Missing include.

fix build with MC + no SMPI

Merge branch 'doc' into 'master'

Fix link in Mutex doc

See merge request simgrid/simgrid!25

remove debug stuff added by mistake...

...

manifest update

need to initialize here also for osx and co.

Somehow OSX "lost" aligned_alloc recently ?
But it's quite useless here anyway, so don't bother.

help mc initialize smpi options.

fix MC build

leak--

requalify tesh as one message changed category

Move SMPI config to smpi_config.cpp file.
Store values for most used values, which can be used millions of times.
In some tests I saw up to 5% of the time spent reading them.

Fix link in Mutex doc

Fix issue with copy avoidance, which was merely working by accident in most cases.
That was causing HPL to loop.

more precise OS description for OpenIndiana.

Merge branch 'master' into 'master'

Master

See merge request simgrid/simgrid!23

Clean up and use of vector for cleaner allocation

oops, this bit wasn't meant to be reverted.

rename this macro.
It's actually useful outside of sampi, to disable malloc override when it conflicts with other codes and is not needed.
Fors instance FFTW uses FFTW(malloc(x)) to actually call fftw_malloc, and our macro was then breaking compilation.

partial revert of e16e0233
These parenthesis are useful for use in macros, such as in HPL

Avoid allocation inside lmm_solve

Add missing constant definitions for Fortran

Merge branch 'master' of https://framagit.org/simgrid/simgrid

maestro_process -> maestro_

make SIMIX_wake_processes a method of simix_global

1 a.m. lazy commit. Plenty of new libs appeared on our radar on fedora after an update (elfutils ?)...
They have multiple ro segments, and their debuginfos are missing.

2-8 is matched as a version number and stripped from libname

cosmetics

Merge branch 'master' of https://framagit.org/simgrid/simgrid

Improve self (less SIMIX more kernel)

MC: also ignore a library that has multiple read-only segments on fedora

depreacate SIMIX_process_on_exit

Add norelro to link flags (see FG #35).

Fix doubled semicolons.

cosmetics (less SIMIX, more kernel)

Merge branch 'master' of https://framagit.org/simgrid/simgrid

e_smx_state_t is now kernel::activity::State

Add a test for mpi_cart_sub based on the bug report by Jonathan Borne.

replace ticks by version of python in project description when python is used for simgrid.

enhance shared tests to validate comms are skipped

Try to have a real mpi_cart_sub

use by_name_or_null for links too

fix asserts

don't know why this was still a struct

Avoid copying data if it comes from/to a shared buffer, even internally.
Mainly useful for MPI_IN_PLACE collectives.

Ignore copies in plain shared_mallocs.

Lame attempt to fix freebsd builds.

/usr/local/bin/ld: /usr/local/llvm-devel/lib/libomp.so: undefined reference to `kmp_set_thread_affinity_mask_initial'

A single lookup is enough.

Parentheses around macro parameters.

Initialize allocated memory.

Memory leak--

Unused stuff.

smpi colls: use C++ containers instead of nul-terminted C vectors

cosmetics

don't forget that calloc assigns 0 to the buffer

cosmetics : I activated -pedantic for a quick pass
I decided to ignore errors related to printf %p which wants a void*-casted pointer
main changes are the removal of spurious ; in the code, and some forbidden dynamically sized arrays.

fix use after delete.

add calloc_intercept to avoid mistmatches.

Merge remote-tracking branch 'framagit/master'

expend more macros in MPI collectives

use catch2 way of doing this

Add tolerance for floating point precision comparisons.
Fails on 32bits if equality is used.

A change in cmake 3.16 makes this syntax necessary.
Let's see if old cmakes (and osx) allow this.
ref https://gitlab.kitware.com/cmake/cmake/issues/19747

Actually free the memory in these cases, should fix leaks and crashes on 32 bits.

include smpi helpers definitions in smpi.h, to define smpi_shared_free again.

Kill now unused macros.

Define simgrid::xbt::InitializationError (please Sonar).

Cleanup around simgrid::ParseError.

Update .mailmap.

rnd: cosmetics to ease the implem

Merge branch 'xbt_random' into 'master'

Choice between ad-hoc and standard distributions implementations

See merge request simgrid/simgrid!21

Reverting the change to xbt_uniform_int

Adding unit tests for the standard library distributions

Updating tests results for dht-chord (due to change to uniform int)

Modifying how uniform integer are generated

Introducing choice between the standard library and ad-hoc SimGrid distribution implementations.

add option "smpi/auto-shared-malloc-thresh"
This applies smpi_shared_malloc automatically to all allocations above a certain size.
Test based on the sample-shared one: malloc >= 8bytes is indeed shared, without using macros.

todo: calloc and co.

plug a memleak on parse error :)

The most important fix ever!

document recent changes

Inventive hack to get flex raising exceptions on parse error

The core of this (over 2500 lines) patch reads as follows:
-    fprintf(stderr, "%s\n", flexml_err_msg);
+    surf_parse_error(flexml_err_msg);

But the code we want to change is generated by Flex, so ... I have to
augment the perl script that rewrite some parts of the Flex result for
that purpose. Because yes, we do have such a perl script.

At the end, we need to regenerate the flex parser with the latest
version of Flex to apply this patch, resulting in that jumbo patch.

also throw an exception when asked to parse an inexisting file

smpi: expend a bunch of macros so that the functions' prototypes become accessible to my IDE

Change smpi::Colls static class into a namespace of functions

Merge branch 'xbt_random' into 'master'

A module for RNG calls

See merge request simgrid/simgrid!20

Merge branch 'master' of https://framagit.org/simgrid/simgrid

power is speed

Assertion to force maximum value to be greater or equal to minimum in uniform int

fix fortran + ARM 64 bits.
I would like to get rid of these lists of architectures, and rely on cmake sizeof_voidp ... but this would mean relying on internal_config from smpi.h, and this is bad practice in simgrid :p Any idea ? Feel free to change it.
Anyway I changed the one in a cpp file that handles 99% of the cases, le .h is there for some ugly corner cases... This should not trigger too many errors in case of a new 64bits architecture popping.

Energy plugins now throws std::logic_error when not properly inited before use

parsing: less asserts, more exception raising

handle flexer errors within the parsing module

Raise the exception ourselves instead of leaking an error code that
must be converted into an exception by our caller.

Parse errors now raise a simgrid::ParseError that you may want to catch

a bit of cleanup, could go further but not now

reduce code dupplication

smpi: many classes died tonight, but that will save kitten on the long term.

smpi::Coll was a class with 11 static methods (one per MPI function
that has several implementations: allgather, allgatherv, etc) and
nothing else.

That class was derivated for each implementation of a given MPI
function, and the resulting class was overloading only one of the
methods while the others were ignored. There was well over 100 such
child classes.

The overloaded methods were static in their class, and always used as
a function (the class was never instanciated).

All this was written with some macros to reduce the burden.

Instead, we now use regular functions in the smpi namespace.

fix ns3 builds

deprecate MSG_set_function, that seems useless since we cannot bypass the parser nowadays

store kernel-level objects in EngineImpl

make piface_ private and have get_iface() everywhere