Let's not assume that an unsigned long int always behave as a char *...

When it comes to such pointer arithmetic, char * is the way to go.
Plus plug a dumb memleak.

Sorry about the previous commit that did not work with full compilation flags.

This function has no reason to go public.

Sorry about the previous buggy commit that did not worked with full warning flags.

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Fix liblua location on some linux distributions, like Archlinux.

Fixed some compilation issues (warnings) in last commits

Hide pretty nasty issue.

In this example, a process is killed right at the same time as it starts
executing somthing. It creates the surf action but is killed before it
gets the opportunity to wait on it. Consequently, the kill does not clean
up the surf action (so technically, the corresponding resources are still
wasted).

This could be "solved" by doing the kill before the simcall that created
the surf action. But more generally, it raises the issue of all the
data that have been allocated during the MSG_task_execute. There is
something really annoying with the kill. The current MSG implementation
is clearly not protected against kills. In case of kill, when doing a
simcall, we should throw an exception and TRY CATCH everywhere. We're far
from this for now so I leave it for another time.

Cosmetics.

Minor tracing/debug output improvement.

Do not try to resume a dying process. The corresponding surf structure
would already have been freed, and this would result in a mess. That's
also why we make sure that resume simcalls occurs before kill simcalls
in SIMIX_run.

Ensure that the same process never appears twice in the list of process_to_run.

Otherwise, it would be awaken twice. The first time, it would execute then
wait on the completion of a new simcall. The second time it would appear
to return from the new simcall but the simcall would not have been
executed.

Since resume and kill are particular functions/simcalls that change
the behavior of other process, it is ok if the process was already in the
process_to_run list (although it must not appear twice). For other simcalls,
I think it is invalid if two simcalls lead the scheduling of the same
process.

Make sure that kill simcalls are processed (with SIMIX_simcall_pre) at the end, right after resume simcalls, which are also done after any other type of simcall.

Add a convenient dynar function to sort the dynar using the Dutch national flag technique.

Fix a very old typo...

Lame attempt to make cleanup and kill coexist

On a timeout we do not wait anymore on a task.

-> Avoid keeping a pointer to an invalid object.

This should indeed be useless so let's remove it.

This commit partially reverts commit 4e0c8570051df3f7114e0097bf888a99946b6138.

Such a lazy resume seem to clash with the use of synchronization
structures. The problem is well illustrated with simgrid-boinc.
Surprisingly, simgrid/valgrind go completely crazy and segfaults in
stuff like pthread_getspecific.

[trace] let user code declare/set/push/pop states for hosts

details:
- useful for gantt-based views

Add tesh for storag.

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

add a link to the scientific tutorial in the 101 section of the documentatino

Fix printf format strings.

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

rewrite the documentation of MSG_task_get_from_host to reflect the fact that it is not implemented anymore

add a word on the logo licensing: CC-BY-SA-3.0

Add full references for the articles.

model-checker : get pointer address for bytes detected as different in heap comparison algorithm

model-checker : change XBT_DEBUG for fprintf

model-checker : reindent, no change

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot//simgrid/simgrid

model-checker : separate bugged1_liveness (deleted)  example in two cases : finite CS requests (bugged1_for_liveness) and infinite CS requests (bugged1_while_liveness)

Avoid double free()s.

Consolidate loops.  Also remove useless initializations.

Break recursion a bit earlier.

Compute the expected LCS length, and use it to stop as soon as the LCS
is complete.

Add a --verbose option for testall.

Fix parsing of options for testall.

Options such as --helpless or --dumpfoobar were wrongly treated as synonyms
for --help or --dump.

Use pointer arithmetic for accessing to dynar elements.

It is more efficient than the xbt_dynar_get_* functions.
Assumes that dynar's contents is contiguous.

Use a smarter algorithm for xbt_str_diff.

The previous one had a time and space complexity of O(n.m), with n and m
being the length of the inputs, and reached the memory limits pretty fast.

Implement the algorithm described in "An O(NP) Sequence Comparison Algorithm",
by Sun Wu, Udi Manber, Gene Myers, and Webb Miller (Information Processing
Letters 35(6):317-323, 1990), with the linear-space divide-and-conquer
strategy described in "An O(ND) Difference Algorithm and Its Variations",
by Eugene W. Myers (Algorithmica 1:251-266, 1986).

Respect the coding style

Remove tabs

Fix documentation navbar and page for tour dynar.

Fix ns3 and gtnets compilation

Need those files to make dist

Remove old files and add new files.

Fix jedule compilation

Fix compilation error with gcc4.4
error: redefinition of typedef 'surf_stat_t'

[routing] rename routing_global_t -> routing_platf_t (and friends)

One day maybe, this could be usefull to enable the declaration (and
simulation) of several platform within one simgrid run. But for now, I
mainly want to make the sg/platf interface less context sensitive and
more usual by expressing directly the AS to which elements are added.

[routing] kill supurious checks, and reformulate error messages

[routing] clarify why we rely on such a dirty hack

[route parsing] make surf_network_resource_by_name public under name sg_routing_edge_by_name_or_null

* This function existed already, but were almost never used, its
  content being inlined in ways too much location.
* Use that function were relevant. That's much cleaner this way.
* Making it public is one step further to the C interface for routing
  creation interface (drop in to XML)

[route parsing] rename network_element_t into sg_routing_edge_t

Also, make this type visible from simgrid/platf.h since we need to
manipulate it to create routes efficiently

ignorable reindent

[route parsing] kill global_routing->size_of_link

- Actually, all links we use are pointers to structure (how
  surprising). This strange thing survived until now because the
  constant model declared to have a size of links being the size of a
  double. But actually, since there is no link in constant routing, we
  could use 0 as size of links in that case.
- Also introduce a sg_routing_link_t that is simply an alias to void*
  for now. It is intended to represent what is stored into link_lib at
  the surf level (that is the core-most link concept)

[route parsing] greatly streamline the generic_new_extended_route function

[route parsing] reduce the amount of dupplicated code

the generic_new_extended_route() can do the work of
generic_new_route(), so kill the simple one and use the complete one
instead.

avoid void* pointers since we know the pointed type in all usage location of this function

[trace] bugfix

[trace] we need to close the file

file presumed to be installed by other header files

Fix some documenttion bar

[trace] updating tesh due to buffering by default

[trace] it seems that buffering affects trace alias generation, fix tesh with no harm

[trace] example of creating a customized graph configuration file

[trace] functions needed to create graph configuration files for Triva by hand

[trace] fix comment

[trace] not tracing to test the absense of output

[trace] pay attention to the return value of get functions, they might be null

[trace] factor code

[trace] let code compile without tracing

[trace] test the TRACE_get_[host|link]_variables

[trace] functions to get already declared user host/link tracing variables

[trace] check if user variables are being correctly used

[trace] update example to show how to get declared marks

[trace] new function to get the declared marks

[trace] move categories dictionary declaration to interface file

[trace] update example to show how to use TRACE_get_categories

[trace] new public function to get declared categories

[trace] register power and bandwidth for hosts/links when --cfg=tracing/platform:1

make clear to simgrider how to edit that tutorial, and regenerate all files

doc rewording

Doc rewording

Add default Layout

Fix warning by doxygen

Use of bypassASroute.xml instead of three_clusters_bypass.xml

This was necessary. Remove previously

Made two platforms for bypass and add test to tesh

Implement bypassRoute and bypassASroute. Add an example.

ben si

also include the 101 presentation into the latex documentation

add a SimGrid 101 presentation as a quick starter for potential users

[DOC] hide a bit the structure list, nobody cares

[DOC] cosmetics: rename some tabs in menus

[DOC] kill the datatype specific page

all the data are now in their home module, alongside with the function
modifying them.

Doc improvement: rename GOS into task usage

who remember of Globus GOS anyway? And Operating System-like names
sound really strange now that the 21 century finally came.

improve the doc of MSG datatypes (and dispatch them in the relevant modules)

rename doxygen group m_file_management into msg_file_management

improve doc of trace-driven simulations

reindent, no real change (beside maybe a typo or two)

Merge doc of platform mgmt functions into simulation control ones

This allows to have a single page about the basics of running a
simulation, with a nice workflow on it.

It's still no "SimGrid 101", but that's the direction to go.

header blurb about MSG_deprecated doc