move the routing stuff to its namespace

Only on macos, these defines were actually ignored.

Add a test for SMPI versions of gettimeofday, clock_gettime and nano/u/sleep

*** macos

fix compilation on macos and with MC

We add a ref directly at creation, so start at 0. Leaks --

leak --

We intercept sleep, usleep and gettimeofday. Add clock_gettime and nanoslepp, also

print the right walue here

Fix bug : limiter_link was not read as a bandwidth for clusters (125MBps became 125)

update doc

Rename topology examples clusters, for a better clarity (I think)

add test for the dragonfly topology

maintainer mode pass, to add dragonfly topology

warnings --

Document the Dragonfly cluster

Have Dragonfly use only one link with n times the bw, instead of n parallel links
We don't know how the load is spread by the routers : packets seems to be spread over parallel links

Bugfixes in dragonfly routing

Add loopbacks and limiters for dragonfly

Add Dragonfly topology. Use XC30's Cray description as a basis
For now minimal routing is supported, but non-minimal one will be added soon.
We still need to add randomization of the links used at each level
No documentation yet

[XBT] Remove unused code

[SMPI] Add XBT_ATTRIB_UNUSED to prevent OSX compilation error

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

don't sonarqube pull requests

[simix] Add comments about the generic simcalls and rename them

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

kill an unused static global

[simix] SIMIX futures

Add a missing file to the archive

make dist: use the right file names

[simix] Add a `run_blocking` simcall and simix::kernelSync

* run_blocking() is a generic blocking simcall. It is given a callback
  which is executed immediately in the SimGrid kernel. The callback is
  responsible for setting the suitable logic for waking up the process
  when needed.

* simix::kernelSync() is a higher level wrapper for this. It is given
  a callback which is executed in the kernel SimGrid and returns a
  simgrid::kernel::Future<T>. The kernel blocks the process until the
  Future is ready and either the value wrapped in the future to the
  process or raises the exception stored in the Future in the process.

* simgrid::simix::{Future,Promise} provide an abstration for
  asynchronous stuff happening in the SimGrid kernel. They are based
  on C++1z futures.

[s4u] Fix double

[s4u] Fix atomic_flag initialization

rename some methods of s4u::Host

no need to save the workers in an array in that example

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

[XBT] Fix array indices in memory_map.cpp

Also add an 'else' case that should never be reached.

See man(5) proc for more details.

[XBT] Add/fix some comments in memory_map.cpp

[SMPI] Remove function declaration from smpi_bench.cpp

There is already another declaration in private.h

[SMPI] Replace some #define with static const variables.

[SMPI] Added a \todo item for further changes.

[SMPI] Replace some xbt_abort with xbt_die + error msg

[SMPI] die() if memory map is not readable.

[SMPI] Indentation / cosmetics in smpi_base.cpp

[SMPI] Move definition of macro TOPAGE to private.hpp

This was used in 2 files and should hence just go there.

[SMPI/MC] Use std::strlen() instead of manual counting.

[SMPI] Added a simple comment on macro SMPI_VARINIT_STATIC

[SMPI] Renamed smpi_c99.cpp to smpi_static_variables.cpp

[s4u] Create actors by functions in the mutex example

[simix] Create actor by passing function and arguments

doxygen: change the layout of namespace documentation

rename the internal target to sync doc on gforge

remove one layer of subsections in S4U doc

update doc to nowadays lexique

small cleanups in s4u::hosts: improve doc, kill useless function

small improvments to the s4u_actor doc

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

reduce Java debt (endless wip)

[simix] Refcounting with SIMIX_cond_{ref,unref}()

[simix] Add warning about atomic operations

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

remove some smells in Java

[simix] Group simcall_process_create()

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

make pastry example functional
no idea what it does though

[simix] Create actors by value (instead of new()-ing and leaking them)

clean chord a bit

[simix] Refcounting with SIMIX_{process,mutex}_{ref,unref}()

Improve the doc of the S4U actors

start including S4U in the doc

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

[s4u] Cleanup s4u mutex example

[s4u] Use simix simix::Mutex refcount support for s4u::Mutex

[simix] Add refcount to Process

[s4u] add mutex

[simix] Fix refcount in Mutex

Revert "[SMPI] Fix wrong return value in MPI_Testany."

This reverts commit efcf0fb465cf0465c462fc28a830ccd4d6b6b13c.

The reason I reverted again is that the standard does actually state

"The array may contain null or inactive handles. If the array contains
no active handles then the call returns immediately with flag = true,
index = MPI_UNDEFINED , and an empty status."

This is a corner case and was correctly handled here.

Add a test for jenkins to try a few configuration options
for the nightly build. This should trigger 16 builds for now, which may be a lot.

fix build with MC but without SMPI

tiny doc formating improvement

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

[SMPI] Update notice in smpirun.in for cluster tags.

[SMPI] Fix wrong return value in MPI_Testany.

See the MPI Standard on this function: flag must be true
if and only if there was at least one operation completed.

[SMPI] Remove outdated comment.

[SMPI] Cosmetics in smpi_base.cpp

[SIMIX] Add a comment

[SMPI] C++ify smpi_mpi_testany(). There's more to do though.

[SMPI] Alignment cosmetics.

[SMX] Alignment cosmetics.

[simix] Add refcount to Mutex

[simix] Make Mutex a C++ class (kind-of)

bugs removal of the day

[SMPI] Die more peacefully when a process calls exit or stop, either before or after MPI_Finalize()

warnings --

[SMPI] Rewrote parsing of smpi-factors in C++

We do want to move the parsing to some other location, as this
might be required for other parameters as well

[SMPI] Alignments in smpi_base.cpp

[CHANGELOG] Added recent SMPI fixes

small pass over the doc

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

[xbt] Move backtrace support for exceptions in a mixin class

* mixin class to add backtraces to any exception;

* code to display exceptions with name, what(), backtraces and nested
  exceptions;

* demangle C++ names (class type names, function names).