Various fixups and cosmetics in the doc

Make the test output easier to understand

fix warnings :(

Please the paranoid compilers that we love

Add a test of CM02 timings with TCP-gamma (and fix the doc :sweat_smile:)

Cosmetics in the messages of this test; no timing change

Allow to disable the TCP windowing modeling by setting network/TCP-gamma to 0

Move a tiny bit of surf to xbt

Merge branch 'master' into 'master'

add link to simgrid-fmi doc in sphinx doc

See merge request simgrid/simgrid!125

add link to simgrid-fmi doc in sphinx doc

Merge branch 'master' into 'master'

fix doc typo

See merge request simgrid/simgrid!124

fix doc typo

Kill a useless function, and rename another one

another useless cleanup

Kill a parameter that was always nullptr

Move two generic functions from surf to xbt

useless cleanups

Kill another bunch of files in doc/ and move their content to docs/

Don't clutter the archive with python notebooks [no-ci]

Convert some insider doc to sphinx, and remove obsolete bits from doxygen sources

doc: Remove one dupplicated image and a 10 years old unused graph that I don't understand anymore

The colorize(simgrid-colorizer) utility does not exist anymore.

[ci-skip]

Integrate a bit of the old FAQ in the modern doc, and reword Models.rst

The integrated part was about the CM02 network model, which
complements nicely the exiting doc about the TCP models, as it only
described LV08 so far.

While at it, I reworded and reorganized this documentation chapter. In
particular, I moved made the page sectionning easier to navigate, and
I moved the links to the non-performance models (routing and MC
compute model) as an annex of this page instead of having them
breaking the flow of the chapter introduction.

Remove more references to MSG in documentation.

[ci-skip]

Polish the polishing.

[ci-skip]

Polish jenkins scripts without MSG.

The right mode is FATAL_ERROR.

Remove MSG. Its EOL was scheduled for 2020

Java was removed

Fixes https://framagit.org/simgrid/simgrid/-/issues/18

Fix MC+sthread+coverage.

[smpi] Flush output streams after the run too.

Directory "examples/deprecated/" vanished.

[ci-skip]

Install SIGSEGV handler unconditionally.

No need to compute coverage for Java anymore.

[ci-skip]

Update scripts for Jenkins, now that Java is gone.

I guess that this line was not meant to be removed.

No need to install Java-related packages anymore.

Minor cleanups.

Typos.

Fix the pages job on gitlab CI

Remove Java bindings. They are not updated since maybe 10 years

We want to remove MSG and slowly transition to SimGrid 4.

pthreads are not used anymore. Standard C++ ones are

Kill remaining traces of win32 support.

Remove ancient hack.

Cosmetics: align with other similar declarations.

Fix make distcheck

Stop trying to build on native WIN32, it's broken anyway

Fix tests built with PYBIND11_ASSERT_GIL_HELD_INCREF_DECREF.

There was more (hidden) calls to inc_ref/dec_ref while the GIL was not held.

All of them are lambdas used as callbacks with a captured py::object.
As a workaround, the reference counter is increased before releasing the GIL,
and the lambda simply captures the raw pointers.

For more details, see the release notes for pybind11 versions 2.10.2, 2.10.3,
and the future 2.11.

Ensure that the GIL is held when using inc_ref/dec_ref.

Use C++ string for argument.

Superfluous py::call_guard.

Reindent.

Update copyright lines for 2023.

Use std::byte for bye-oriented data manipulation (sonar).

Really exclude MBI scripts from Sonar analysis.

[ci-skip]

LGTM.com will be shut down in the next days.

[ci-skip]

Pointer to const++ (sonar).

[ci-skip]

Use pointer-to-const when possible (Sonar).

Redundant cast.

Kill unimplemented declarations.

Make the definition match the declaration in dtypes.h.

Kill unused file.

Reduce duplication of compiler flags for warnings.

Add -Wextra to CFLAGS too.

... and fix associated warnings.

Merge "else" branches.

Document recent change [noci]

Big fat error message when trying to enable MC on not supported archs

The previous message was ways too easy to miss [no-ci].

Merge branch 'faster_activity_removal' into 'master'

Replaced std::list by std::set to keep track of activities

See merge request simgrid/simgrid!123

Replaced std::list by std::set to keep track of activities

Cosmetics.

* use existing functions sthread_enable/disable
* useless casts
* static variables are already zero initialized

Use C++ string_view.

Replace static function by a lambda.

Fix doc.

better failure handling for streams

Address misc Sonar issues.

Cosmetics: "transfert" -> "transfer".

Kill useless computation.

Check bounds.

[ci skip] some release notes about the I/O streams

Completely revise the way to deal with Streamed I/Os

Do not implement a new funky HostModel but handle the io_stream call
in CLM03. Basic idea (thx alegrand): start from a regular
NetworkAction and add some extra constraints if it is an I/O stream.

+ Pros: easy to implement and inherit of all the complexity of the
network part. This would have been too much work and redundancy with a
new model. No extra flag, just a new type of I/Os (similar to the
Comm::sendto spirit)

+ Cons: had to cheat a bit to NOT inherit some of the network model
(LV08) complexity for the I/O part (bandwidth factor). Still has to
find a way to not pay the network latency if the stream starts from a
disk. Had to add a little hack to reserve more space in communicate
for the extra constraints.

This new type of I/O is tested in teshsuite/s4u/io-stream (with the
basic CM02 model without crosstraffic to verify if bottlenecks are
correctly handled, and then with the default config)

this belongs to the Impl not a specific model

further simplification/cleanups

Reduce the number of lambdas involved for python bindings.

Try to fix build by installing binutils.

Remove explicit conversion to std::string when it's not required.

Some of them were redundant.
Some of them became optional after the removal of xbt::string.

Typo.

Keep integer operations.

Use boolean value.

Mark "override" (Sonar).

Cosmetics.

simplify the I/O stream thing A LOT. Might be plunged in CLM03 afterall

Also ignore the brand new python 3.11 on appveyor

Remove a work around for a 2017 bug in Python + Windows

Help windows builds: do not redefine XBT_PUBLIC

Public headers must remain C++14 for now

Revalidate a tesh file in Java after recent changes

Missing include

setter function only need a simcall in MC or with parallel execs

This change introduce a new kind of simcalls alongside
simcall_answered and simcall_blocking: simcall_run_object_access that
is dedicated to object setter functions.

This is an answered simcall if running in // or in MC, and just a
regular function call if runnning a plain simulation.

This may speed up large simulations with a huge amount of activities,
but the perf improvement is not evaluated yet.

The performance could be further improved with a SIMGRID_HAVE_PARALLEL
option allowing the compiler to know beforhand that the simcall branch
will never be taken. But such an option would require to be tested and
I'm too lazy for that.

Allow the MC replay to use the 'zero' buffering

Do not MC_assert on failed xbt_assert, it's too shaky

I'll handle it from the MC side instead