Added small section on backbone.

Removed wrong endtags from documentation.

- There is no such thing as endnote or endremark; just use indentation.

Updated section on network equipments (mostly cosmetics).

- Added the backbone tag, though

Updated description and presentation of available resources.

Updated the 'sharing policy' part for links.

Updated platform.doc to explain the cluster tag more thoroughly.

Rephrased cluster description

Documentation overhaul started.

Boost.Context context factory

 * This is a portable replacement for ucontext.h (makecontext,
   swapcontext, getcontext, setcontext) which is not in recent POSIX
   specs and was apparently removed from Mac OS X since 10.9. POSIX
   2008 still has ucontext_t however (moved into signal.h).

 * Currently works only for Boost <= 1.55 (the Boost.Context API
   changed slightly afterwards).

 * Does not work with MC because we currently depend on the contexts
   being ucontext_t (we'd have to convert fcontext into ucontext_t).

 * No support for parallel execution support (yet).

Fix previous commit

Tentatively fix the detection of ucontext.h in Darwin

Added xbt_assert statement to smpi_mpi_dt.c

* This will help prevent a value <= 0

Fixed bug in SMPI datatypes, causing SG to segfault.

- For pre-defined datatypes such as MPI_INT, the 'in_use' counter of
  that datatype was able to obtain negative values in certain cases.

  This caused SimGrid to crash with a segfault, for instance when
  running fupermod.

This bug was reported by Tania Malik on
the 24th of February on the SG Mailing list.

[SURF] Added comment for surf_share_resources

[SURF] Added simple method comment for AsDijkstra::addLoopback()

[mc] Fix realloc() in mc_process.cpp

[mc] Fix pointer dereference after free()

[mc] exit() instead of abort() in normal operation

[mc] Add a message to explain no property violation is found

[mc] Remove mc_region_contain(), use the method instead

[mc] C++ify RegionType, StorageType enums

Namespaced and strongly-typed.

[mc] Fix compilation error on clang (and group all the region creation functions together)

error: 'MC_region_sparse' has C-linkage specified, but returns user-defined type 'simgrid::mc::RegionSnapshot' which is incompatible with C

temp

[mc] Enable record in liveness mode

stupid me

[mc] Use vector<RegionSnapshot> instead of vector<unique_ptr<RegionSnapshot>> in RegionSnapshot

[mc] Fix typo in e_mc_region_storage_type_t

[mc] Remove deprecated MC_snapshot_read()

[mc] RegionSnapshot, make all fields private

[mc] RegionSnapshot, make data private

[mc] RegionSnapshot class

[mc] Remove broken test

We don't handle NULL as a valid/special region anymore.

[mc] Remove mc_translate_address()

Not used and probably not very useful/usable with chunked snapshots.

more verbose error message on error

[mc] Fix mc_translate_address() for MC_REGION_STORAGE_TYPE_PRIVATIZED:

It was incorrectly calling itself insteaf of translating the region in
the "sub-region".

[mc] Make Process::socket_ private

[mc] Make Process::memory_map_ a std::vector

[mc] Mark some Process attributes as private

[SMPI] Fixed portability issues with shm_open.

- According to "man 3 shm_open", these handles should
  begin with a slash (/); this commit fixes that.

[SMPI] Added several document blocks for ois, or and ois

- I hope this makes it easier to understand what is going
  on here!

[SMPI] Just some cosmetics (indentation), no changes

[SMPI] Improved several comments in the code

[SURF] Fixed config option network/weight_S_parameter

- This configuration option is actually called
  network/weight_S; I changed that. Note though that
  network/weight_S is stored in a variable called
  sg_weight_S_parameter, which adds to confusion.

[mc] Fix cross-process access to simcall_comm_***any__get__comms

The array in an array of smx_synchro_t and not of s_smx_synchro_t.

[mc] Fix remote_ptr

[mc] Fix printf format

[mc] Replace the override word with MC_OVERRIDE

The compilers used by the CI infratrsucture do not handle this. In the
future, we might detect if the compiler grokes it and we might
conditionnaly use:

[mc] Fix spurious call fo remote()

[mc] Remote deprecated functions MC_snapshot_read_pointer()

[mc] Fix the translation of privatisation section in Process::read_bytes()

[mc] Private Process::pid

[mc] Make a std::vector of Process::checkpoint_ignore

[mc] Move cross process reading support for SBT structure in a separate file

[mc] Move methods in Process class

[mc] Add remote_ptr for marking pointers-to/addresses-in the remote process

[mc] Remove compatibility stuff

[mc] Fix bug in Snapshot::read_bytes

MC_region_read is allowed to return a pointer to another buffer containing the data.
We have to handle this case.

[mc] Make C++ classes out of addres_space, process, snapshot

Removed PIPOL documentation and added CI (Jenkins)

- PIPOL seems to have been an old system used for that
  purpose; all references were removed or updated.

- Added a file called "inside_ci.doc". There are sometimes
  tricky things that one wants to do with Jenkins and it's
  good for us to have a starting point here.

Removed broken reference from FAQ

- The reference to "faq_more_processes" did not exist.
  I removed it, as doxygen complained about it.

Fix the implicit declaration issue - Ad(rien)

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr/gitroot/simgrid/simgrid

Fix java cloud integration tesh files

Added dependency on FLEX 2.5.39 to MaintainerMode

With a minor version such as 2.5.35 (available in wheezy),
MaintainerMode will break: The generated files will contain
signatures that are incompatible with SimGrid. (Apparently
generated functions changed their signature during these versions,
from "int" to "yy_size_t")

Fix cloud integration tesh files

Compilation is at least ok - Ad(rien)

missing to add few files - Ad(rien)

Forgot to add the declaration - Ad(rien)

More progress toward the atomic simcall for vm migration - Ad(rien)

First steps to add a new VM simcall - Ad(rien)

Fix broken link

Fix broken link

[mc] Mark many MC symbols as hidden

Some of them cannot be hidden because they are used in the unit tests.

[mc] Fix MC_free_object

xbt_free() does not take a pointer to the pointer but the pointer.
This behaviour is different from xbt_dict_free, xbt_dynar_free...

[mc] Fix parameter order in unit test of mc_snapshot

[mc] Only use prctl(PR_SET_PDEATHSIG) on Linux

[mc] Fix typo

[mc] Knowledge about the size of pointer types in DWARF

Some compilers do not emit DW_AT_byte_size for DW_TAG_pointer_type, so
we fill this. We currently assume that the model-checked process is in
the same architecture.

This fixes the model-checker in clang.

[mc] Remove useless variable

Fix xbt_fifo_foreach

Does not compile on some versions of clang

[mc] Cleanup horrible for loop

[mc] Cleanup horrible for loop

[mc] Fix XBT_ERROR message

[mc] Remove designated initializers

[mc] Remove designated initializers

[mc] Fix formatting specification

[mc] Remove designated initializers

[mc] Fix type of zero_buffer_size in mc_process.c

Fix sign-compare warning.

[mc] Fix unitialized variable

[mc] Add missing inttypes.h include

[mc] Fix mm_fake_malloc() implementation

[mc] Fix mmalloc with fortran

Use a .bss segment for data storage when initializing the library.
This was removed from a previous commit but it is needed after all.
However, in this implementation we should avoid using it as much as
possible: it should only be used for the dlsym() calls.

[mc] Fixed the compilation on non-MC build

I just broke it.

[mc] Fix the umpire tesh files

[mc] Fix segfault in MC_request_is_enabled() executed on MCed-side

[mc] Fix umpire tests invocations (call simgrid-mc)

The tesh files are still broken however.

Added include_path and dependencies for FreeBSD < 10.0

- Commit eea4e2cc87b80c35b33f46377187181e57692440 has enabled C++11
  for SimGrid. However, FreeBSD 9.1 does not have a compiler that
  supports this. Here's a nasty workaround, making the bold assumption
  that libc++ is installed (by default, it's not) and where we can
  find it.

- With this hack, FreeBSD CI should work again :)

Added reference link to comment in MakeLib.cmake

Fixed exception tests

- New configuration option "exception/cutpath" introduced. This makes
  it possible to remove the path to files in backtraces as used for exceptions.

- .tesh files adjusted to reflect this change.

Fixed typo in sg_config.c