fixed several problems in gather, gatherv, allgather, allgatherv, and scan

removed check that sent/received requests are for the same size message.

Merge back master branch

Revert "Use private mapping (we already have early unlinking)."
Apparently, this blows out memory.

This reverts commit b3f59725051f14d38fc6d9f63474bda6c207830e.

Use private mapping (we already have early unlinking).

Use shared segments to implement SHARED_MALLOC.

tree_bcast and antibcast don't actually use the root parameter, so I removed it.

changed match_recv and match_send...They were requiring matching communicators,
which was causing communication to fail after MPI_comm_dup. Real mpi only tests for
matching size, src, tag.

fixed build_tree to enable MPI broadcasts with root nodes other than 0.

Let's assume that Hurd systems provide working MMAP services

light update to the FAQ: we're not using autotools anymore

Get ready for RC2, to take last minute change from Pedro

updating NEWS about tracing

[trace] to proceed, check if platform is traced in functions that need it

Cope with new way of destroying actions, now if the action is destroyed assume that it finished and the remain is zero.

Bug fix. Cope with the new way actions are handled.

get ready for 3.6-rc1

typo

merge

Java and Ruby were killed away

Added changes for SMPI.

proposition of NEWS content for the 3.6 release

Regenerate files in maintainer mode.

Remove variable parts from flexml generated files (maintainer mode).

That is:
- remove the comment about generated date;
- use a relative path when generating dax_dtd.l.

The purpose of this patch is to avoid to generate files with the only
difference being a comment line.

[trace] remove old source file with functions that are no longer used

[trace] cosmetics, remove TRACE_is_active, use TRACE_is_enabled instead

[trace] graphicator needs the platform to creata a graph of it

details:
- users should specify --cfg=tracing/platform:1 from now on

[trace] adding a new boolean parameter (tracing/platform) to register platform in the trace file

[trace] updating tracing-related section of the FAQ

[trace] interface cosmetics: removing pre-processor defines, substitute by function calls

[trace] adding new way of set user variables for links, by providing src and dst

details:
- instrumentation gets the routes between src and dst
and set the variable for all the links of the route

[trace] cosmetics, cleaner public include tracing header

fix compilation error if gtnets is to be compiled without tracing

[trace] fix tests: tracing-tasks and smpi-tracing-ptp

details:
- command line parameters for tracing smpi have changed

[trace] bugfix, parameters were wrong

[trace] new smpi tracing options

details:
- to activate the traditional gantt-chart visualization, pass -trace
     as parameter. Then, the tracefile can be visualized with Paje using
     $ Paje smpi_simgrid.trace
- to activate the graph-view and resource utilization, pass
     -trace -trace-triva -trace-resource as parameters. Then, the
     tracefile can be visualization with Triva using
     $ Triva --graph --gc_conf smpi_uncat.plist smpi_simgrid.trace

- other options include:
   - group mpi processes by where they are executed: -trace-grouped
   - specify a different trace filename: -trace-file <tracefile>

[trace] default colors for mpi states

[trace] updating tesh's to follow recent changes in tracing system

[trace] msg process and tasks tracing also needs platform

[trace] removing volume case study, deprecated at 3.6

[trace] smpi grouped trace implies user wants to trace smpi as a whole

[trace] let the tracing system (and not the instrumentation interface) decide what to trace

[trace] only need to declare resource utilization types if categorized/uncategorized are selected by user

[trace] isolating buffer dumping from the simulation, only dump if trace is enabled

[trace] controlling the callbacks and push/pop of containers based on TRACE_needs_platform

[trace] new function returns true if user options need the platform structure

correcting mode of a perl script to be executable

Let the user set the latency with the constant network model

Added an optinal timer for those who want to sample the remaining throughout execution.

Shut down the gtnets verbose output when advancing simulation clock to a given amount.

Apply "coordinates" config option in surf_config, and not in xbt/config.

[gras] Don't define variables twice.

Declare them "extern" in include files.
Found by compiling with "-fno-common".

[surf] Don't define variable "platform_filename" twice.

Declare it "extern" in include file, and define it elsewhere.
Found by compiling with "-fno-common".

[mc] Don't define variable "raw_heap_fd" twice.

Declare it "extern" in include file.
Found by compiling with "-fno-common".

Actually comment the declaration/definition, since it is not used.

[tesh] Don't define variables twice.

Declare them "extern" in include file.
Found by compiling with "-fno-common".

Delete unused variable.

Delete old/unused file.

It seems unused since commit 6f94b475ee53a96bbe5739ad0764b82649451f36.

Tasks must be initialized.

Move tests at proper place.

Fix stupid off-by-one error, and make check survive to NDEBUG.

Merge back master branch.

Conflicts:
src/smpi/smpi_bench.c

Very basic memoizer.

Merge back master branch.

[trace] Fix tests: tracing-ms, and tracing-categories.

This basically reverts commit 533fc9ef1e41dcc1902b990d489e8b23c8740e15
("update tracing tesh's to new order of events caused by the change in the automatic event ordering").

[trace] Fix insert_into_buffer.

Register get_route_latency in global_routing, and use it.

Avoid an unnecessary double call to get_route...

Define get_route_latency.

Do not compute a full extended route when it is not needed.

Merge _get_route and _get_latency.

Rewrite remplace in surf_routing_rulebase and avoid calls to strlen..

Save another few percents in elements_father.

Stop using a dynar for path_src/dst, and use an array allocated on stack.
Since elements_father is called very often, it is a non-negligible economy.

If it reveals not sufficient, there are at least three solutions:
- revert this patch; or
- increase ELEMENTS_FATHER_MAXDEPTH; or
- dynamically switch to dynar for large structures.

Sanitize types, slightly improve, and reindent elements_father.

Change interface for elements_father, and avoid to allocate a dynar.

Use realloc and make _xbt_dynar_expand a bit faster.

[trace] Do not split comm if trace is not active.

[trace] Cache config options.

[trace] Guard expensive computations with TRACE_is_active.

Fixed the reamining value, now distinguish between flows that have completed and are still to be started.

Add an hidden option to enable ucontext on Mac.
cmake -Ducontext=on .
For the moment ucontext don't work on MAC OSX

In mac ucontext.h is not detected by cmake but we want to use it.
Set flag "-D_XOPEN_SOURCE" in Flags.cmake

Merge back master branch.

If ucontext.h is not present don't try to run prog_AC_CHECK_MCSC.c.

Action replayer: don't hardcode the usage of raw contextes

Use variadic macros

Action replayer: remove dirty hacks, they didn't work anyway

Add missing test before set properties.

[trace] cosmetics on user variables tracing, simpler interface

Update ChangeLog

[trace] fix on user link variable declaration

Add a script for install ns3

Fix error message.

Subtraction (optionlist_cpy - name) was upside-down.  Change to only keep
the name of the variable.

Optimisation of get_route.
Remove the copie of e_route.
Directely give result of get_route into e_route.

Define and use a function to run the processes to run.

Don't include generated headers into distrib.

Add some print for debug (trace level)

Use flag -Drelease=on on pipol for the moment.

Change the handling of SIMIX requests in model checker too.

Try to improve xbt_parmap.

Do not pre-compute the job share for each thread, and let the load
balance automatically.

Some more cleanup in smx_context_raw.

Remove smx_ctx_raw_self_parallel which is the same as smx_ctx_base_self.
Then the raw_factory static variable is not needed anymore.

Remove the get_thread_id field from context_factory.

It is now unused.