Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Public GIT Repository
Change how we lock things up ...
authorAugustin Degomme <adegomme@users.noreply.github.com>
Thu, 18 Apr 2019 15:54:40 +0000 (17:54 +0200)
committerAugustin Degomme <adegomme@users.noreply.github.com>
Thu, 18 Apr 2019 15:54:40 +0000 (17:54 +0200)
MPI RMA seemed a god idea, but it just did not work.

src/smpi/include/smpi_file.hpp
src/smpi/mpi/smpi_file.cpp

index 5a41b65..72efd93 100644 (file)
@@ -21,7 +21,8 @@ class File{
   int flags_;\r
   simgrid::s4u::File* file_;\r
   MPI_Info info_;\r
-  MPI_Offset shared_file_pointer_;\r
+  MPI_Offset* shared_file_pointer_;\r
+  s4u::MutexPtr shared_mutex_;\r
   MPI_Win win_;\r
   char* list_;\r
   public:\r
@@ -34,8 +35,6 @@ class File{
   int sync();\r
   int seek(MPI_Offset offset, int whence);\r
   int seek_shared(MPI_Offset offset, int whence);\r
-  int lock();\r
-  int unlock();\r
   MPI_Info info();\r
   void set_info( MPI_Info info);\r
   static int read(MPI_File fh, void *buf, int count,MPI_Datatype datatype, MPI_Status *status);\r
index d5717ee..46937ce 100644 (file)
@@ -9,6 +9,8 @@
 #include "smpi_datatype.hpp"\r
 #include "smpi_info.hpp"\r
 #include "smpi_win.hpp"\r
+#include "smpi_request.hpp"\r
+\r
 //setup here, because we have templates in smpi_file we want to log\r
 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_io, smpi, "Logging specific to SMPI (RMA operations)");\r
 \r
@@ -22,17 +24,24 @@ XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_io, smpi, "Logging specific to SMPI (RMA op
 namespace simgrid{\r
 namespace smpi{\r
 \r
-  File::File(MPI_Comm comm, char *filename, int amode, MPI_Info info): comm_(comm), flags_(amode), info_(info), shared_file_pointer_(0) {\r
+  File::File(MPI_Comm comm, char *filename, int amode, MPI_Info info): comm_(comm), flags_(amode), info_(info) {\r
     file_= new simgrid::s4u::File(filename, nullptr);\r
     list_=nullptr;\r
     if (comm_->rank() == 0) {\r
       int size= comm_->size() + FP_SIZE;\r
       list_ = new char[size];\r
       memset(list_, 0, size);\r
+      shared_file_pointer_ = new MPI_Offset[1];\r
+      shared_mutex_ = s4u::Mutex::create();\r
+      *shared_file_pointer_ = 0;\r
       win_=new Win(list_, size, 1, MPI_INFO_NULL, comm_);\r
     }else{\r
       win_=new Win(list_, 0, 1, MPI_INFO_NULL, comm_);\r
     }\r
+    simgrid::smpi::Colls::bcast(&shared_file_pointer_, 1, MPI_AINT, 0, comm);\r
+    simgrid::smpi::Colls::bcast(&shared_mutex_, 1, MPI_AINT, 0, comm);\r
+    if(comm_->rank() != 0)\r
+      intrusive_ptr_add_ref(&*shared_mutex_);\r
   }\r
 \r
   File::~File(){\r
@@ -61,9 +70,9 @@ namespace smpi{
   }\r
 \r
   int File::get_position_shared(MPI_Offset* offset){\r
-    lock();\r
-    *offset=shared_file_pointer_;\r
-    unlock();\r
+    shared_mutex_->lock();\r
+    *offset=*shared_file_pointer_;\r
+    shared_mutex_->unlock();\r
     return MPI_SUCCESS;\r
   }\r
 \r
@@ -88,10 +97,10 @@ namespace smpi{
   }\r
 \r
   int File::seek_shared(MPI_Offset offset, int whence){\r
-    lock();\r
+    shared_mutex_->lock();\r
     seek(offset,whence);\r
-    shared_file_pointer_=file_->tell();\r
-    unlock();\r
+    *shared_file_pointer_=offset;\r
+    shared_mutex_->unlock();\r
     return MPI_SUCCESS;\r
   }\r
 \r
@@ -122,29 +131,31 @@ namespace smpi{
   /* pages="84--93"*/\r
   /* }*/\r
   int File::read_shared(MPI_File fh, void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Status *status){\r
-    fh->lock();\r
-    fh->seek(fh->shared_file_pointer_,MPI_SEEK_SET);\r
+    fh->shared_mutex_->lock();\r
+    fh->seek(*(fh->shared_file_pointer_),MPI_SEEK_SET);\r
     read(fh, buf, count, datatype, status);\r
-    fh->shared_file_pointer_=fh->file_->tell();\r
-    fh->unlock();\r
+    *(fh->shared_file_pointer_)=fh->file_->tell();\r
+    fh->shared_mutex_->unlock();\r
     return MPI_SUCCESS;\r
   }\r
 \r
   int File::read_ordered(MPI_File fh, void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Status *status){\r
     //0 needs to get the shared pointer value\r
+    MPI_Offset val;\r
     if(fh->comm_->rank()==0){\r
-      fh->lock();\r
-      fh->unlock();\r
+      val=*(fh->shared_file_pointer_);\r
     }else{\r
-      fh->shared_file_pointer_=count*datatype->size();\r
+      val=count*datatype->size();\r
     }\r
+\r
     MPI_Offset result;\r
-    simgrid::smpi::Colls::scan(&(fh->shared_file_pointer_), &result, 1, MPI_OFFSET, MPI_SUM, fh->comm_);\r
+    simgrid::smpi::Colls::scan(&val, &result, 1, MPI_OFFSET, MPI_SUM, fh->comm_);\r
     fh->seek(result, MPI_SEEK_SET);\r
     int ret = fh->op_all<simgrid::smpi::File::read>(buf, count, datatype, status);\r
     if(fh->comm_->rank()==fh->comm_->size()-1){\r
-      fh->lock();\r
-      fh->unlock();\r
+      fh->shared_mutex_->lock();\r
+      *(fh->shared_file_pointer_)=fh->file_->tell();\r
+      fh->shared_mutex_->unlock();\r
     }\r
     char c;\r
     simgrid::smpi::Colls::bcast(&c, 1, MPI_BYTE, fh->comm_->size()-1, fh->comm_);\r
@@ -168,29 +179,30 @@ namespace smpi{
   }\r
 \r
   int File::write_shared(MPI_File fh, void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Status *status){\r
-    fh->lock();\r
-    fh->seek(fh->shared_file_pointer_,MPI_SEEK_SET);\r
+    fh->shared_mutex_->lock();\r
+    fh->seek(*(fh->shared_file_pointer_),MPI_SEEK_SET);\r
     write(fh, buf, count, datatype, status);\r
-    fh->shared_file_pointer_=fh->file_->tell();\r
-    fh->unlock();\r
+    *(fh->shared_file_pointer_)=fh->file_->tell();\r
+    fh->shared_mutex_->unlock();\r
     return MPI_SUCCESS;\r
   }\r
 \r
   int File::write_ordered(MPI_File fh, void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Status *status){\r
     //0 needs to get the shared pointer value\r
+    MPI_Offset val;\r
     if(fh->comm_->rank()==0){\r
-      fh->lock();\r
-      fh->unlock();\r
+      val=*(fh->shared_file_pointer_);\r
     }else{\r
-      fh->shared_file_pointer_=count*datatype->size();\r
+      val=count*datatype->size();\r
     }\r
     MPI_Offset result;\r
-    simgrid::smpi::Colls::scan(&(fh->shared_file_pointer_), &result, 1, MPI_OFFSET, MPI_SUM, fh->comm_);\r
+    simgrid::smpi::Colls::scan(&val, &result, 1, MPI_OFFSET, MPI_SUM, fh->comm_);\r
     fh->seek(result, MPI_SEEK_SET);\r
     int ret = fh->op_all<simgrid::smpi::File::write>(buf, count, datatype, status);\r
     if(fh->comm_->rank()==fh->comm_->size()-1){\r
-      fh->lock();\r
-      fh->unlock();\r
+      fh->shared_mutex_->lock();\r
+      *(fh->shared_file_pointer_)=fh->file_->tell();\r
+      fh->shared_mutex_->unlock();\r
     }\r
     char c;\r
     simgrid::smpi::Colls::bcast(&c, 1, MPI_BYTE, fh->comm_->size()-1, fh->comm_);\r
@@ -210,54 +222,6 @@ namespace smpi{
     return simgrid::smpi::Colls::barrier(comm_);\r
   }\r
 \r
-  int File::lock()\r
-{\r
-  int rank = comm_->rank();\r
-  int size = comm_->size();\r
-  char waitlist[size];\r
-  char lock = 1;\r
-  int tag=444;\r
-  int i;\r
-  win_->lock(MPI_LOCK_EXCLUSIVE, 0, 0);\r
-  win_->put(&lock, 1, MPI_CHAR, 0, FP_SIZE+rank, 1, MPI_CHAR);\r
-  win_->get(waitlist, size, MPI_CHAR, 0, FP_SIZE, size, MPI_CHAR);\r
-  win_->get(&shared_file_pointer_ , 1 , MPI_OFFSET , 0 , 0, 1, MPI_OFFSET);\r
-  win_->unlock(0);\r
-  for (i = 0; i < size; i++) {\r
-    if (waitlist[i] == 1 && i != rank) {\r
-      // wait for the lock\r
-      MPI_Recv(&lock, 1, MPI_CHAR, MPI_ANY_SOURCE, tag, comm_, MPI_STATUS_IGNORE);\r
-      break;\r
-    }\r
-  }\r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-int File::unlock()\r
-{\r
-  int rank = comm_->rank();\r
-  int size = comm_->size();\r
-  char waitlist[size];\r
-  char lock = 0;\r
-  int tag=444;\r
-  int i, next;\r
-  win_->lock(MPI_LOCK_EXCLUSIVE, 0, 0);\r
-  win_->put(&lock, 1, MPI_CHAR, 0, FP_SIZE+rank, 1, MPI_CHAR);\r
-  win_->get(waitlist, size, MPI_CHAR, 0, FP_SIZE, size, MPI_CHAR);\r
-  shared_file_pointer_=file_->tell();\r
-  win_->put(&shared_file_pointer_, 1 , MPI_OFFSET , 0 , 0, 1, MPI_OFFSET);\r
-\r
-  win_->unlock(0);\r
-  next = (rank + 1 + size) % size;\r
-  for (i = 0; i < size; i++, next = (next + 1) % size) {\r
-    if (waitlist[next] == 1) {\r
-      MPI_Send(&lock, 1, MPI_CHAR, next, tag, comm_);\r
-      break;\r
-    }\r
-  }\r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
 MPI_Info File::info(){\r
   if(info_== MPI_INFO_NULL)\r
     info_ = new Info();\r