Rework how model checking and mmap get enabled/disabled

Simplify test: model checking relies on linux-only syscalls such as signalfd,
mremap, so it won't work on anything else.

But do not set HAVE_MMAP to 0 if MC cannot be built, other parts could use it
Courtesy of M. Volat

Test for mremap function and store result in internal_config.h.
From M. Volat

Setup and use a LD_LIBRARY variable in build.
libdl is linux-only, so set this variable as the result of a find_library
command here and let it empty on other systems. From M. Volat.

From M. Volat : more portable way of opening shm buffers for privatization

handle MPI_IN_PLACE for this collective

a platform to test the AS bypass feature

Spell checking ;)

fix MC builds

It seems that MC does not love when exceptions are raised.

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

fix the last test after the recent change in MSG_hosts_as_dynar order

still 2 tests to go before it works again

fix another example

fix another example after the recent change in msg_hosts_as_dynar

fix the tesh of many tests after the order change in hosts_as_dynar

fix an example after the recent change to hosts_as_dynar modifying its order

Destroy all hosts by the end of the simulation.

This plugs huge memleaks, and make sure that the dtor of the energy
plugin actually makes the expected output.

tesh: add an option to keep on disk the obtained output

This helps regenerating the tesh files.

tesh: show the full path to tesh file

host_list is now a std::map instead of xbt_dict

move some content out of parsing to the classes

vacation commit
chase some sonar minor smells

small cosmetics in the storage

inline a function called only once

cosmetics: use C++ type names

rename MSG_host_(get/set)_params into MSG_vm_(get/set)_params

Do not throw an exception on assert, but display backtrace+abort

Merge branches 'master' and 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

Create a s4u::VirtualMachine to clean things out.

This is still to be populated, with the content of the msg_vm module.

rename surf::VirtualMachine to surf::VirtualMachineImpl

This makes room for a s4u::VirtualMachine class that should arrive soon.

tiny simplification

continue removing content from HostImpl

Really fix the issue.

Fix bug in SMPI tracing, where messages were sometimes badly matched.
This eparates sent and received messages when trying to match a new one to avoid matching a send with another send.

smpi replayed waitall was not working, as request vector is destroyed inside the waitall called.
Store information before the call to trace them properly at the end of the wait

add some debug messages for smpi tracing

remove now useless file

cosmetics

remove a redundent forward declaration

fix case when no fortran compiler is found

cleanup handling of Fortran compiler in cmake (Patch from M. Volat)

add a few fortran (unimplemented) declarations
Yes I know at some point I should add all of them.

add some defines in fortran

Add a check so that process_init exits cleanly when improperly called.

kill a useless constructor

HOSTIMPL IS NO LONGER A RESOURCE! At least! \o/

kill dead code

Kill HostImpl::cpu_. Use the one of the s4u::Host

reindent after previous changes

put the HostImpl as s4u::Host->pimpl instead of as an extension

hello clang, that's another ForEach macro of ours

kill a bunch of empty ctor/dtor

simplification: inline a virtual function that is never derivated

further ignorable cleanups

code simplifications around host construction

Storage list is passed as a parameter, not through a global dict of
storages.

code simplifications in VMs

use static_cast to please sonar + reindent

do standard C++

Destroy the elements explicitly instead of having them destroyed when
they are removed from the dict container.

kill a stupid function. Let's do regular C++

cleanup in the Link field names

cleanups in NS3: it's on my way

I need to clean the platform creation stuff. This is blocking for more
interesting changes such as the fact that each cluster has its own
network model.

NS3.25 is out now

cleanups in the model initialization

factorize some code between NS3 cluster creation and other clusters

cosmetics in the creation of NS3 clusters

one step further to sort out the spagetti plate of AS creation

reindent, no real change

move content from the sg_platf to the object hierarchy

remove one malloc

fix NS3 build

make some field private, to please sonar

Sonar rational is that protected fields are the sign of a logic that
spreads over all sub-classes. I tend to strongly agree with this point.

cosmetics in clang-format

make As->father_ protected

cosmetics: kill some C type instances

Sanitize the network_model->communicate() API

- use s4u::Host instead of netcards in the API
- kill remaining C bits
- (+ clang-format in action)

kill commented code

please sonar

Reduce the layering madness a bit

+ the changes requested by the clang-format hook

point to the MSG doc, not the XBT one on synchro. It's less awfull

rewrite a FAQ entry

AppVeyor: don't build the doc, it's windows

fix a Java tesh after Christian recent changes

missing file

Make it easier to have clang-format as a git hook

Plus, document it.

little doc reorg: split a page in two

Re-activate the compilation of the doc. When did it break??

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

[ENERGY] Fixed a bug (division of integers)

Well, that should've been a division of doubles.
I also fixed the tesh tests.

API format unification

Merge branches, and adapt the new code to the new refactoring.

unify the naming of that property

[Energy] Fix the power_slope in the energy plugin

Since the consumption for one core is now explicitly given,
the slope needs to be computed differently, since we must not add
energy for the first core again.

remove an unused parameter

fix compilation on windows, bummer

disable the maestro-set test on windows, nobody will ever use it there

drop xbt_os_sem_get_value: unused internally, deprecated on OS X El Capitan

OS X El Capitan deprecates the sem_init() function

cosmetics in CMakeFile.txt

some old linkers (as on Mac) don't like --version

please sonar by using every parameters (+cosmetics)

don't test equality to 0.