[doc] More TODO

[s4u] More support for C++-style time and durations

[s4u] Support for C++11-style duration in ConditionVariable

Better compatibility witd std::condition_variable API.

[mc] Fix NT_GNU_BUILD_ID support

[mc] Add documentation and fix some things

[doc] Kill remaining reference to XBT_set

and there was a some datadesription title remaining as well.

[doc] @deprecate XBT structures

[doc] TODO / Letter to Santa

Really use the right URL, bummer.

correctly update the SonarQube URLs

change nemo.sonarqube.com to sonarqube.com

document how to regenerate a travis/sonar token

dont spellcheck the smpi collectives

fix some typos

Merge commit '458ff11'

[mc] Remove unused pointer_to_data_member trait

[mc] Documentation cleanup

[s4u] Mailbox::receiver return a s4u::ActorPtr

[mc] Avoid extra memory allocation and fix off-by-one buffer overflow

[mc] Better documentation of AddressSpace

[java] Fix RngStream.setPackageSeed

* it is static so the first argument is not an instance;

* we need to convert jint to unsigned long to make the Java binding
  talk to the C binding correctly.

[doc] Add todo about user .then()

[doc] Misc

Add an assert in case a platform using cluster routing does not link nodes to links properly.
This is related to https://github.com/simgrid/simgrid/issues/96

Crude hack to ignore cruft from Java on Windows

[doc] TODO

[doc] Fix 'the page appear twice in the hierarchy'

[doc] Under the hood

Add references and other things.

[doc] Under the hooks: S4U

[git] Added clang-format pre-commit hook.

This hook helps us maintain a well-formatted code base.
Install it via copying the hook to .git/hooks/pre-commit

Copy the name of the "file", as we don't know where it comes from.
If it's not generated by __FILE__ (fortran, for example), it may be destroyed too soon.
This can cause a leak, I will see to that later

don't try to mmap with size 0 when a *** code asks for smpi_shared_malloc(0).

doc improvement

[doc] MC

[doc] Under the hood: simgrid::kernel::Future

[doc] Documnetation about using generic simcalls

[doc] Suggest C++ alternatives to xbt containers

[xbt] Documentation and cleanup

[xbt] Move throwpoint out of xbt_ex in WithContextException

don't mix stderr and stdout, it breaks windows

revalidate a tesh file after I changed disk_content.txt

kill the last bits about cocci

[xbt] Remove useless bits

[mc] Remove xbt_dict in ModelChecker

kill our last '#ifdef _MSC_VER'

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

should solve invalid read issues

[xbt] Move DJB2_HASH_FUNCTION in our XBT_ namespace

remove useless decrement

freaking paranoid flags!

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid into undynarfy_simdag

move from vector to set
 + these were sets anyway
 + all the bugs disappear
 + code is simpler
 - output order change => revalidate 2 tesh files

[SMPI] Make trace_call_location a member

attempt to replace internal dynar by std::vector

[s4u] Allocate Mailbox on the heap and return MailboxPtr

[s4u] Allocate ConditionVariable on the heap and return ConditionVariablePtr

[s4u] Allocate Mutex on the heap and return MutexPtr

[s4u] Allocate Actors on the heap and return ActorPtr

grouped trace or not, MPI_LINK type should be tied to root.
This caused issues with complex platforms with several level of AS (g5k.xml), and grouped tracing (several MPI_LINK types were created, causing an abort when trying to use one).

dead code --

[.gitignore] Ignore more s4u binaries

[DOC] Clarify PAPI counters + privileges

[DOC] Documented tracing/precision configuration option.

[SMPI] Fix includes for PAPI.

After a recent refactoring, some includes went missing.

[INSTR] Cosmetics for alignments...

[DOC] Document the PAPI counter options

[s4u] Headers cleanup

XBT_PUBLIC on FutureBase::schedule() method

Fix MC

[simix] Execute future callbacks in the main loop

By avoiding to execute them directly, we avoid problems such as stack
overflows, resource acquisition problems, etc.

s/NULL/nullptr/ in our C++ codebase

Avoid (conditionnaly) including C++ headers files in C headers

oops

as MC is mutually exclusive with NS3, move the test from coverage to flags.

Revert "Add ns3 to coverage test, to check nightly that it still compiles"

This reverts commit 0a56bb06e8beadc5bc15d30a42ab5ec5824ffebc.

this file was moved

Add ns3 to coverage test, to check nightly that it still compiles

Fix compilation of NS3 model

Avoid depending on C++11 stuff when including C/SMPI headers

The user might compile C++ without C++11 and would not be able to
compile the code even if he would be able to compile it in C.

fix bug raised by rriemann.

[simix] Manage s_smx_mailbox with new/delte

Because it has a boost::intrusive_ptr now.

Add missing file to dist

leak --

[xbt] Forgot to properly return the return value in Task

[simix] add intrusive_ptr for mailbox receiver.

Bring back the missing void

This is supposed to be C...

[s4u] XML deployment example

catch some bugs in fifo and parmap

fix one rule catches: comments in comments

[SMPI] Fixed wrong delete (should've been delete[])

Thanks Augustin

[s4u] replace smx_process_t by Actor in Mailbox::setReceiver() & Mailbox::receiver()

small changes

chasing blockers in collectives (part 1)

document what flops_amount and bytes_amount should be

woops

please sonar on ++

blockers--

cosmetics

a few smell in pastry, including a nasty one

Some #include fixes