Fix warning introduced by previous commit

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Completion of the routing for fat trees

Add some routing for the fat trees
Unsign some ints

remove file introduced in 4a8e5b1e8

Changelog update

Fix leak in process_join

better to add this file ...

properly add a smpicxx "compiler"

allow MPI codes to use timezone in their gettimeofday (but we replace it
to NULL anyway). The previous macro prevented the compilation of some
code.

Added a definition of MPI_File (MPI-IO) to allow smpicc to compile code that declare MPI_File variables.

Some updates in ChangeLog.

have barrier_wait return XBT/MSG_BARRIER_SERIAL_PROCESS for one process
Also have it reset the counter when barrier is completed, to allow reuse

fix teshes

actually change the value as said in previous commit

change default value of maxmin/precision to 1e-3 for smpi. Fix bug [#17132]
The default one was uselessly low, since the actual computation precision is now surf/precision.
This lead to some bug on 64 bit systems when comparing large values (>1M) with insanely high precision (1e-9).

requalify tesh to account for new finalize

Use the xbt barrier to finalize smpi processes cleanly.
This removes the MPI_Barrier that was used before, which might have caused problems in some cases

add msg and xbt versions of barrier.
MSG/xbt_barrier_init(unsigned int count) creates the barrier object for all processes
MSG/xbt_barrier_wait(msg/xbt_bar_t bar) waits on it
MSG/xbt_barrier_destroy(msg/xbt_bar_t bar) deletes the object (only one process should call it)

typo --

typo --

add MSG_get_as_by_name call, answering [#17311]

Fix tesh-simdag-flatifier

Update changelog

Reorganize AddTests.cmake

Corrections to fat trees, set the size of connection vectors right

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Rewrite of the fat trees implementation

There was too much levels of backslash escapes.  Remove one of them.

It seems that it changed with commit 782233, when the add_test statements
were changed from add_test(testname exe arg...) to
add_test(NAME testname COMMAND exe arg...).

This broke test memcheck-smpi-replay-9.

Don't use xbt_assert for error checking, it may be disabled.

Specify dependencies between memcheck tests.

Allows to run memcheck tests in parallel with e.g.
    ctest -D ExperimentalMemCheck -j 8

Remove useless script (replaced by cmake macro ADD_TESH_FACTORIES).

Move tests so that the real binary is tested by valgrind, and not the tesh tool.

Remove last references to the now obsolete testsuite/ directory.

Restructure teshsuite smpi

Restructure teshsuite simdag

Restructure teshsuite simix

Restructure teshsuite xbt

model-checker : restore previous version of smpi_finalize if MC is enabled

model-checker : deal with the soundness of DPOR only if DPOR is enabled

model-checker : fix the detection of determinism

Remove absolute path from xbt-log tesh

Add teshfiles to CMakelists.txt of teshsuite/mc

permission change

Fix memcheck with new Add_test macros

add script for jenkins DynamicAnalysis build (memcheck+coverage)

add enable_memcheck_xml flag, to output valgrind in xml format (necessary for jenkins).
This triggers enable_memcheck if not provided.

Fix DefinePackage mc CMakeLists.txt

Fix teshsuite/surf/sur_usage/CMakeList.txt

Move mc testsuite to teshsuite

Move xbt testsuite to teshsuite

Remove simeng_usage.tesh (not used)

Move surf testsuite to teshsuite

Remove redundant test.

Sort file lists.

Remove stale temp file.

Fix some javadoc warnings (remains 2).

New ADD_TESH and ADD_TESH_FACTORIES cmake macros

fix path to deployment fil in tesh example

leak --

Add missing CMakeLists.txt

Reorganize teshsuite/msg

Add an example of use of the previous interface.
This is based on the masterslave_mailbox example for MSG, but adds two instances of MPI application:
one doing a simple send/recv, the other performing an alltoall.

Force valgrind to output in XML.
This will break cdash use, but enable jenkins parsing and displaying of the reports. Hopefully.

Begin to add an interface to instanciate SMPI programatically.

This adds SMPI_init, SMPI_finalize, and SMPI_app_instance_register

This allows user to deploy MSG+MPI applications in the same simulation,
as well as deploying several instances of SMPI with the same or different application,
without using smpirun. This means that we can now handle several MPI_COMM_WORLD.

This is only a very early step, as for now the interface still depends on MSG calls
 to deploy the application, and run the processes.

We should work on an interface to do this for SMPI, or add a generic interface
that would allow several SimGrid interfaces to run alltogether.

explode smpi_main into modules

forgotten in 0395dfc0

Fix windows java build

add private (optional) data copy function callback to _send _isend _recv _irecv simcalls
It used to be globally set, but if we want to mix layers of SimGrid (SMPI + MSG calls)
we would want to have different copy functions used during the same simulation

new flex run

Make MSG action module initialization/finalization an explicit call
This avoid setting up these modules every time, which could cause some issues when mixing

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Fix failed conflict (oups)

Add MSG_process_join [#13601]

Add in DefinePackage.cmake the man pages

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Add a man page for smpicc and smpirun

Fix warning about undefined identifier [-Wundef].

Thanks to Samuel Thibault for the report.

[mc] Enable Fortran 90 code with model cheking

[mmalloc] Extends the junk area and use finer grained allocations

With this we are able to run Fortran 90 code at the expense of 2 more
pages per state.

No need to copy these files.

Add --setenv srcdir=... to tests when needed.

Fix surf inclusion path for test smpi-tracing-ptp.

Forgot to run distcheck after previous commit.

Register new files for dist.

Add missing xml file.

[mc] Check error in MAP_FAILED

[mc] mprotect the region *after* zero-ing ignored parts:

Doing it the other way round segfaults.

[mc] Add basic test for lexical-block scoped variable

Merge "mc"

[mc] Fix DW_AT_start_scope handling in mc_checkpoint

[mc] Do not use "simdata" variable (workaround for broken test)

With DWARF4, the "simdata" variables in a nested scope seems to
prevent state equality detection and breaks a test :

  * happens with DWARF4 ;

  * does not happen it the variable is at the main scope of the
    function ;

  * the variable is found either way (DWARF2 and DWARF4) ;

  * the scope addresses seems fine in both versions of DWARF (the
    semantic of the DW_AT_high_pc is different but it is handled
    correctly).

As a temporary workaround, not using this variable fixes the test.

Fix tesh files after commit c35d96a.

Test cannot work if !HAVE_RAWCTX.

Fix the default working set size of migration

Cherry-pick from the hypervisor branch.
Note that 90% is just an example. More cleanup and documentation should
be necessary.

Conflicts:
src/msg/msg_vm.c

Fix tracing options ignored when set in xml config file [#14853]

Should fix a build error happening on 32bits architectures, related to the size of an adress

Merge branch 'smpi-topo'

Conflicts:
src/smpi/smpi_pmpi.c

Rename option multiple use of task and fix leak

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Merge with master

Fat Tree routing is almost complete, except there is no routing yet

Add option to msg to debug multiple use of task