Fix a doc error about actors (Tutorial_algorithms)

Nitpicking the reviews

MiB is for mebibyte, 1024^2 bytes and other unimportant changes.

Add '-O0' flag for: cmake -DCMAKE_BUILD_TYPE=Debug

Minor polishing English: Configuring_Simgrid.rst

oops

timer on windows WSL seems less precise and was counting 0ns for some events... which were then skipped as < 1e-6s, and the trace changed

add test for call location with ti traces/replay/adjustment/sleep/computing=0.
Idea is to replay twice a trace with an adjustment file meant to speedup the sleep (and only it, to avoid variability).
It's clearly not realistic, but timings should be reproducible (or not..).

replay : allow to really use --cfg=smpi/simulate-computation with replay.
Remove it from the teshes that had it wrongly activated.
It should not break, as it should have been useless before.

Add handling of sleep in replay.
We can trace sleep events with --cfg=tracing/smpi/sleeping. Now we can replay them as well.
Even if 1 second is 1 second, let's allow to accelerate/slow these down artificially with smpi/comp-adjustment-file.
This should allow to test the feature.

changelog

Have trace-call-location work with filenames and not full paths.
It's much easier this way to use adjustment files, and name collisions in a given code are not common.
If it's still needed, previous behaviour can be restored using "smpi/trace-call-use-absolute-path" option

Add call_location to ti-trace and replay as well.
A new "location" event in the trace is printed

Merge branch 'rework-energy-plugin' into 'master'

Rework energy plugin

See merge request simgrid/simgrid!14

Merge branch 'master' into 'rework-energy-plugin'

# Conflicts:
#   include/simgrid/plugins/energy.h

Fix warning: `content' may be used uninitialized.

as said in the test : The MPI standard says that there is no way to use MPI_Request_free safely with receive requests

Fix build on openindiana.

On openindiana, getopt() is declared in <stdio.h>, <stdlib.h>, and <unistd.h>.
Include all of them to avoid build errors when it's #define'd to smpi_getopt.

[sonar] fix some bugs and smells related to disk addition

Fix bug # + whitespace cleanup.

Update .mailmap.

[sonar] Make variable private.

[sonar] Put parentheses around macro parameters.

[sonar] Avoid const_cast.

There's no more need for ActorPtr there.

Use plain pointers in internal structures, and hopefully fix more memory leaks.

Kill unused vector.

Prefer sh to bash.

introduces <disk> and s4u::Disk

Merge branch 'master' into disk

Merge branch 'master' of https://framagit.org/simgrid/simgrid

regenerate smpi_extended_traces.h and friends after the addition of MPI_Bsend and friends

Kill TRACE_smpi_finalize() and have the container unregistered as soon as the actor leaves

Of course this requires to revalidate some tesh files, as the ending
date is impacted by this change.

Merge branch 'master' into disk

Merge branch 'master' of https://framagit.org/simgrid/simgrid

remove trace finalize from process ending, cleanup is done by trace_end anyway.

fix a memleak coming from cyclic references in smart pointers

Before that change, the SMPI extension of actors got a smart reference
onto the S4U actor. That prevented S4U actors from being garbage
collected, since a SMPI extension is freed (and its smart references
released) only when the S4U actor is destroyed.

The change of this commit simply replace smart references with dumb
pointers to break the deadlock in the reference cycle, so that s4u
actors get collected after use.

document last change

Merge branch 'master' into disk

Merge branch 'master' of https://framagit.org/simgrid/simgrid

warning --

move newly implemented calls out of the 'not yet implemented' section

changelog update

activate bsend tests.
Modify one to stop spending too much time sleeping as we test with bogus platforms.

add MPI_Bsend, MPI_Ibsend, MPI_Bsend_init, MPI_Buffer_attach, MPI_Buffer_detach.
fun fact: we are not actually using the provided buffer in SMPI, as we use our own buffers internally for all detached calls (bsend means detached).

Merge branch 'master' into 'master'

Improving the performance of the NS-3 bindings by:

See merge request simgrid/simgrid!18

Improving the performance of the NS-3 bindings by:
  + Stop moving NS-3 forward when there is no flow, and synchronizing NS-3 with SimGrid only when a new flow starts instead.
  + Cancelling the Stop event we scheduled in NS-3 if the simulator stops before the event, to prevent untimely stops.

Start preparing for a release

Don't mandate C++14 as some build daemons still don't have it

fix make dist (again and again)

MC: switch to xxhash as a (fast) hashing function.

Mandates C++14 but should be faster according to
https://aras-p.info/blog/2016/08/02/Hash-Functions-all-the-way-down/

Add a fast hash function (mandates C++14 for MC)

This comes from
https://github.com/RedSpah/xxhash_cpp/commit/a310676e1514b49d78f0c9ced0678efea4f82fd9

This requires C++14:
  xxhash.hpp:288:40: error: variable declaration in a constexpr function is a C++14 extension

So bump the dependencies of the Model Checker to C++14. That's an
intrusive move, but MC is experimental anyway, and C++14 isn't that
modern anymore.

fix make dist

Make this test more verbose to improve debuggability

Merge the two wifi tests together

Merge the two wifi platform files

And rename the result to simply 'wifi.xml'

modernize these platform files

integrate the wifi unit tests

reduce the verbosity of this test and increase its effectiveness

This is merely a crash test

Remove the Codacy badge since we unplugged that project

add missing platform file in the dist

Document recent changes

add NS3 files to the dist even when NS3 is not configured

Merge branch 'master' into 'master'

NS-3: unblock the number of communications + detect when several flows are simultaneously finishing

See merge request simgrid/simgrid!17

mention closing of GH#207

Merge branch 'master' into disk

rework a bit and typo fixes

update documentation

Merge branch 'master' into disk

fix formatting

adding a test to check if the NS-3 bindings can handle flows that simultaneously end

Unblock the number of communications that can be done with NS-3 by
  + looping on the ports used to communicate,
  + and closing the sockets on the receiver sides (nb. the senders sockets were already closed). This point also improves the NS-3 bindings performance.

wrote a small blurb to explain the TCP model in practice

I am so sorry.

To detect all the flows that are finishing at the same time, allow NS-3 to have a next_occuring_event of 0.
To avoid inconsistencies between SimGrid actions and NS3 flows, set the remainings of an action to 0 only when its flow is finished in NS3

convert a last s4u test to disks

another test conversion to disks

Align Disk get/set_data() with the Extendable version of that feature

Merge branch 'master' into disk

remove another pimpl in smpi initialization

smpi: get ride of process_data and use a regular Extension

Revert "debug a problem making LSAN to segfault"

The new information are not very informative, and break many tests
that were working.

This reverts commit 219b128344e14ff691c5f9615741d006ac79aeec.

revalidate java examples

fix distcheck and doc

rework that test too (no windows stuff and no tabs)

do not use win_storage_content.txt anymore

replay-storage becomes replay-io ... with disks

rework old storage example to get rid of win_storage_content.txt

use smaller file

get rid of this example
we have its MSG counterpart in teshsuite

please 32-bit

revalidate last smpi-io test

location of disk changed when moving from remote_io.xml to
hosts_with_disks.xml (located on bob while on carl before). The shared
file is now opened locally by bob (was opened remotely on carl before)
and the recessary data transfers for remote accesses change to.
If we switch carl and bob in hostfile_io we observe the same behavior
as before, only the hostnames differ.

take change of signal location into account

Merge branch 'master' into disk

let all but io-shared smpi-io tests use the hosts_with_disks platform
file.

allows for mount of remote disks in file system plugin

* host has to declare a <prop> in the platform file whose id is
"remote_disk" and value has the following format
"mount_point:disk_name:host_name"
* Extend the io-file-remote example and the hosts_with_disks.xml
platform file to test this feature

debug a problem making LSAN to segfault

document existing coding convention in C, and stick to it

Add sg_actor_{get,set}_data()

This fixes https://framagit.org/simgrid/simgrid/issues/31

Align Link get/set_data() with the Extendable version of that feature

Align Storage get/set_data() with the Extendable version of that feature

That was easy.