rewrite the install doc, and integrate latest feedback on Mac builds

mark as advanced some options that are useless to the users, and improve some doc

remove a bit of cruft from the install doc, more remains to be cleaned

cosmetics

forgot the test file

use system malloc for the raw heap if GNU ld is used

make this example be more valgrind compliant by increase host speed.
When tasks end after the "Finalize" reception, nothing is safe ...
Still has an invalid free in the end.
did some typo correction too

Use xbt_malloc (and friends) instead of direct malloc()

This is good practice as it asserts that the result is not null, and
it actually help me right now when digging in the MC.

Add -Wall to CMAKE_Fortran_FLAGS, unless enable_compile_warnings=OFF.

This triggers lots of warnings, mainly about implicit function declarations,
but I don't know how to fix them properly for now.

Linker option is useless when '-c' is present.

this was fixed too

mention bug fix in ChangeLog

add test_sd_avail.tesh to the list

add a tesh file for the test of availability traces

Avoid to compile files when they're not needed.

This file does not belong to TRACING_SRC; define SIMGRID_SRC.

Really remove deleted file.

Let's be honnest

refresh the README, and re-add it to the archives

that was really ancient (shame shame)

This prevent periodic availability/state traces to loop forever

Fix _sg_do_model_check use with model_check=OFF

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

cosmetics

add an example to test availability traces. Weird behavior and runs
forever (thus no tesh yet)

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Restructure config headers

no need to explicitly tell that resources are initially up anymore.

when the first event of a trace (availability or state) starts at a time
greater than 0, this means that the default value has to be used
meanwhile. Create a dummy event whose value is -1 and handle this in
surf_presolve.

when the value of an event is a negative one, don't update resource
state during presolve. Allows to use default status up to the time (>0)
of the "real" first event.

add more debugging info there. Nice to know what is the new value
assigned to the link

chainsend: print some transfer stats, move debug prints to where they belong

also count up bytes when transfering, so that the peer can print its "transfer speed" when it's done, and finally update tesh accordingly

Fix model checker config issue

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Move config from surf to simgrid

Cosmetics : Remove whitespaces for mquinson :-)

model-checker : remove tesh bugged2 (too long with the new version of DPOR)

model-checker : update tesh bugged1 with the new version of DPOR

model-checker : interleave all enabled processes for each state and apply DPOR only once per process

model-checker : cosmectics

Remove comm from src_proc->comms and dst_proc->comms when finish it,
if is detached (dsend)

Currently, with dsend action, the wait of src_proc is not necessary to
finish the communication. In this case, only dst_proc removes this
communication from its list and destroys it, if src_proc is always
running. When src_proc makes a process_cleanup after that, it
retrieves this communication in its list while it doesn't exist
anymore and thinks that this communication isn't for it. This led to a
simulation error.

remove comm from rdv if comm destroyed before being finished

doc fix: AS has no 'name' attribute, but a 'id' one

reindent, no real change

Typos.

Use cat+here document, instead of non-portable echo -e.

make doxygen happy

SimGrid 3.7 is ways too recent for GRAS (+cosmetics)

document how to react when stuff break during the upgrade

ignore that binary file

change the way we handle MPI_Request termination
to avoid using smx_action too much in smpi.
Removes a few more leaks in collectives
Handling of waitany was changed, it should return sooner and avoid a few unnecessary simcalls

Spell check...

This is useful for those typing ./configure & make without looking at output. :)

Add ctest2junit.xsl for jenkins

Another missing include, needed with tracing=off.

model-checker : update tesh bugged1_liveness

File simgrid_modules.png is automatically generated.

Add rule to generate png files from DOC_FIGS.

Sort list, and add missing file output.goal.pdf.

Remove/add a few includes.

Revert "I'm so glad that this line is useless"

This reverts commit 5904252e9e4e84030ee544d5efbd832dffa696a7.

It broke builds with tracing=off.

Enable tracing for Nightly_memCheck too.

Remove now unused support for remote exceptions.

Plus slight reindent in ex.h.

Define target before using it.

Rename function (create->reset), and kill empty function (destroy).

Use a sinlock instead of a mutex for mallocators.

Factorize code for mutex locks.

Protect mallocators for concurrent acces only with parallel mode.

Enable smpi for Nightly_memCheck.

make an error message informative

I should stop coding at night -- sorry

no need for unused variables

plug a memleak on my way

model-checker : update tesh bugged1 and bugged2

model-checker : forget one fix in MC_state_set_executed_request

model-checker : fix dpor algorithm if max depth reached

model-checker : restore previous version of MC_state_set_executed_request, fixed with commit 87d50bb063f2937d73b984bed011fef018a761e2

add a bunch of new fortran bindings, to make bigdft happy

model-checker : remove independance between iSend/iRecv and Wait

model-checker : one region in snapshot for data and bss segments of libsimgrid

document an ugly pimple in the code that were added for autorestart to work

this file went public, obviously, so let's document it properly

cosmetics

doc: rename involved into contributing, and write a first version of this page

the ref guide is not separated anymore

further improve the doc on documenting simgrid

document how to document simgrid so that other can do that too

no need to declare twice the list of files that must be copied into the documentation

document the unit testing mecanism

fix doxygen markup

improve the internal doc on cmake files

take care of the generation of doc/doxygen/logcategories.doc after last cleanup

put some automatic links instead of letting the user search for themselves

chainsend: change tesh to test with 8192 pieces

chainsend: change test platform latencies and bandwidth to LAN-like values

chainsend: decrease message size, it was actually too big for no good reason

chainsend: change default number of pieces

chainsend: add number of pieces as parameter of the broadcaster

I'm so glad that this line is useless

this file is now useless