[SMPIFF] Make call location conditional.

This commit introduces the -enable-call-location
compile-time switch for smpiff.

[SMPI/INSTR] Wrap filenames in traces in quot. marks

[SMPI] Modified smpiff.in to enable caller location

This injects pre-processor directives that are then used
to replace MPI calls within the user code.

[SMPI] Add caller location to tracefiles

Please note that we can't use stack unwinding because that
would make the simulation less faithful, as it introduces
non-neglegible overhead.

This implementation is still subject to change.

[SMPI] Added #include private.hpp statements

[SMPI] Make smpi_container() available via private.h

[SMPI] Add private.hpp for C++ functionality

[SMPI] Introduce smpi/papi_events option

[SMPI/PAPI] Added cmake switch for SMPI+PAPI

This commit includes:

- Enable/disable PAPI bindings via ccmake
- The FindPAPI.cmake file
- The #define for C/C++

fix some doxygen formating problems

documentation shuffeling

outline a page on high-level concepts to describe your platform

doc: move the 'find an XML example' part into the platform page

completely rewrite the 'Getting Started' page

doc: kill a useless and unused file

Sharpen the install documentation

Nobody likes reading the doc, so get straight to the point.

improve I/O Java examples

add File.seek to Java API

trace-simple is now process-create
  ... that needs a platform at least ;)

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

don't run some mpich3 fortran tests when there is no privatization
We don't provide manual way of privatizing global variables in Fortran anymore.
So on some (BSD) systems, these tests would fail.

merge

cosmetics

In the code, in the comments, in doxygen... Messy code go away!

doxygen fixups

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

xbt::config: fix doxygen

doc example: change trace-simple into process-create

trace-simple was really brain dead, and we were missing an explicit
process-create example

fix one, rename another

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

rename tracing example

woops, I commited a local test

done reformating the doc of MSG examples. Many examples remain undocumented

doc example: actions and apps

Doc example: model-based ones + add many TODO

Rework the presentation of MSG tracing examples

kebab case

Further reorganize the MSG examples' documentation

fix mistakes in script

tar xzf fails randomly on netbsd for now, try another method

better presentation of the examples in the doc

doxygen: Fix 3 out of 23235235235 small formating issues

Doc: Kill formating pragma that are unused since 10 years

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

cosmetics

revise CMake doc

silence warnings from boost (only on netbsd..
this happens when we use  boost::intrusive::constant_time_size<false> for virtual machines
If anyone has any idea on how to remove this one... It does not pop on other systems

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

some more forgotten override markers

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

tweak the documentation rendering

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

move text and add all cmake options
 + a few are not explained though

Doc improvment

reword the doc of the switch feature

doc: improve section titles

Use only the C++ dtor for Synchro::Raw

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

move some content to the SynchroRaw dtor

teshfile: dont sort output

Try to avoid leaking detached comms.

kill useless code

make overring methods as so to please clang

[mc] Generalize AddressSpace::read<T>() to return a Remote<T>

[mc] Fix MC with the class-hierarchification of simgrid::simix::Synchro

rename s4u Async to Activities

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

Use C++ to implement dynamic dispatch

Have a look at the code of SIMIX_simcall_exit() to understand what
this change is about.

cosmetics

simix::Synchro: Factorize the refcounting for child classes

simcall_execution_destroy() -> simgrid::simix::Exec::unref()

Plus cosmetics on my way.

SIMIX_comm_destroy() -> simix::Comm::unref()

kill 4 more getter simcalls

simix::Comm: turn another function into a method

SIMIX_mbox_get_head() -> simcall_mbox_front()

smx_mailbox should be objects. They should be merged into s4u::Mailbox

mbox: kill a getter simcall

s4u: rename the private implementations as such

simix: change two more getter simcalls into methods

Fix BoostContext #include

SIMIX_comm_get_remains() -> simgrid::simix::Comm::remains()

+ kill that getter simcall, there is no need

remove a useless call

turn SIMIX_comm_new() into a proper constructor

improve an error message

SIMIX_comm_cancel() -> simix::Comm->cancel()

cosmetics

kill smx_private.hpp We already have a smx_private.h

inline a bunch of useless functions

sort Context files

kill a useless accessor

Pfff. These functions are actually not available from the high APIs

smx: synchro->suspend() and synchro->resume() as proper methods

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

MC and NS3 are known to not work together

split smx_synchro_t into a hierarchy of C++ classes

- The change is still rather crude since the code of these objects'
  methods is still spread around in the code (search for dynamic_cast
  in this patch to find the resulting horrors).
  I wanted to keep the patch small to have a chance to finish it
  without revert.

- This breaks MC (at least) because I dunno how to read an object in
  the remote process

[mc] Use bool instead of int for match_pairs

[mc] Don't use new/delete for HeapLocationPairs

remove an useless pimple around exceptions

[mc] Use std::set for the list-of-heap-location-pairs

kill an unused simcall: comm_get_state

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

Kill host simcalls (deprecated, unused)