lmm: cosmetics in documentation (reduce redundency)

finish the removal of lagrange-related things

lmm: rename some fields for clarity

Remove the lagrange-based models

Sorry Pedro, but this simplification really makes me happy :)

lmm::{Variable,Constraint}: Obey our coding conventions wrt fields' names

Avoid a >>unused parameter ‘host’<< error on user code

Reduce code duplication.

Cosmetics.

Don't leave an empty catch block.

Unused parameters argc/argv.

[sonar] Replace private inheritance with a private member.

Add gemm.c to sonar exclusions, this code is not ours.

fix MC builds on gcc

fix lua builds

MC: rename some files

MC: finish emptying an old C file

Its content was dispatched to classes (that's still a bit cheatty in
inspect/ but that's in progress)

MC: inline a function that is now trivial

rename a file

fix build on stable debian

fix make dist, stupid f*** bummer

point to the right sonar repo

cleanup after the split of kernel/resource/profile into several classes

MC::Region: Also remove the permanent_addr thingy

That was needed for the MMAP privatization of SMPI, which is gone.

mc: cosmetics

Merge branch 'tracemgrsplit' into 'master'

Splitting trace_mgr into several files, one per class

See merge request simgrid/simgrid!4

fix make dist

fix gitlab-ci.yml

inline a function

kill the RegionSparse subclass now that there is no alternative

MC: cosmetics (fight the mc_model_checker singleton)

MC: remove support for flat storage of regions

This is another move to unclutter the MC source code. The road is
still long, but I'm progressing.

ci: don't rebuild specifically to build and linkcheck the doc

MC::remote: snake case

mc: Also remove the process_index

This was used to switch between MMAP private segments

Kill the support for privatized SMPI in MC mode

Update sonar-project.properties key

sonar: move the simgrid project in the simgrid organization

Don't pretend we can move a parallel exec

mc: snake_case the checkers

mc: snake_case a class

mc: change 3 static functions into private methods

And inline a fourth one

mc: move code around in the hope that it will sort itself while doing so

ignore java from coverage

Missing include (HAVE_MREMAP).

mc: tricks to improve the coverage

- change "if (..) xbt_die" into xbt_assert(..)
- kill dead code

fix non-MC builds when libevent is not found

further tidy the includes in MC

mc: kill some useless includes

Specify that we use framagit as a gitlab instance

Also, don't generate the link for generated pages, and remove the
exception about them in the linkchecker.

nope sonar, that's not some commented code

Fix project_description.sh.

Useless include.

fix some typo in the comments, just to launch a rebuild on servers

Having jenkins all white after restart is annoying

Plug a memleak

docker: drop root priviledge in our tutorial images

More borken link fixed

One was hidden in the doxygen comments and other ones required some
changes on the website.

doc: fix some borken links

Some by using a newer version, some by simply removing the link, some
by ignoring them in linkchecker

linkcheck doc: we won't fix javasphinx ourselves

oops

os_timer: detect when our implementation needs to be augmented

mc: create RegionSparse, RegionDense and RegionPrivatized (WIP)

The content is still in the ancestor class, with a switch on the type_
field. This will soon change.

RegionSnap: only use pointers to regions for sake of simplicity

mc: privatized regions now use a vector of pointers for sake of homogeneity

This commit is ... not very helping the readability as is. I hope to
make a real hierarchy of classes here around soon.

mc: some snake_casing on the way

mc: that FIXME was easy to fix :)

deactivate clock_gettime on SunOS, as it does not work for threads.
CLOCK_THREAD_CPUTIME_ID is declared, but is unimplemented, execution fails and we don't check it.
This can be checked by the absence of _POSIX_THREAD_CPUTIME in unistd.h
Sadly, deactivating posix_gettime only for thread timers is not practical in xbt, so just default to another for all timers.

try to make rma tests faster

Disable parallel ucontexts on 64bit SunOS.

Ucontexts and TLS don't play well together on this platform.

For the record, here is a sample test code. The output should be the same before and after
swapcontext (recall that option "-m64" may be mandatory to compile in 64bit mode).

--------------------
#include <iostream>
#include <stdexcept>
#include <system_error>
#include <thread>
#include <ucontext.h>

thread_local int x = 1;

static char stack[66536];
static ucontext_t ctx;
static ucontext_t octx;

static void wrap()
{
    std::cerr << "o. After swapcontext...: x = " << x << " (" << std::this_thread::get_id() << ")\n";
}

static void thread_fun()
{
    x = 2;
    std::this_thread::sleep_for(std::chrono::milliseconds(100));

    ctx.uc_stack.ss_sp = stack;
    ctx.uc_stack.ss_size = sizeof(stack);
    ctx.uc_link = &octx;
    makecontext(&ctx, &wrap, 2, (int)0xdeadbeef);
    std::cerr << "o. Before swapcontext..: x = " << x << " (" << std::this_thread::get_id() << ")\n";
    swapcontext(&octx, &ctx);
    std::cerr << "o. Finish of thread....: x = " << x << " (" << std::this_thread::get_id() << ")\n";
}

int main()
{
    std::cerr << "x. Main (before thread): x = " << x << " (" << std::this_thread::get_id() << ")\n";
    std::thread thr(thread_fun);
    getcontext(&ctx);
    thr.join();
    std::cerr << "x. Main (after join)...: x = " << x << " (" << std::this_thread::get_id() << ")\n";
}

Save worker's context directly in TLS.

g++ needs this include but not clang

I'm really puzzled

Ahem. You mean I need to actually compile with MC after moving files?

add s4u-cloud-simple to the list of examples

This example and the other cloud ones should probably be rewritten to
be more informative to the users, one day. This commit mostly create a
section in the list of examples that I'll be able to link to from the
main web page.

mc: move some files related to ELF, DWARF or unwind reading into their own directory

argh, linkchecker needs --check-extern to be really useful

ci@doc: fix the parameter of linkchecker

doc: fix the last broken links (?)

fix more dead links in the doc

stupid me, that file was moved just before

Only linkcheck the pages that we just generated

fix dead links on the webpage, and linkcheck it upon generation

write in the tuto that we need a recent version of SG

Merge branch 'master' of https://framagit.org/simgrid/simgrid

cosmetics: remove occurrences of "msg_platform.xml"

cosmetics do not use msg in log class names

Write in doc that some s4u objects are not smart pointers

Update the releasing doc

please sonar, pass parameters to lambda

make sure that nobody can compile s4u without simgrid/forward.h

mc::Snapshot: various cleanups and refactoring

- Obey our naming conventions for fields
- Change some functions into methods

Add a link from smpirun(1) to the online doc

Fix FG#3.

sosp: cosmetics

Use known PYTHON_EXECUTABLE.

More cleanup of tmp files (openindiana).

Deobfuscation.

F comes before G, and correct bug number.

Return const& for consistency.

more bugs got closed

Finish the conversion to python of the hostfile generation

 - Fix the XML syntax to please the python stupid parser
   The previous one was not invalid, I think, but anyway
 - Be compatible with both Python 2 and Python 3
 - The host order was changed in one example.

smpirun: use a python chunk to generate missing hostfiles

This way, we have a real XML parser, able of parsing any valid XML file.
The perl version was so painfully crude thay you could almost believe
it was written in Perl or something.

sonar: explict