security commit before using the ax!

change generated trace format
cosmetics

doesn't hurt to use types expected by some xbt_dynar functions

Rewrite xbt_getline.

* fix a buffer overflow
* correctly return -1 when nothing can be read

Avoid to return from inside a TRY block.

Initialize variable.

Useless, but gcc whines if not initialized.

Add a new test on availability for the SimDAG API.
Issue was reported by Ricardo Rodriguez on 29/12/12 and fixed in
previous commits.

This way of passing arguments has changed since a long time.
Fixing all tesh files accordingly. Yet, now that this mechanism is
effective, absolute paths are output everywhere, hence the need to
hide just like we do for contexts. I wish I had a cleaner solution but
I don't.

Bug fix in trace management.
When using periodicity, the first event indicates when events start and
has undefined value (-1) as the value of the resource is used (e.g., the
bandwidth value precised in the xml file). When looping with periodicity,
the -1 value was used, which resulted in links with bandwidth -1.0 and
could be noticed only in very specific situations.

Bug fix. The date given when updating the state of a resource was incorrect. It could result in incoherent traces.

Additionnal information never hurt.

Docfix

Further cleanup in the ignore file

- ignore the files touched to track dependencies around java examples
- don't ignore the files for the gras tutorial, as there is no such
  tutorial anymore

use our xbt_getline on every platform to ease our cmake mess

Also, as stdio.h is not loaded by root headers of the simgrid tree, we
need to explicitely load it in some locations.

always have display_timing activated for smpi, as it is quite useful

Rename getline as xbt_getline.

Update documentation about java bindings.

Fix javadoc warnings.

Make javadoc less verbose.

Add MPI_Alltoallv support to the SMPI replay tool. Make it easy to change MPI_Datatype for the SMPI replay tool (IS benchmark uses MPI_INT and some others use MPI_BYTE)

Connect log categories used in java bindings.

Change message to debug loglevel.

Fix java examples: catch exceptions on failures.

Don't let exceptions pass through the MSG layer.

Typo.

Run Java tests from build directory, instead of source directory.

Remove output file after run.

There's no test for java_io.

Improve dependencies around simgrid.jar (again).

Strip libraries in release mode only.

SG_java_tracing is not a separate library anymore.

Improve output of check_dist_archive.

cleanups in .gitignore files

- re-kill two files that got re-added when merging with github
- ignore java compiled files

Merge branch 'master' of github.com:mquinson/simgrid

Update the MPI_Waitall for SMPI replay tool, remove unnecessary loop

Another fix in build depends.

Hope it is correct now.

Workaround a bug in cmake -E touch, where the modifiction time is
truncated when file exists.

model-checker : remove var in list of global variables with MC_ignore_data_bss

Add missing files for dist.

Consolidate .gitignore files.

model-checker : fix index of dynar in get_location

Try to guess JSG_BUNDLE on unknown systems.

Add rules to install Java bindings.

Fix library name.

chainsend: remove active wait at peer termination

Use predefined variables instead of hardcoded values.  Fix #15322.

Typo.

Fix dependencies for Java and its examples.

Try to avoid to rebuild targets when not needed.

Do the right thing for 'root' and 'end' in dot_add_parallel_task
Various cosmetics

typo

chainsend: reduce filesize in tesh to avoid timeouts in slow platforms

chainsend: remove end of data message, send that information at chain initialization

bugfix in Task.setDataSize(): change both C and Java worlds

Compile with a recent flexml

make it compile in paranoid mode

ignore some new stuff

model-checker : update tesh bugged1_liveness and chord_neverjoin

model-checker : remove trigger for state equality detection

model-checker : debug message if log enabled

model-checker : variable used ifdef MC_VERBOSE

model-checker : start heap comparison from local variables

model-checker : fix get_local_variables

model-checker : get bytes used in std_heap instead of chunks used

model-checker : remove unnecessary variable

Remove remaining cruft from simgrid-java import.

Enable tests for all Java examples.

Enable build for all Java examples.

Oops... forgot to include Java bindings for tracing.

Avoid to modify simgrid.jar at each build.

ignore some new stuff

Merge branch 'with_java'

Add CMakeLists.txt for examples/java.

Update CMakeLists.txt for java_bittorrent.

Adding MPI_Alltoall and MPI_Waitall to the SMPI replay tool

Fix path.

don't compile simdag_trace if Tracing is off

protect TRACE_sd_dotloader in case Tracing is off

Final fix for the java-bittorrent example.

Combine the native libraries in simgrid.jar.

Move around remaining files from SimGrid-java.

Add java-bittorrent example (still not working).

Fix warning: [cast] redundant cast to java.lang.String.

Enable compile warnings for Java too.

Don't define variables in header file.!

Don't catch exceptions if you don't know what to do after that!

MSG functions should normally not throw any exception.

Fixes warnings about "maybe uninitialized variables".

Build simgrid.jar.

Build libSG_java.

Define Java source files.

This file is useless now.

Add Cmake option "enable_java", and search for required dependencies.

final revalidation of this multi-example

more complicated than expected. should be okay now.

Simplify the way files are handled
More debug

revalidate that too

really revalide tesh (loader set some categories)

revalidate tesh with category dumping

revalidate tesh file

use new category setting function name

make the category setting function public

Warn the user that declaring explicitly 'root' and/or 'end' task in
the DOT file will be ignored. These two tasks have to be dummy ones
and are overwritten anyway.
Add debug

add default categories to typed tasks
remove category set/get functions
dump category if set