this test should now work with out-of-source builds

replace xbt_dynar_member by xbt_dynar_search_or_negative in this test.

There is a weird bug with xbt_dynar_member on some systems.
When an exception is raised, backtracking mechanism of libc6 can cause segfaults (and valgrind complains quite a lot, even on systems where it does not crash)
Is this related to https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=735090 ?

example obtained stack
 Invalid read of size 4
    at 0x476E383: backtrace (backtrace.c:141)
    by 0x43DC03B: xbt_backtrace_current (backtrace_linux.c:84)
    by 0x43DB200: xbt_dynar_search (dynar.c:474)
    by 0x43DB31F: xbt_dynar_member (dynar.c:511)
    by 0x80494A3: test_launcher (host_on_off_processes.c:35)
    by 0x43C889E: smx_ctx_sysv_wrapper (smx_context_sysv.c:187)
    by 0x46B2BDA: makecontext (makecontext.S:87)

As functionality is the same, using the exception-less version of xbt_dynar_member should avoid the problem, until we find out more about it

[mc] Fix FD checkpoint/restore

model-checker : comment debug printf

model-checker : save and restore file descriptors

deactivate test that actually needs MPI_Type_get_envelope

cleanup after martin's cleanup

clean after augustin ;)

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

fix the tesh of one last command

Thanks adsein for all your great work on these points.

changelog update

Add preliminary support for MPI_Pack, MPI_Pack_size, and MPI_Unpack.
Activate tests for these functions. Somes cases with too complex imbricated datatypes are not supported (yet).

fix compilation without mpich3 testsuite

update gitignore and changelog

revalidate yet another tesh output

I also changed the outputs done by the program to ease the life of tesh.

revalidate another tesh file

revalidate a tesh output

Add mpich3 tests for MPI_Info calls.
As expected, the get_nthkey does not behave as expected, and it won't.

Add MPI_Info_* support.
This adds MPI_Info_create, MPI_Info_free, MPI_Info_get, MPI_Info_dup, MPI_Info_delete, MPI_Info_get_nkeys, MPI_Info_get_nthkey, MPI_Info_get_valuelen functions.
This is just basically a xbt dict wrapper.

We may have issues with the get_nthkey, as the xbt dict does not really keep the order.. but this mpi call is hum ... stupid? aniway.

[mc] Fix the previous stack-cleaning optimisation

[mc] Do nto clean the main stack

We only need to clean the stacks of the application processes.
Otherwise, we spend a *lot* of time cleaniong the stack in the MC code
which slows SimGridMC a lot and is useless anyway.

The way we check if we need to clean the stack is currently quite
haskish and could be improved.

[mc] Add stack-cleaning compiler wrappers

This compiler wrappers clear each satck frame before using it in order
to avoid issues with unitialized variables in SimGridMC state
comparison.

Compiling with those compiler is much slower.

Remove some most simcall HEADERs

[popping] allow to omit the handler

simcalls handlers are good to get extra arguments from the simcall
(such as the issuer) or to check the parameters, but when there is no
such thing to do, they just load the picture for nothing.

document my recent changes in simix

rename smx_action_t to smx_synchro_t

This is an old idea, that I want to implement since at least 3 years.
It removes an ambiguity with surf_action_t, and makes it explicit that
these things are a way to synchronize the processes with their
environment.

better handling of blocking simcalls in the generated popping

Blocking simcalls were marked as simcalls returning void. Being
explicit helps in that obscure part of the code.

some more cosmetics in the popping generator

Generate automatically the simcall_HANDLER_* prototypes

- Writing this code manually was burdensome
- This allows to check that the definition in simcall.in actually
  match the handler prototype (safer as we are casting wildly)
- This allows to detect (and destroy) some now unused simcalls

kill dead code

[popping] cosmetics in doc and generator

rename all SIMIX_pre_* to simcall_HANDLER_*

This is consistant with simcall_BODY_*, and more explicit

Rename smx_user to libsmx (to mimick libc/smx)

finish the s/smurf/popping/ renaming

Actually, that strange dance is called Popping in English and Smurf
only in French :)

improve a bit the documentation of popping, and align code with doc

make smx_popping_bodies.c parsable by eclipse (kinda)

cosmetics in the popping generator

typo

kill dead code

further simplification of the popping in simix

Remove the 'TUTORIAL: New API' chunks

This loads the code, and I'm not sure that it is of any help,
actually. Adding a new API is rather uncommon, and the existing ones
are clean enough to serve as an example, nowadays.

rename a generated file involved in the kernel popping

kill dead code

[mc] Split config code into mc_config.c

[mc] Make MC_resolve_subtype() and MC_resolve_subtype() static functions of mc_dwarf.c

Those functions belong to the mc_dwarf.c layer and are only used there
anyway. Move them here, mark them as static in order to reduce the
number of exported symbols and reduce the cross-layers dependencies.

small correction

provide user-friendly errors when replay encounters a badly formatted line.
Avoids segfaults in this case

Somehow .. we forgot to replay allgather.

root should be optional for gather replay (as it is everywhere else)

Add tracing for RMA calls

previous commit was a mistake. Handle the case more gracefully.

don't push null request back in the dynar

we should not set error flag when wait or test is called with a null request.
This is explicitly allowed by the standard.

avoid code duplication that lead to out-of-date fortran mpi_init_thread

[mc] Document/simplify MC_request_is_enabled()

[mc] Simplify mc_update_comm_pattern

[mc] DRY with mc_update_comm_pattern() (broken)

[mc] DRY by adding get_call_type()

[mc] Try to DRY in MC main loops

add a (unused) fortran datatype for compilation of recent bigdft

somehow we forgot MPI_REAL datatype C-fortran compatibility

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

using walltimer in adaptive algorithm

doc update

Apply patch suggested by fabien Chaix. This avoids issues with reqq being deleted in replay waitall
This also removes the MPI barrier in replay finalize, which was not needed anymore

Loooong due Changelog update

Add option to configure the factors used for IB model

[smpi+mc] When restoring a snapshot, always remap the SMPI privatisation segment

After restoring the global variables in a snapshot, the global
variable containing the currently active SMPI privatization segment is
overwritten. As a consequence, the segment SMPI thinks active might be
inconsistent with the currently active segment (which the kernels
knows about).

In this case, we want to remap the segment regardless of what SMPI
thinks.

We might be more clever to avoid unecessary segment switch if the
segment which is really mapped is the same as the one we want.

really fix dist

fix dist

Change verbosity of debug messages

Add a new Infiniband network model, based on the works of Jerome Vienne.
This computes penalties on communications to account for the slowdowns experimented on real systems, and modeled by jerome
check http://mescal.imag.fr/membres/jean-marc.vincent/index.html/PhD/Vienne.pdf for details

known issue: doesn't work yet with permanent receive mode, as some surf actions are not released properly

Add a safe version of lmm_get_var_from_cnst to avoid looping forever when iterating on a dynar we reorder dynamically

Remove irrelevant API documentation

disable clang on travis

don't test if we cant build

because we need noise on IRC

add a little link to travis status from the README

sharing config between travis and jenkins seems non-trivial

tell travis which config to test

we need doxygen, and I fail to see who's creating the VERSION file

try to use the jenkins on travis too

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

I'm not sure of why flexml generated a different flex file, but the content seems ok too

test if I can write a little travis config file

better estimate of window for adaptive algorithm

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

PJ_value_get assumes value exists, this is not the case here so fix it

Hard-coded colors:
- see comments in the code

[mmalloc] Expand the junkarea

In some cases (Fortran + Clang compilation) this is needed. We nee to
fix this more cleanly.

[mc] Add support for DW_OP_regN locaitions from DW_AT_frame_base

Fix DWARF based introspecion support when compiling with LLVM.

[mc] Prepare support for register location in DWARF location expression evaluation code

This is needed in order to support this:

  DW_AT_frame_base  : 1 byte block: 56     (DW_OP_reg6 (rbp))

[mmalloc] Fix junkarea handling in free

The call free(junkarea) was broken and was trying to delegate to
mmalloc instead of using junkarea.

Because of this libsimgrid broken when compiling with LLVM with
mmalloc support.

try to simplify the way simcalls are generated

kill dead code

ask swig to please doxygen. Tools will drive me nuts

ignore more cruft

rename SIMIX_simcall_{pre,post} to SIMIX_simcall_{enter,exit}

ensure that the generated files are autonomous and not included within another file

please doxygen keep calm

that file was seriously outdated