
 638   size = smpi_comm_size(comm);
 639   if(rank != root) {
 640     // Send buffer to root
 641     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
 642   } else {
 643     // FIXME: check for errors
 644     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
 645     // Local copy from root
 646     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
 647                        (char *)recvbuf + root * recvcount * recvext, recvcount, recvtype);
 648     // Receive buffers from senders
 649     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
 650     index = 0;
 651     for(src = 0; src < size; src++) {
 652       if(src != root) {
 653         requests[index] = smpi_irecv_init((char *)recvbuf + src * recvcount * recvext,
 654                                           recvcount, recvtype,
 655                                           src, system_tag, comm);
 656         index++;
 657       }
 658     }
 659     // Wait for completion of irecv's.
 660     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
 661     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 662     xbt_free(requests);
 663   }
 664 }
 665
 666 void smpi_mpi_gatherv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 667                       void *recvbuf, int *recvcounts, int *displs,
 668                       MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
 669 {
 670   int system_tag = 666;
 671   int rank, size, src, index;
 672   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
 673   MPI_Request *requests;
 674
 675   rank = smpi_comm_rank(comm);
 676   size = smpi_comm_size(comm);
 677   if(rank != root) {
 678     // Send buffer to root
 679     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
 680   } else {
 681     // FIXME: check for errors
 682     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
 683     // Local copy from root
 684     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
 685                        (char *)recvbuf + displs[root] * recvext,
 686                        recvcounts[root], recvtype);
 687     // Receive buffers from senders
 688     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
 689     index = 0;
 690     for(src = 0; src < size; src++) {
 691       if(src != root) {
 692         requests[index] =
 693           smpi_irecv_init((char *)recvbuf + displs[src] * recvext,
 694                           recvcounts[src], recvtype, src, system_tag, comm);
 695         index++;
 696       }
 697     }
 698     // Wait for completion of irecv's.
 699     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
 700     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 701     xbt_free(requests);
 702   }
 703 }
 704
 705 void smpi_mpi_allgather(void *sendbuf, int sendcount,
 706                         MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
 707                         int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
 708                         MPI_Comm comm)
 709 {
 710   int system_tag = 666;
 711   int rank, size, other, index;
 712   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
 713   MPI_Request *requests;
 714
 715   rank = smpi_comm_rank(comm);
 716   size = smpi_comm_size(comm);
 717   // FIXME: check for errors
 718   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
 719   // Local copy from self
 720   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
 721                      (char *)recvbuf + rank * recvcount * recvext, recvcount,
 722                      recvtype);
 723   // Send/Recv buffers to/from others;
 724   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
 725   index = 0;
 726   for(other = 0; other < size; other++) {
 727     if(other != rank) {
 728       requests[index] =
 729         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,
 730                         comm);
 731       index++;
 732       requests[index] = smpi_irecv_init((char *)recvbuf + other * recvcount * recvext,
 733                                         recvcount, recvtype, other,
 734                                         system_tag, comm);
 735       index++;
 736     }
 737   }
 738   // Wait for completion of all comms.
 739   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
 740   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 741   xbt_free(requests);
 742 }
 743
 744 void smpi_mpi_allgatherv(void *sendbuf, int sendcount,
 745                          MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
 746                          int *recvcounts, int *displs,
 747                          MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
 748 {
 749   int system_tag = 666;
 750   int rank, size, other, index;
 751   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
 752   MPI_Request *requests;
 753
 754   rank = smpi_comm_rank(comm);
 755   size = smpi_comm_size(comm);
 756   // FIXME: check for errors
 757   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
 758   // Local copy from self
 759   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
 760                      (char *)recvbuf + displs[rank] * recvext,
 761                      recvcounts[rank], recvtype);
 762   // Send buffers to others;
 763   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
 764   index = 0;
 765   for(other = 0; other < size; other++) {
 766     if(other != rank) {
 767       requests[index] =
 768         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,
 769                         comm);
 770       index++;
 771       requests[index] =
 772         smpi_irecv_init((char *)recvbuf + displs[other] * recvext, recvcounts[other],
 773                         recvtype, other, system_tag, comm);
 774       index++;
 775     }
 776   }
 777   // Wait for completion of all comms.
 778   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
 779   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 780   xbt_free(requests);
 781 }
 782
 783 void smpi_mpi_scatter(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 784                       void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
 785                       int root, MPI_Comm comm)
 786 {
 787   int system_tag = 666;
 788   int rank, size, dst, index;
 789   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
 790   MPI_Request *requests;
 791
 792   rank = smpi_comm_rank(comm);
 793   size = smpi_comm_size(comm);
 794   if(rank != root) {
 795     // Recv buffer from root
 796     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm,
 797                   MPI_STATUS_IGNORE);
 798   } else {
 799     // FIXME: check for errors
 800     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
 801     // Local copy from root
 802     smpi_datatype_copy((char *)sendbuf + root * sendcount * sendext,
 803                        sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
 804     // Send buffers to receivers
 805     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
 806     index = 0;
 807     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
 808       if(dst != root) {
 809         requests[index] = smpi_isend_init((char *)sendbuf + dst * sendcount * sendext,
 810                                           sendcount, sendtype, dst,
 811                                           system_tag, comm);
 812         index++;
 813       }
 814     }
 815     // Wait for completion of isend's.
 816     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
 817     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 818     xbt_free(requests);
 819   }
 820 }
 821
 822 void smpi_mpi_scatterv(void *sendbuf, int *sendcounts, int *displs,
 823                        MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, int recvcount,
 824                        MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
 825 {
 826   int system_tag = 666;
 827   int rank, size, dst, index;
 828   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
 829   MPI_Request *requests;
 830
 831   rank = smpi_comm_rank(comm);
 832   size = smpi_comm_size(comm);
 833   if(rank != root) {
 834     // Recv buffer from root
 835     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm,
 836                   MPI_STATUS_IGNORE);
 837   } else {
 838     // FIXME: check for errors
 839     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
 840     // Local copy from root
 841     smpi_datatype_copy((char *)sendbuf + displs[root] * sendext, sendcounts[root],
 842                        sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
 843     // Send buffers to receivers
 844     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
 845     index = 0;
 846     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
 847       if(dst != root) {
 848         requests[index] =
 849           smpi_isend_init((char *)sendbuf + displs[dst] * sendext, sendcounts[dst],
 850                           sendtype, dst, system_tag, comm);
 851         index++;
 852       }
 853     }
 854     // Wait for completion of isend's.
 855     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
 856     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 857     xbt_free(requests);
 858   }
 859 }
 860
 861 void smpi_mpi_reduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
 862                      MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, int root,
 863                      MPI_Comm comm)
 864 {
 865   int system_tag = 666;
 866   int rank, size, src, index;
 867   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
 868   MPI_Request *requests;
 869   void **tmpbufs;
 870
 871   rank = smpi_comm_rank(comm);
 872   size = smpi_comm_size(comm);
 873   if(rank != root) {
 874     // Send buffer to root
 875     smpi_mpi_send(sendbuf, count, datatype, root, system_tag, comm);
 876   } else {
 877     // FIXME: check for errors
 878     smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
 879     // Local copy from root
 880     if (sendbuf && recvbuf)
 881       smpi_datatype_copy(sendbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
 882     // Receive buffers from senders
 883     //TODO: make a MPI_barrier here ?
 884     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
 885     tmpbufs = xbt_new(void *, size - 1);
 886     index = 0;
 887     for(src = 0; src < size; src++) {
 888       if(src != root) {
 889         // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
 890         //  mapping...
 891         tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
 892         requests[index] =
 893           smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, src,
 894                           system_tag, comm);
 895         index++;
 896       }
 897     }
 898     // Wait for completion of irecv's.
 899     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
 900     for(src = 0; src < size - 1; src++) {
 901       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 902       XBT_DEBUG("finished waiting any request with index %d", index);
 903       if(index == MPI_UNDEFINED) {
 904         break;
 905       }
 906       if(op) /* op can be MPI_OP_NULL that does nothing */
 907         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
 908     }
 909     for(index = 0; index < size - 1; index++) {
 910       xbt_free(tmpbufs[index]);
 911     }
 912     xbt_free(tmpbufs);
 913     xbt_free(requests);
 914   }
 915 }
 916
 917 void smpi_mpi_allreduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
 918                         MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
 919 {
 920   smpi_mpi_reduce(sendbuf, recvbuf, count, datatype, op, 0, comm);
 921   smpi_mpi_bcast(recvbuf, count, datatype, 0, comm);
 922 }
 923
 924 void smpi_mpi_scan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
 925                    MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
 926 {
 927   int system_tag = 666;
 928   int rank, size, other, index;
 929   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
 930   MPI_Request *requests;
 931   void **tmpbufs;
 932
 933   rank = smpi_comm_rank(comm);
 934   size = smpi_comm_size(comm);
 935
 936   // FIXME: check for errors
 937   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
 938
 939   // Local copy from self
 940   smpi_datatype_copy(sendbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
 941
 942   // Send/Recv buffers to/from others;
 943   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
 944   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
 945   index = 0;
 946   for(other = 0; other < rank; other++) {
 947     // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
 948     // mapping...
 949     tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
 950     requests[index] =
 951       smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag,
 952                       comm);
 953     index++;
 954   }
 955   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
 956     requests[index] =
 957       smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
 958     index++;
 959   }
 960   // Wait for completion of all comms.
 961   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
 962   for(other = 0; other < size - 1; other++) {
 963     index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 964     if(index == MPI_UNDEFINED) {
 965       break;
 966     }
 967     if(index < rank) {
 968       // #Request is below rank: it's a irecv
 969       smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
 970     }
 971   }
 972   for(index = 0; index < rank; index++) {
 973     xbt_free(tmpbufs[index]);
 974   }
 975   xbt_free(tmpbufs);
 976   xbt_free(requests);
 977 }