Revert "rename SIMIX_process_get_maxpid() to SIMIX_process_get_nextpid() and make it public"

This reverts commit 9306ddd4b063b1934dbab43f967e380d0181e393.

kill an unused definition

rename SIMIX_process_get_maxpid() to SIMIX_process_get_nextpid() and make it public

This ends the Fix #15 after the recent commit of @mpoquet. Thanks for
that again.

Merge branch 'master' of github.com:mquinson/simgrid

Merge pull request #17 from mpoquet/master

Candidate patch to issue #15

kill two empty files

who needs such an empty constructor?

less void*, new type: surf_host_t

Plus some small cosmetics

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

do not output a user unfriendly line

"Switching host model to compound since you changed the network and/or cpu model(s)"

- Hard to understand what's going on without reading the right part of
  the source.
- I cannot think of a situation where this would do any good

- My evil plan is to change the xbt_lib of all hosts by a boost map of
  Hosts, so the host model will be gone, and hosts will always
  dispatch to their content. One this is done, objectifying everything
  will be really easy.

ignore more cruft

MASSIVE cleanup: s/workstation/host/

- simdag is not affected for now (it's a user interface, it will be
  rewamped soon)
- It means that the workstation/model option is changed into host/model

That's a really intrusive change, and I'm sorry for the ones having
unmerged branches (Sorry Christian, I thought of you when I was almost
done). But I feel that this is a good move for the project, important
to the objectification of the whole.

using trace timestamp precision when printing to trace files

new option to set trace timestamp precision

the number must be an integer, whose value is the
desired number of digits after the decimal point
for all timestamps registered when tracing

[mc] Cleanup the DSO ignore list and add some entries

[mc] Fix the DSO debug ignore list

This is nasty. We must get rid of this.

Fix the cmake for the host-on-off tests

Fix #7

Fix the host-on-off refcount test

host-on-off: add basic tests

[jenkins] Enable debug (Ã-g) in the builds

Add the missing breaks

Move the host-on-off fix above

If our host is OFF, we should always get a HOST_FAILURE.

This seems to fix issues where a host was turned off but its processes
were not woken up with HOST_FAILURE.

Clean the possibly dangling waiting_synchro pointer

Fix host-on-off

This is a temporary workaround. This should probably be fixed at a
lower layer instead.

The test stil has a refcount handling bug (two +1 but only one -1).

Fix the documentation

Comment on a function whose behavior may be misleading...

Do not build html/msg-tuto-src.tg anymore

This is not referenced anywhere. Those things are intended to go on
the website.

The tar is not reproducible by default (see
https://bugs.debian.org/789715) because it contains timestamps.  The
-n flags can be passed to gzip in order to omit the timestamps but
this option is not available in `cmake -E tar`. We would like to avoid
depending on tar+gzip because they are often not available on Windows
systems.

Add missing #include

generate-dwarf-functions: add a 'Usage' comment

Fix reference to generate.sh (now generate-dwarf-functions)

[mc] Fix include guards

[mc] Remove ugly #include

Add some #includes

second attempt

(attempt to) Disable fortran for mac platforms, for now.
If we ever find a user for SMPI+Fortran on apple, we will need to investigate what to do to
correctly plug the user_main function (correct underscore handling is a likely guess)

happy now?

please the paranoid freak

Don't try to change the rate of task once it's done, the new test in
SD_task_set_rate raises a justified warn.
Add a comment to warn readers that such a change must be done before the
beginning of the execution of a task.

forgot to declare newly added actions_io.txt and
storage_deployment.xml files.
These files are needed by the early prototype of storage action replay.

first prototype of storage action replay

prepare implementation of first prototype of I/O trace replay

add two declarations for fortran

fix memory leak

Fix thread safety issue in process cleanup

While trying to find the root cause of the occasional failure of the
kademlia test, I found a thread-safety issue here:

When running in parallel mode all worker threads can call the
`SIMIX_process_cleanup()` concurrently which does things such as:

~~~c++
XBT_DEBUG("%p should not be run anymore",process);
xbt_swag_remove(process, simix_global->process_list);
xbt_swag_remove(process, SIMIX_host_priv(process->smx_host)->process_list);
xbt_swag_insert(process, simix_global->process_to_destroy);
~~~

The SWAG are modified concurrently by the worker threads without
synchronization. Sometimes, they go into inconsistent states (for
example, `swag->count` is no more consistent with the number of
elements really in the swag).

This fix might not be the best way to do it.

Improve the doc and checkings of SD_task_set_rate.

do not generate the timestamps to help debian building reproducibly

Find objdump before admitting privatization is possible and compiling it.
MacOS has mmap and no objdump, so this disables the feature on this platform for now

remove unused var

MSG_process_get_data(): don't segfault if there the process has been cleaned up

[mc] Remove some extern "C"

clang was complaining about C-linkage functions with non-C-linkage return/parameter types.

Add support for new Boost.Context API

Parallel implementation for Boost.Context context

This is really a copy of the code of smx_context_sysv.c. (The same
logic is duplicated without mushc difference between most
implementations.)

[cmake] Fix broken -D_DWARWIN_C_SOURCE

Do not try to link against boost_context when there is none

[cmake] Do not find cmake as required

This is hanlded afterwards anyway and we need to succeed if Boost.Context is not found.

merge smpi_replay_init and smpi_replay_finalize into smpi_replay_run

rename a test in order to easily select it

Add the detection of Boost.Context

It seems I forgot this in the commit :/

Update comments about process swag hookups

some sorting in the [smpi/xbt]_replay stuff

- prefix public symbols with xbt_ as any other public symbols
- kill smpi_action_trace_run() as it is now a complicated no-OP
- Much cruft remains to be sorted in this area unfortunately

typos in comments

Remove a file associated to a test that got removed recently

[java] Add missing throw NativeException specifications, fix javadoc

[java] Fix javadoc

[java] Synchronize Storage.getByName() throw specification with the javadoc

Don't use -pthreads on Mac OS X

Clang is not happy about it.

Fix warning in xbt_os_time.c on Mach

Remove the install/ directory in the run_DynamicAnalysis.sh script

This directory is not used and conflicts with the INSTALL file on
case-insensitive filesystems.

[cmake] Detect libunwind on Mac OS X

Try to detect libunwind.{so,dylib} on x86_64

Debian ships the x86 code in libunwind-x86_64.so but Mac OS X uses
libunwind.dylib.

Add jenkins script for the debug build

Add missing __APPLE__ test in xbt_os_thread.c

Add missing headers in xbt_os_thread.c

[cmake] Add _DARWIN_C_SOURCE

It is needed when defining a specific value of _XOPEN_SOURCE.

Get rid of the MACOS tests

I don't know where it's supposed to come from but it's not defined.

Remove extraneous parentheses

clang is not happy.

fix unused return value warning

Define a version for _XOPEN_SOURCE

700 is for X/Open7 (superset of POSIX 2008)

[cmake] Try to simplify the ucontext checks

Remove IS_WINDOWS (not used)

Remove windows_context (not used)

Remove PRINTF_STR

It was only used in tests.

useful error message when requesting for the debug log level while using -DNDEBUG

SMPI replay: make sure that the replay is inited even if rank 0 is not first for some reason

small doc improvement

Remove non-statis initializer in s_dw_type, s_mc_object_info

Not supported with GCC < 4.8.

[jenkins] Remove unused jenkins scripts

Kill the pipol build scripts

pipol does not exist anymore.

[jenkins] Cleanup memcheck files in the DynamicAnalysis script

Remove unused variable

[SMPI] smpi_process_init: revert to SIMIX_process_count() use

[SMPI] Update test output (smpi_replay.tesh)

Cosmetics

[SMPI] index_to_rank_map must be a xbt_dict, not a xbt_dynar

[SMPI] change SIMIX_process_count() by process count

[SMPI] reqq must be a xbt_dict not a xbt_dynar

[SMPI] Fixed smpi_replay_init()

- Force context switch to be sure that MSG_processes begin
initialization and fill various variable (e.g. group->rank_to_index
_map)

[SMPI] Fixed smpi_replay_init()

- Bug raised when there are MSG_processes which are not
participating to SMPI. The smpi_replay initialization supposed
a MSG_process with index equal to 0.

tiny small cleanup of a messssy code

Java should prefer the bundled version of native libs

Using the bundled version removes any versionning problem for the
simgrid_full.jar. This fixes #9 on github.