Merge branch 'hypervisor' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid into hypervisor

Add a test program to see multicore behaviors.

As far as tested through this test program, it looks that the current
support of multicore in SimGrid correctly works for physical and virtual
machines. The CPU share of a task or a VM never exceeds the capacity of
one of the CPU cores. The total CPU share of all tasks and VMs on a PM
never exceeds the product of the number of cores and the capacity of a core.
(But, it is not possible to pin a task to a specific core.)

TODO: use this program for regression test.

Fix miscalculation of CPU shares on a multicore PM.

The recent commit adding the load capping feature broke CPU share
calculation on a multicore PM. This patch fixes the problem.

The bound value "0" means that there is no CPU bound for that task or
VM. On a single-core PM, this is true. The task can use all CPU resource
on that PM. On a multicore PM, the task can use the resource of
only a CPU core.

Even MSG_{task/vm}_set_bound() is not used in a simulation program,
simulation results will be wrong for multicore PMs. This is because
the bound value "0" is used internally.

Fix private host variable after a migration - Adrien

Minor typo in documentation (bad _ position in platform/cluster/router name)

Fix silly bug in msg process sleep bindings - Adrien

remove a nasty iteration causing big slow down

Oh, I found lmm_constraint_used(). Now we use this function instead of
nasty iteration.

$ ./examples/msg/cloud/scale ../examples/platforms/g5k.xml

The output of the old code:
duration 1.835514
duration 1.934927
duration 2.011892
duration 1.906476
duration 1.944293
duration 1.922941
duration 2.000016
duration 1.944532
duration 1.978881
duration 1.901449

The output of the new code:
duration 0.294958
duration 0.298755
duration 0.304680
duration 0.296415
duration 0.301704
duration 0.310724
duration 0.303856
duration 0.304807
duration 0.311928
duration 0.303926

add a test program to see scalability issue.

Use this with a profiler (e.g., valgrind).

TODO:
- clean up code.
- cover more possible combinations.

Merge branch 'hypervisor' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid into hypervisor

Estimate actual migration bandwidth

more cosmectic changes - Adrien

cosmetic changes - Adrien

Add VM.setBound() and cosmetics changes - Adrien

Minor changes for fixing dp_intensity at java level - Lucas, don't waste your time to read all commits ;)

Fix VM params once for all - Adrien

Merge branch 'hypervisor' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid into hypervisor

Fix super slow and meaning less code

The master process launches 10000 VMs on 1000 PMs.
Then, MSG_process_sleep() by the master process takes 0.3 seconds in the
real world. With this fix, the function returns in 0.01 seconds.

Fix problems on host on/off

Merge branch 'master' into hypervisor

Conflicts:
src/bindings/java/jmsg_synchro.c
src/bindings/java/org/simgrid/msg/Host.java
src/include/surf/surf.h
src/smpi/colls/allgather-RDB.c
src/smpi/colls/allgather-SMP-simple.c
src/surf/cpu_cas01.c
src/surf/surf.c
src/surf/surf_routing.c
src/surf/workstation.c

Add MSG_host_on and MSG_host_off

Fix of pastry

Add pastry msg example (First attempt)

Change xbt_os_timer interface to handle cpu time, thread time and
wall time distinctly.
Windows section isn't test.

Signed-off-by: Guillaume Serrière <guillaume.serriere@esial.net>

Use HEAD as default reference for git archive.

The default branch may be undefined.

Add a small value to avoid rounding differences between x86 and x86_64.

Change type double for size_t.

Remove unused variables.

Comment out useless operation.

Add missing dependency.

wrong file name in cmake file

add missing prototype

openmpi recently changed its decision for alltoallv algo

add missing replay files to dist

forgot one file

we now have an mpich selector, and a bunch of new algorithms (--cfg=smpi/coll_selector:mpich)

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

SIMIX call + MSG function + Java binding for get_core

model-checker : restore while statement for bugged1_liveness example

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Properties available for cluster tag

model-checker : update bugged1 and bugged2 tesh (different compilation flags)

model-checker : MC doesn't work with thread context

disable optimizations for build MC in jenkins

unused variable if tracing disabled

model-checker : increase timeout in tesh

model-checker : missing #ifdef

model-checker : update bugged2 tesh

model-checker : fix (again ..) DPOR for iSend/iRecv and Wait communications

- add rdv_cpy in s_smx_action_t structure. comm.rdv is used for
  garbage collection and set to NULL when the communication matches
  with another communication already pushed and waiting in the
  mailbox.
- iSend/iRecv and Wait communications are independant if the
  communications are not in the same mailbox. Otherwise, the
  iSend/iRecv communication process issuer must be different of the
  src_proc or dst_proc of the Wait communication, or, src_buff and
  dst_buff of the communications must be different.

model-checker : improve debug messages

barrier tests

end of ompi collectives addition, with barrier

add tests for scatter

add scatter algos from ompi

unused variable

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

add reduce scatter collectives from openmpi, and fix existing one
and add tests, without doing separate commits because it is 2AM

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

fix Node.java

Simplify the link specifications for libSG_java on win32 (untested).

The variable SIMGRID_LIB_NAME_NAME is never used, and probably gets an
undefined value here.  Remove its definition.

The variable SIMGRID_LIB_NAME is never set.  Remove reference to it.

Finally, use "target_link_libraries" for all platforms since I can't find any
reason to avoid it on win32.

Note that these changes are untested.

Prototypes were changed by previous commit.

further simplification of the storage API, keep size only as nmemb was
never really used.

Use correct modifier, and don't lie about pointer type.

Address compilation warnings.

Add CMakeLists.txt for examples/msg/semaphores/.

Sort entries.

Add files to the dist archive.

This file doesn't belong to the dist archive.

Use real parameter name in comment.

AS access from MSG layer

remove warnings 2

remove warnings

Remove debuging printf

Fix jmsg_as getSons

Add msg As getModel and GetHosts

Add missing files

Access AS hierarchy at Msg layer

add test for gather collectives

add gather collectives from ompi

Fix bug happening with MPI_Datatypes
Provide better support for contiguous datatypes

add allgatherv algo from ompi

add new allgather algo from ompi

size_t instead of unsigned long for storage size and used_size

simplify the simcall stack for file unlink
there are still a few leaks: as unlink does not totally destroy the
data structures. If the same file descriptor is reopened (new file is
created), here comes the leak ...

there is no stat on files anymore

cleaning step: uniform naming (stream to fd) + some cuts at 80
characters

one parameter less for open

get rid of mode for open in Java bindings too

get rid of "mode" parameter in the open file function. It wasn't used
anyway.

add missing file in dist

remove warning

remove warning

add new algos for reduce from ompi

add another ompi bcast algo

add one more bcast algo

useless line

add tests for ompi selector

add a new allreduce algorithm from openmpi

activate commute flag for MPI_Op, adds smpi_op_is_commute to test it (-1 FIXME !)

remove warnings in smpi selector

model-checker : update tesh for liveness example