handle non commutative case for scan/exscan

make sure refcount of a comm is really 1 when initialized

quick and naive implementation of the MPI_Exscan collective

MPI_Waitsome and MPI_Testsome can actually handle NULL parameter for indices

MPI_Translate_ranks should return MPI_PROC_NULL if we provide MPI_PROC_NULL as parameter

testany should work and return a flag if we test 0 comms.

Implement MPI_IN_PLACE behavior for collectives

Fix MPI_Comm_Split, to increment reference counter of the group, as it is shared between processes

add a reference counter in order to avoide deleting MPI_Comm, and MPI_Group, too soon

have persistent communications use a PREPARED flag to implement the fact that they have not already been sent
This is useful when testing their status before launch, to have an empty MPI_Status returned, as specified

Make internal collective flags negative (incorrect in MPI), to avoid confusion with user's messages
This was seen when user's code was using MPI_ANY_TAG to receive any message (from the userland code), and lead to confusions.

fix tracing issue with some communicators

Make distcheck succeed.

Use the same parameter name in the code and in the documentation.

Fix paths for msg/energy tests.

Make it build again after commit 152117af2fbcf4c99d0da5d10a6813aac7eee007
(added dvfs support).

add one missing test

fix dist build

Merge branch 'dvfs'

Added DVFS and energy consumption support.

added tesh tests for DVFS

added tesh tests for dvfs

add MSG_host_get_process_list() function.

cosmetics

pushing but never popping means useless code
remove blanks in empty lines

This used to work by accident

better handling of loop endings
The upper bound may not be inside the set,
or the stride can be negative, with upper bound < lower bound

get the rank and not the index for process creation

use the right index for sendrecv optimization

unify collective tags
allows to quickly identify the type of the collective when debugging
avoid some collisions with wrong messages being received

handle MPI_IN_PLACE for basic reduce

do not create communicator if process is not inside its group

Merge branch 'dvfs'

Conflicts:
buildtools/Cmake/MakeExe.cmake
src/include/surf/surf.h
src/surf/simgrid_dtd.c

added dvfs support

added dvfs support

Changelog update, more to come

make not_yet_implemented() a macro outputting the name of the function
Also tell the user to contact the team if he wants the support for the function.

Add a huge variety of not yet impelmented functions, to compile MPICH3 test suite (without RMA or fortran)

Test -eq is for numerical values.

Use construct "Use Alternate Value" to achieve the desired effect.

optimize MPI_Sendrecv if a process has to exchange with himself only
This helps avoiding some lockings of lazy network model when one process waits for itself

avoid breaking replay, handle MPI_OP_NULL case

Fix smpi_sleep to execute the sleep on the simulated host (ignoring running host power)

handle non commutative reduce operations

try again and again to be more portable with this test

same as before, to make ci happy

try again to be 32/64 bit agnostic

modify reduce test to provide better coverage

try to make the shared test compatible with 32bit architectures

mpich allgatherv was using wrong size value

mem leaks

Add a test for SMPI shared malloc and free

units for bandwidth properties too

These "properties" are actually bandwidths: allow users to declare units
in the XML file

start to clarify this example

remove an ugly pimple thanks to units in XML

allow to use units for storage too (bits, or bytes, or information bits
or bytes, multiplied up to the Tera)

separate allreduce tests, with one large and the other small, to avoid to lose too much time in testing, and triggering timeouts.

fix two nasty bugs in complex datatypes handling, caught with test suite.

mem leak

pass collective selectors through mpich-coll test suite

star-mpi's pairwise alltoall is only valid for power of 2 cases, add openmpi's one instead

correct a few bcast algorithms and change the test to actually use them all

have allreduce test work on much larger arrays to trigger segmentation in one algorithm

ompi selector was using the wrong algo for alltoallv, add the right one and use it

increase tesh timeout for replay

add forgotten test for an mpich algorithm

apply some coding standard in function naming (agier has to be in
vacations ... ;))

don't call things storage when it's mount

don't call things storage when it's mount

This is a bug in the implementation in OpenMPI, with OpenMPI accidentally working.
That's because MPI_ANY_SOURCE is also -1 in OpenMPI.

test for barrier algorithms was testing scatter ...

change some defined values to less current ones

MPI_ERR_COMM was sometimes returned instead of MPI_ERR_RANK in SMPI

reduce_scatter default implementation was a mess

if we send 0 data, don't bother with subtypes

add option "smpi/use_shared_malloc", with true as default, to allow disabling the shared memory SMPI stuff dynamically
Useful for debug purposes, to see if the shared memory is the cause of a bug

yet another simplification of the storage API: we don't manage
file contents, no need for a buffer as parameter ...

size shouldn't be accessible from the user API.

Fix of pastry

Add pastry msg example (First attempt)

Change xbt_os_timer interface to handle cpu time, thread time and
wall time distinctly.
Windows section isn't test.

Signed-off-by: Guillaume Serrière <guillaume.serriere@esial.net>

Use HEAD as default reference for git archive.

The default branch may be undefined.

Add a small value to avoid rounding differences between x86 and x86_64.

Change type double for size_t.

Remove unused variables.

Comment out useless operation.

Add missing dependency.

wrong file name in cmake file

add missing prototype

openmpi recently changed its decision for alltoallv algo

add missing replay files to dist

forgot one file

we now have an mpich selector, and a bunch of new algorithms (--cfg=smpi/coll_selector:mpich)

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

SIMIX call + MSG function + Java binding for get_core

model-checker : restore while statement for bugged1_liveness example

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Properties available for cluster tag

model-checker : update bugged1 and bugged2 tesh (different compilation flags)

model-checker : MC doesn't work with thread context

disable optimizations for build MC in jenkins