Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Public GIT Repository
Allow to use non absolute path in MPI IO.
[simgrid.git] / src / smpi / mpi / smpi_file.cpp
index 8d841ef..c743cf9 100644 (file)
 
 #include "smpi_file.hpp"
 #include "smpi_status.hpp"
+#include "simgrid/s4u/Disk.hpp"
+#include "simgrid/s4u/Host.hpp"
 #include "simgrid/plugins/file_system.h"
 
 #define FP_SIZE sizeof(MPI_Offset)
 
 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_io, smpi, "Logging specific to SMPI (RMA operations)");
 
+MPI_Errhandler SMPI_default_File_Errhandler = MPI_ERRORS_RETURN;
+
 namespace simgrid{
 namespace smpi{
 
-  File::File(MPI_Comm comm, char *filename, int amode, MPI_Info info): comm_(comm), flags_(amode), info_(info) {
-    file_= new simgrid::s4u::File(filename, nullptr);
+  File::File(MPI_Comm comm, const char *filename, int amode, MPI_Info info): comm_(comm), flags_(amode), info_(info) {
+    std::string fullname=filename;
+    if (simgrid::s4u::Host::current()->get_disks().empty())
+      xbt_die("SMPI/IO : Trying to open file on a diskless host ! Add one to your platform file");
+
+    size_t found=fullname.find('/');
+    //in case no fullpath is provided ... just pick the first mountpoint.
+    if(found==std::string::npos){
+      auto disk = simgrid::s4u::Host::current()->get_disks().front();
+      std::string mount;
+      if (disk->get_host() != simgrid::s4u::Host::current())
+        mount = disk->extension<simgrid::s4u::FileSystemDiskExt>()->get_mount_point(disk->get_host());
+      else
+        mount = disk->extension<simgrid::s4u::FileSystemDiskExt>()->get_mount_point();
+      XBT_DEBUG("No absolute path given for file opening, use '%s'", mount.c_str());
+      fullname.insert(0, mount);
+    }
+
+    file_= new simgrid::s4u::File(fullname, nullptr);
     list_=nullptr;
     if (comm_->rank() == 0) {
       int size= comm_->size() + FP_SIZE;
       list_ = new char[size];
+      errhandler_= SMPI_default_File_Errhandler;
       memset(list_, 0, size);
       shared_file_pointer_ = new MPI_Offset();
       shared_mutex_ = s4u::Mutex::create();
@@ -36,8 +58,8 @@ namespace smpi{
     }else{
       win_=new Win(list_, 0, 1, MPI_INFO_NULL, comm_);
     }
-    simgrid::smpi::Colls::bcast(&shared_file_pointer_, 1, MPI_AINT, 0, comm);
-    simgrid::smpi::Colls::bcast(&shared_mutex_, 1, MPI_AINT, 0, comm);
+    simgrid::smpi::colls::bcast(&shared_file_pointer_, 1, MPI_AINT, 0, comm);
+    simgrid::smpi::colls::bcast(&shared_mutex_, 1, MPI_AINT, 0, comm);
     if(comm_->rank() != 0)
       intrusive_ptr_add_ref(&*shared_mutex_);
   }
@@ -60,7 +82,8 @@ namespace smpi{
     return MPI_SUCCESS;
   }
 
-  int File::del(char *filename, MPI_Info info){
+  int File::del(const char* filename, MPI_Info)
+  {
     //get the file with MPI_MODE_DELETE_ON_CLOSE and then close it
     File* f = new File(MPI_COMM_SELF,filename,MPI_MODE_DELETE_ON_CLOSE|MPI_MODE_RDWR, nullptr);
     close(&f);
@@ -107,7 +130,8 @@ namespace smpi{
     return MPI_SUCCESS;
   }
 
-  int File::read(MPI_File fh, void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Status *status){
+  int File::read(MPI_File fh, void* /*buf*/, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Status* status)
+  {
     //get position first as we may be doing non contiguous reads and it will probably be updated badly
     MPI_Offset position = fh->file_->tell();
     MPI_Offset movesize = datatype->get_extent()*count;
@@ -152,7 +176,7 @@ namespace smpi{
     }
 
     MPI_Offset result;
-    simgrid::smpi::Colls::scan(&val, &result, 1, MPI_OFFSET, MPI_SUM, fh->comm_);
+    simgrid::smpi::colls::scan(&val, &result, 1, MPI_OFFSET, MPI_SUM, fh->comm_);
     fh->seek(result, MPI_SEEK_SET);
     int ret = fh->op_all<simgrid::smpi::File::read>(buf, count, datatype, status);
     if(fh->comm_->rank()==fh->comm_->size()-1){
@@ -161,17 +185,18 @@ namespace smpi{
       fh->shared_mutex_->unlock();
     }
     char c;
-    simgrid::smpi::Colls::bcast(&c, 1, MPI_BYTE, fh->comm_->size()-1, fh->comm_);
+    simgrid::smpi::colls::bcast(&c, 1, MPI_BYTE, fh->comm_->size() - 1, fh->comm_);
     return ret;
   }
 
-  int File::write(MPI_File fh, void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Status *status){
+  int File::write(MPI_File fh, void* /*buf*/, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Status* status)
+  {
     //get position first as we may be doing non contiguous reads and it will probably be updated badly
     MPI_Offset position = fh->file_->tell();
     MPI_Offset movesize = datatype->get_extent()*count;
     MPI_Offset writesize = datatype->size()*count;
     XBT_DEBUG("Position before write in MPI_File %s : %llu",fh->file_->get_path(),fh->file_->tell());
-    MPI_Offset write = fh->file_->write(writesize);
+    MPI_Offset write = fh->file_->write(writesize, 1);
     XBT_VERB("Write in MPI_File %s, %lld bytes written, readsize %lld bytes, movesize %lld", fh->file_->get_path(), write, writesize, movesize);
     if(writesize!=movesize){
       fh->file_->seek(position+movesize, SEEK_SET);
@@ -181,16 +206,16 @@ namespace smpi{
     return MPI_SUCCESS;
   }
 
-  int File::write_shared(MPI_File fh, void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Status *status){
+  int File::write_shared(MPI_File fh, const void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Status *status){
     fh->shared_mutex_->lock();
     fh->seek(*(fh->shared_file_pointer_),MPI_SEEK_SET);
-    write(fh, buf, count, datatype, status);
+    write(fh, const_cast<void*>(buf), count, datatype, status);
     *(fh->shared_file_pointer_)=fh->file_->tell();
     fh->shared_mutex_->unlock();
     return MPI_SUCCESS;
   }
 
-  int File::write_ordered(MPI_File fh, void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Status *status){
+  int File::write_ordered(MPI_File fh, const void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Status *status){
     //0 needs to get the shared pointer value
     MPI_Offset val;
     if(fh->comm_->rank()==0){
@@ -199,16 +224,16 @@ namespace smpi{
       val=count*datatype->size();
     }
     MPI_Offset result;
-    simgrid::smpi::Colls::scan(&val, &result, 1, MPI_OFFSET, MPI_SUM, fh->comm_);
+    simgrid::smpi::colls::scan(&val, &result, 1, MPI_OFFSET, MPI_SUM, fh->comm_);
     fh->seek(result, MPI_SEEK_SET);
-    int ret = fh->op_all<simgrid::smpi::File::write>(buf, count, datatype, status);
+    int ret = fh->op_all<simgrid::smpi::File::write>(const_cast<void*>(buf), count, datatype, status);
     if(fh->comm_->rank()==fh->comm_->size()-1){
       fh->shared_mutex_->lock();
       *(fh->shared_file_pointer_)=fh->file_->tell();
       fh->shared_mutex_->unlock();
     }
     char c;
-    simgrid::smpi::Colls::bcast(&c, 1, MPI_BYTE, fh->comm_->size()-1, fh->comm_);
+    simgrid::smpi::colls::bcast(&c, 1, MPI_BYTE, fh->comm_->size() - 1, fh->comm_);
     return ret;
   }
 
@@ -222,7 +247,7 @@ namespace smpi{
 
   int File::sync(){
     //no idea
-    return simgrid::smpi::Colls::barrier(comm_);
+    return simgrid::smpi::colls::barrier(comm_);
   }
 
   MPI_Info File::info(){
@@ -241,5 +266,15 @@ namespace smpi{
   MPI_Comm File::comm(){
     return comm_;
   }
+
+  MPI_Errhandler File::errhandler(){
+    return errhandler_;
+  }
+
+  void File::set_errhandler(MPI_Errhandler errhandler){
+    errhandler_=errhandler;
+    if(errhandler_!= MPI_ERRHANDLER_NULL)
+      errhandler->ref();
+  }
 }
 }