improve the doc of the host plugin API

document the last changes in the right place

Merge branch 'master' of github.com:simgrid/simgrid

Merge pull request #307 from Jean-Emile/v3.20-expose-simgrid-jni

Expose Host Load for Java API through JNI

Merge branch 'master' into v3.20-expose-simgrid-jni

doxygen: kill group m_process_management

S4U stability will not decrease in the future

use a travis badge with the travis logo

woops, I broke the build while fixing the doc

docs: try to add a doxygene xample, but breathe does not handle this yet

Add a link from API ref to example

move the this_actor namespace to the top of API

I'm using it all the time.

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

Improve the doc of parallel executions

This fixes https://github.com/simgrid/simgrid/issues/261

Ignore new binary

Expose Host Load for Java API through JNI

improve the doc of s4u::Mailbox

Define XBT_ATTRIB_DEPRECATED_v325.

Remove features marked with DEPRECATED_v322.

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

start the dev of v3.22

doc: update the procedure to release a version

docker: the stable version is enough now that we released

support ns3.29 in cmake (todo: try to use wildcards in this file?)

Restore "sudo: required", for mc/ptrace.

Display errno on error.

Fix dist.

Release v3.21

fix dist after Martin

Merge branch 'master' of github.com:simgrid/simgrid

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

docs: more links to the MSG doc

Informative message if a newcomer launches BuildSimGrid before cmake

Replace README.git by a badge stating that we welcome PRs

The badge is also linking on a tutorial on how to do PRs.

Kill duplicate #include.

[SMPI/DVFS] Make sure Adagio is guarded by #if HAVE_SMPI

The include was necessary to define HAVE_SMPI in the first place

[DVFS] Add two comments

[SMPI/LB] Normalize load + notify heap of changes

[SMPI/LB] Add a XBT_DEBUG statement

[SMPI] Add comments to explain variables

[ENERGY] Add getter for idle consumption

We currently still have one idle value per pstate, however this
should change soon. For this reason, this implementation
only uses the value from pstate 0 and will move towards the
next syntax.

Doing this allows us to avoid changing the signature of the
function (as the pstate will then be no longer required).

[SMPI/LB] Intercept realloc and calloc calls for memory consumption

Thanks Rafael Keller Tesser for the implementation

[ENERGY] Change behavior on 1-core machines

In fc45b14055d16a944771ccf34cd94f5511e6fb24 the behavior was modified
when a machine specifies the Idle:OneCore:AllCores energy consumption
but only has a single core.

Using the AllCores consumption does make more sense in this case as
it allows users more easily to model full load with MPI+OpenMP applications:
All cores are actually used with OpenMP but only one process uses MPI.

Hence changing the behavior to use the AllCores value instead.

[S(A)MPI] Add/modify include guards

[S(A)MPI] Add copyright header

Mark unused parameters.

Sonar cosmetics.

Actually use given parameters.

Merge nested try blocks (Sonar).

Replace "switch" statement by "if" (Sonar).

remove some obsolete files

docs: don't fail when files to clean don't exist

try to improve SVGs

docs: add a link to the cited paper

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

s4u::Semaphore: use a simpler example with no mutex

Sorry Millian, I'm a psychopath.

hide private globals to avoid name clashes

Remove unused compile flag.

COMPILER_ID never matched GCC (it should have been GNU).

Clang's address sanitizer is not compatible with -Wl,-z,defs.

See: https://clang.llvm.org/docs/AddressSanitizer.html#usage

Document the semaphores' example (and fix other doc glitches)

Merge branch 'master' of github.com:simgrid/simgrid

add svg and some description for dragonfly topology

Merge pull request #303 from mpoquet/s4u-semaphore

S4u semaphore

[examples] add s4u-synchro-semaphore

This example does a barrier with one semaphore and one mutex.

[s4u] implement semaphore as direct SIMIX wrapper

docs: cosmetics in Javadoc

Acknoledge that the doc conversion is not finished in 3.21

This way, we can release the fall release before chrismas.

doc: remove the simix module. Was never written anyway

docs: run javasphinx on RTD.org too

docker[build-deps]: we now need javasphinx

gitlab-ci: generate the docs with UTF encoding

include the full Java API doc in sphinx

Further improvements to the docs

- Convert MSG and Java (not the javadoc, only generalities) to Sphinx
- Get rid of Exhale and write the doxygen directives manually.
  - I'm too picky on how things should look
  - ./Build.sh tries to check for missing directives, somehow
- Restore some doc chunks that got lost in MSG when converting to
  msg_legacy.cpp. Initially, I thought that MSG could be strongly
  deprecated, but now I understand that some people are not ready for
  the shift to S4U yet.

fix make distcheck after augustin

Fix the doc target

git: ignore some newly created examples

doc: remove some obsolete figures, move manpages to docs

docker: s4u needs libboost-all-dev to compile

Merge branch 'master' of github.com:simgrid/simgrid

Allow to chain calls to activity::Comm functions

(and the same for Exec and Io activities)

We want to write something like:

  CommPtr comm = mailbox->put_async(data, 8)->set_rate(0);

Before, all these functions were returning an Activity* in the hope of
allowing such chaining, but it was failing, as most of these functions
only exist in Comm, not in Activity. This commit improves this.

It also opens a Pandora box. The method
   Activity* Activity::start()
is now overriden by the method
   Comm* Comm::start()
. (Comm is a subclass of Activity)

I believe that changing the return type to a subclass is OK when
overriding a method, but I'm not 100% sure. At least, both GCC and
clang seem OK with that code.

docs: s/Virtual Platform/Simulated Platform/

tuto smpi: big fat warning stating that it's not finised yet

docs: update copyright and cut links to broken tables

Merge pull request #302 from mpoquet/rename-s4u-synchro-examples

Rename s4u synchro examples

[examples] s4u-{barrier,mutex} -> s4u-synchro-*

[examples] smpi-replay-mmd: use s4u::Barrier

[doc] rtd: link to example s4u-barrier

Update changelog

send warning here instead of debug

fix warnings

activate fortran attr tests

Have attributes actually work in fortran... the horror
Callbacks signatures and behavior differ slightly from C, so try to do that correctly, if not cleanly

get was done, now fix set

protect against failed get

Fix dist.

Merge remote-tracking branch 'github/master'

docs: show the sections in manual's chapters

Trick ahead: the sections are regular chapters, but with UTF
non-breaking spaces before their names to visually indent them a bit
in the sidebar.

The main page should now be changed because it looks ugly with that
trick. But the content had to be changed anyway, maybe replace with
the current content of the main webpage, that in turn should be
emptied of all letters to put nice pictures instead

docs: this file got renamed at some point -- kill dupplicate

docs: build on RTD, configure our theme

fix some borken links in doc