Lots of bugfixes for the fat trees, it should at least not crash when using it

small cosmetics to AsClusterFatTree::generateDotFile()

Fix some bugs in fat trees

make the xbt_os_time module public

update the comments of that file

listing new files

start testing remote I/Os

leak--

allow several hosts to open the same file simultaneously

Throw an exception only when it's really not implemented

Move unachieved release goals from ChangeLog to TODO file.

Cosmetics: keep alphabetical order.

Update doc for surf++

Documentation for stack size, stack guard and context factory

Add some words about %e fore spaces in logs.

When the parameter parser is jammed, display the full parsed string

add some doc about the trap I just felt into

Free previously set process data.

Free smpi_instances.

Free powerPeak which is unused here.

Some tests have different outputs when !HAVE_TRACING.  Fix them.

This field definitely has sense only when tracing is compiled in.

Fix race condition.

Avoid to launch and cancel the task at the same time.  It seems to work with
HAVE_TRACING, but fails without.  In fact, the task cancelation happens before
the task starts to execute.  As a workaround, add a small delay before firing
up the cancel.

Skip simcall when HAVE_TRACING.

And try to keep the same visible behavior with and without tracing.

Cosmetics: reuse already defined variable.

task->counter is initialized only when HAVE_TRACING.

Use task pointer instead to compute the key.

Disable tracing tests when !HAVE_TRACING.

Use boost::intrusive in CpuTi

Fix a a wrong use of cmake, which makes linking fail when smpi is disabled

further document the parmap mess. Next step should be refactoring/simplifying

greatly improve the documentation of the parallel execution in simix

previous version was initializing retval=0 and then testing retval!=MPI_ERR_REQUEST. This seems dubious to me

move a declaration. Should fix compilation bug on MacOS X .

Fix compil without tracing, which was broken multiple times ...
Warning : some tests are broken when tracing is disabled

Revert "Replace xbt_heap by boost::heap::fibonacci_heap"

This reverts commit fb588fbb8c119a8f04e6d2cb15b663257786ba70.

Replace xbt_heap by boost::heap::fibonacci_heap

Remove unnecessary casts

Unify models apis

Fix a bug in SMPI that leads to a segfault when one of the request in MPI_StartAll is MPI_REQUEST_NULL

Fat trees may actually be used

Add a routing for fat trees

third time's the charm ?

The tag cluster accepts the topology fat_tree

Add a function returning an instance of fat tree

merge Fred and Henri description of the same stuff

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Added documentation of the  --cfg="smpi/simulation_computation" feature of mpirun

updating ignore patterns-list should be complete now

document the smpi/simulation_computation option and list it in the
index (with the one on privatization too)

Set return value.

Don't try to kill non-existing process (*process == NULL).

Fix dead assignments.

That's when a value stored in a variable is never used.

Add check for error.

Fix warning about duplicate typedef.

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Fix use of wrong variable

Added a --cfg="smpi/simulation_computation" to smpirun. The default
value is "yes", meaning that SMPI will benchmark computational parts
of the simulation application and simulate them using smpi_execute(), as
it's always been done in the past.

Disabling the simulation of computation is useful when smpirunning an "application"
that is in fact doing a "live replay" of another MPI app (e.g., ScalaTrace's replay tool, various on-line simulators that run an app at scale). In this case the computation due to the replay logic
should be be simulated by SMPI.

For the time being, for smpirunning such an "application", the approach is:
1. use --cfg="smpi/simulation_computation:no"
2. add calls to smpi_execute() in the "application"

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Rewrote smpi_sleep() and smpi_usleep() so that:
1. the code is not duplicated but shared in a static private function
2. sleeping is done via an actual simcall_process_sleep rather than a bogus computation

Augmented SMPI tracing to allow tracing of sleep events

forgot a comma ...

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot//simgrid/simgrid

add color for "test", not sure it's mandatory, but it won't hurt

update the ignore patterns after the recent source reorganizations

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

Modified smpi_sleep() so that it returns 0, instead of the number of seconds
it was passed in (not that people check that return value much, but...)

Added a smpi_usleep function and usleep -> smpi_usleep macro

Modify one of the replay examples to use the 'test' action. the test on
process of rank 1 fails (send not posted yet) while that on process of
rank 2 succeeds (the wait then becomes a noop action)

add support of MPI_Test in smpi_replay and TRACING-TI

document smpi global variable privatization

Fix warning introduced by previous commit

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Completion of the routing for fat trees

Add some routing for the fat trees
Unsign some ints

remove file introduced in 4a8e5b1e8

Changelog update

Fix leak in process_join

better to add this file ...

properly add a smpicxx "compiler"

allow MPI codes to use timezone in their gettimeofday (but we replace it
to NULL anyway). The previous macro prevented the compilation of some
code.

Added a definition of MPI_File (MPI-IO) to allow smpicc to compile code that declare MPI_File variables.

Some updates in ChangeLog.

have barrier_wait return XBT/MSG_BARRIER_SERIAL_PROCESS for one process
Also have it reset the counter when barrier is completed, to allow reuse

fix teshes

actually change the value as said in previous commit

change default value of maxmin/precision to 1e-3 for smpi. Fix bug [#17132]
The default one was uselessly low, since the actual computation precision is now surf/precision.
This lead to some bug on 64 bit systems when comparing large values (>1M) with insanely high precision (1e-9).

requalify tesh to account for new finalize

Use the xbt barrier to finalize smpi processes cleanly.
This removes the MPI_Barrier that was used before, which might have caused problems in some cases

add msg and xbt versions of barrier.
MSG/xbt_barrier_init(unsigned int count) creates the barrier object for all processes
MSG/xbt_barrier_wait(msg/xbt_bar_t bar) waits on it
MSG/xbt_barrier_destroy(msg/xbt_bar_t bar) deletes the object (only one process should call it)

typo --

typo --

add MSG_get_as_by_name call, answering [#17311]

Fix tesh-simdag-flatifier

Update changelog

Reorganize AddTests.cmake

Corrections to fat trees, set the size of connection vectors right

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Rewrite of the fat trees implementation

There was too much levels of backslash escapes.  Remove one of them.

It seems that it changed with commit 782233, when the add_test statements
were changed from add_test(testname exe arg...) to
add_test(NAME testname COMMAND exe arg...).

This broke test memcheck-smpi-replay-9.

Don't use xbt_assert for error checking, it may be disabled.

Specify dependencies between memcheck tests.

Allows to run memcheck tests in parallel with e.g.
    ctest -D ExperimentalMemCheck -j 8