profile: cosmetics: inline a function and rename a variable

s:k:profile: turn two functions into static methods

align file position to the C++ namespaces

properly split init/start for Exec activities

Merge branch 'master' of https://framagit.org/simgrid/simgrid

make sure to define _FILE_OFFSET_BITS as early as possible

It won't be effective if defined after the system headers are loaded.

Please codacy, forget about Catch2

doc: reword to remove crufts of the old cunit

tidy some #includes in MC

Please Sonar.

Remove last references to testall.

factor surf_action_ in ActivityImpl

uniform naming across activities

cosmetics

[sonar] Split declarations, unshadow variables.

RIP cunit.

Convert the unit tests of xbt::config to Catch2.

Convert the unit tests of xbt::str to Catch2.

Convert the unit tests of xbt::dict to Catch2.

Reduce number of #include.

Check for emptyness, and populate dynar before testing xbt_dynar_foreach_ptr.

properly split init and start for IO activities

Ignore Catch2 in sonar

Revert "Try to improve coverage reports for MC tests."

This reverts commit db3df03114cb65a9c27c2c1dfd6faf964b571254.

The following tests are broken (timeout): mc-bugged1-liveness-visited-ucontext,
mc-bugged1-liveness-visited-ucontext-sparse and mc-umpire-comm-dup-no-free2.

To reproduce, it seems that compile_optimizations should be disabled.

fix makedist

Convert the unit tests of xbt::dynar to Catch2

cosmetics

Try to improve coverage reports for MC tests.

Define coverage_checkpoint().

It's defined as an alias for __gcov_flush() when coverage is enabled, or a
no-op otherwise.

Define COVERAGE for C++ too.

Remove unused static functions.

Refactorize and speedup a unit test

I don't think there is a real need to test each region size from 1 to
256. Testing on [1;32[ should give a sufficient coverage, I think.

Remove the now useless unit_test_framework

convert the two other boost::unit_test suites to Catch2

Convert a first unit test to Catch

Add the Catch header

This is a header-only library for unit-testing. Including the header
in our project is the recommended way of using it. No need to test for
its presence, then.

Boost::unit_test_framework shall soon vanish from our tree. Testing
for its presence is too bothersome, and Catch seems easier to use
anyway.

sonar: kill unused imports in java

uncomment forgotten line, includes smpi_helper in C++ codes as well

avoid sending misleading log message

Our cmake files are so fragile, fix last changes.

[jenkins] Temporary disable LTO on NixOS/gcc 7.4.0/ld 2.30.

Optimize MC builds a bit further.

ContextUnix belongs to Simix.

Include cmake/Flags.cmake after DefinePackages.

The former uses variables defined in the latter (e.g. MC_SRC).

Improve coverage, even with high log threshold.

Kill dead code in kademlia examples.

[java] Delete broken test.

[java] Catch StopRequest during VM migration.

[sonar] Inform that some properties are overridden by Jenkins.

[sonar] Only exclude from coverage a subset of python files.

Enable running parmap_bench for coverage.

parmap_bench: make timeout a runtime parameter.

Kill dead code.

This test for mallocators has never been used.

Process.java: reduce the debugging scaffolding now that it works

this file should not be executable

Only unregister the kill timer once, in maestro context

Remove workaround for g++ 4.8.

g++ 5.0 or higher is advertised in the doc.

Implement xbt::Result with  boost::variant.

std::variant is today not an option because it's C++17.

Fix memleak.

The comment seems to be invalidated by commit 4f2d08b0ae4625d32890dc4613e1d842ad0f7b77
"Sanitize the API of this_actor::parallel_execute()"

Document a recent example

activity::CommImpl: stick to our naming standards for the fields

help scan-build understanding that status is not used unintialized

Properly call Actor::on_destruction() in maestro context

This induces a harmless change in trace-process-migration.tesh and
fixes the s4u-actor-exiting example \o/

inline a function

no need to remove the killed actor from canceled comm: refcounting is working

refcounting on the src and dst actors of a comm

The pimpl of s4u objects is const

But the one of activities and the cpu_pimpl of host (the codebase is
not ready yet).

always cancel the comms of killed actors in the context of that actor (not in maestro)

Always call process_on_exit in the actor context

I'd like to kill that parmap.h at some point

Let's first reduce its visibility

sonar was right: this if/else if was missing a else

trick sonar 'identical sub-expression on both side of >'

Restore final messages in Java examples.

They should be OK now that the termination of Java processes has been repaired.
These messages were removed by commit d535c50c617ba838b99de4bd251a6ac076774d00
"Somehow fix the killing of actors in Java".

Try to silent scan-build.

[sonar] Don't use default capture for lambda.

[sonar] Remove variadic functions.

Change helper functions to static methods of StopRequest.

Move StopRequest out of Context.

Using context::Context in fully qualified name was redundant.

[sonar] Anonymize unused parameters.

Help scan-build not seeing that "status" is initialized.

Also kill TODO: source is not known when it's irecv.

sonar: don't catch exceptions we have no idea about

Remove useless 2nd parameter "catch_block" for try_n_catch_stoprequest().

sonar cleanups

- kill dead code
- stick to Java variable naming convention
- prefer isEmpty() to size()==0

appveyor: don't test python. mingw cannot deal with pybind11 yet

add a small comment about the memleak introduced here

Stop using Context::StopRequest directly in libsimgrid-java.

Define helper functions to use Context::StopRequest outside of libsimgrid.

Rationale: exceptions sometimes fail to pass correctly between shared
libraries, specially on FreeBSD or OS X.

Hope to fix double-free: task may by destroyed on finalize().

Merge remote-tracking branch 'github/master'

coverage : avoid matching cobertura pattern with jacoco files

Use $PYTHON_EXECUTABLE in tesh files.

Improve process termination in Java world.

Merge branch 'master' of framagit.org:simgrid/simgrid

Remove 2 (out of 3) horrible hacks around Java contexts

Previously, we did not even try to kill java contexts because we
failed to do so in some cases.  Now, we try to kill them just like we
kill the other contexts, even if we don't always succeed.

One difficulty comes from the fact that some threads are created from
the C++ (from the deployment file) and then attached to the JVM, while
some others are created from Java directly (when calling new
Process().start()). The C++ vs Java stack is directly inverted between
cases, complicating the try/catch logic.

In practice, in this changeset, we try harder to convert between the
C++ StopRequest and the Java ProcessKilledError at the language
boundaries.

Also, we don't assert that JavaThread::stop() can actually detach the
thread: it won't for threads that are born in Java because their Java
stack was not unwinded yet. So throw a ProcessKilledError for that.

This is not prefect either since we still need to brutally kill the
JVM after the simulation using exit(0). I added some debug functions
to get more information. Just comment the first call to exit(0) in
jmsg.cpp to see the state of all user threads that we failed to
destroy.

They are all in the C++ world, without any [Java] stack, not blocked
on any Java synchronization object. I suspect that the system thread
is terminated, but the C++ std::thread object is still referenced
somewhere, preventing it from being garbage collected. That's weird
that the JVM still waits for them before ending (and thus mandating
the last the Horrible Hack -- exit(0) in the C++ side of the JVM
system process).

Gosh this is complicated. I'd love to have something like pybind11
dealing with all that shit automatically...

Fix++

Got:
> ctest --output-on-failure -R 'java|python'
> 'python'' is not recognized as an internal or external command,
> operable program or batch file.
> Command exited with code 255

Fix ctest invocation on appveyor.

Last attempt for python/mingw.

Merge branch 'master' of framagit.org:simgrid/simgrid

Try to get python compiling even with MinGW

appveyor: also build and test python