java: use the appveyor-provided libwinpthread-1.dll

appveyor: only build the java parts

docs: cosmetics + document 'java-all' target

add a new target to build all Java examples and their dependencies

appveyor: Use the provided mingw64

stupid me. try again

try to please clang

Merge branch 'master' of framagit.org:simgrid/simgrid

doc: fix broken inline markup

doc: a word about the template project

Merge branch 'async_io' into 'master'

Async io

See merge request simgrid/simgrid!1

fix declaration

remove reference to glibc malloc functions, as they are not portable.
Instead move implementation of the wrappers before the include containing '#define malloc _sampi_malloc' to avoid looping

please bsd systems

fix distcheck. Add docs folder to excludes for now

[SMPI] Add sampi.h header

[SMPI] Fix datatype to aid_t instead of int

[CMAKE] Add load_balancer.hpp to cmake

[EX/SMPI/LB] Install src file correctly

[SMPI/AMPI] Make AMPI examples work and install correctly

[EXAMPLES/LB] Disable non-existing LB-replay test

[CMAKE] Well, remove privatized header...

[SMPI/LB] Small cleanups

better handling of size at creation

fix debug messages

SIMIX_io_destroy is ~IoImpl
throw the on_completion signal

working version.

declare an Io::OpType enum class

first compiling version

Implement I/O as asynchronous activities

[DVFS] Move comment + change get_host() visibility

[SMPI/LB] Make LB + Mapping classes XBT_PRIVATE

[SMPI/LB] Make header file private

[CMAKE] Add new ampi files to cmake. This should build now

[SAMPI] Move ampi signals to simgrid::smpi::plugin::ampi

This will still not build, but it is simpler to to see the changes with smaller commits

[SAMPI] Move tracing functions definitions to instr_ampi.cpp

This will still not build, but it is simpler to to see the changes with smaller commits

[SAMPI] Move tracing functions to instr_ampi.hpp

This will not build, but it is simpler to to see where the functions went

[SAMPI] Rename example from load_balancer to AMPI

This has nothing to do with the LB, just with AMPI

[SAMPI] Rename from sampi_pampi.cpp to ampi/ampi.cpp

[SMPI/LB] Add comment noting that an arg must not be 0

[SMPI/LB] Check migration counter before the LB execution

[SMPI/LB] Implement GreedyLB with a Fibonacci Heap

[SMPI/LB] Use mapping class within the LB

[EXAMPLES/LB] Add a replay example for the LB plugin

[CMAKE] Activate LB example

[CMAKE] Add the LoadBalancer file to cmake

[Plugins/LB] Add LoadBalancer class

[SAMPI] Update the sampi_loadbalancer code

This is a first version for our new load balancing
module. It's not yet ready, but we're getting there.

[EXAMPLES] Added first example/test for SAMPI (load balancer)

[CMAKE] Add sampi_pampi.cpp and smpi/sampi.h to cmake

[SMPI/LB] Add files load_balancer.hpp and smpi/sampi.h

[SAMPI] Add sampi_pampi.cpp

This file contains the implementation for several PAMPI_* functions

[SMPI] Add 3 tracing functions for SAMPI

- TRACE_Iteration_in
- TRACE_Iteration_out
- TRACE_migration_call

[SAMPI] Added AmpiMigrateTIData

[ENERGY] Add new hook to fix issue with communication calls

See the comment in the commit

[SMPI/INSTR] Replace ! with 'not' ...

[CMAKE] Cosmetics (sort some smpi files)

reduce memory footprint of a test (640MB was a bit too much for some ci vms)

Fix double dashes.

add scripted description update for appveyor and travis

add the dumb script used to update project description on jenkins to the repo

oops

add system detection for ci builds.
Not really possible with cmake, so done by hand with help from https://unix.stackexchange.com/questions/6345/how-can-i-get-distribution-name-and-version-number-in-a-simple-shell-script
This will help scripting the description of the slaves

woops, revalidate this tesh too

Automatically rebuild the pages on git push on framagit

cosmetics in error message

simplify this example

cleanups in sphinx config file

Merge branch 'master' of scm.gforge.inria.fr:/gitroot/simgrid/simgrid

doc: convert another chapter to RST

Get the documentation to build on RTD

doc: 'installation' converted to RST

doc: Main concepts

basic sphinx/breathe configuration for the documentation

plug leaks... Still don't like what's done here, it will need a good rewrite.

uniformity in Activity cancel()

Merge branch 'master' of git+ssh://scm.gforge.inria.fr//gitroot/simgrid/simgrid

test exec->cancel() and simplify another test

allow to cancel a s4u::Exec

Cannot use range-based for loop when container is modified.

One more filtered lib.

Wonder if we should not use a white list instead.

filtered_libraries++

Fix memory errors.

Spurious 'n'.

Keep list of filtered libraries sorted.

Remove useless thread_local.

It doesn't make any difference if context/factory is not "thread".

as the comment was saying, that was unsafe, and flang was doing something else

Don't free there for intel compiler, it breaks.
Yes, that means leaking.

[HostLoad] And lastly: Update the hooks used

[HostLoad] Update the update() method to use ExecImplPtrs

These ptrs are stored in the class, see the previous commit

[HostLoad] Add method HostLoad::add_activity(ExecImplPtr)

The HostLoad plugin keeps track of all the computations that are going on
and does no longer have to rely on calculations of the sort time_passed*speed.

Instead, we can now access the total cost of the computation and keep track
of how much is still remaining. Like this, we always account for exactly
the cost of that calculation.

[HostLoad] Update when calling getters

This will allow us to remove the CpuAction hook and replace it with
hooks that are only used after a calculation has completed.

If for instance a daemon (dvfs, load balancer, ...) wants to get
up-to-date information, this is now assured through the update call.

[HostLoad] Update comments + add debug statement

[HostLoad] Elaborate on comment

[HostLoad] Remove wrong 'was_prev_idle' notion

The load is only updated after a call to LMM; this means, that
we get the real load the action caused by querying the constraint
and we don't need to have a variable for that state.

[ENERGY] Remove HostLoad-plugin dependency

[SURF] Cosmetics for CpuAction

missed one

make a copy of args for each process
Not optimal as it's only for fortran (ifort) that it's useful.
Done this way to see if it helps flang as well

add another library to excludes to please mc