Slight simplification.

Use what was previously added, and fix broken tests

If size read is 0 (eof), don't initiate faulty comm which will crash.

storage : Allow to write inside a file without reducing its final size (for parallel IO)

MPI_File_get_size, MPI_File_get_amode, MPI_File_get_group, MPI_File_sync

Complete --help-logs.

New log appenders stdout and stderr. Use stdout for xbt_help.

try to address comment made in FG#8

Set cfg=smpi/simulate-computation:no.

Fix default MPI_Barrier.

Mpich3 test comm_group_rand was sometimes failing.

Revise to fool cppcheck.

fix test binary path

fixed issue

Add a test for callback disconnection

Allow for callback disconnection

xbt::signal::connect now returns an unsigned int id and callbacks are
stored in a map <id, callback>.
a new xbt::signal::disconnect(unsigned int id) method has been added.

Fix build errors with gcc 5.4.0.

Use default destructor for resource::Model.

Remove empty functions

Use std::unique_ptr to manage memory.

leaks --

fix issue seen on 34f5b82ed231ecce .
We were writing inside an existing file, reducing its size for the fs.
And then used_size was becoming <0, which for an unsigned is quite large.
This seems to point to another issue in storage, as used_size might not be initialized properly

fix io-shared (remove spurious ordered_read) and do write then read.

check for readonly flag before writing to a file.

[sonar] kill commented code

[sonar] define each identifiers on its line

nope sonar, that's not commented code

please sonar

doc: 2 more internal references

fix GH#133
When a host is turned off, also shutwdown and turn off the VMs hosted
by this host. This is a rather crude patch that implies to browse the
whole list of existing VMs. A better solution requires a bit more work
and time

please sonar

Use std::vector instead of plain arrays in smpi_topo.

Remove a level of indirection in sd::Global.

Tidy up mc/mc_unw a little.

Remove custom destructors for instr/paje.

Remove a level of indirection, and custom destructors for instr/jedule.

Remove custom destructors for s4u_Filesystem.

Restore warning for unit-less values.

32 bits insists of having some timestamps off by 1us ... Hide them.
And fix my windows line endings mess.

be cleaner with memory

fix out of source builds

please clang

Merge branch 'file' into 'master'

MPI IO

See merge request simgrid/simgrid!6

try to get rid of some variability

add hostfile as well for tests

Change how we lock things up ...
MPI RMA seemed a god idea, but it just did not work.

Add some tests for io.

Comment out a buggy line... Can't put a finger on what goes wrong here, but values seem insane and break all tests
TODO : investigate

cleanups debug messages for read_all write_all

cleanups

Revert "Inline Context::self()."

This reverts commit 92061e0bc62b9a2ef3bdc041e5e9fe716ada1120.

It's failing on appveyor (mingw64) with:
C:\mingw-w64\x86_64-7.2.0-posix-seh-rt_v5-rev1\mingw64\bin\g++.exe    -g3 -O3 -funroll-loops -fno-strict-aliasing  -finline-functions  -fdebug-prefix-map=C:/projects/simgrid=. -static-libgcc -static-libstdc++ -Wl,--add-stdcall-alias -m64  -shared -o lib\libsimgrid-java.dll -Wl,--out-implib,lib\libsimgrid-java.dll.a -Wl,--major-image-version,3,--minor-image-version,22 -Wl,--whole-archive CMakeFiles\simgrid-java.dir/objects.a -Wl,--no-whole-archive @CMakeFiles\simgrid-java.dir\linklibs.rsp
CMakeFiles\simgrid-java.dir/objects.a(jmsg.cpp.obj):././src/bindings/java/jmsg.cpp:342: undefined reference to `__imp__ZTHN7simgrid6kernel7context7Context8current_E'
CMakeFiles\simgrid-java.dir/objects.a(jmsg.cpp.obj):././src/bindings/java/jmsg.cpp:342: undefined reference to `__imp__ZTHN7simgrid6kernel7context7Context8current_E'
CMakeFiles\simgrid-java.dir/objects.a(jmsg.cpp.obj):././src/bindings/java/jmsg.cpp:342: undefined reference to `__imp__ZTHN7simgrid6kernel7context7Context8current_E'
CMakeFiles\simgrid-java.dir/objects.a(JavaContext.cpp.obj):././src/bindings/java/JavaContext.cpp:81: undefined reference to `__imp__ZTHN7simgrid6kernel7context7Context8current_E'
collect2.exe: error: ld returned 1 exit status

[sonar] Remove the use of "sprintf".

Define PropertyHolder::set_properties.

It allows to have a single simcall when setting many properties.

Constify get_properties() and and remove simcalls.

change verbosity of some messages, to ease testing

comments about implem

[sonar] Remove custom destructors for surf/PropertyHolder.

move everything to the implemented zone.

[sonar] Remove custom destructors for CpuTiProfile.

MPI_File_read_shared, MPI_File_write_shared, MPI_File_read_ordered, MPI_File_write_ordered, MPI_File_seek_shared, MPI_File_get_position_shared

Use std algorithm for binary search.

MPI_File_set_info, MPI_File_get_info, MPI_File_get_position

Useless smart pointer.

Cosmetics.

Typo.

Use the good interface.

Smart pointer is not necessary for Actor::self.

Inline Context::self().

Uniformize get_impl(): const attribute, and return raw pointer.

Methods of simix::Global have direct access to their members.

[sonar] clean_action() called from destructor should not be overridable.

Read_all, Write_all, Read_at_all, Write_at_all
Imperfect algorithm, needs to be tested

Read_at, Write, Write_at

Test using macros for arguments checking, saves some duplicated lines.

Don't make exception on timeout.

It breaks for example xbt_cond_timedwait which is expected to report timeout by
a regular return.

Delete unused private function.

[sonar] Remove custom destructors for routing/DragonflyZone.

[sonar] Remove custom destructors for surf/network_ib.

[sonar] Remove custom destructors for xbt_replay.

[sonar] Remove custom destructors for examples/s4u/.

read, seek + init
TODO: properly init plugin, only when needed.

Don't explode here, as flatifier may try exactly to do this.

french comment --

Allow units in smpi factors.
To make it optional (as parse_factor is used for actual factors and not only seconds on some occasions), remove the warning in surf if a unit-less value is used.

Avoid returning uninitialized bytes in fortran processor names.

Skeleton for MPI_IO

Fix 32 bits build

Revert "Reactivate an umpire test, once disabled in 56fefe1bf81ca."

This reverts commit 1797da7d294b83c915fe49dad633855985eccb64.

don't compile non working and non compiling test

Pretend we support MPI 3.1.
We don't support all of it, obviously, but what we have may be enough for some codes.

comment tests we don't support in MPI3, and fix a few we support

MPI_Count can be used in ops too.

MPI_INFO_ENV ... Still does nothing for now

Reactivate an umpire test, once disabled in 56fefe1bf81ca.

MPI_Comm_get_info, MPI_Comm_set_info

Support MPI3 datatype MPI_Count

please sonar: replace void* by unsigned char* for raw buffer

please sonar

yet another attempt to handle MPI special values in fortran
Without dereferencing potentially unassigned variables.
Old way with a struct and common block does not work with dlopen provatization somehow.

move CPU models to kernel::resource too

cosmetic cleanups in network models