partial leak plug in chord

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

allgather was forgotten in ti tracing. fix this

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

let parsing raise C++ exceptions, kill a dict, reindent

cosmetics

use a proper destructor for the paje::value type

cosmetics in instr: use sensible identifier names

ahem

Merge branch 'master' of github.com:simgrid/simgrid

Merge pull request #202 from Takishipp/clear_fct

Turn paje_value to a class

codacy

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

delete unused parameters

mess up with parsing and exceptions

delete unused parameters

remove unused parameters of some fcts

overall optimization of map usage
replace all find != end + at by a try/catch on at.
This should save a useless traversal of the [unordered_]map each time
we want to access an element.

fix MSG compatibility layer

codacy

uniform allocation is better

kill degomme's masochist troll ;)

kill another dict in the C++ world

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

simplify process/actor restart

try to silence a valgrind leak

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

simcall_mutex_unlock is back but keep the simplification of another
simcall

fix make dist for MC builds

cosmetics in error message

sonar

Revert "kill one simcall, simplify another"

This reverts commit 8639295f6bedeb3c9e1a60a1056925c4fe892fa4.

please sonar (initialization lists) + reindent

fix PJ_value class and its methods

fix conflict

simplify semaphores related simcalls

tiny change

modernize two more simcalls

give s_val PJ_value as a constructor

Looking for libelf (required by MC).

Return what was apparently intended.

Prefix is unsigned and can't be negative.

Merge "if" statements.

kill one simcall, simplify another

cleanups

simplifications

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Revert "Give back control to maestro as late as possible."

This reverts commit c7829c256a041aae9a60454263de30188b3f2fcc.

Tests are failing on Travis, and build faild on Appveyor :-(

remove unused variable

Give back control to maestro as late as possible.

The test allred from smpi-mpich3-coll-thread (with thread contexts factory and
mmap privatization) occasionally segfaults on thread exit:

teshsuite/smpi/mpich3-test/coll$ ../../../../smpi_script/bin/smpirun \
    -platform ../../../../examples/platforms/small_platform_with_routers.xml \
    -hostfile ../../hostfile_coll --cfg=smpi/running-power:1e9 \
    --cfg=smpi/async-small-thresh:65536 --cfg=contexts/factory:thread \
    --cfg=smpi/privatization:1 -np 4 ./allred
[...]
 No Errors
Segmentation fault.

Backtrace:
#0  do_lookup_x (...) at dl-lookup.c:98
#1  0x00007ffff7de596d in _dl_lookup_symbol_x (...) at dl-lookup.c:737
#2  0x00007ffff6a4da75 in do_dlsym (...) at dl-libc.c:97
#3  0x00007ffff7deaaa4 in _dl_catch_error (...) at dl-error.c:187
#4  0x00007ffff6a4dabf in dlerror_run (...) at dl-libc.c:46
#5  0x00007ffff6a4db78 in __GI___libc_dlsym (...) at dl-libc.c:210
#6  0x00007ffff730dfbe in pthread_cancel_init ()
    at ../nptl/sysdeps/pthread/unwind-forcedunwind.c:55
#7  0x00007ffff730e16c in _Unwind_ForcedUnwind (...)
    1at ../nptl/sysdeps/pthread/unwind-forcedunwind.c:129
#8  0x00007ffff730c5d0 in __GI___pthread_unwind (...>) at unwind.c:129
#9  0x00007ffff7307365 in __do_cancel () at pthreadP.h:280
#10 __pthread_exit (...) at pthread_exit.c:29
#11 0x00007ffff7c12df9 in xbt_os_thread_exit (...)
    at [...]/src/xbt/xbt_os_thread.c:251
#12 0x00007ffff7c938ab in stop (...)
    at [...]/src/kernel/context/ContextThread.cpp:205
#13 simgrid::kernel::context::ThreadContext::wrapper(void*) (...)
    at [...]/src/kernel/context/ContextThread.cpp:159
#14 0x00007ffff7c16131 in wrapper_start_routine (...)
    at [...]/src/xbt/xbt_os_thread.c:154
#15 0x00007ffff7306064 in start_thread (...) at pthread_create.c:309
#16 0x00007ffff6a1862d in clone ()
    at ../sysdeps/unix/sysv/linux/x86_64/clone.S:111

Even if I don't fully understand what's going on, I suspect that a segment
switch is occurring while the thread is running some cleanup handlers.  Thus the
proposed fix tries to delay the call to xbt_os_sem_release as late as possible.

Option was removed by commit 16ba43eb3e96c1e430734f866a4316e7e8a229ae.

Run smpi tracing tests in their own directories.

Avoids failures when tests are run in parallel.

examples/msg/trace-host-user-variables: remove generated files.

tools/graphicator: run tesh in build directory.

examples/smpi/replay_multiple: put generated file in build directory.

teshsuite/smpi/mpich3-test/f77/datatype: put generated file in build directory.

teshsuite/smpi/mpich3-test/f{77,90}: remove unused includes.

Use actual names for configuration options (kebab-case + a few renames).

Add missing calls to XBT_LOG_CONNECT.

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

try to please sonar and avoid protected fields

remove useless function

make the cpp file easier to read

char* to string == free--

adress smells in cpuTI

dont document a deprecated function, and properly mark it so

don't repeat yourself (DRY). Implement MSG on top of S4U instead

fix gcov tests

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

be more explicit

some of clang-format

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

try to please codacy and reduce NPath complexity

please both sonar and codacy
but not for the same smell

only codacy would have spot this
fInput didn't even exist ...

try to improve coverage

kill another old-fashioned simcall

remove useless try/catch

cosmetics

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

some cleanups in maxmin

turn paje_value to a class

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

plug two more leaks

sonar: align with some files that moved in smpi

gramar in comments

Merge branch 'master' of github.com:simgrid/simgrid

MC: checker kindly ask the app whether an actor is enabled instead of reading tons of remote memory

foward.h should remain as short as possible

Merge pull request #200 from Takishipp/clear_fct

Replace a function by its contents

cosmetics and comments

try with privatization

activate new fortran test

Add some missing SMPI fortran bindings (recently supported functions)

Split up Fortran bindings in several files to avoid 2000 lines files.

Explode 3700 lines of smpi_pmpi.cpp file in several smaller files.

Suppress also the privatization dlopen handle "leak" in valgrind.

Big move of all SMPI files in subfolders because it was a mess.

bindings : all C/F77 bindings + PMPI_* entry functions, which will be split up into several files next
mpi : all MPI structures (Request, Op, Info, Datatype, ...) implementation.
colls : untouched, collective comms folder
internals : all SMPI specifics (sharing, dvfs, instr, privatization, processes...)
include : all *.hpp and .h files (should it be moved ? it's added by default in the include path now)

remove spurious ;

plug leaks in low level tests

adding a higher level init function ensures that all data structures
are correctly deallocated.
Would be better to not allocate them at all (dict of mailboxes for
instance), but no user won't ever write XBT or SURF test, will they?