[examples] smpi-replay-mmd: use s4u::Barrier

[doc] rtd: link to example s4u-barrier

Update changelog

send warning here instead of debug

fix warnings

activate fortran attr tests

Have attributes actually work in fortran... the horror
Callbacks signatures and behavior differ slightly from C, so try to do that correctly, if not cleanly

get was done, now fix set

protect against failed get

Fix dist.

Merge remote-tracking branch 'github/master'

docs: show the sections in manual's chapters

Trick ahead: the sections are regular chapters, but with UTF
non-breaking spaces before their names to visually indent them a bit
in the sidebar.

The main page should now be changed because it looks ugly with that
trick. But the content had to be changed anyway, maybe replace with
the current content of the main webpage, that in turn should be
emptied of all letters to put nice pictures instead

docs: this file got renamed at some point -- kill dupplicate

docs: build on RTD, configure our theme

fix some borken links in doc

getting closer to the release

complete the list of bugs closed in this release

also prevent to mix leaf-like and inner content in <AS>

This fix https://github.com/simgrid/simgrid/issues/116 just like we
fixed https://github.com/simgrid/simgrid/issues/296 earlier, that did
the same for <zone>

Also, really allow to use bypassZoneRoute in place of bypassASroute.
I guess that this one is simply untested :(

Having orphaned elements such as bypassZoneRoute when no tag declare
it as a potential content triggers a bug in flexml preventing the file
generation to proceed
  Use of uninitizalized value in $instates{$tag}
:( :(

[examples] s4u-barrier: shared_ptr -> BarrierPtr

Merge pull request #299 from mpoquet/example/s4u-barrier

[examples] add s4u-barrier

Merge pull request #301 from mpoquet/s4u-barrier-refcounting

[s4u] Barrier refcounting

[s4u] Barrier refcounting

[examples] add s4u-barrier

Disable parallel executions with non-thread contexts under Tsan.

Raw/boot/sysv contexts lead to incomprehensible errors (segmentation fault, timeout).

Restore CMDARGS before LINKARGS (commit 11c619824e2acd338705a14680d99aaad4b80506).

It was breaking smpi_ampi and smpi_replay under TSAN.
Remove redundant -std=gnu++11 from LINKARGS, so that it can be overridden on command line.

Allow dlopen privatization with Tsan too.

RTLD_DEEPBIND is not supported by sanitizers.

Define HAVE_SANITIZER_THREAD.

Cosmetic rename.

Cosmetics: use cmakedefine01.

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

convert options to sphinx

Gosh that was a painful week-end.

let's not use useless casts

return the correct value in MPI_get_attr and friends in fortran instead of a random pointer value

pass linkargs before cmdargs to avoid overriding a potential -std argument

that's already converted to sphinx

ignore another binary

convert the SMPI doc to sphinx

fix make distcheck

improve doc to avoid mixture between Comm::set_src_data_size() and Activity::set_remaining()

improve the error messages so that you can understand them without reading the source code

convert the old SMPI tuto to sphinx (was only a placeholder)

convert the remain bits of S4U doc into sphinx

missing file

convert S4U examples to sphinx

improve documentation of DTD content

improve the doc of Actor::on_destruction()

Explain the difference with this_actor::on_exit()
This fixes https://github.com/simgrid/simgrid/issues/289

nice err msg for bummers

avoid a warning about unit-less bandwidth

tuto smpi: lab on visualization with class S, not A

Revert "Dlopen privatization should be okay now for TSan."

This reverts commit 67e587e01b533cbe388602107fdd5ea6e8970513.

Revert "Remove usage of RTLD_DEEPBIND."

It's in fact needed for starpu and some of the smpi proxy apps.

This reverts commit f257ec7c9ab6e14b11ea63378065db42105882b5.

Target_libs may be multiple.

tuto smpi: start lab 3 (Execution Sampling)

But I'm stuck because that version of the NAS benchmarks is in
Fortran, and I fear that our macro don't work in this case...

smpi tuto: Lab2 (Tracing and Replay)

smpi tuto: Lab 1 on vizu

smpi tuto: finish the Lab0

fix ns3, again

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

Unify the host names in cluster description files

This will allow to have only one hostfile for all of them.
Particularly useful for the tuto.

Dlopen privatization should be okay now for TSan.

Remove usage of RTLD_DEEPBIND.

It does not seem to be mandatory, and sanitizers are complaining.

Let's see if it passes on CI servers.

Move check for null pointer before dereference.

tuto smpi: Lab0 (hello world) drafted

smpirun: make sure that <cluster is on its own line when computing the hostfile automatically

dockerfiles: install our files under /source/ and refresh images

tuto smpi: finish (for now) the platform section; draft the install section

cosmetics

cosmetics in graphical representations of cluster descriptions

hopefully fix the NS3 test

fix make distcheck, as usual :(

ignore a directory generated by sphinx

docs: sphinx 1.8.0 was released, so use it

Merge branch 'master' of github.com:simgrid/simgrid

Rename cluster.xml to cluster_backbone.xml

also, fix the make dist and some cosmetics.

cleanups in the cluster platform files

docs: prefer svg to png, and inclusion to copy/paste

cosmetics on the graphical TOC

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

fix sectionning and one typo

Graphical representation of example platforms

Merge pull request #292 from kovin/master

Cover with a test Mailbox::ready() method introduced in commit 1ed0e64dc40

Merge branch 'master' into master

SMPI tuto: Start stealing content from SMPI courseware

tuto smpi: add a picture explaining how it works

allow to have hidden/shown code blocks in the doc

Add an assert/fixme around Actor::set_auto_restart.

Use a std::vector for actors_at_boot_.

Several actors may use the same name (e.g. app-masterworker-multicore).
Also fixes a memory leak.

start the SMPI tuto

Typo.

tuto: don't speak of s4u processes (but actors)

docs: simplify and document that file

killing trailing whitespaces on png files is not cleaver

DTD: remove the last occurence of <gpu>

tesh: informative message for another error condition

Fix the DTD to not allow to mix internal node content with leaf content in a given zone

Fix https://github.com/simgrid/simgrid/issues/296

fix the SMPI tests that mandate smpi/wtime == 0

align doc and code on a more sensible value

Merge branch 'master' of framagit.org:simgrid/simgrid

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid