make cluster routing a bit more flexible, to allow adding other kinds of clusters
for each node, link creation is made inside the specific routing file,
except for loopback and backbone which are done in surf_routing if they are needed

add handling of the torus topology inside clusters

update dtd to add torus_dimensions tag to clusters

Only initialize comm_self when it is used (saves a lot of memory when a large number of nodes is used)

coverage + modelchecker were behaving very badly (timeout for every test) on continuous integration systems

fix dist build

avoid compiling too many times mtest files from mpich testsuite, just use it as a static lib
This should speed up compilation of testsuite, and avoid problems with parallel builds

Memleaks fixes on VM

I meant to paraphrase the expression 'give me liberty or give me death', actually

Add -std=gnu99 to compile flags.

That's the C dialect we're using anyway, and it allows initial
declarations in for loops.

respect the wishes of the blamee ;)

english orrection

Fix a bug

Add doc to new tool

Add normalizing pointers addresses tool

Fix

Remove all dynamic casts

Merge lmm into base to avoid diamond inheritance

Replace swag by boost::intrusive::list in surf

fix an example of vm migration

Revert "prevent using garbage in data field"

smx_host_t and smx_storage_t should be dict_elm.

This reverts commit 9c6d72b5bbc9f9b0f9d61c8964fabacaaa2a9914.

This revert is a cheri-pick from the hypervisor branch.

Conflicts:
src/simix/smx_host.c

Keep the capping setting of a VM after migration.

Cherry-pick from the hypervisor branch.
Manually fix conflicts around c++ surf.

Conflicts:
src/surf/vm_workstation.c

forgot some functions in last commit ...

ok.. let's make all in surf.h xbt_public

fix win build (missing xbt_public)

remove double implementation

fix cxx flag for win build

put back some data necessary for win build

Clean surf interface

Fix segfault at end of simulation.

Happens when msg_global is NULL, and only with MSG_USE_DEPECATED.

Fix build with MSG_USE_DEPRECATED.

One more valgrind suppression for backtrace/makecontext.

Cosmetics: use dashes instead of underscores in test names.

Cosmetics: fix spacing.

Use values of type double.

Parse contents *after* having set other fields (particularly "m_usedSize").

This is already called by the constructor of the base class NetworkCm02Model.

Fixes memory leak.

Delete temporary strings.

Fixes memory leak.

Fields already initialized by constructor of the base class Storage.

Fixes memory leak.

Field already exists in StorageModel.

Fixes valgrind error about conditional jump depending on uninitialized value.

This is already destroyed by Storage::~Storage.

Fixes double-free error.

Remove unused methods.

Clang warned about overloaded functions of different types.

Make prototype match overloaded function from class NetworkModel.

Fixes Clang warning.

Comment unused parameter.

Fixes compiler warning.

Comment unused functions.

Should be removed if they are really unused.

Fix initialization order.

Compilers whine when it's different from the declaration order.

Remove useless information from debug message.

Fixes error with format string.

Initialize variables.

Use SG_{BEGIN,END}_DECL() for what it's designed to serve.

In XBT_LOG_NEW_SUBCATEGORY_helper, protect function declaration with SG_{BEGIN,END}_DECL().

Also remove now useless extern "C" specifications.

Untabify.

Restructure surf++ workstation vmworkstation

These defines are useless.

Restructure surf++ storage

Fix network_interface bug

Add missing files (again)

Restructure surf++ cpu and network

Fix WorkstationCLM03::fileSeek return type

Add MSG_file_seek function

Add MSG_file_tell function and prepare MSG_file_seek

Update io tesh file according to MSG_file_write bug fix

Fix MSG_file_write bug

category will be strduped in surf.cpp: Action::setCategory. No need to
do it twice. leak --

Fix memleak

no need to protect surf_mins by ifdef, allocated whatever the factory

cannot compare dynar to 0

Fix memleak

Fix smpi memleak

leak--

Oops I forget to add new header to DefinePackages.cmake

Fix issue with surf.h included in simix.h

Fix network constant issues

Fix Memleaks

Fix perms for files installed on scm.gforge.inria.fr.

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Fix memleak

Protect special characters.

Fix memcheck_tests where CMake apparently break words on '('.

Fix free of uninitialized values

Resolve memory leaks

Move quote to run this test correctly with memcheck (and actually see errors).

Doc update.

Release goal++

fixes were trashed by merge

Should be sg_size_t.

Initialize variable there too.

Initialize another bunch of variables.

Correct condition.

Parameters are unused.

Initialize a few more variables.

Ok, ok. Let's keep 32bits for a while

Put set_bound and set_affinity at Cpu level

Fix storage.cpp writeActions issue

Initialize variables.

Fix delete/free mismatch.

Fix clang warnings about mismatched declarations (struct vs. class).

Fix doxygen/javadoc warnings.

Connect new log categories.

Parse c++ files too.

Fix no storage share resource in VM

More updates in next release goals.