cleanups in .gitignore files

- re-kill two files that got re-added when merging with github
- ignore java compiled files

Merge branch 'master' of github.com:mquinson/simgrid

Update the MPI_Waitall for SMPI replay tool, remove unnecessary loop

Another fix in build depends.

Hope it is correct now.

Workaround a bug in cmake -E touch, where the modifiction time is
truncated when file exists.

model-checker : remove var in list of global variables with MC_ignore_data_bss

Add missing files for dist.

Consolidate .gitignore files.

model-checker : fix index of dynar in get_location

Try to guess JSG_BUNDLE on unknown systems.

Add rules to install Java bindings.

Fix library name.

chainsend: remove active wait at peer termination

Use predefined variables instead of hardcoded values.  Fix #15322.

Typo.

Fix dependencies for Java and its examples.

Try to avoid to rebuild targets when not needed.

Do the right thing for 'root' and 'end' in dot_add_parallel_task
Various cosmetics

typo

chainsend: reduce filesize in tesh to avoid timeouts in slow platforms

chainsend: remove end of data message, send that information at chain initialization

bugfix in Task.setDataSize(): change both C and Java worlds

Compile with a recent flexml

make it compile in paranoid mode

ignore some new stuff

model-checker : update tesh bugged1_liveness and chord_neverjoin

model-checker : remove trigger for state equality detection

model-checker : debug message if log enabled

model-checker : variable used ifdef MC_VERBOSE

model-checker : start heap comparison from local variables

model-checker : fix get_local_variables

model-checker : get bytes used in std_heap instead of chunks used

model-checker : remove unnecessary variable

Remove remaining cruft from simgrid-java import.

Enable tests for all Java examples.

Enable build for all Java examples.

Oops... forgot to include Java bindings for tracing.

Avoid to modify simgrid.jar at each build.

ignore some new stuff

Merge branch 'with_java'

Add CMakeLists.txt for examples/java.

Update CMakeLists.txt for java_bittorrent.

Adding MPI_Alltoall and MPI_Waitall to the SMPI replay tool

Fix path.

don't compile simdag_trace if Tracing is off

protect TRACE_sd_dotloader in case Tracing is off

Final fix for the java-bittorrent example.

Combine the native libraries in simgrid.jar.

Move around remaining files from SimGrid-java.

Add java-bittorrent example (still not working).

Fix warning: [cast] redundant cast to java.lang.String.

Enable compile warnings for Java too.

Don't define variables in header file.!

Don't catch exceptions if you don't know what to do after that!

MSG functions should normally not throw any exception.

Fixes warnings about "maybe uninitialized variables".

Build simgrid.jar.

Build libSG_java.

Define Java source files.

This file is useless now.

Add Cmake option "enable_java", and search for required dependencies.

final revalidation of this multi-example

more complicated than expected. should be okay now.

Simplify the way files are handled
More debug

revalidate that too

really revalide tesh (loader set some categories)

revalidate tesh with category dumping

revalidate tesh file

use new category setting function name

make the category setting function public

Warn the user that declaring explicitly 'root' and/or 'end' task in
the DOT file will be ignored. These two tasks have to be dummy ones
and are overwritten anyway.
Add debug

add default categories to typed tasks
remove category set/get functions
dump category if set

update category setting function name

add global task counter
add tracing functions

add a specific file to manage tracing in SimDag

remove set/get category functions. Managed in another way now

use proper header

Generate a VERSION file with release number during make dist

Merge simgrid-java documentation into simgrid

Use -x to test for executable.

Added xbt_dynar_remove_n_at to remove an n-sized slice from a dynar

This function is used to speed up pulling out trace events from the buffer

Revert "Add ModelChecker build type"

This reverts commit 07eb7317b31474d0b6702c255741b194dbfd2d6d.

Conflicts:
CMakeLists.txt

Add documentation to create simcalls

Fix XBT_PUBLIC for pid simcall

Move Java sources (Java files) to src/bindings/java/org/.

Move Java sources (C files) to src/bindings/java/.

Move Java examples to examples/java/.

Incorporate simgrid-java in simgrid-java/.

In order to keep the history of the simgrid-java repository,
the following procedure was used:
$ git remote add -f java /path/to/simgrid-java.git/
$ git merge -s ours --no-commit java/master
$ git read-tree --prefix src/bindings/java/ -u java/master
$ git commit -m 'Incorporate simgrid-java in simgrid-java/.'

Add (empty) ChangeLog entry for release 3.10.

Merge branch 'v3_9_x'

Add (empty) ChangeLog entry for release 3.9.

Increase version number.

Fix masterslaveDeployment.xml

Merge branch 'v3_9_x'

Modify teshs timings

Merge commit '4df273f15273f959fc9e6ed69d2bf5e607ec9bf7' into HEAD

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

Fix missing proto for PID functions

Merge branch 'v3_9_x'

Merge remote-tracking branch 'github/master'

Add test for distcheck.

Add script to compare git repository and tardist.

Add file to tardist.

Remove old cruft.