test if I can write a little travis config file

try to simplify the way simcalls are generated

kill dead code

ask swig to please doxygen. Tools will drive me nuts

ignore more cruft

rename SIMIX_simcall_{pre,post} to SIMIX_simcall_{enter,exit}

ensure that the generated files are autonomous and not included within another file

please doxygen keep calm

that file was seriously outdated

make my previous commit also compile under MC (sorry)

our usage of doxygen is improvable

use an automatic table of contents instead of a manual one

Make it much easier to follow control flow through simix

One of the main difficulty in navigating the source code when debuging
was to find your way from MSG to SURF, through SIMIX. The simcall
mechanism really breaks the flow.

The solution is to add a dummy call to the simcall body, such as:
    if (0) SIMIX_pre_host_off(&self->simcall, host);

With the "if (0)", it will be cut at compilation and have no impact on
the code behavior. But you can go to that function in eclipse, press
F3 and you are within the kernel now. No need to grep your way around.

ok eclipse, change your config file yourself, you're big enough

ignore more cruft

try to have valid chunks in generated files to please eclipse

Allow to recreate VMs in a better way (I guess)

Instead of removing the VM from the host_lib (and potentially create
issues at the routing level), test whether it exists in the VM layer
before whining that we cannot redo it.

Remove VMs from the lib of existing hosts so that they can be recreated

add parenthesis to shut up a useless warning

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

one more test for the migration - adrien

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

Conflicts:
src/bindings/java/smx_context_java.c

fix msg_host_is_avai... in msg_host_is_on - adrien

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

make msg_vm_migrate robust (i.e. now SRC or DST can be turned off during the migration) - fix teshsuite slee_host_off in java (but did not fix the output as I don't know how to do it), discover a bug on VM destroy (it is impossible to recreate the same VM: you get /Users/alebre/DEVELOPMENTS/SIMGRID/simgrid.orig/src/msg/msg_vm.c:209: [msg_vm/ERROR] host vm0 already exits) - Adrien

[mc] Fix segfault when a function does not have a name

This happens when compiling with LLVM (clang/dragonegg).

[mc] Give the real type of mc_heap/std_heap (xbt_mheap_t, not void*)

[mc] Simplify tests specifications for mc-bugged1-liveness*

better estimation of dynamic threshold

more informative message when a process gets killed

please a bit doxygen

missing call to XBT_LOG_CONNECT

don't define obsolete doxygen variables that we don't use

rename MSG_host_is_avail() to MSG_host_is_on()

(and same in Java)

Fix bug in keyval delete

give correct pointer when calling delete function

duplicated lines

store the int in a long-enough char array

cleanup, remove some useless functions

Add MPI_Type*keyval and MPI_Type*attr functions

Add MPI_Comm_*keyval and MPI_Comm*attr functions
These are just aliases for MPI*keyval and MPI*attr deprecated functions

activate some more tests

Fix compilation issue

Implement MPI_Keyval_create, MPI_Keyval_free, MPI_Attr_get, MPI_Attr_put, MPI_Attr_delete calls

provide new unimplemented signatures for RMA MPI calls

don't provide sync-gforge-doc* targets if doc is not enabled (cmake warning)

various fixes about replay and buffer usage

When display timing is set, also display global simulation time and application times
This allows to check if most of the time is spent in the application, or in Simgrid
Add a hint if more than 75% of the time is spent inside the application's code (to use replay or sampling)

Change way replay is handled, to allow cohabitation between replay and "classic" SMPI

this buffer was not meant to be shared

use correct free method for buffer

add MPI_Win_get_group, and activate some tests using *c2f and *f2c calls

avoid issues in fortran codes

Add forgotten MPI_Comm_f2c and MPI_Comm_c2f calls

[smpi] Leave the underlying structure of MPI_File opaque

[mc] Fix conversion from char 0 into  char*

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Fixes in adaptive algorithm

31e0f216b4 was sending some other executables to the wrong directory

have last algos use also temporary buffers

change name of some targets for mc, to avoid warnings by recent cmake

avoid the flag finline-functions with mc and clang, also

add some more calls to smpi temp buffers allocation functions

Disable the multiple replay test with MC.
It uses too much memory on ci slaves.

remove unwanted !

activate this flag only for gcc, as it now generates a warning for clang > 3.4
The flag is not used by clang, which used to just ignore it.

intercept correctly calls with unitialized communicators

Have replay always use shared buffers instead of allocating new ones, even inside collective ops.

for replay and collectives, only allocate buffers once (grow it if needed).
As we don't have shared malloc on all platforms, this should be more ci-friendly

fix bug still happening with dash

Fix replay files (alltoallv replay has changed since it was generated))

make deployment script generation posix friendly (remove bashisms, and try to stay efficient)

Add an example that shows how to replay multiple applications at the same time
Check README for more details

Add an option to have a sleep time before the start of a replay instance

small changes to make multiple replay easier

Added adaptive algorithm to find optimal threshold over simulations

use barrier from the active selector for replay

same issue with java bindings without NDEBUG

use _XBT_GNUC_UNUSED instead of previous buggy fix.
Thanks agier for the report

Revert "Don't use variables only for asserts."

This reverts commit c63217359371b823ac279159633e66bc0ea8bb6f.

Don't use variables only for asserts.
When enable_debug is turned to off, they become unused and induce warnings/errors

NDEBUG was not used on C++ files when enable_debug was set to 0

Fix failing tests when enable_debug is not activated.
Adds an alternative tesh file for logs

Fix Cmake warnings/errors since Cmake versions > 2.8.12

[xbt/surf] Change the costly heapremove+heapinsert used in share resource lazy algorithm.
Add a xbt_heap_update function, to set a new value for a element in the heap

fix reduce_scatter ompi

Win build does not support mmap, or shared_malloc

Always build Fortran bindings..
They are in C, they don't need Fortran compiler, and if we release the built library, we want them.
And also it fixes the build, broken since my last commit ..

Implement MPI_*_c2f MPI_*_f2c functions
Actually they were already implemented but with another name, make them public..

missing include

put back sleep time before actual send and recv.

doc update

don't set knomial factor for reduce, have it be computed at runtime

add one algo to the list

[mc] Add a (compile time) option for content addressage page store

With a simple hash, we expect collision to happen: when inserting a
new page in the store, each stored page with the same hash is compared
(memcmp-ed) with the current page.  If a page already present is
inserted, the content of the stored page is always pulled in the
cache: when inserting n pages, into the page store at least 2×n pages
are pulled in the cache.

With this option, a collision-free fingerprint of each page is
computed.  As there is no collision, we do not have to check the
content of the stored pages.  MD4 is used as we do not need security
against malicious users and it is much faster than more sescure
cryptographic hashes.

Fix bug in addtests macros.
Variables are global in Cmake, and ARGR was used int two different macros, resulting in tests being executed will all factories activated..
In the end only Thread factory seems to have been tested in the last few months ...

Fix issue with precision in 394ea1fb (on 32 bits platforms mainly)

requalify tesh

Fix order of mailbox checking
Some messages were not assigned correctly. This is still a mess.

no \n in debug messages