[SMPI] Fixed broken build; added missing header file and fixed function name

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

catch a couple more reinterpret_cast

[INSTR] Purely cosmetics: Aligned '='

[INSTR] Removed duplicated code by calling another function.

[Energy] Updated in-file documentation regarding the new energy model.

[DOC] Incorporate changes to paths from 62ab7fd228 in doc

[SMPI] Introduced smpi/iprobe-cpu-usage option.

This option allows us to account for lower energy consumption for
Iprobes. The value here must be larger than 0 and at most 1 (with 1 being the default)

fix the compilation of MPICH3 tests with the absolute paranoid flags (enable_maintainer)

git ignore the newly activated MPICH3 tests

travis: don't run the tests on OSX when the build failed

bin/graphicator is the last built binary. If it exists, then
everything else was built too.

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

fix

Fix compilation with warnings

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

more minor smells removed

fix a few minor smells

remove 3 useless reinterpret_cast

solving copy_data_callback issue by adding a new smpi function that can be changed by user

sonar: the regex are not as cool as the one of bash

split a big blurb into a separate function to reduce the level of conditionnal nesting

sonar is picky, so let's be verbose

sonar: ignore another file + many cosmetics

prefer the stack to the heap for temp data

Add the failing tests name to the final output for mpich3 tests, to ease identification.

I see dead dynars!!!

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

simplify and reverse comparison for accumulates in Waitall
(+1 for vectors!!)

sonar: ignore another generated file

back() doesn't help so save it. set a link to nullptr

dynar--

also get the popped value (to see if it solves issues)

new doesn't return NULL, this can be spared

dynar--(x3)

dynar--

smells --

cleanup a bit

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Poke around trying to get jenkins to display files in src/bindings/java

try to fix --help

fix what clang-format broke

typo

Add coverage info for .java files in the simgrid jar.
Also simplify the way we handle java tests in coverage to avoid keeping a list of tests here.

smpi_replay: allow to register extra events before things start (+plug a memleak)

Hide a bit an internal datatype to please sonar

kill two dynars

smells and bugs

please sonar there too

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

allow users to create clusters with pstates

ignore added cruft in java tesh output

reactivate flags

Try to have java coverage with jacoco.
Should instead break everything.

Moar foreach !

reindent

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

sonar: ignore coverage on XML files (and some others)

undynarify Torus

another try at having coverage info on travis, for sonar

Try to get coverage files on travis

please sonar

simplify the way tesh deals with sorted diffs

rename some C type for consistency

sonar: allow 'Pointers should not be cast to integral types' everywhere in source

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

less free in Dragonfly and Torus

check that max is not -1 befor using it as index

Don't do the loop ourselves, let jenkins handle this part with Configuration Matrix
This should improve readability of the output

Add more infos to Flags output, and write them to a file.
This will be used to set the description of the build

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

please sonar

name parameters in prototypes

no == for doubles
TODO or FIXME, not both => TODO

Cleanup Sanitizer jenkins script to allow separate launch

checking if a unsigned int is >0 is a bad idea
1-2 = 4294967295 is positive !! check 1 > 2 instead
revalidate tesh, previous one might have been silently false
should please sanitizer

do not try to remove an out-of-index piece
should please sanitizer

plug a bunch of memleaks

plug a memleak

useless cleanups to the Java bindings

useless cleanups to the Java bindings

sonar: JNI mandates extra parameters (+cosmetics)

please sonar

- Ignore RngStream, which we did not author
- Mark the whole java bindings as using the C linkage, because the JVM
  wants it so. So we cannot move these symbols in a namespace.
- Mark the whole XML cruft as using the C linkage, because FlexML
  wants it so.
- Mark the whole MSG API as using the C linkage, because it does.

finish the transition from C structures to C++ objects

Actually, we should stop using sg_platf_new_link and use
NetZone::createLink() but this later function is not ready yet.

And I don't want to revert the work of Fred so I'd better fix it.

woops

WIP stop using const char* in C++ layers
(and ugly bprintf, const_cast and free that sonar doesn't like)

cosmetics in ChangeLog

please sonar

- Remove redundent declaration
- mark functions as extern "C" in their declaration, not only prototypes
- also stop having a C function and a C++ function sharing the same
  name with differing prototypes, even if sonar did not complain.

please sonar by moving includes at the top

Update changelog

plug some other memleaks

plug a bunch of memleaks

cosmetics while digging for a memleak

plug a memleak. I should beter kill that XBT container instead

plug an obvious memleak

tesh: better handling of very large sorted output

- truncate the diff at 250 lines (in any cases)
- show the unsorted output if the diff was asked to be sorted

fix a suppurious failure on sanitizers

save some useless calls when there is no request to handle

cosmetics for sonar

Avoid unsafe things

save some more lines