ns3: kill an unused global container :(

Try to fix crashing ns3 example. Not sure if it is correct.

Add some s4u::Link setters, and doc improvements

doc: link++

Sort list of filtered libraries, and add libzstd to the list.

Valgrind: ignore more unwind cruft.

Seen with libunwind 1.3.2.

Make sure that VM::get_speed() returns the correct value after a migration

For that, I reset the physical fields of the CPU (speed_, pstate_ and
speed_per_pstate_) to the ones of the new physical host during the
migration.

Maybe we should change only the speed_, and prevent the use of pstate
things in VM?

Another approach for this commit could be to make Host::get_speed()
and friend virtual, and to override them in the VM to use the values
of the underlying physical CPU (ie, of get_pm()->pimple_cpu) instead
of the one of the VM's VCPU, but I fear to still use the wrong speed
in some cases, in particular when a new execution in created onto the
VCPU.

This forbids speed_per_pstate_ to be 'const', since we reset it for
VCPUs on VM migration. Another approach could have been to destroy and
re-create the VCPU on migration, but I'd have to update the LMM to
point the Execs to the newly created resource, which seems
troublesome.

Ignore suspended VMs when computing the next_occurring_event at the VM level (patch by Fred)

VM: allow to chain some setters

Add jarfile generation script for github, using actions.
This workflows builds jars on linux, osx, and windows, combine them in a final job, which outputs the jar (zipped :\ ) which can be downloaded and published.
The workflow is set up to be run on demand for now (from the actions tab on the github repo, link is a bit hidden as you have to click on the workflow descriptions to be able to run it), but we could have it run when a release is done, and the artifact attached automatically.

these tests need debug messages, don't run them if not activated
"large" one is fine (less verbose), so testing is still performed

when enable_debug is turned off, these tests were failing.
Raise the level of 3 underlying messages to verbose to avoid debug mode.

better this way.

Add an assert to please scan-build.

Fix "Assigned value is garbage or undefined" in 2nd loop (around lines 43-44).

that was failing and launching address for every sanitizer ...

Rename examples: slave -> worker.

revert some overzealous changes

optimize a bit

these ones were critical actually.

check smpi compilation scripts with shellcheck.net
surprisingly fine.
Sadly sonarcloud does not allow external plugins so checker can't be included.

shellcheck tools/jenkins scripts.
Mostly quoting stuff ..

use shellcheck on smpirun
rules were mainly about escaping, quoting stuff, getting rid of -a and -o
but also some UUOC https://github.com/koalaman/shellcheck/wiki/SC2002
or performance improvement https://github.com/koalaman/shellcheck/wiki/SC2129
and some trap hint : https://github.com/koalaman/shellcheck/wiki/SC2064

two remainings : DEFAULT_NUMPROCS variable is unused. unclear what it was about, should it be the default num of cores in a generated platform ? or the default -np setting ?
"local" is not posix, but a proposal for now

Remove unused state.

[sonar] Fix more implicit casts that should not lower precision (S5276).

Cosmetics.

Try to fix for 32bits systems.

[sonar] Explicit cast when loosing precision (src/xbt/, and parts of surf/).

That's enough for tonight....

[sonar] Explicit cast when loosing precision (teshsuite/).

[sonar] Explicit cast when loosing precision (C++ examples).

[sonar] Explicit cast when loosing precision (C examples).

const++

Stick with brutal C-style casts (and fix compilation errors).

Fix parentheses around macro arguments (and prefer C++ style casts).

Suppress global variable.

cast hugepages macros parameters to int64 (#344)

cast hugepages macros parameters to int64

Add an example of wifi communication

Remove this dupplicated and unused platform file

Provide a S4U function to control the SNR level of an host on a wifi link (+documentation)

Fix pip builds and distcheck

Tentative implementation of Activity::suspend() and resume()

I decided not to change the State when the activity is suspended,
because that State merely denotes whether pimpl_ was created already
or not.

This commit also adds a is_suspended() method, as well as an example.

doc: simplify a sentence

Fix pip build

small improvements to the ns3 doc

Rename the async-* tests into comm-*

Use correct type for variables, and avoid loosing precision.

[sonar] Make cast explicit.

Fix return type.

[sonar] Const etc. (round #3).

Reindent.

[sonar] Const for pointer and reference parameters (slight return).

[sonar] Const for local variables.

[sonar] Declare functions "const" (round #2).

Missing declarations for some fortran bindings.

[sonar] Convert integer literals to bool literals.

Fix simcalls.py after rename s/simcall/simcall_/.

Any idea on how to fix this?

As a wild guess, tried to change the condition with 'message->state->routing_table[i][j] != -1'
but got weird crash (double free detected).

[sonar] Declare functions "const" in examples/ and teshsuite/.

[sonar] Declare functions "const" in src/instr/.

[sonar] Declare functions "const" in src/kernel/.

[sonar] Declare functions "const" in src/mc/.

[sonar] Declare functions "const" in src/plugins/.

Make Engine::set_config(...) static functions.

[sonar] Declare functions "const" in src/s4u/.

[sonar] Declare functions "const" in src/simix/.

[sonar] Declare functions "const" in src/smpi/.

[sonar] Declare functions "const" in src/surf/.

[sonar] Declare functions "const" in src/xbt/.

Fix typo, and consider more files for exclusion.

[sonar] Add const qualifier for reference parameter.

[sonar] Declare function "noreturn".

[sonar] USe a typedef for type alias.

[sonar] Remove redundant casts.

Ignore sonar issues about concatenatable namespaces.

Kill unused ctor.

Merge branch 'smpi' into 'master'

Typo in SMPI gather algorithm

See merge request simgrid/simgrid!37

Typo in SMPI gather algorithm (comment)

fix some long -> double faulty convertions reported by sonar

Spelling fix, just like the line below.

Use std::vector.

Remove redundant access specifier.

Regenerated.

Prefer using initialization lists in ctors.

tools and contrib spelling mistakes

speeling mistakes in teshsuite (even mpich tests because why not)

spellings mistakes in doc/

spelling mistakes in docs/

spelling mistakes in include/ and examples/
still with codespell

Fix most of spelling mistakes in src/
using codespell (https://github.com/codespell-project/codespell)
exclude catch.hpp

Finish converting the way we use cfg=smpi/host-speed ourselves -- Bummer

Fix pip builds

Align the definitions of surf_parsed_filename accross files

Clarify one paragraph in the doc

Accept units for 'smpi/host-speed' config element

split surf_parse into a separate file to make it reusable from elsewhere

Also rename surf_parse_* functions into xbt_parse_*

Also, make the file name and line number explicit, as parameters to
functions that need it (less hidden global state is better). But I was
too lazy to clean smpi::parse_factor() tonight: the pandora box
remains closed for tonight.

leaks --
These lines were not supposed to be included in latest commit.
But as I had already written the commit message warning of memory leaks, I decided to add them anymway, in order not to lie.

don't throw in smpi_helpers when passing configure, it may confuse some checkers
petsc fails detection of getcwd and others, because we are pulling them in our header with a different signature

improve handling of persistent requests.
not great, could leak in some cases.

Finished = inactive
One is allowed to call MPI_WAIT with a null or inactive request argument. In this case the operation returns immediately with empty status.

standard says handle should be set to MPI_DATATYPE_NULL.

This call can be performed before MPI_Init, avoid bench_end/bench_start.