[surf] Wrap the sigc++ API to provide the same API as boost::signals2

[surf] Fix build with sigc++

Fix Java build

java CPU surf binding used to register itself to the list of models that
must be called through shareResources directly. But this was useless
because CPU models are invoked from the host models (leading to
dupplicated lines in the tesh file).

Now that it is not possible anymore to register to that list of models
(which was removed), we must fix the java CPU surf binding.

[appveyor] update to what symengine is doing

This introduces a new appveyor script in charge of downloading a given
file, dealing with appveyor's transient network errors.

I hate hollow doxygen comments

Simplify how shareResources() is called in each models

- Host->shareResources() is in charge of calling the ones of Cpu, Net
  and Storage
- VM->shareResources() must be called after the Host one

So, don't make a list `model_list_invoke` of two elements that must be
called in a very specific order. Instead, directly call these methodes
in surf_solve().

A next step could be to put the content of Host->shareResources and
maybe VM->shareResources() in surf_solve so that Host and VM can stop
being resources just to dispatch calls to the real resources.

But L07 must be dealed with before (eg by moving the content of
Host07->shareResource() into Cpu07->shareResources() and leaving
Link07->shareResources() empty).

rename a global to make its purpose clear (hopefully)

kill more dead code

kill dead code

[mc] Move MC-related out of simix and into mc where it belongs

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

deal with portability issues induced by ptrace

[mc] Better explanation for DW_OP_call_frame_cfa

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

move all VM+energy code into callbacks

This keeps the main files clean of any energy related code.

unused variable

more explicit header inclusion guard

cosmetics in the VM/energy code

kill some dead code

Prefer the C-ish sg_host_get_name() over sg_host_name()

Both were defined, for some reason

[mc] Make mc_diff_info static

[mc] Simplification, remove profiling code

[mc] Move the MCer wait_for_requests logic outside of MC_wait_for_requests

[mc] Merge Server class into ModelChecker

The distinction was mainly there because Server class was only useful
in split-process mode. Now the other mode does not exist and the
Server class is always used.

[mc] Remove Process:status_

[mc] Replace some exit() calls by return

[mc] Move privatization flag initialization

Fix the snapshot tests.

[mc] Fix exit status naming convention

[mc] Move Server in simgrid::mc

[mc] Simplify mc_server

[mc] Fix privatisation support

It was broken (TODO) since the switch to split-process MC.

[mc] Remove MC code in sigsegvhandler

We do not have mc_stack in the model-checked process.

[mc] Generate a message showing the path on crash of the model-checked

[mc] Move model-checker message processing logic in its own method

[mc] ptrace the model-checker application

The first goal is to be able to detect crashes of the model-checked
application in the model-checker. This first patch only implement the
ptrace but does not detect the crashed properly yet.

As we are using ptrace, we do not need to using messages to
stop/resume the model-checked application. The HELLO message is
removed whose only purpose was to synchronise the execution of the two
processes (wait for the model-checked application to be ready before
trying to read its memory map).

sanitizes host user_data: create a lib level

Don't segfault when one level of the lib has a NULL free_f

[tesh] try to properly quote the regexps for Perl 5.22

[L07] Don't segfault on point-to-point communications

NetworkL07Model::communicate() tries to use host->executeParallelTask(2, ...)
(to change P2P comms into parallel tasks), but host was never
initialized. (fix #28)

We should add a test for that too, I guess.

[win] protect the inclusion of a non-existing file

[cmake] 'not' and 'NOT' are different, but only on windows

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

[smpi] Use virtual memory layout to find the data segment

... Instead of extrating the position of the .data and .bss sections
with objdump:

* don't spawn a separate process (objdump);

* works even with PIE;

* works even without section header table;

* works even if weird sections are used;

* works at the segment granuality instead of the section granularity.

However some heuristic is used which might break in some cases: using
the help of the program header table would be a good idea (but would
add a dependency on ELF).

Currently only implemented on Linux but the SMPI privatisation was
only available on Linux anyway.

inline another getter simcall: host_get_nb_pstates

[SMPI] Renamed smpi/async_small_thres to smpi/async_small_thresh

We need a unified naming scheme, and that was particularly easy to fix.

A sh.exe appeared in appeveyor path, breaking mingw

Fix out-of-tree builds after 3203ed1, sorry

(fix #32)

[Gitignore] Blacklist mpich3-test binaries

fix an easy fixme

[cmake] all java stuff in the same place

[cmake] recompile with swig if the executable is found

It used to be controled by the maintainer_mode option, but this is
stupid. That option should die (along with flexml, probably).

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

inline two more simcalls: host_get_pstate and host_get_consumed_energy

[mc] Fix error in dependency checking

Introduced by:

    [mc] Cross process access to simcall synchro

[mc] DRY in MC_request_depend()

[mc] Use std::vector for Process::heap_info

[mc] Use std::unique_ptr for Process::heap

inline two more getter simcalls: host_get_core and host_get_state

fix a test that got broken when I suppressed some simcalls

The execution order changed a very little bit as host_get_speed is not
a simcall anymore, and the process got the opportunity to start a new
task (and do the corresponding output) before being killed at the same
timestamp. But it actually dies at that timestamp, everything alright.

typo (s/deamon/daemon/)

add another library to the whitelist of ignored debugging symbols

Kill two getter simcalls, and replace them by (almost) direct calls to surf

kill two useless functions: surf_as_cluster_{get,set}_backbone

kill an almost unused function: surf_model_name

kill some dead (commented) code

make it easier to ignore SMPI temp files, and do so in the .gitignore

now that CMake dependency is bumped to 2.8.8, dont deal with older ones

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

Bump the minimal version of cmake to 2.8.8

We are using CMAKE_CXX_COMPILER_VERSION that was only introduced in
this version. See https://github.com/joakimkarlsson/bandit/issues/40

Thanks Christian for noticing and debugging the problem.

[Gitignore] Ignore mpich3-test temporary files

[Gitignore] Applied sort to examples.

I hope this makes it easier to add more files...

[Doc] Fixed misplaced link

[Doc] Added description for the boost context factory

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

update the preferred citation

[SIMIX] Updated error messages for contexts

The "boost" context was not mentioned in the list of
existing contexts that are output when an error occurs.

kill dead code (duplicated from just above)

remove old cruft dating from cdash

Kill an unused simcall: host_get_name

kill dead code

[surf] tiny cleanups around the virtual machines

- rename the file vm_interface.[ch] into virtual_machine.[ch]
- rename the type VM into VirtualMachine
- have the VirtualMachine constructor register the VM to the host lib
  - it was in Model13::CreateVM, that can now be emptied and soon killed
  - other VM models won't forget to do so

Kill the setset datacontainer: it's unused since a while

fix build on non-linux arch

Reduce the amount of implicit include directories

This is intrusive to quite a lot of files, but I think that it helps
making the source code more explicit about what's public and what's not.

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

cleanups in cmake+perl interactions

forgot this one

try to fix some compilation erros

[cmake] tiny cleanup around smpi

disable lua on CI for now

was too fast on merging the commits, sorry

[cmake] mark two variables as advanced to hide them from ccmake

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

[cmake] report the compiler version when we think it's too old

try to do what distcheck says..

ahem :p (is this file even necessary?)

Add CMakelists file

handle MPI_WIN_NULL in fortran

make tracing work better with gatherv and scatterv

[cmake] clean the gcc version detection and handling