Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

New example for MSG host ON/OFF switching

New: MSG_host_get_pstate() and smpi_get_host_pstate()

'auto'? seriously?

Simplify the stack direction detection

For some reason, it did not work on Windows.

Use xbt_strdup instead of strdup

Use _strdup is strdup is not available

Thank you, Windows.

Some (partial) fixes for cross-compiling to Windows

make sure that the doxygen don't use LaTeX, even for formulas

forgot that reference to a renamed function

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further energy interface cleanups (see changelog)

MSG_host_get_pstate_number() -> MSG_host_get_pstate_count()

[mc] Make Process:object_infos a srd::vector of std::shared_ptr

[mc] Give ctor/dtor for s_dw_type

[mc] Add ctor/dtor for s_mc_object_info

[mc] Make s_mc_snapshot_stack::context not a pointer

[mc] Make s_mc_snapshot_stack::stack_frames a std::vector

[mc] Make s_mc_global_t::stacks a std::vector

[mc] Make s_mc_stack_frame::frame_name a std::string

[mc] Make s_mc_snapshot_stack::local_variables a std::vector

[mc] Make s_local_variable::name a std::string

[mc] Move s_local_variable in mc_snapshot.h

[mc] Make Snapshot::snapshot_regions a std::vector

[mc] Make Snapshot::to_ignore a std::vector

[mc] Make Snapshot::ignored_data a std::vector

[mc] Make Snapshot::current_fds a std::vector

[mc] Make Snapshot::stack_sizes a std::vector

[mc] Make Snapshot::enabled_process a std::set

[Cmake] Fixed typos in and restructured Options.cmake

[Cmake] Fixed wrong set() syntax in cmake files

- Files CTestConfig.cmake and Options.cmake were affected

- The variable BUILDNAME is declared to be INTERNAL; this
  means that it should not be displayed in any GUI. However,
  as the "keyword" (note the quotation marks here) TYPE was
  given (this does not exist!), it was still displayed; however,
  the "docstring" property was missing, so I added it.

- Check out the documentation here:
  http://www.cmake.org/cmake/help/v2.8.7/cmake.html#section_Properties

[mc] Do not clobber CMAKE_C_FLAGS and friends

[doc] Fix header

[Doc] Added references to the calibration scripts

[Doc] Corrected section reference

[Doc] Added section on smpi/use_shared_malloc

[Doc] Removed misplaced \b from options.doc

[Doc] Added description for smpi/os, smpi/ois, smpi/or

[Doc] Added default value for smpi/display_timing

[Documentation] Added a note for smpi/cpu_threshold

[mc][doc] Fix MC links

[mc][doc] Document the model-check/dot_output option

[mc][doc] Document the model-check/terminate option

[mc][doc] Document the model-check/visited option

[mc][doc] Document the model-check/max_depth option

[mc] Marh the model-check/snapshot_fds option as disabled

We need to bring it back in the new MC model.

[mc][doc] Document the model-check/hash option

[mc][doc] Add doc about model-checke/timeout

[mc][doc] Record/replay and sparse snapshots

[Documentation] Added descriptions for 3 more configuration directives.

- Added: smpi/test, smpi/wtime and smpi/iprobe

[Documentation] Changed reference name

[Documentation] First batch of updates of configuration options

[Documentation] Added reference to tracing options

- I didn't want to duplicate the options from the
  tracing doc page, so I just added a link to this
  page; technically it should be included there though,
  as these options are relevant for the index.

[Documentation] Added ~40 missing configuration options

These options were missing, but it's important to have
these documented.

[Documentation] Updated MC config options

These are the options that I could find in src/

[Documentation] Changed word 'config item' to 'config option'

[Documentation] Sorted existing configuration options

[Doc] Beautification of a simple sentence

- Also use %As instead of As - this prevents "As" becoming a link
  to the "Autonomous System".

Updated backbone-tag documentation

Added further note for FATPIPE sharing policy.

Added anchors and references for link sharing policies.

Fixed typo in documentation of surf_routing.hpp

Added small section on backbone.

Removed wrong endtags from documentation.

- There is no such thing as endnote or endremark; just use indentation.

Updated section on network equipments (mostly cosmetics).

- Added the backbone tag, though

Updated description and presentation of available resources.

Updated the 'sharing policy' part for links.

Updated platform.doc to explain the cluster tag more thoroughly.

Rephrased cluster description

Documentation overhaul started.

Boost.Context context factory

 * This is a portable replacement for ucontext.h (makecontext,
   swapcontext, getcontext, setcontext) which is not in recent POSIX
   specs and was apparently removed from Mac OS X since 10.9. POSIX
   2008 still has ucontext_t however (moved into signal.h).

 * Currently works only for Boost <= 1.55 (the Boost.Context API
   changed slightly afterwards).

 * Does not work with MC because we currently depend on the contexts
   being ucontext_t (we'd have to convert fcontext into ucontext_t).

 * No support for parallel execution support (yet).

Fix previous commit

Tentatively fix the detection of ucontext.h in Darwin

Added xbt_assert statement to smpi_mpi_dt.c

* This will help prevent a value <= 0

Fixed bug in SMPI datatypes, causing SG to segfault.

- For pre-defined datatypes such as MPI_INT, the 'in_use' counter of
  that datatype was able to obtain negative values in certain cases.

  This caused SimGrid to crash with a segfault, for instance when
  running fupermod.

This bug was reported by Tania Malik on
the 24th of February on the SG Mailing list.

[SURF] Added comment for surf_share_resources

[SURF] Added simple method comment for AsDijkstra::addLoopback()

[mc] Fix realloc() in mc_process.cpp

[mc] Fix pointer dereference after free()

[mc] exit() instead of abort() in normal operation

[mc] Add a message to explain no property violation is found

[mc] Remove mc_region_contain(), use the method instead

[mc] C++ify RegionType, StorageType enums

Namespaced and strongly-typed.

[mc] Fix compilation error on clang (and group all the region creation functions together)

error: 'MC_region_sparse' has C-linkage specified, but returns user-defined type 'simgrid::mc::RegionSnapshot' which is incompatible with C

temp

[mc] Enable record in liveness mode

stupid me

[mc] Use vector<RegionSnapshot> instead of vector<unique_ptr<RegionSnapshot>> in RegionSnapshot

[mc] Fix typo in e_mc_region_storage_type_t

[mc] Remove deprecated MC_snapshot_read()

[mc] RegionSnapshot, make all fields private

[mc] RegionSnapshot, make data private

[mc] RegionSnapshot class

[mc] Remove broken test

We don't handle NULL as a valid/special region anymore.

[mc] Remove mc_translate_address()

Not used and probably not very useful/usable with chunked snapshots.

more verbose error message on error

[mc] Fix mc_translate_address() for MC_REGION_STORAGE_TYPE_PRIVATIZED:

It was incorrectly calling itself insteaf of translating the region in
the "sub-region".

[mc] Make Process::socket_ private

[mc] Make Process::memory_map_ a std::vector

[mc] Mark some Process attributes as private