more than 100 codacy treats, not bad

but I'm not sure that any of these changes actually fixed a bug. At
most, they sometimes reduced the brain overload, which is already
something.

codacy treats

chop, chop, chop includes

cut some more includes

further codacy cleanups

remove some useless includes

cosmetics: kill a useless redundent declaration

this header file is much less interesting now that it's almost empty

move some public MC prototypes to a public header file

pull the emergency break: disable the liveness tests for now. Sorry

simgrid::surf::Storage => simgrid::surf::StorageImpl
this avoids confusion with simgrid::s4u::Storage

Action::links() cannot be used for NS3Actions

rename simix::Mutex to simix::MutexImpl

tidy the scope of some more locals

maxmin: be more explicit about the leaked variables

tell maxmin about the action using each variable

small cosmetics to kill time

first step towards a CommPtr

ignore some unwind cruft

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

last bunch of codacy treats for tonight. Stop.

fix 2 java tesh

useless includes

reduce the scope of some variables to please codacy

remove some explicit keywords that I barely understand

silence a really supurious warning in cmake

fix make dist

cosmetics to please codacy

sonar: also ignore that rule in hpp files

plug a small memleak

one level less in the last lib

Java package names should not be uppercased

remove an empty file

remove an useless import in python

sonar: dont' complain when we follow the advices of codacy

hunt down some more short negation forms

hunt down some more short negation forms

kill all horizontal tabs

remove (void) in C++

add the codacy badge to the readme

please codacy: use long form of negation in C++

and clang-format got annoying on this one

a few more smells

remove spurious non breaking spaces, grrr

Add support for flang and ifort Fortran compilers.

Require to properly set flags/libs in the wrappers.
Tested with flang under FreeBSD and ifort under Linux.

Only use -Wno-format-nonliteral if compiler is GCC or Clang.

Define worker_function more rigourously to xbt_main_func_t.

Handle some litteral string -> char* casts.

It's 100% legit in C, but icc seems to process it like C++, and
since simgrid is being ported to C++, well...

Use FindThreads to check for pthreading

It will prefer using threading as library if possible, and fallback
on -pthread only if necessary, which some compilers/systems
do not support anymore.

Flush output of energy tests.

That'll ensure in order output.

useless cosmetics around NS3 long routes

update the NS3 doc to be more explicit about long routes

NS3: more informative messages in one case of misconfiguration

ns3: preserve the rich informative type in a function call

Add formatting to out fortran energy tests.
This is meant to ease comparison with reference, as free format may differ with various compilers.
And output is also nicer.

NS3: be explicit when ignoring long routes

give some hints about platforms that can be used in NS3

more user-friendly error message

Explicit direclty the 3 potentially missing libraries instead of
forcing them to configure thrice to discover them.

smpi_replay: make it easier to override some actions

There is even an example.

list recent changes

remove unvalidated Bconnection attribute

few smells less in MC

now useless that app-pmm is dead

Kill a stupid example

A tiled matrix multiplication is a good idea, but doing the
multiplication for real in MSG is not so much

Make attribute 'model' of <storage_type> optional: for future usage

Remove attribute content_type of <storage_type>: was never used

Make it easier to work with the XML parser

We ask flex to generate C code, but compile it with g++ so it breaks.
So we fix the C code with a bunch of sed. Who would think of
generating C++ code directly?

sonar: v3.16 is out now

Convert our README file to markdown

This is only to get all those nice little badges on github and gitlab
[no ci]

sonar: disable dupplication in teshsuite too

try to please travis

no more content_type

a vector of keyval structs is a map

travis: previous cosmetics commit made it fail in any case

tiny updates to the doc of huge pages

Merge pull request #168 from simgrid/smpi_huge_pages

Add support for huge pages in SMPI

we want to execute ctest on PR on travis

Add a comment and extend the doc.

Add documentation for smpi/shared-malloc-hugepage and SMPI_PARTIAL_SHARED_MALLOC.

bummer

start reducing smells in MC code

Clean the code.

kill an unreachable statement (thanks sonar)

instr: kill an unused structure field to please clang

cosmetics

Merge branch 'master' of github.com:simgrid/simgrid

Disable uninteresting events in TI mode

Only 3 events must be logged in TI mode, but if we don't disable them,
chunks of Pajé trace ends up in the file supposed to be TI formated.

loudly fail when asked to replay a non-existing file

drop module strbuff. We don't need it anymore.

Killing XBT (and reduce our maintainance burden) was a major
motivation in the switch to C++.

remove a broken feature: backtraces in log format

Drop unused functions: xbt_str_varsubst(), xbt_strbuff_varsubst()

sonar: try to reduce verbosity of the coverage

Remove an empty file (thx, sonar)

travis: activate MC on linux so that sonar checks it (fix #158)

restore (and comment) a test for a feature

reassure sonar: reinterpret_cast are the way to go in this file

instr: merge the TI output in the converted code (WIP)

The TI output is a pimple added at some point to trick the TRACING
infrastructure into generating a Time Independent trace of the
executed MPI application, so that this trace can later be replayed
with smpi_replay.

This was done in pure C, with a large amount of pointers to functions.
This cannot be cleanly ported to C++ without a large amount of
factories so that we can subclass each class of event and pick the
right one at runtime.

Instead, this was converted in a ugly way, with a global defining the
type of output that we want today, and each print() function checking
that global to adapt its code.

The bug that I'm chasing is still there, as the replay does not look
for the file that was actually generated, but it's getting better
already.

We will soon rewrite the whole tracing infrastructure with many signals
that are fired at the places that we want to observe. Then, both the
TRACING and the TI modules will register functions in these signals to
be informed of what's going on in the simulation. But they will not
share any code anymore.

Soon...

try to please clang 5.0
and remove useless exit in failing test

couple of minor smells

Merge branch 'master' of github.com:simgrid/simgrid

Merge pull request #167 from simgrid/smpi_execute_public

Add smpi_execute_public